h********n
发帖数: 4079 | 1 我有三个转基因老鼠: A(+/-), B(+/-), C(+/+) & C (+/-)
其中A(+/+)不能活, B只需要(+/-)
A和B老鼠都是B6, C是FVB
cross breeding 步骤:
1. A(+/-) X B(+/-) --> A(+/-)B(+/-) in B6
2. A(+/-)B(+/-) X C(+/+) --> A(+/-)B(+/-)C(+/-) in B6/FVB
3. A(+/-)B(+/-)C(+/-) X C(+/-) -->
(1) A(+/-)B(+/-)C(+/+)
(2) A(+/-)B(+/-)C(+/-)
(3) A(+/-)B(+/-)C(-/-)
最终要比较(1)(2)(3)的phenotype, 但是由于A&B是B6, C是FVB, 最终三组会出现背景
不一样的情况, 比较结果可能不可靠. 有人告诉我只要数量够多应该可以.
不知道我说清楚了没有,
各位有什么建议吗?
谢谢. |
h********n
发帖数: 4079 | |
D*a
发帖数: 6830 | 3 a++为什么不能活？knockin么？是的话不能用－/－，应该是＋/0
c++也是一样的问题
background你要是没有办法弄成一样的就照直写就行了，也可以说这样有variation所
以跟自然生物界的更接近blablabla，
如果你phenotype强的话肯定没问题。另外也看你怎么定义多用几只老鼠了，我们一样
的background用的老鼠都是10只以上，8只就是没办法了，四五只就是实在没办法了 |
h********n
发帖数: 4079 | 4 A是transgene, homozygous的A++老鼠发育有问题. 我写成A+/-, 不知道合适不合适.
最终的mating 是 FVB/B6 X B6, 好像后代的background不太一样. 我打算每组用20只
老鼠. 当然phenotype强才好.
有没有啥办法知道FVB/B6 X B6后代的背景情况, 比如测一些gene?
谢谢.
所以跟自然生物界的更接近blablabla，
样的background用的老鼠都是10只以上，8只就是没办法了，四五只就是实在没办法了
【在 D*a 的大作中提到】
: a++为什么不能活？knockin么？是的话不能用－/－，应该是＋/0
: c++也是一样的问题
: background你要是没有办法弄成一样的就照直写就行了，也可以说这样有variation所
: 以跟自然生物界的更接近blablabla，
: 如果你phenotype强的话肯定没问题。另外也看你怎么定义多用几只老鼠了，我们一样
: 的background用的老鼠都是10只以上，8只就是没办法了，四五只就是实在没办法了
|
w****a
发帖数: 84 | 5 用你的CROSS方法得到的三组背景都是B6/FVB。但是严格地说，由于发生重组，背景基
因型并不完全相同。增加每组的数量的好处是提高POWER，另外由于每个个体的重组型
不同，增加每组的数量提高了组内背景基因型的差异性， 如果在此基础上仍能发现组
间差异， 这种差异性更可能来源于转基因的影响。
(1) A(+/-)B(+/-)C(+/+) |
D*a
发帖数: 6830 | 6 你这种情况是+/0， +/-是非常错误的写法。
没必要测背景情况，你测一堆snp又能说明什么？你又不是要写哪个snp跟哪个
phenotype有关系。20只不少了，没有phenotype就是没有phenotype了，不会是背景的
问题。就算是背景的问题你也不能把一顿有tendency的数据都归结到背景上，基本上就
可以换project了。否则只要significant，就算reviewer非要说背景问题，你也可以回
答得了。
我知道很多做转基因的想要换背景，也是backcross两到三代就开始实验的，之后重复
重复看看吧，没有人等到20代才正式开始做实验的。
【在 h********n 的大作中提到】
: A是transgene, homozygous的A++老鼠发育有问题. 我写成A+/-, 不知道合适不合适.
: 最终的mating 是 FVB/B6 X B6, 好像后代的background不太一样. 我打算每组用20只
: 老鼠. 当然phenotype强才好.
: 有没有啥办法知道FVB/B6 X B6后代的背景情况, 比如测一些gene?
: 谢谢.
:
: 所以跟自然生物界的更接近blablabla，
: 样的background用的老鼠都是10只以上，8只就是没办法了，四五只就是实在没办法了
|
h********n
发帖数: 4079 | |
O******e
发帖数: 4845 | 8 Try to use "Tg" to denote transgenes.
【在 D*a 的大作中提到】
: 你这种情况是+/0， +/-是非常错误的写法。
: 没必要测背景情况，你测一堆snp又能说明什么？你又不是要写哪个snp跟哪个
: phenotype有关系。20只不少了，没有phenotype就是没有phenotype了，不会是背景的
: 问题。就算是背景的问题你也不能把一顿有tendency的数据都归结到背景上，基本上就
: 可以换project了。否则只要significant，就算reviewer非要说背景问题，你也可以回
: 答得了。
: 我知道很多做转基因的想要换背景，也是backcross两到三代就开始实验的，之后重复
: 重复看看吧，没有人等到20代才正式开始做实验的。
|
h********n
发帖数: 4079 | 9 I see
thanks.
【在 O******e 的大作中提到】
: Try to use "Tg" to denote transgenes.
|
D*a
发帖数: 6830 | 10 多谢前辈提醒
knockin是基因置换吧，Tg是随机插入，对不？我上面混了
lz这种情况应该是Tg，不是knockin
【在 O******e 的大作中提到】
: Try to use "Tg" to denote transgenes.
|
O******e
发帖数: 4845 | 11 Right.
【在 D*a 的大作中提到】
: 多谢前辈提醒
: knockin是基因置换吧，Tg是随机插入，对不？我上面混了
: lz这种情况应该是Tg，不是knockin
|
