由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: 计算
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b******y
发帖数: 2729
1
来自主题: Seattle版 - 在说一遍云计算服务 (转载)
【 以下文字转载自 Apple 讨论区 】
发信人: sunfic (sunfic), 信区: Apple
标 题: 在说一遍云计算服务
发信站: BBS 未名空间站 (Sun May 23 16:08:24 2010, 美东)
这个看起来牛逼哄哄的东西现在有两个瓶颈
一个是服务器端的运算能力,的确云计算可以通过数量换速度,但并不是所有的应用都
能这么干,特别是想要直接到桌面显示的程度。
一个是普通用户的网络带宽,大家可以做个简单的计算,要达到1024×768分辨率 60Hz
16bit色深需要的网络带宽是多少?考虑到比较成熟的视频压缩技术又要多少?
上面这两个瓶颈都是可以解决的,但是需要时间。那些说2-3年云计算成熟的人我不知
道你们的自信来自哪里
现阶段能够看到的唯一云应用就是云存储。
q***2
发帖数: 1861
2
Good! Go Microsoft, WA need you a!

时通讯和文件共享程序。谷歌和IBM也参与了竞标。
美国农业部首席信息官克里斯·史密斯(Chris Smith)称,之所以选择微软,是因
为该部半数雇员已经在使用该公司的Exchange电子邮件系统。由于云计算程序将数据存
储在提供商的远程服务器上,用户可以节省购买电脑和维护及升级软件的费用。“这使
我们不再需要购买硬件,将来连软件升级也不需要了。”史密斯说。
史密斯称,美国农业部将为每个电子邮箱支付大约8美元的使用费,明年计划节约
600万美元。
谷歌今天表示,并未获得竞标机会。该公司在一份电子邮件中称:“在存在完全且
开放的竞争的环境中,用户已经选择了谷歌,纳税人也因此节省了数百万美元。”
谷歌上周表示,已经击败微软,赢得了一份价值670万美元的合同,为美国总务管
理局处理电子邮件。此前,明尼苏达州、纽约市和加利福尼亚州相继选择了微软的云计
算软件。
10月,谷歌起诉美国内政部,声称未能获得一份通讯软件合同的竞标机会,原因是
竞标要求规定必须使用微软产品。
IBM发言人史蒂夫·托马斯科(Steve Tomasc... 阅读全帖
x******4
发帖数: 3001
3
我以前用的是Simple Power,后来这公司被Cirro 收购,等到该renew的时候发现新提
供的plan不厚道,所以果断选择更换。
在电费比较网站http://www.powertochoose.org/_content/_compare/compare.aspx输入自己的zip code邮编,就可以看到所有自己可选的电力公司的plan,我当时看了半天,发现有很多plan虽然标的平均价格很低(最低可达5.3cents),实际上不一定合算。
关于month-to-month 和Fixed price
这其实是宣传的一个噱头,这个只是接入的第一个月给的特别优惠,过完第一个月就按
照市场上的费率计算,每个月会有波动,但是市场上的费率大概是10cent~12cent/kwh
。所以如果住的时间够长,签一个12个月合约(注意签合约的话,如果提前结束服务,
需要支付$200的提前终止服务费),在合约期内的固定费率,总的来说还是可以比month
-to-month要便宜些。
下面就单独讨论Fixed price的plan
以Cirro Energy 的Smart Lock 6 为例,它的EF... 阅读全帖
x******4
发帖数: 3001
4
我以前用的是Simple Power,后来这公司被Cirro 收购,等到该renew的时候发现新提
供的plan不厚道,所以果断选择更换。
在电费比较网站http://www.powertochoose.org/_content/_compare/compare.aspx输入自己的zip code邮编,就可以看到所有自己可选的电力公司的plan,我当时看了半天,发现有很多plan虽然标的平均价格很低(最低可达5.3cents),实际上不一定合算。
关于month-to-month 和Fixed price
这其实是宣传的一个噱头,这个只是接入的第一个月给的特别优惠,过完第一个月就按
照市场上的费率计算,每个月会有波动,但是市场上的费率大概是10cent~12cent/kwh
。所以如果住的时间够长,签一个12个月合约(注意签合约的话,如果提前结束服务,
需要支付$200的提前终止服务费),在合约期内的固定费率,总的来说还是可以比month
-to-month要便宜些。
下面就单独讨论Fixed price的plan
以Cirro Energy 的Smart Lock 6 为例,它的EF... 阅读全帖
k**0
发帖数: 19737
5
来自主题: TVGame版 - 游戏机和云计算
别人要所有计算都在"云"上, 当然只能那样算了.
现实存在的"云计算"服务如Microsoft Azure, 或理念上较接近的服务端, 再普通不过
的如AMAZON.COM网站,大量计算都是在服务器上,客户只是用个web browser.
说穿了,Cloud computing还是受限于计算量,网络和最重要的 - 性价比.
l*3
发帖数: 2279
6
no, 我计算转动能的坐标仍然是静止的直角坐标系.
我这么说吧, 我是这么计算 "转动能" 的:
首先, 转动能的计算只需要考虑每个质点相对质心的速度.
对圆盘上每个质点来说, 其速度 (指在静止直角坐标系中相对于质心的速度) 可以分解
为两个方向, 一个是垂直于圆盘的方向, 另一个是在圆盘内的方向, 这是一个正交分解
.
垂直于圆盘的速度方向的值, 可以由支点 (即杆的末端) 相对重心的速度唯一决定, 这
一部分的速度对应的动能, 其实就相当于 <1. 质心不动, 2. "圆盘上每个质点在平行
于圆盘上方向的速度分量为0"> 时, 杆转动 (杆转动是指 支点在一个球面上移动 的这
种行为) 对应的转动能.
平行于圆盘的速度方向的值, 可以由圆盘上一个参考点P相对重心的速度来决定, 这一
部分的速度对应的动能, 相当于 <1. 质心不动, 2. 支点不动> 时, 圆盘以支点为轴线
转动, 对应的转动能.
这两部分动能的计算, 可以用转动惯量和角速度表达, 这样子我说起来就比较方便.
具体的你还是看下26楼, 那有附图.
t******n
发帖数: 2939
7
☆─────────────────────────────────────☆
remraf (习博士) 于 (Tue Sep 17 17:51:16 2013, 美东) 提到:
算了一下,假如读牙医,跟本科毕业工作的比,投资能回来吗。
一般本科毕业生,50000起薪;
码工,7万起;
石油化工,9万起。
22岁开始工作。
牙医,贷款4年付学费24万,利息6%。
2年住院医,工资5万一年
28岁开始工作,
工作起薪18万。
考虑税后收入,收入的投资收益(税后),贷款利息抵税,每年工资涨3%.
计算结果:
工作到35岁时,牙医收入总和(扣除贷款后)开始超过普通本科生;
到42岁时,开始超过码工;
到65岁退休时,才赶上石油化工。
到65岁退休时,
普通本科 14000k(即1千4百万)
码工 20000k (即2千万)
石油25000k (即2500 万)
牙医25000k (即2500 万)
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pipigou123 (Keep your feet on the ground.) 于 (Tue... 阅读全帖
h*h
发帖数: 27852
8
【 以下文字转载自 Piebridge 讨论区 】
发信人: orz (采姑娘的小蘑菇), 信区: Piebridge
标 题: 女友身价计算表&男友身价计算表zz
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 18 12:19:37 2010, 美东)
女友价格计算表【要有女人的男人来看】
底价都是1000元
身高超过168cm,每过1cm+100元
身高低于160cm,每低1cm-100元
有酒窝+100
留长发的+150元
会跳舞的+100元
会唱歌的+100元
人妖非主流浮夸打扮-200元
胸部A-B的-100元 C-D +200元
体重超过110斤的,每超过10斤-100元
体重不足100斤的,每差10斤-100元
近视的,超过300度,每100度-100元
双眼皮+100元 单眼皮+50
谈过恋爱的,被甩一次-100元,甩别人一次+100元
没有谈过恋爱的+100元
初吻对象是你 +300元
初吻对象不是你 -200元
初夜对象是你 +500元
初夜对象不是你 -400元
初恋对象是你 +300元
超过22岁的,每超1岁-100元
有病史的,每一项-100元
会游泳+1
d********u
发帖数: 5383
9
来自主题: Joke版 - 在说一遍云计算服务 (转载)
【 以下文字转载自 Apple 讨论区 】
发信人: sunfic (sunfic), 信区: Apple
标 题: 在说一遍云计算服务
发信站: BBS 未名空间站 (Sun May 23 16:08:24 2010, 美东)
这个看起来牛逼哄哄的东西现在有两个瓶颈
一个是服务器端的运算能力,的确云计算可以通过数量换速度,但并不是所有的应用都
能这么干,特别是想要直接到桌面显示的程度。
一个是普通用户的网络带宽,大家可以做个简单的计算,要达到1024×768分辨率 60Hz
16bit色深需要的网络带宽是多少?考虑到比较成熟的视频压缩技术又要多少?
上面这两个瓶颈都是可以解决的,但是需要时间。那些说2-3年云计算成熟的人我不知
道你们的自信来自哪里
现阶段能够看到的唯一云应用就是云存储。
H********g
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10
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: xiao86 (xiao86), 信区: Military
标 题: 【数学/计算问题求教】
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 19 14:36:54 2017, 美东)
下面这个问题,大家有好的方法简化拟合吗:
从一个细胞开始,里面5个拷贝质粒,其中一个是突变子。然后开始扩增,每一代,每
一个细胞分裂成两个,然后质粒复制一套(不考虑新突变)、之后随机分到两个子细胞
里,但是每个细胞总是保持5个拷贝的质粒。比如第一次分裂之后,有两个新细胞,8个
拷贝的没有突变的质粒,2个突变质粒。那么两个细胞可以是各取一个突变质粒,也可
以是一个细胞拿两个而另一个细胞全部都是没有突变的。
然后问题是,N代扩增以后,突变子在种群(N~10-30)里的分布:五个质粒拷贝里,有
0,1,2,3,4,5个突变拷贝的分布.
我能想到的就是拟合每一个细胞和每一次分裂;但是因为是分裂是以2为底数的指数过
程,计算量也是随N指数扩增,当N=30的时候,要计算5亿次才能得出下一代的结果,
computationally impossible。
... 阅读全帖
b***t
发帖数: 155
11
http://www.cyd.com.cn/zqb/19990715/GB/9560^Q813.htm
1999中国大学排行榜评价标准和计算方法
一、排行榜评价标准和权重
1、学术(权重:50%)
(1)院士和大学校长评分(学术声誉),权重:30%;
(2)被SCI、EI、ISTP(缩写释义参见文末注释)收录的论文数,权
重:20%。
2、新生质量(权重:30%)
以1998年各校录取的大学本科新生高考成绩为标准计算。
3、师资(权重:10%)
(1)有副教授以上职称教师占教师总数的比例,权重:5%;
(2)教师数/学生数之比,权重:5%。
4、科研经费(权重:10%)
以各大学年度科研经费总金额为标准计算。
我们给学术设定了最高的权重,因为它是排行榜中仅有的产出指标。
新生质量设定了第二高的权重,因为大学能吸引什么样的学生与该校提供
的教育能产生的价值有直接关系。还有20%的权重分配给了师资和科研经
费,这些投入指标更多是代表政府的意见,而不是社会的意见,但是考虑
到政府在经费和行政管理方面的重大作用,仍然设定了较高的权重。
二、计算原则
为了使上述各项得
q*****g
发帖数: 1568
12
发信人: hoover (欣儿), 信区: Campus
标 题: 1999中国大学排行榜评价标准和计算方法
发信站: 华南网木棉站 (Thu Jul 15 14:43:03 1999), 转信
1999中国大学排行榜评价标准和计算方法
中国青年报
  一、排行榜评价标准和权重
  1、学术(权重:50%)
  (1)院士和大学校长评分(学术声誉),权重:30%;
  (2)被SCI、EI、ISTP(缩写释义参见文末注释)收录的论文数,权
重:20%。
  2、新生质量(权重:30%)
  以1998年各校录取的大学本科新生高考成绩为标准计算。
  3、师资(权重:10%)
  (1)有副教授以上职称教师占教师总数的比例,权重:5%;
  (2)教师数/学生数之比,权重:5%。
  4、科研经费(权重:10%)
  以各大学年度科研经费总金额为标准计算。
  我们给学术设定了最高的权重,因为它是排行榜中仅有的产出指标。
新生质量设定了第二高的权重,因为大学能
n*o
发帖数: 442
13
http://www.hp.com.cn/newsroom/030711.htm
中国科学技术大学和中国惠普有限公司联手共建高性能计算实验室
日前,中国科学技术大学和中国惠普有限公司签署合作协议,决定联手共建国内高校中
迄今为止规模最大的高性能计算实验室,以推动科研和人才培养。本次双方签署的协议
是一个全面的合作方案。根据合作协议,中国惠普支持中国科学技术大学建立一个基于I
A-64架构的高性能计算机系统,该系统包括采用NUMA结构的两台Superdome超级服务器和
采用Beowulf技术的先进机群,所有处理器都采用惠普公司和Intel公司投巨资联合开发
、最近刚刚发布的安腾-Madison 64位芯片,主频为1.5GHz,三级缓存达到6M,每周期执
行6条指令。借助惠普Superdome服务器,整个系统建成以后峰值计算能力将达到每秒115
20亿次(1.15万亿次),一举成为国内高校中迄今为止规模最大的高性能计算系统之一。
根据目前公布的世界前500高性能计算机排名,该联合实验室的运算能力有望跻身世界
前100强之列。
中国科学技术大学是国内著名高校,在国际上享有很高的声誉和知名度
j******n
发帖数: 108
14
来自主题: Apple版 - 在说一遍云计算服务
你觉得在所有的 application 中,能并行的多,还是串行的多?
如果能并行的计算,特别是个人计算,真的那么普及的话
multi-core cpu 的前景显然更加明朗
所以我才说 cloud computing 目前的定位在于大规模数据分析的
这些分析多数都比较容易并行处理,比如 list intersection, aggregation
非要把字处理、视频解码移到 cloud 里,其实用的是存储,不是计算
这些计算在 cloud 里和个人电脑里没有什么区别
e********k
发帖数: 39
15
1.深度计算,并行计算,高性能计算
2.计算机图形学,科学可视化,几何建模
本人本科物理专业,不太喜欢现在的凝聚态~~研究生想读应用数学与计算科学,我对上面
这些方面不太了解,以上哪个好一些啊?
谢谢啦~
r********3
发帖数: 2998
16
来自主题: CS版 - 感觉云计算其实是伪科学
拜托,给你指明了从virtual machine角度去看待Cloud Computing的技术革新,你还在
这里说什么Http Server。那数据怎么办?数据库怎么用http server扩展?你是故意想
套大家跟你细讲吧?你要不去具体注册一个Amazon EC2用用看,第一次试用免费。
IEEE Cloud现在也已经办起来了,你随便抓几篇paper来看看别人研究什么问题,不就
明白了。举个例子,比如现在研究很热的Live Migration。不了解云计算的人,刚听到
的时候会吓一跳。传统IT架构下,Live Migration是不可能实现的,但是Cloud里面依
托Virtualization技术可以实现。把以前不可能的事情,现在变成可能,你觉得还是伪
科学?
另外,早就给你说了,云计算不是具体某个科学创新。如果只是科学创新,那没什么了
不起的。云计算更多是business上的创新,这个才真正是它可怕的原因。举个最直接的
例子,云计算对于很多大型企业来说,每年光是机房空调电费上,都可以带来30%左右
的开销节省。你觉得像Morgan Stanley,Walmart这些大企业,每年3... 阅读全帖
S******n
发帖数: 5022
17
来自主题: Hardware版 - 求个建议装机计算用
用GPU计算,应该选AMD的卡吧。
GTX 7系列或者6系列 都是游戏卡,计算能力不行的,特别是双精度计算都不行。
民用计算还是AMD的7990和7970强。

CPU
4
S******n
发帖数: 5022
18
算Monte Carlo还是AMD的卡好。
CUDA对AMD的唯一优势就是定义了一堆科学计算的函数。
只要不涉及复杂的包含函数的科学计算,一般都是AMD的显卡快。特别是像金融计算、
密码学计算。
m**********e
发帖数: 12525
19
来自主题: Hardware版 - 用于科学计算的单机该怎么配
唉,楼主是杀老鼠的,
它的计算机做的其实根本不是传统意义上的科学计算,
而是对离散数据的mining,所以正确性不能有闪失.
你看本贴许多跟帖的也是杀老鼠的,所以一再提及内存种类选择的重要性.
你说,我们这些在传统数值计算领域混了这么多年的,可曾听说过内存可靠性要求吗?
从来没有,因为正如你所说的,科学计算算法都要求内禀收敛,除非涉及临界点边缘
的计算,machine error都不需要考虑.
t**********g
发帖数: 3388
20
【 以下文字转载自 ScitechNews 讨论区 】
发信人: Cnews (chinanews), 信区: ScitechNews
标 题: [KJPT]阿里巴巴宣布成“阿里云” 专注云计算(图)
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Sep 10 21:03:53 2009, 美东)
编者按:阿里巴巴今天晚上在其成立十周年晚会上宣布,将会成立一家从事云计算业务的新公司“阿里云”。阿里巴巴集团公关部向新浪科技表示,目前没有更多关于这家公司的信息可以提供......
此前泄漏的阿里巴巴云计算网站首页截图
北京时间2009年9月10日晚间消息,根据网友此前爆料,阿里巴巴已注册了alibabalabs.com的域名,同时,访问该域名时显示阿里巴巴云计算的字样。而目前,该域名已经无法访问。
去年12月30日,阿里巴巴集团旗下子公司阿里软件宣布,将筹建多个“电子商务云计算中心”,首个云计算中心将在2009年初落户江苏南京,首期投资额将达上亿元人民币,并将在未来几年内追加投资。
阿里巴巴集团现有6家公司,分别为阿里巴巴网络、淘宝网、阿里软件、支付宝、中国雅虎。(信息来源:新浪网)
s*******e
发帖数: 664
21
☆─────────────────────────────────────☆
stallone (stallone) 于 (Fri Dec 18 22:24:21 2009, 美东) 提到:
最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
下面具体说下我的疑惑吧。
我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
而统计计算主要涉及向量,矩阵,三维数组等的运算,当然还有其他的优化问题。
我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来快。
所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
用C做统计计算,要注意些什么。
如能推荐相关资料那是再好不过的了。
在此先谢过!
☆─────────────────────────────────────☆
pptwo (pp) 于 (Fri Dec 18 22:45:04 2009, 美
N******K
发帖数: 10202
22
没看懂你说的啥 你计算的部分有没有可以解耦和的?
先从计算角度分析 再考虑编程
比如 水文的模拟,计算流域面积 是否可以分区计算 ?

node
G****r
发帖数: 5579
23
这个低端的云计算,就象 PC, 会做的太多了, 永远是白菜价。
所不同的是, 早期的 PC 在 IBM HP 主导的时代还是很能赚钱的, 门槛也不低, 后
来(因为技术的发展)变得门槛越来越低, 大家都会, 就变得大家都没钱赚。 IBM
干脆就把 PC 部卖了。 也正是低端的云计算类似 后期的 PC, IBM 前些年就没重视
低端的云计算。
因为有 AMAZON, Saleforce.com NetSuite 这些浪货一开始就在搞,低端的云计算
过去, 现在和将来都没钱好赚。
s****y
发帖数: 503
24
现在的云计算、大数据技术,比如hadoop,好像涉及数据仓库的知识。比如hive和BI、
ETL有联系。
云计算技术还会向数据挖掘和机器学习方向发展吗?data mining有很多算法和技术,
今后有没有可能被云计算运用?
现在云计算技术的发展方向是什么?
n******7
发帖数: 12463
25
来自主题: Programming版 - 并行可以降低计算复杂度??
最近看一篇文章,GPU计算的
用的deep learning
其中提到NN的计算复杂度是O(MN+LN^2)
M是输入的unit,N是所有layer的hidden unit,L是layer数
然后用GPU并行之后,就是M,N的linear时间复杂度了?
说原因是,计算两个N dimension vector的内积,用CPU是O(N)的,用GPU是O(1)
这是鬼扯吧?
我怀疑实际原因是,他们的GPU平台有近3K个core,计算中M在2000左右,N在几千数量级
所以他们是用core的数量K 抵消的一个N的复杂度
大家看是不是这样?
f*******a
发帖数: 663
26
来自主题: Programming版 - 【请教】该选择哪个云计算平台?
单机的科学计算做多了,不知不觉已经落伍。最近遇到这样的系统需求,希望采用云平
台来实现。看着一堆的新术语和AWS, hadoop, BOINC, ROCKS等平台介绍,实在没有什
么概念。经常看见这里高手出没,所以前来请教,恳请各位指教,非常感谢!
=====================================================================
大体上而言,这是一个包含两种节点的数据采集分析应用的框架。
第一类节点是大量数据采集节点,负责数据采集、预处理及发送。
第二类节点是运算分析节点,统合所采集的数据,进行综合处理分析,以用于后端应用
及服务。可能包括超级运算节点,统合大量的分析数据。同时负责局部区域的数据存储。
1. 可连接性需求
a) 局域网情况。有些实验场景条件所限只能布设单纯的局域网。
b) Internet情况。节点可能在局域网内,无独立IP。
2. 数据传输需求
半实时自动同步至云平台(例如比实时延迟5~10分钟),而后运算节点即可分析相应
数据。目前的传输需求大概是 5~10MB/min(对每个数据采集节点),但有可能会有... 阅读全帖
h**********c
发帖数: 4120
27
来自主题: Programming版 - 数值计算
感觉您是我聊过最大牛的ID,
我这点东西也七八年不碰了就是晒晒吧,PDE我没做过,老板有一个硕士我见过这人老
中,给他做过PDE网格,三角化,我理解是通过网格的精细化来保证收敛。老板说过一
个人在做navier stoke,可能打错了。我这么专的人,当然很感兴趣。不过老板给过我
一个小模型,让我解解看,数值解,ODE,我两个晚上没弄出来,可能觉得我不行,我
是纯CS,偏重计算机图形,本加硕都是加拿大的。老板那个硕士据说是南大数学系的或
着计算机双修的,奥数金牌等等,没考证过,门清者自门清,不需要我多嘴,水平可定
是有的,可能也在MMT混,有两三面之源,没有深交。
说到我做过什么基本都在我个人主页我以前公开过,从来也不是什么秘密,我还在雀斑
出没,所以你如果www.heteroclinic.net有什么有兴趣的东西,我寻找VC。
单说科学计算,我干过什么吧,解ODE,我做过两个模型,一个是CR3BP,通俗说是地球
月亮卫星三体,光这个模型的MATLAB code画图就的上千行MATLAB,python 加上C++/
OPENGL的code 就几万,行数不重要,重要的是理解什么东西干了什么... 阅读全帖
h**********c
发帖数: 4120
28
来自主题: Programming版 - 数值计算
感觉您是我聊过最大牛的ID,
我这点东西也七八年不碰了就是晒晒吧,PDE我没做过,老板有一个硕士我见过这人老
中,给他做过PDE网格,三角化,我理解是通过网格的精细化来保证收敛。老板说过一
个人在做navier stoke,可能打错了。我这么专的人,当然很感兴趣。不过老板给过我
一个小模型,让我解解看,数值解,ODE,我两个晚上没弄出来,可能觉得我不行,我
是纯CS,偏重计算机图形,本加硕都是加拿大的。老板那个硕士据说是南大数学系的或
着计算机双修的,奥数金牌等等,没考证过,门清者自门清,不需要我多嘴,水平可定
是有的,可能也在MMT混,有两三面之源,没有深交。
说到我做过什么基本都在我个人主页我以前公开过,从来也不是什么秘密,我还在雀斑
出没,所以你如果www.heteroclinic.net有什么有兴趣的东西,我寻找VC。
单说科学计算,我干过什么吧,解ODE,我做过两个模型,一个是CR3BP,通俗说是地球
月亮卫星三体,光这个模型的MATLAB code画图就的上千行MATLAB,python 加上C++/
OPENGL的code 就几万,行数不重要,重要的是理解什么东西干了什么... 阅读全帖
t********n
发帖数: 71
29
研究方向:
以分子动力学为主要手段的蛋白质构象动力学研究
蛋白质机构预测及设计
计算资源:吉大新建的计算中心是国内高校最快的(每秒40万亿次浮点数计算),我们
学院正在建设一个计算平台,具体由我负责。
待遇:房补18W(一次付清),安家费4W(一般分期付以避税)。启动经费25W。其余按
学校副教授标准。
22(18+4)W的购房和安家补贴加25W的启动经费当然不算什么,但相比其他内地985高
校也差不多。在长春的房价水平也可以首付100平米的住房了,即使没有多少积蓄,两
个人的公积金也可以应付月供了。至于说待遇落实到不是问题,我回去承诺的是100平
米的实验室空间,实际上拿了140平米。购房安家补贴均是一次到位。我没有任何关系
。大家可以翻翻以前我在海龟版的帖子,就应该了解我发文都是实实在在。我自己就是
一个千老LOSER,请各位牛人手(口)下留情。
实事求是讲,任何一个目前能够在美国找到一份永久性工作的都看不起这样的待遇。我
们想找的是的确有回国意向,并需要一个稳定和有一定前景工作的候选者。我们学院目
前编制不紧张,副教授只要有不错的文章和一两个基金就可以上教授了。招聘到的人到
校后... 阅读全帖
l*******i
发帖数: 153
30
来自主题: Biology版 - 急:qPCR结果计算方式
qPCR测了一批基因在不同时间点的表达(1-6天),现在作图时碰到一个问题:
因为所有时间点、所测基因的表达都要与未处理组(即day 0)比较,所以我在计算时,
把每个基因在未处理组中的表达设为 1, 这样计算不同时间点基因变化的倍数。其中
有两个基因在未处理组不表达(program给出的CT值为undetermined,即未
amplification),这样计算时就无法得到dela CT,也就没法作图。
我的想法是把没有扩增的基因的CT值设为最大CT值,即40,然后计算delta CT,以方便
作图。但是,实验室博后认为这样不对,是artificial effect;正确的做法,应该用
positive control,然后未处理组和各个时间点的都与positive control比较。我觉得
这样很混乱,因为是一批基因,按博后的意见的话,我得每一个基因对应一个positive
control,做出的图不太好理解。
不知各位有无碰到这种情况?你们都是怎么处理的呢?最好能提供一两篇有关类似问题
的文献。谢谢!
s******s
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31
来自主题: Biology版 - 这里有免费的云计算存储资源
【 以下文字转载自 DataSciences 讨论区 】
发信人: shakuras (doskey), 信区: DataSciences
标 题: 这里有免费的云计算存储资源
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 3 15:25:10 2014, 美东)
这里有免费的云计算存储资源
有一个Petabyte-scale的云计算资源,可以用来储存数据以及进行科学计算,
有点类似AWS,现在有许多NIH以及NASA等也在使用。这个资源现在对非营利
科研用途是免费的, 上面还有一些pipeline,比如基因组分析一类的。不管
是有大的project或者自己用来玩玩都可以,3/12号有一个demo的seminar
教如何注册和使用。有兴趣的可以快去报名注册。
注册的时候“how did you hear about this OSDC demo", 你填mitbbs
就行, 不要填我的名字shakuras. 我没啥好处可以捞,这个信息完全是内部统
计用。
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Z******5
发帖数: 435
32
因为要比较不同测序平台、不同课题组来源的数据,需要对各个样品进行z-score转换
,才能进行比较。
目前计算p value,q value都没问题;但是还需要计算基因的foldchange来进一步过滤
掉差异不显著的基因。但是原数据肯定是不能进行直接的计算,那么z-score标准化后
,如何计算foldchange呢?
p******a
发帖数: 582
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我知道问题在哪了,我一直都是在考虑的CASSCF的计算情形,也以为你是在讨论CASSCF
与普通CISD的区别,而你实际上是在解释普通CISD和MRCI的区别。其实你解释的MRCI的
configuration获取的方式我是知道的。我只是一直困惑于同样都是生成额外的excited
determinants并优化其组合(当然cas还变换determinant),为啥一般的CI方法就被称
为single reference而casscf却被称作mulit reference?是不是由于普通的CISD都是
局限于从基态HF detereminant进行single和double exciation来获取新的
detereminant而casscf在活性空间内进行的是full CI的计算,这样就相当于考虑了各
种可能的detereminant从而被称为multi reference.这样的话如果我不去刻意选取任何
的活性空间,对一个hf detereminant进行full CI的计算(仅优化detereminant前的系
数),这样的一个普通full CI计算是否也可称为multi refe
i*****q
发帖数: 186
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basf好像有计算化学专门的研究组
有些计算化学方面的软件也很需要人的 如果编程方面比较强的话
uc-irvine有个教授就做计算化学方面的 后来创办相应的计算软件公司吧
b****n
发帖数: 379
35
来自主题: Chemistry版 - 计算化学求助
版上的计算化学大牛们请指点指点小弟!
我用Gaussian 03计算了分子的electron distribution,也generate了cube file。现
在想要知道两个LUMO orbital之间的electronic coupling有多大。reviewer 要求计算
matrix element的具体数值以用来比较。从来没接触过那么深的计算化学,不知道怎么
算。求指点!拜谢先!!
p******1
发帖数: 1388
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我靠!! 作鸡真的很不容易!
联想到以前, 老板的FUNDING年度报告到期了, 但实验数据拿不出手....于是联合一个
新来的老中, 做计算的, 要求从受体结合实验的数据里找到规律. 但同一结构类型的化
合物, 药理结果完全分散状态, 根本集中不了. 于是老中的老婆, 号称日本PHD来着,也
做计算的, 就挑选其中有用的数据, 也就是跟理论计算相对吻合的结果写报告. 中间几
次修改数学模型, 才得到个大概的说得过去的结果. 用另一个做计算的学生的话来说,
虽然都是垃圾化合物, 但如果能用理论解释结果, 也算是没有白费工夫.
再后来, 要求从已有的数据来预测新设计化合物的药理实验结果, 本来是本系的一个组
做受体结合实验, 但出于大家都可以理解的原因,老板在外面重新找了个人来做实验,
结果出奇的好, 虽然都不是什么很好的先导化合物, 但结果和理论预测非常吻合. 老板
靠这个申请到了X00万,轰动一时, 校报, 本地报纸都报道了,大幅标语也挂到了系楼的
正前面, 好似中国文革的那架势. 还有电视台来录像,我被恶心到了...... 另一个老中
千老很配合, 也因此得到了殊荣:从普通博士后升... 阅读全帖
m****n
发帖数: 51
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来自主题: Computation版 - 如何高速计算这个积分
对于本积分,这样处理有两个问题
1。Gamma函数值很大,这样计算累计误差很大。
2。收敛慢,是由于三角函数的Taylor展开对大综量慢收敛。对于本积分,由于a很小,导
致积分区间很大,所以,级数展开效率不开。如果a远大于1,有效积分区间[-1,1],三
角展开收敛较快,但是实际计算时,仍然要使用计算正负交错级数的Euler公式。
这个积分可以转化到[0,Pi]区间计算,工作量大一些,但是我现在不考虑它了,反正累得
是计算机。
h***s
发帖数: 2499
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来自主题: Computation版 - 求助,关于monte carlo计算 (转载)
【 以下文字转载自 Science 讨论区 】
发信人: hjxds (Kiss My Shiny Metal Ass), 信区: Science
标 题: 求助,关于monte carlo计算
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 14 21:29:10 2007), 站内
发信人: hjxds (Kiss My Shiny Metal Ass), 信区: Physics
标 题: 求助,关于monte carlo计算
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 14 21:28:34 2007), 转信
用monte carlo可以比较简单快捷的计算phase transition等问题,例如ising model。
具我的理解,这样的计算都是thermal equilibrium的保守系里的phase transition。
那monte carlo能否处理一个非保守系的问题,例如还是2d ising model,但是有外部能
量的输入,并且不能表达成势能形势,也就是说有(反)摩擦力施加在系统上,这样的
话monte carlo是不是彻底没戏,还是能通过什么途径
e********k
发帖数: 39
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我现在面临的选择有这些,
材料科学与工程专业:主要是聚合物,薄膜,纳米,可是我自认为不喜欢化学,只是自
认为啊,大学基础化学考了65分。。。。也可能那是学的不认真吧,我也许并不了解化学
应用数学和计算科学:主要是科学计算,数值模拟,计算机图形学,课程我看和计算机
科学的80%相同,但不了解这个学科,不知道难不难,虽然当初c语言和matlab很喜欢,
也考的很高分数,转专业还是慎重些好吧,希望听听大家的意见
学计算数学会不会很难出成果阿?很担心自己去了跟不上,听说凝聚态比较容易出成果
另外,如果将来想搞计算材料学的话,那硕士读计算科学好呢还是读材料好?我本身对这
两个学科都没有接触,本科现在是物理,将来不想进公司什么的,想去美国大学里面当个
教授.大家给点建议吧...谢谢啦
l*********a
发帖数: 52
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来自主题: Computation版 - 诚心请教关于计算材料学的前景!
我弟弟拿到瑞典皇家工学院的攻读博士的offer,专业是计算材料学,具体研究储
氢材料的。
请教各位,目前在企业里,计算材料学应用得怎么样?职位多不多?计算材料学是
纯理论研究吗?和实际工程应用联系紧不紧密?未来主要从事于什么职业?另外,他国
内硕士阶段专业是物理冶金physical metallurgy(钢铁),如果计算材料学博士读完
后,还可以把方向转成物理冶金或材料加工等应用比较广泛的方向来吗?
期待并忠诚感谢您的回复!有包子!
y*******n
发帖数: 22
41
第九章
社会义的计算(三)
竞争的“解决办法”

在关于社会主义经济学的讨论中,前面两个章节的内容现在看来十分相近。前一章讨论
这样的信念:社会主义制度将完全摒弃通过价值形式进行计算的方法,取而代之的将是
本质上建立在能量单位或某些物理量基础上的某种计算方法。虽然这种观点还没有消声
匿迹,并且为一些自然科学家和工程们所坚持,但它已被经济学家们明确地抛弃了。与
此相似的第二章论述了这样一个建议,即价值应该由运用数理经济学方法的计划权威通
过计算程序来发现,而不应该通过市场竞争来确定。关于这种观点,帕累托(非常离奇
的是,人们竟常常认为他是坚持这类观点的人)已经说过一些也许是结论的话,他在说
明怎样通过联立方程组决定市场价格的因素后,又补充道:
“这里也许要说明的是,这种决定方式绝对没有要达到价格的数量运算的目的。让我们
对这种运算
s******s
发帖数: 13035
42
来自主题: Economics版 - 这里有免费的云计算存储资源
【 以下文字转载自 DataSciences 讨论区 】
发信人: shakuras (doskey), 信区: DataSciences
标 题: 这里有免费的云计算存储资源
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 3 15:25:10 2014, 美东)
这里有免费的云计算存储资源
有一个Petabyte-scale的云计算资源,可以用来储存数据以及进行科学计算,
有点类似AWS,现在有许多NIH以及NASA等也在使用。这个资源现在对非营利
科研用途是免费的, 上面还有一些pipeline,比如基因组分析一类的。不管
是有大的project或者自己用来玩玩都可以,3/12号有一个demo的seminar
教如何注册和使用。有兴趣的可以快去报名注册。
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x*z
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43
来自主题: EE版 - Matlab计算精度请教
【 以下文字转载自 Computation 讨论区 】
发信人: xxz (星星), 信区: Computation
标 题: Matlab计算精度请教
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 12 00:52:49 2009), 转信
我正在用matlab的lmisolver解线性矩阵不等式,碰到一个问题如下:
我需要求解A(X1,X2)<0, where X1 and X2 are unknown matrices,
所以我用lmisolver已经得到一个数值解X1_0和X2_0,为了验证结果,
我计算矩阵A(X1_0,X2_0)的eigenvalues,发现一些在-3E-6附近,
现在我老板的担心是,这些特征值这么小,可能是由于Matlab的计算误差使得
所有特征值都满足小于0的要求。所以希望我得到一些别的数值解使得A矩阵的
特征值离y轴更远点。
我想请教大家,我老板的担心是多余的吗?难道Matlab连1E-6这种计算精度都达不到?
谢谢。
c*u
发帖数: 916
44
Fiber当然是不能换的,要不然这个问题就过分简单了:-) 我必须用SMF-28光纤,因为我
在公司,有很多别的人需要把那个光纤弄成smf-28。
多少个mode可以很容易计算,到底有哪些mode可以列举出来,甚至这些mode的分布也可
以计算出来。我所不明白的是,
1。对于这些mode经过透镜后,怎么计算,怎么用ABCD matrix或者其他办法。这样我至
少可以计算worst case scenario,
2。正如同你所说,比如有5个mode,这5个mode不见得光强度一样,这种mode间的
leakage和最后分布与光纤长度和弯曲度显然有关。显然不定态是很难弄的,有什么办
法保证大致上只在一个mode,或者全部均匀分布?
xiexie,

not
simple
the
s********k
发帖数: 6180
45
假设我有两个时间序列x(i),y(i),i=1:n. 一般的correlation计算要等到全部n个采样
完成之后再计算。我现在想用一种online的方法来实时计算,从i=2开始就开始计算两
个序列的相关性,每次时间序列有一个新的采样correlation更新一次,当然由于采样
不完全,所以允许correlation的误差存在,但是希望大体走势应该是越来越趋近最后
的准确值,不知道有没有这样的实时算法存在。谢谢
g******s
发帖数: 733
46
基本上是按照一篇论文中类似装置的谐振频率的计算方法。实际上有4x10个fingers,图
中只画出4x6个fingers。算rotation stiffness的时候只算了一个finger,算mass
moment of inertia的时候只算了圆形微镜,忽略了fingers,因为fingers比圆形微镜小
很多。得到的谐振频率为46.7KHz。
而用商业软件算的结果是10KHz,实测的是8-10KHz。总之我的结果是实际的4倍。
估计mass moment of inertia的计算应该是对的,虽然忽略了fingers导致mass moment
of inertia 偏小。主要错误估计在rotation stiffness的计算。麻烦哪位告诉我,这
里应该怎么计算rotation stiffness?先谢了!
a***n
发帖数: 86
47
材料科学比较特殊,感觉你的认识很模糊,建议你最好了解下材料类研究具体的工作方
式和实验手段,看你自己喜欢不,或者能适应不。科学计算是什么样子的,很好想象,
你应该也了解。如果以后搞计算材料学,学计算好入门,但物理基础很关键。

化学
l*********a
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48
来自主题: Engineering版 - 诚心请教关于计算材料学的前景!
我弟弟拿到瑞典皇家工学院的攻读博士的offer,专业是计算材料学,具体研究储
氢材料的。
请教各位,目前在企业里,计算材料学应用得怎么样?职位多不多?计算材料学是
纯理论研究吗?和实际工程应用联系紧不紧密?未来主要从事于什么职业?另外,他国
内硕士阶段专业是物理冶金physical metallurgy(钢铁),如果计算材料学博士读完
后,还可以把方向转成物理冶金或材料加工等应用比较广泛的方向来吗?
期待并忠诚感谢您的回复!有包子!
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