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Biology版 - ERK In vitro kinase失败的原因?
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j***i
发帖数: 39
1
做一个EKR1/2底物磷酸化的实验,用ERK1/2抑制剂发现磷酸化被block掉.
但是32-ATP体外磷酸化做了两次,都没信号。
磷酸化实验没问题,因为positive control可以被phos-ERK2磷酸化。
有没有可能ERK不是上游直接Kinase?
不知道那位有好的idea?
h**********y
发帖数: 18
2
我做过一个实验,不是MAPK,用的是MAP2K,
发现在in vitro kinase的条件下,MAP2K自己就可以autophosphorylation,我猜想
MAPK应该也会是类似的情况,毕竟体外的实验总是有一些artifact。另外,看早期的
MAPK的paper,他们的in vitro kinase assay是不需要加入MAP2K的。当然加入MAP2K之
后,对MAPK底物的磷酸化会强很多。
另外,你在你的kinase里面有没有加入DTT?我们发现某些kinase因为某些特定位置的
aa,对DTT是敏感的。而ERK在相应的位置恰好存在一个这样的aa

【在 j***i 的大作中提到】
: 做一个EKR1/2底物磷酸化的实验,用ERK1/2抑制剂发现磷酸化被block掉.
: 但是32-ATP体外磷酸化做了两次,都没信号。
: 磷酸化实验没问题,因为positive control可以被phos-ERK2磷酸化。
: 有没有可能ERK不是上游直接Kinase?
: 不知道那位有好的idea?

j***i
发帖数: 39
3
谢谢hanchenjammy的分享。
1)我用了1mM DTT在Kinase Buffer。这次我去掉DTT试试;
2)“当然加入MAP2K之后,对MAPK底物的磷酸化会强很多” EK293T中才纯化的ERK2,收
细胞前,用EGF刺激细胞,让EKR磷酸化,所以可以替代加MAP2K;
3)我发现分子量很小的一个位置(20Kd?),有信号,而对照点突变没有,可能是降解
产物。所以在想:是不是全长不容易被磷酸化?降解的反而暴露出位点?
有没有新的结果,给告详解。
j***i
发帖数: 39
4
update my result.
其他的条件都没变,就重新纯化地物蛋白,把GST切除点,可以被磷酸化了。
可能GST对蛋白的结构有一定的影响。
再次感谢hanchenjammy 。
s*********s
发帖数: 110
5
good~

【在 j***i 的大作中提到】
: update my result.
: 其他的条件都没变,就重新纯化地物蛋白,把GST切除点,可以被磷酸化了。
: 可能GST对蛋白的结构有一定的影响。
: 再次感谢hanchenjammy 。

h**********y
发帖数: 18
6
cong~~

【在 j***i 的大作中提到】
: update my result.
: 其他的条件都没变,就重新纯化地物蛋白,把GST切除点,可以被磷酸化了。
: 可能GST对蛋白的结构有一定的影响。
: 再次感谢hanchenjammy 。

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