z*******0
发帖数: 35 | 1 完全新手，现在想做一个meta analysis的文章，请问有什么好的学习资料或网站么？ |
g*****e
发帖数: 43 | 2 http://www.cochrane.org/
【在 z*******0 的大作中提到】
: 完全新手，现在想做一个meta analysis的文章，请问有什么好的学习资料或网站么？
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z*******0
发帖数: 35 | 3 是想做一个gene therapy 对某个疾病的治疗效果的文章，想查一下过去的
临床研究。目前还在读文献，昨天刚开始做，所以基本上什么都不懂，希望
高手能够给一个基本的方向，或者有什么好的文章或者例子，推荐一下。 |
t*d
发帖数: 1290 | 4 看看这个吧：
http://glass.ed.asu.edu/gene/papers/meta25.html
再区亚马逊或图书馆弄两本书看看。
没有什么太深的东西。就看你怎么把不同的数据集综合起来，确定显著性和作用效果。
好多现成方法都非常直观。
现在不少人用综合不同的 GWAS 数据集，做meta－analysis。好多人都凭直觉来做，也
说得过去。比如最简单的就是，gene在A集中显著，B集中也显著，那就更确信这个gene
的association。如果A集中显著，B集中不显著，那就再费点脑子，massage一下数据（
也就是 meta－analysis 一下）。当然这种massage的方法最好别人发表过的。各种
massage的方法多如牛毛，你再组合组合，很大的可能你可以找到一种方法，弄个显著
出来。不过这样能不能通过review，就看你运气了。
【在 z*******0 的大作中提到】
: 是想做一个gene therapy 对某个疾病的治疗效果的文章，想查一下过去的
: 临床研究。目前还在读文献，昨天刚开始做，所以基本上什么都不懂，希望
: 高手能够给一个基本的方向，或者有什么好的文章或者例子，推荐一下。
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t******s
发帖数: 55 | 5 如果A集中显著，B集中不显著，那就再费点脑子，massage一下数据（
晕，碰运气呢，听说生物系的人不是要学一门统计的么
Generally speaking, there are two ways to perform meta-analysis,by combining
effect sizes (parametric method) or combining significance levels (non-parametric
method). For each method, the statistic for meta-analysis was selected based
on the null. For example, if the null is that no genes are differentially
expressed in all studies vs all genes are DE genes, then the maximum p-value
statistic can be used to combine p-values.
Anyway, y |
t*d
发帖数: 1290 | 6 终于有块玉砸了过来。解释的蛮清楚的，多谢！有好的meta-analysis的书可以推荐么？
ps：很多学校的生物系没有把统计设成必修课。
combining
parametric
based
value
As
【在 t******s 的大作中提到】
: 如果A集中显著，B集中不显著，那就再费点脑子，massage一下数据（
: 晕，碰运气呢，听说生物系的人不是要学一门统计的么
: Generally speaking, there are two ways to perform meta-analysis,by combining
: effect sizes (parametric method) or combining significance levels (non-parametric
: method). For each method, the statistic for meta-analysis was selected based
: on the null. For example, if the null is that no genes are differentially
: expressed in all studies vs all genes are DE genes, then the maximum p-value
: statistic can be used to combine p-values.
: Anyway, y
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