j*b 发帖数: 341 | 1 版上可有人用过,gene targeting efficiency is almost 100%.
Cell Stem Cell. 2011 Jun 3;8(6):688-94.
Targeted gene correction of laminopathy-associated LMNA mutations in patient
-specific iPSCs.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21596650 |
c**********n 发帖数: 177 | 2 求大牛展开说说。貌似我们学校有个PI就做HGPS的,貌似也用iPSC。。 |
z*t 发帖数: 863 | 3 我觉得crispr胜在便宜易用,adv基本还是targeting vector的东西,对非es cell的
somatic细胞比较好用。
patient
【在 j*b 的大作中提到】 : 版上可有人用过,gene targeting efficiency is almost 100%. : Cell Stem Cell. 2011 Jun 3;8(6):688-94. : Targeted gene correction of laminopathy-associated LMNA mutations in patient : -specific iPSCs. : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21596650
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d****i 发帖数: 2346 | 4
patient
http://ac.els-cdn.com/S1934590911003419/1-s2.0-S193459091100341
这个comment里的表上写的是46%。
【在 j*b 的大作中提到】 : 版上可有人用过,gene targeting efficiency is almost 100%. : Cell Stem Cell. 2011 Jun 3;8(6):688-94. : Targeted gene correction of laminopathy-associated LMNA mutations in patient : -specific iPSCs. : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21596650
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j*b 发帖数: 341 | 5 加上negative selection,接近100% (文章中)
老鼠ES,加上negative selection,也只有15%左右
【在 d****i 的大作中提到】 : : patient : http://ac.els-cdn.com/S1934590911003419/1-s2.0-S193459091100341 : 这个comment里的表上写的是46%。
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n********k 发帖数: 2818 | 6 这应该同CRISPER没得比!筛选达到100%,不双筛呢!而且同源臂长很多了,而且与具
体位点影响大了。我的KO单选,ES里面基本效率是20-50%, 为什么,ES 高表达呀。同
理在这篇文章了,所以复杂着呢。
【在 j*b 的大作中提到】 : 加上negative selection,接近100% (文章中) : 老鼠ES,加上negative selection,也只有15%左右
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j*b 发帖数: 341 | 7 不双筛是46%
如果不是promoter trap,用CRISPR做Knockin的效率是多少?
文章里用的可是人ESC。难度很大
不一定同源臂越长,重组越高。比如用BAC,200kb 直接做KO vector,效果很差
【在 n********k 的大作中提到】 : 这应该同CRISPER没得比!筛选达到100%,不双筛呢!而且同源臂长很多了,而且与具 : 体位点影响大了。我的KO单选,ES里面基本效率是20-50%, 为什么,ES 高表达呀。同 : 理在这篇文章了,所以复杂着呢。
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d****i 发帖数: 2346 | 8 如果真是这样的效率,其实已经很好了,但是好几百kb的操作肯定比CRISPR的几百bp的
操作难度要大。两个技术各有优缺点。 |