n**********1 发帖数: 251 | 1 最近在做microRNA相关的一些东西,目前已经检测了有一些基因的表达变化和一些
microRNA有相关性,下面的问题就是如果证明这个microRNA是结合在这个基因的mRNA上
面,直接抑制这个基因的表达,也就是如何证明两者的直接作用的关系,多谢。 |
l******u 发帖数: 936 | 2 google: luciferase assay, microrna
【在 n**********1 的大作中提到】 : 最近在做microRNA相关的一些东西,目前已经检测了有一些基因的表达变化和一些 : microRNA有相关性,下面的问题就是如果证明这个microRNA是结合在这个基因的mRNA上 : 面,直接抑制这个基因的表达,也就是如何证明两者的直接作用的关系,多谢。
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n**********1 发帖数: 251 | 3
多谢楼上的,luciferase真是万能的啊,呵呵。
还有其他的方法吗?
【在 l******u 的大作中提到】 : google: luciferase assay, microrna
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a***e 发帖数: 1010 | 4 not many people are examining the "direct" binding.
you can think about FRET, crystallography...... |
n**********1 发帖数: 251 | 5
反正就是公认的方法就可以了,楼上可以稍微详细点说说吗?
【在 a***e 的大作中提到】 : not many people are examining the "direct" binding. : you can think about FRET, crystallography......
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t*d 发帖数: 1290 | 6 还需要点突变miRNA的 binding site。
【在 l******u 的大作中提到】 : google: luciferase assay, microrna
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n**********1 发帖数: 251 | 7 很有道理,多谢。
【在 t*d 的大作中提到】 : 还需要点突变miRNA的 binding site。
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h********n 发帖数: 4079 | 8 you can check and buy luciferase product here
http://www.genecopoeia.com/product/search/index.php?prt=16
I used it (buy the plasmid with the gene's 3-UTR on that and make point mutation by myself) and it worked quite well. |
n**********1 发帖数: 251 | 9 thank you for your advice |
H*****e 发帖数: 120 | 10 I am interested in miRNA too recently but no previous experience. How do
you guys knockdown miRNA. There are a few methods in the literature. For
stable line, can regular shRNA work? Thanks! |
b******9 发帖数: 102 | 11 可以试试LNA,这东西现在应该有商业化的试剂盒吧。另外也可以参考下面2篇paper.
1.Barbara Robertson et al.Specificity and functionality of microRNA
inhibitors.
link: http://www.silencejournal.com/content/1/1/10/abstract
2.Genhua Zheng, Victor Ambros, Wen-hong Li. Inhibiting miRNA in
Caenorhabditis elegans using a potent and selective antisense reagent.
link:http://www.silencejournal.com/content/1/1/9/abstract
【在 H*****e 的大作中提到】 : I am interested in miRNA too recently but no previous experience. How do : you guys knockdown miRNA. There are a few methods in the literature. For : stable line, can regular shRNA work? Thanks!
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