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全部话题 - 话题: metabolomics
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b****n
发帖数: 75
1
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: bioben (hehe), 信区: Biology
标 题: 吉林大学中日联谊医院青千招聘(癌症系统生物学)
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Feb 3 12:27:02 2018, 美东)
Faculty and Qin Qian positions at the CSBC at JLU
http://csbc.org.cn/
We are looking for energetic and talented people to join our faculty (吉林大
学中日联谊医院肿瘤系统生物学中心, http://csbc.org.cn/). We are particularly interested in receiving applications from candidates with background in
(1) cancer systems biology;
(2) cancer metabolomics;
(3) studies of relationships between ch... 阅读全帖
S***R
发帖数: 309
2
请想审稿的人把姓名、email和简单的自我学术介绍发到我信箱。
k********g
发帖数: 1686
3
来自主题: Immigration版 - 求一篇文章
学校的数据库里查不到。。。
Metabolomics for Personalized Nutrition Research and Clinical Applications
Authors: Schnackenberg, Laura K.; Sun, Jinchun; Pence, Lisa; Bhattacharyya,
Sudeepa; Sonko, Bakary J.; Beger, Richard D.
Source: Current Pharmacogenomics and Personalized Medicinenomics), Volume 8,
Number 3, September 2010 , pp. 202-217(16)
包子答谢!
m******b
发帖数: 74
4
来自主题: Immigration版 - 请帮忙查几个book chapter
请有wiley online library 账户的兄弟姐妹帮忙查几篇book chapter,发到williams.
y***[email protected]。具体如下:
Book Title: Toxicogenomics: a powerful tool for toxicity assessment(book)
之Chapter 18: the development of a metabonomic-based drug safety testing
paradigm
Book Title: Encyclopedia of Drug Metabolism and Interactions
之Metabonomics in Understanding Drug Metabolism and Toxicology(作者Bo Wen)
Book Title: Electromigration Techniques:Theory and Practice
之Chapter 15- application of electromigration techniques:metabolomics-
... 阅读全帖
n*****e
发帖数: 3
5
来自主题: Immigration版 - 求paper review
在本版潜水了一段时间,获益非浅。终于要开始自己的申绿之旅,苦于review 太少。
如果各位前辈有review可以转介麻烦站内私信联系。
我的专业领域:Risk Assessment; Pharmacology; Toxicology and Metabolomics.
谢谢,非常感谢!
S*******r
发帖数: 3
6
你好,我想参与审稿。我没有审过phytochemistry他家的paper,不过我的信息在
reviewer的database里面了,上周刚给editor发邮件要求审稿,editor已经同意了。我
目前在给其他几家杂志审稿,我自己是做natural product和plant metabolomics的,
请问怎么联系?谢谢!
l**********8
发帖数: 305
7
来自主题: Immigration版 - 求质谱相关审稿机会
本人正在绿卡申请准备中,希望哪位前辈如果有多余的审稿机会,可以推荐我。先在此
谢过。
研究方向: 质谱应用 (MALDI-TOF/TOF, QIT-TOF, LC-Q-TOF, triple quad);MS-
based metabolomics, proteomics, protein de novo sequencing,glycosylation
analysis.
如需CV,请站内联系。
谢谢!
a*********0
发帖数: 268
8
来自主题: Immigration版 - 有偿求审稿
今年开始就一直在努力的找审稿的机会,给很多杂志的主编副主编发过邮件要审稿。大
部分都有回复说把我放在reviewer list了。可是好几个月过去了,到现在为止一片审
稿都没有收到。老板也找过了要代为审稿,现在为止也没有信。 绿卡LD指望不上,就
压到我的肩上了。想年底试一试。关键就卡在审稿上了。现在为了审稿都有些
desperate了。真要成绝望的主妇了。所以,有偿求审稿。可以私信谈报酬。 我主要做
纳米邻域以及生物方面的应用还有蛋白质组学和代谢组学方面的。发过nanoletters和
analytical chemistry档次的文章。 具体研究领域如下:Nanoparticles synthesis,
characterization, modification, and applications in biosensor, food science,
and environmental safety. Plasmonic nanoparticle coupling and optical
properties study at single particle level. Pr... 阅读全帖
a*********0
发帖数: 268
9
谢谢好心的楼主转审稿机会。我是做proteomics和metabolomics的。还有
nanotechnology的background。现在在做postdoc。研究方向是selectively detection
of bacteria and fungi in food samples including yogurt and milk. 我的google
scholarhttps://scholar.google.com/citations?user=lldXTZYAAAAJ&hl=en 如能得
到楼主的推荐,将非常感谢。
y*******g
发帖数: 125
10
来自主题: Immigration版 - 求bioinformatics方向杂志审稿
大家好,我是bioinformatics基因调控网络方向,目前从事metabolomics工作,希望版
上大拿如果有杂志审稿机会请forward给我,yondchang at gmail.com, 保证一周内
submit
,祝大家圣诞快乐!

发帖数: 1
11
来自主题: Immigration版 - 求分析化学审稿机会

谢谢!我的专长主要包括flow injection analysis,sample preparation,
speciation, separation techniques, atomic spectrometry, mass spectrometry(
GC/LC), environmental analysis, pharmaceutical analysis, bioanalysis,
metabolomics
t*******r
发帖数: 364
12
人类代谢表型组计划项目招聘研究助理2-3名博士后3-4名
一、课题组背景:课题组依托遗传工程国家重点实验室、遗传与发育协同创新中心,负
责人唐惠儒教授曾在英国留学17年、在中科院等工作10年,长期从事代谢组学技术与疾
病代谢基础等研究,在PNAS,Cell Res,J Proteome Res, Anal Chem等期刊发表170多
篇论文,被引4000余次。现任JPR、Metabolomics等多个国际期刊编委或副主编。
二、岗位职责:岗位均受国家基金等项目资助。
鼓励个人研究兴趣,参与或独立从事实验室课题研究,,申报承担研究课题。
三、应聘条件:请背景合适者投简历,不合适者看别的招聘信息。
研究助理:具有代谢组学、荧光探针合成、GC-MS、LC-MS等方面的研究经历,掌握多种
技术交叉者优先。鼓励个人研究兴趣,参与或独立从事实验室课题研究。
博士后:具有博士学位并发表过SCI论文;具有荧光探针等有机合成、代谢组学、GC-MS
、LC-MS、NMR等方面的研究背景,具有多种经历者优先,有代谢组核磁共振或色谱质谱
分析经历者优先。具有很强的责任心和良好的团队合作精神。鼓励学科交叉。
四... 阅读全帖
t******k
发帖数: 5617
13
来自主题: PhotoGear版 - 难道生物学的世纪真的来临了?
这个好啊,现在不光要做proteomics,还要做metabolomics和translatmics.而且发展
的趋势不是仅仅做定性,而是要做定量分析。不但科研上要用,以后还会在个性化诊断
治疗阶段对病人使用,你做的东西以后前景会很广啊
b******3
发帖数: 377
14
来自主题: PhotoGear版 - 难道生物学的世纪真的来临了?
推荐几个metabolomics或者proteomics的组吧,我要找博后。
f****6
发帖数: 4472
15
来自主题: PhotoGear版 - 难道生物学的世纪真的来临了?
metabolomics没太大用,proteomics也不好说。关键是活性,而且你要找到某蛋白和某
疾病的causal relationship,这个很重要。就像你说的,定量也非常重要,搞生物的
人对这个好像不太关注。
t******k
发帖数: 5617
16
来自主题: PhotoGear版 - 难道生物学的世纪真的来临了?
metabolomics刚起步,很多东西还是空白,所以没显现出很大用处。proteomics实际上
比转录组学要重要,因为转录水平并不能非常好的体现蛋白水平的情况。定量的问题是
,以前精度不够,以后随着一起的发展,肯定会越来越多
r****r
发帖数: 379
17
我结合自己的体会,一个问题就在于,很多功能研究,必须将cellular/biochemistry/
physiological phenotypes 变成molecular(transcriptomics/protemoics/
metabolomics) phenotpyes,我才愿意去做高通量筛选和高通量的数据采集,不然高通
量筛选会因为输出不方便检测而变得不可操作,高通量采集会因为没有对应定量的输入变化而产生一堆毫无意义的数据。
mcp这个protimocis杂志上的数据,有多少生物学家们会去看?因为其中大部分定量数
据都是没有实现这个转化,只是在时间窗口上和功能吻合罢了,比如研究分化,就采集
分化不同时期的表达谱,这会有很大帮助吗?
如果我可以通过前期的高通量数据采集,然后能够用一群分子的变化代替分化的表型变
化,这个时候我就可以将这群分子的变化当作输出实现高通量的筛选,累积更多的干涉
到输出的定量数据,最后在这个基础上建模。
l******o
发帖数: 2649
18
1。
因为我觉得手法很前沿
是bioinformatics proteomics transcriptome bench work systems biology
这套能做,有整合经验挺好,发展空间大。实在不行还可以换organism,不是很多人有
机会做这一套我感觉
2。
这个老板领域有一些fellowship外国人可以申请所以他才这样要求。虽然实验室开始做
一些类似systems biology的东西,确实做metabolomics以外,研究方法相对更传统。
f**********e
发帖数: 79
19
Postdoctoral position is available immediately in the laboratory of Marjorie
Lou at the University of Nebraska. We are looking for a highly motivated
person with a PhD degree in molecular biology, biochemistry or related
fields. Applicants with cell biology skills are preferable. Possible
projects will be related to the functional of thiol oxidoreductases (
glutaredoxin and thioredoxin) in oxidation damage repair and their role in
cell signaling, using eye tissue as a model.
Employment opportuni... 阅读全帖
y*****s
发帖数: 1047
20
来自主题: Biology版 - 达人们来说说omics
genomics proteomics metabolomics lipodomics glycomics
是火坑吗? 有前途吗?
m**********2
发帖数: 6568
21
来自主题: Biology版 - 系统生物学是不是一个大忽悠
“忽悠我们了”?那时你在上小学么?where's your critical thinking?
"炒冷饭"? 很早以前就有现在的海量数据吗?
我现在处理的,有几万个microarray,几万个metabolome,几千个proteome的数据,还
要和十
几年的field trial数据结合起来。每提一个query,公司的server就要跑上好几天--好
在今年
批下来钱来买一个更强大的的server.
“生物不该当作系统研究吗”?当然不是新概念。从两千年前到200年前,大家都这么
认为。但是只有
现在,我们才刚刚能力开始探索这个方向。
系统生物学和分子生物学一样,只是一个手段。一个人能作出什么成果,归根结底在于
他能问出什么
样的问题。对于一个好的biologist,系统生物学和其它的分支没有区别,也没有高下
之分。就象你
修汽车,诊断用的电脑,和螺丝刀,都是工具。而在车盲手里,都一样是没有用处。
h**********r
发帖数: 671
22
我不想审稿。但三个月之后实验室可能要装备些metabolomics instruments.我能预约
下到时候有问题请教您?多谢!
s********n
发帖数: 2939
23
你还让不让人活,人家靠这个估计有好几十篇Nature, Science的,如DNA结构,RNA结
构,proteins结构,genome,transcriptome,proteome,metabolomics...,如果他们
的结果是正确的话。呵呵。
a***y
发帖数: 19743
24
来自主题: Biology版 - 博后offer选择求建议
我也是感觉蛋白的技术可能普世一些。
2的技术industry还是有用的吧,他们实验室本来也有筛选小分子药物,对应他们找到
的target来筛选。做NMR好像是做metabolomics,也有LC。
其实两边的技术都是感觉过了这个村就没这个店了。
蛋白
vs
动物。
很多industry job和博后没有handle过动物都不要的……
s******y
发帖数: 28562
25
从赚钱的角度来讲是一个非常好的坑

研究的,如果走omics的路
j****x
发帖数: 1704
26
算不上非常好的坑啦,业界工作相对好找而已,当然了,只是相对于大部分纯生物坑而言
人家本来的坑找工作也不难的说
s******y
发帖数: 28562
27
是的,必须有病人的样品源,所以其实也不是谁想做都能做的。
但是真实做起来其实就是各种分析化学手段而已。
h*****s
发帖数: 153
28

My boss wanna me do some NMR chemometrics research on -omics. Since my co-
supervisor is a mathematics professor and I am really into math and computer
science, I would like to make my project more mathematical. Do you think it
is a good idea for doing that, but the challenging part is I need to design
my project by myself well to combine both and balance both well.
s******y
发帖数: 28562
29
这里有两个问题:
1。你们如何解决样品库的来源?还是你们打算先用某些“训练样品”
来优化你们的算法?
2。我赞成你做更多数学方面的东西,这样你将来不想做生物了也比较容易
抽身而走,但是你可能得找一个得力合作者来给辅助你做生物那方面的东西。

computer
it
design
h**********r
发帖数: 671
30
我们也准备做这些。机器也有,都不太会玩儿。我们主要做海藻微生物代谢和lipid的
。有兴趣可以交流交流。我微生物的bench work做得多。互补一下。
s******y
发帖数: 28562
31
这两个坑好像最近特别的热,但是其实有好多技术问题没有解决,比方说
如何保存病人的样品就是一个大问题。
对于那些测DNA, RNA,还有蛋白的,可以把样品给固定了,但是这些固定
过程很难防止一些小分子的代谢产物的流失和在储存运输的途中的改变。
h*****s
发帖数: 153
32

My previous boss for my undergraduate project course is a cholesterol person
, it would be easy to get cell samples from his lab to do some lipidomics
analysis. My supervisor has connections with the Cancer research center
affiliated to our uni, some potential collaborations might be involved.
I quite like biology, but the wet experiment is just so tedious for me.
s******y
发帖数: 28562
33
那你尽量留在数学那边好了,wet bench 让其他人去做

person
C*******e
发帖数: 4348
34
并不是只有“病人的样品”才能做-omics的
他们那个主要是开创研究方法
是不是一定要跟疾病挂上钩倒不是很重要
h**********r
发帖数: 671
35
微生物里的做得挺多了。我其实不太关注lipid的代谢,还是想了解一下lipid的代谢和
其他主要代谢的调控。
t******t
发帖数: 3045
36
NMR is a bad keng, statistics and informatics seem good keng

computer
it
design
c****g
发帖数: 93
37
关注一下,居然是做chol的

person
s******a
发帖数: 252
38
NMR has no major future here, not enough throughput & sensitivity.
s******y
发帖数: 28562
39
啊?可是代谢物大部分都是小分子,用NMR不是正好么?
质谱敏感是敏感,但是不好定量。
b*******g
发帖数: 1309
40
QQQ MS 是小分子定量的标准方法 gold standard
用NMR 看一个小分子容易,看1000个小分子就不是太容易了
s******y
发帖数: 28562
41
那倒是。。。如果太多分子混在一起,是不是NMR的谱就没有办法读了?
V***b
发帖数: 3419
42
好坑,跳吧。一个基因一个基因敲除的时代过去了,现在热点在于研究细胞动态过程,
代谢物的flux。

研究的,如果走omics的路
z*t
发帖数: 863
43
磁场频率达到800M Hz就能分得比较好
但这种机器据说市面上卖几百万美刀
现在常规的是400M Hz
用nmr最爽是可以non-invasive测细胞/组织代谢物,对clinical sample或者rare
sample比较适用。而且如果你找的合适的nmr信号标记细胞,你可以in vivo观测细胞
R****n
发帖数: 708
44
well said.

and
n********k
发帖数: 2818
45
there were two science papers, one was on human brain stem cells using
lipids as a stem cell/proliferation marker. I thought it is very cool and
has tremendous potentials but I have no expertise on the subject whatsoever
and cannot really comment on it...
Magnetic Resonance Spectroscopy Identifies Neural Progenitor Cells in the
Live Human Brain
h*****s
发帖数: 153
46

and
whatsoever
This paper is really cool, what about the other one, can you send me the
linkage? Thanks in advance.
z*t
发帖数: 863
47
这姐们在我们隔壁,准备联合几家买800MHz的NMR
从H1谱上来看,她们标记的不应该是脂类,因为化学位移只有1.28ppm,可能是某种烃
类。做有机的高手可以帮忙解读下

and
whatsoever
h**********r
发帖数: 671
48
在你们隔壁的姐们是做啥的?我也做烃类。
z*t
发帖数: 863
49
neural stem cell
z*t
发帖数: 863
50
我跟做有机的人聊过,nmr的sensitivity比MS要弱。不过因为是non-invasive的对特定
的实验用很好的用处。
至于代谢物list没有查过,估计在一百个左右的已知代谢物?
还有问题感觉就是定量,看过profiling的data感觉不少fold change并不理想,要在microarray数据里早就剃掉了

was
(
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