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Biology版 - 请问大家对Biomedical informatics 了解吗?今后就业前景如何?
相关主题
zt 去年 Gerstein 在 GB 发的牢骚文章大家有没有看看Bioinformatics and Genomics intern
转专业方向BME生物医学工程这个专业怎么样?
请问下 bioinformatics 好找工作么求bioinfo/genomics工作推荐
迷茫啊,各位给点建议吧请问Genome Biology的投稿有啥要注意的
帮人贴个上海bioinfo招聘 (转载)MS/PhD in Life Sciences (bioinformatics) UNLV Spring 2015
诚心请教:学习bioinformatics如何入手?一个35B的药厂在招Sr Director of Bioinformatics
关于Bioinformatics 职位资深千老想学个Online Master of health informatics
大家有兴趣申请一个生物信息学板么?bioinfo在industry的机会?
相关话题的讨论汇总
话题: biomedical话题: 计算机话题: 方向
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1 (共1页)
d******t
发帖数: 65
1
大家好,我有个问题想请教大家。
我的背景是:国内本科在一所名校就读,学的是生物工程和工商管理双学士,有较强的
数学功底和工科背景。然后在国内念了硕士,方向是分子进化,老板在国内是大牛。来
美后在一所普通大学的医学院念生物医学,方向是神经科学,做大脑疾病方面的研究。
读了两年,感觉不太喜欢做实验,而且生物很琐碎,今后就业前景黯淡,看了一些网上
的讨论,感觉对学生物的抱怨特别多。
因为不是非常喜欢生物,想转行,但想结合以前的背景,拿个硕士毕业。网上调查了一
番,感觉自己生物医学信息学比较适合我的背景,能够把以前的知识综合利用起来。而
且这个专业属于交叉学科,历史较短,全美只有二十来所大学能够提供这个专业,毕业
人数不是很多。但是这个专业应用挺广,能够在工业界,医学或者学术界发展。个人想
法是申请biomedical informatics的博士,无论今后在美国或者回国发展都行。
不知道这个专业在美国的就业行情如何。根据网上搜索,查到这个专业出来的工资在7
万-14万之间。不知是否属实。
个人调查了一下,国内开有这个专业的大学不多,而且非常不成熟,海归后竞争压力应
该比较小。北大医学院今年才开设了生物医学信息学中心。我想学成后归国,应该能够
找个好点的位置,在这个领域占一席之地或者成为领军人物。
因为了解的信息有限,或许想法有点幼稚,请各位大牛指教,指条明路。
在此谢过!
s******a
发帖数: 252
2
I'm not very close to medical informatics, so just two cents from 300 feet
away.
It's been a good job market for medical informatics and the pay is good. It'
s basically conventional IT with applications to medicine. I don't see much
potential in its academic research, which very much follows regular IT.
Not sure about your personal expectation. I tend to think personality is
more important than background.
v**********h
发帖数: 230
3
就业不清楚,我们系的FACULTY95%以上都是服务于MD的。基本上不用FUNDING可以靠医
院的钱养活自己和实验室,大部分都是这种运作模式.我知道有些学校开始扩招,比如
UCSD。
国内的现状比较惨淡,正如你所说,可能也就是刚刚设立开课在大学里;在医院机构,
很多是联合医院一起在做。国家一直有些项目在支持这个领域。从信息系统的角度讲国
内医院软硬件都基本建立起来了,如以计算机和数据库为核心的各种临床信息系统。但
更核心的涉及到数据挖掘利用,决策支持等,我看目前还都在摸索中,成果相对较少。
在这边上了一些课之后发现这边的医院的信息支持可真够强大,不同部门之间的信息交
流、病人档案的管理,一切都比较人性化。国内可能真的又很长的路要走。回去可能有
比较大的发展空间。
d******t
发帖数: 65
4
非常谢谢你的解答和进一步确认。
最近了解了一下,就业市场确实比较好!个人对这个非常感兴趣。本人个性比较好,非
常容易和人相处,打成一片。就个人而言,无论在学术界或者工业局或者医院发展都可
以。
最自己想做的,有个幸福美满的家庭和几个天真可爱的孩子,比什么都重要!个人今后
的前途和命运要看机遇了,现在做好准备就是。
非常谢谢!

It'
much

【在 s******a 的大作中提到】
: I'm not very close to medical informatics, so just two cents from 300 feet
: away.
: It's been a good job market for medical informatics and the pay is good. It'
: s basically conventional IT with applications to medicine. I don't see much
: potential in its academic research, which very much follows regular IT.
: Not sure about your personal expectation. I tend to think personality is
: more important than background.

d******t
发帖数: 65
5
非常谢谢你耐心的回复以及提供的那么多有用信息。
这位前辈对这个领域的了解比较全面吧!其实,我正在考虑申请你们学校的申请,不知
道申请行情怎样?是不是竞争非常激烈?请前辈指点一下。我也正在考虑一些其它学校
的申请,比如你提到的UCSD, 以及UCSF, University of Pittsburgh,University of
Washington in Seattle, University of Wisconsin Madison, University of
Nebraska Omaha (bioinformatics), University of Michigan Ann Arbor (
Bioinformatics), Georgia Institute of Technology (bioinformatics),
Washington University in St.Louis (computational and System biology) .
不知道这些学校的申请难度如何,哪些教授正在招兵买马?知道内部消息的前辈请多多
指教!
个人不介意今后留在美国还是回国发展,哪里适合发展就去哪里。
谢谢!!

【在 v**********h 的大作中提到】
: 就业不清楚,我们系的FACULTY95%以上都是服务于MD的。基本上不用FUNDING可以靠医
: 院的钱养活自己和实验室,大部分都是这种运作模式.我知道有些学校开始扩招,比如
: UCSD。
: 国内的现状比较惨淡,正如你所说,可能也就是刚刚设立开课在大学里;在医院机构,
: 很多是联合医院一起在做。国家一直有些项目在支持这个领域。从信息系统的角度讲国
: 内医院软硬件都基本建立起来了,如以计算机和数据库为核心的各种临床信息系统。但
: 更核心的涉及到数据挖掘利用,决策支持等,我看目前还都在摸索中,成果相对较少。
: 在这边上了一些课之后发现这边的医院的信息支持可真够强大,不同部门之间的信息交
: 流、病人档案的管理,一切都比较人性化。国内可能真的又很长的路要走。回去可能有
: 比较大的发展空间。

v**********h
发帖数: 230
6
一年招收2-3个PHD,1-2个MASTER,招生人数比较少,因为是系里的TRAINING FUNDING
,非绿卡申请人活非公民很难拿到,除非你是DIRECT ADMISSION BY 老板。不敢说项目
多好,但因为招生人数的限制直接导致了竞争比较激烈。UCSD的项目比较小,他们的头
听过讲座,说实话感觉不是太强势,虽然从HAVARD过去的,不看好那个DBMI的发展。个
人之见,仅供参考。最后祝你一切顺利!

of

【在 d******t 的大作中提到】
: 非常谢谢你耐心的回复以及提供的那么多有用信息。
: 这位前辈对这个领域的了解比较全面吧!其实,我正在考虑申请你们学校的申请,不知
: 道申请行情怎样?是不是竞争非常激烈?请前辈指点一下。我也正在考虑一些其它学校
: 的申请,比如你提到的UCSD, 以及UCSF, University of Pittsburgh,University of
: Washington in Seattle, University of Wisconsin Madison, University of
: Nebraska Omaha (bioinformatics), University of Michigan Ann Arbor (
: Bioinformatics), Georgia Institute of Technology (bioinformatics),
: Washington University in St.Louis (computational and System biology) .
: 不知道这些学校的申请难度如何,哪些教授正在招兵买马?知道内部消息的前辈请多多
: 指教!

c*******n
发帖数: 300
7
美国有很多学校都有bioinformatics这个专业,不止20来所大学。
我有几位班同学读这个专业,一位准备毕业后回国。

【在 d******t 的大作中提到】
: 大家好,我有个问题想请教大家。
: 我的背景是:国内本科在一所名校就读,学的是生物工程和工商管理双学士,有较强的
: 数学功底和工科背景。然后在国内念了硕士,方向是分子进化,老板在国内是大牛。来
: 美后在一所普通大学的医学院念生物医学,方向是神经科学,做大脑疾病方面的研究。
: 读了两年,感觉不太喜欢做实验,而且生物很琐碎,今后就业前景黯淡,看了一些网上
: 的讨论,感觉对学生物的抱怨特别多。
: 因为不是非常喜欢生物,想转行,但想结合以前的背景,拿个硕士毕业。网上调查了一
: 番,感觉自己生物医学信息学比较适合我的背景,能够把以前的知识综合利用起来。而
: 且这个专业属于交叉学科,历史较短,全美只有二十来所大学能够提供这个专业,毕业
: 人数不是很多。但是这个专业应用挺广,能够在工业界,医学或者学术界发展。个人想

o********r
发帖数: 775
8
Biomedical informatics不同于bioinformatics吧

【在 c*******n 的大作中提到】
: 美国有很多学校都有bioinformatics这个专业,不止20来所大学。
: 我有几位班同学读这个专业,一位准备毕业后回国。

s*****0
发帖数: 357
9
该专业倒适合你的背景,不过对就业别期望太高。曾经火过,当年号称是可以和CS一较
高下的热门专业,现在远不如从前,大部分工作都是院校或者研究所里的位子。本版和
隔壁的统计版有不少就读于该专业的学生,不妨听听他们的现身说法。理论上随着大量
数据的积累将来应该会对人才有大量需求,但将来是哪年没人知道,而且在工业界有多
少实际的应用也未可知。而且bioinfo本身还分门别类,看你最终能跟上什么老板干上
什么方向还有就是赶上什么大环境才能知道就业的相对难易.

【在 d******t 的大作中提到】
: 大家好,我有个问题想请教大家。
: 我的背景是:国内本科在一所名校就读,学的是生物工程和工商管理双学士,有较强的
: 数学功底和工科背景。然后在国内念了硕士,方向是分子进化,老板在国内是大牛。来
: 美后在一所普通大学的医学院念生物医学,方向是神经科学,做大脑疾病方面的研究。
: 读了两年,感觉不太喜欢做实验,而且生物很琐碎,今后就业前景黯淡,看了一些网上
: 的讨论,感觉对学生物的抱怨特别多。
: 因为不是非常喜欢生物,想转行,但想结合以前的背景,拿个硕士毕业。网上调查了一
: 番,感觉自己生物医学信息学比较适合我的背景,能够把以前的知识综合利用起来。而
: 且这个专业属于交叉学科,历史较短,全美只有二十来所大学能够提供这个专业,毕业
: 人数不是很多。但是这个专业应用挺广,能够在工业界,医学或者学术界发展。个人想

s*****0
发帖数: 357
10
很多学校开设的Biomedical informatics跟bioinformatics有交叉,传统的medical
informatics跟bioinformatics区别还是不小的。

【在 o********r 的大作中提到】
: Biomedical informatics不同于bioinformatics吧
相关主题
诚心请教:学习bioinformatics如何入手?Bioinformatics and Genomics intern
关于Bioinformatics 职位BME生物医学工程这个专业怎么样?
大家有兴趣申请一个生物信息学板么?求bioinfo/genomics工作推荐
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c*******n
发帖数: 300
11
lz五楼的帖子,不是自己说要申请bioinformatics吗?

【在 o********r 的大作中提到】
: Biomedical informatics不同于bioinformatics吧
B********g
发帖数: 40
12
Biomedical informatics 与Bioinformatics应该有区别的. 微软就新设立了Health
Solutions Group, 与Biomedical Informatics相关 , 在北京也有分部.
d******t
发帖数: 65
13
哦,忘了说一下。 Bioinformatics 和biomedical informatics确实有差别,前者很很
多方向,后者主要应用信息技术在医学领域比如临床数据的分析处理上。它们有些交叉
,比如有的学校Biomedical informatics下面有Bioinformatics这个方向,而有的学校
在bioinformatics下做些医学相关的。
我选择有些学校的Bioinformatics,因为我看了它们有医学应用等方向。所以想过去后
选择那方面的导师,做医学方面的bioinformatics。不过具体要做什么,还是和导师以
及所在的实验室有关。
个人比较偏向于做医学相关的bioinformatics或者biomedical informatics.具体能够
申请到什么学校,还是要看运气以及自己努力了。
从个人了解的信息来看,biomedical informatics这个领域还是很有发展前景的。能够
提供biomedical informatics 博士教育的美国大学不多,不过能够提供
bioinformatics的美国大学倒是挺多的。
我个人在斟酌当中。
谢谢各个的指点!很乐意挺多更多人的意见!
谢谢!

【在 B********g 的大作中提到】
: Biomedical informatics 与Bioinformatics应该有区别的. 微软就新设立了Health
: Solutions Group, 与Biomedical Informatics相关 , 在北京也有分部.

o********r
发帖数: 775
14
每个program有自己的强项,所以你申请前要想好你到底想做啥,比如WashU (st.
Louis)的NextGen Seq十分强,如果你想做这方面WashU是个好选择。Pitt的Bioinfo是
和CMU合作的,因此他们在计算机领域的实力非常强,如果你想做Imaging相关的研究,
Murphy实验室很不错,不过最近他那里好像没啥中国学生。

【在 d******t 的大作中提到】
: 哦,忘了说一下。 Bioinformatics 和biomedical informatics确实有差别,前者很很
: 多方向,后者主要应用信息技术在医学领域比如临床数据的分析处理上。它们有些交叉
: ,比如有的学校Biomedical informatics下面有Bioinformatics这个方向,而有的学校
: 在bioinformatics下做些医学相关的。
: 我选择有些学校的Bioinformatics,因为我看了它们有医学应用等方向。所以想过去后
: 选择那方面的导师,做医学方面的bioinformatics。不过具体要做什么,还是和导师以
: 及所在的实验室有关。
: 个人比较偏向于做医学相关的bioinformatics或者biomedical informatics.具体能够
: 申请到什么学校,还是要看运气以及自己努力了。
: 从个人了解的信息来看,biomedical informatics这个领域还是很有发展前景的。能够

d******t
发帖数: 65
15
非常谢谢你的指点。
看来你对这个领域比较了解,和我收集到的信息比较一致。
个人感觉我现在缺的就是计算机方面的背景。我想如果今后做bioinformatics或者
biomedical informatics的话,计算机方面的背景和知识非常重要,生物方面的知识因
为很多年的耳濡目染,如果某方面的知识欠缺的话,可以很快补上。所以我想加强计算
机方面的知识,掌握这个工具,然后做起事情来就会顺手的多。
因为我现在做的是Neurodegerative diseases (Huntington's Disease),这是一种
protein misfolding 引起的疾病。因为疾病的发病机制非常复杂,现在的生物研究感
觉有点小打小闹的感觉,研究某个或者几个蛋白或者基因的功能试图攻克某个疾病,个
人感觉不太可能,有点带着运气的成分。疾病的攻克需要很强大的计算机等信息技术才
能解决,因此我今后想做蛋白折叠与疾病之间的关系这个方向。
读博期间方向非常重要,不过我认为还是学习阶段。因为实验室和导师的限制,也许不
能够做自己最想做的。也许在博士毕业后,可以去合适的实验室做博后,做自己最想做
的研究和方向。不知道这个想法对不对。请高人指点。
谢谢!

【在 o********r 的大作中提到】
: 每个program有自己的强项,所以你申请前要想好你到底想做啥,比如WashU (st.
: Louis)的NextGen Seq十分强,如果你想做这方面WashU是个好选择。Pitt的Bioinfo是
: 和CMU合作的,因此他们在计算机领域的实力非常强,如果你想做Imaging相关的研究,
: Murphy实验室很不错,不过最近他那里好像没啥中国学生。

v**********h
发帖数: 230
16
就我这里的说法来讲,Department of Biomedical Informatics一般有两个分支,一个
是传统的bioinformatics,主要囊括genomics & proteomics;另一个主要的方向其实
是clinical informatics,主要是跟医院合作的。前者跟临床也有交叉,比如GENOMICS
分析来预测癌症的发生的可能性(似乎有一个预测的东东已经被批准使用,乳腺癌相关
的吧),但总的来说是局限于研究性的;而后者则应归类为health care,跟医院直接
密切相关,服务于医院系统,这个方面的专业在全美要少很多。这一领域包含了很多的
东西,比如HUMAN FACTOR, PRIVACY, INFORMATION RETRIEVAL,NURSING INFORMATICS,
HEALTH INFORMATICS EXCHANGE,STANDARDS AND INTEROPERABILITY...我见过的一个很
COOL的软件用来帮助医生预测疾病的发生或者药物使用,可以大大降低各种因素带来的
误判和误用。其实这个东西原理上讲很简单,就是有足够的TRAINING DATA SETS,美国
这边因为各种PRIVACY POLICY的限制,研究用的样本可能不是太方便;就这个意义来讲
,国内的资源太丰富了,如果医院直接可以互相合作的话,简直是取之不尽用之不竭啊
。我看好这方面的前景。

【在 o********r 的大作中提到】
: Biomedical informatics不同于bioinformatics吧
v**********h
发帖数: 230
17
google有一个 Google Health personal health record system,不知道算不算相关。

【在 B********g 的大作中提到】
: Biomedical informatics 与Bioinformatics应该有区别的. 微软就新设立了Health
: Solutions Group, 与Biomedical Informatics相关 , 在北京也有分部.

o********r
发帖数: 775
18
个人看法是短期内这些complex disease基本上没啥希望可以有直截了当的医疗上的突
破,更多的是致病机理之类的了解,为治疗上的突破打下基础。
读博以及千老过程中的方向,如果以后做faculty会有些影响,去industry的话基本没
啥区别,他们需要的是你可以运用你掌握的技能来解决问题,因此在读博期间多掌握些
计算机技能更重要。毕竟目前bioinfo的问题更大程度上是一些简单但是海量的运算问
题,还不需要十分高深的计算机理论基础。Bioinfo更多追求的是实用方案,而不是理
论上的最佳方案 (again, personal opinion)。
如果你的目标是加强计算机方面的知识,我建议你申请CMU那个和Pitt合作的program,
CMU在生物/医学上远不及Pitt,不过说到计算机两个学校的差别可能更大,进了CMU你
可以随便选CS的课。

【在 d******t 的大作中提到】
: 非常谢谢你的指点。
: 看来你对这个领域比较了解,和我收集到的信息比较一致。
: 个人感觉我现在缺的就是计算机方面的背景。我想如果今后做bioinformatics或者
: biomedical informatics的话,计算机方面的背景和知识非常重要,生物方面的知识因
: 为很多年的耳濡目染,如果某方面的知识欠缺的话,可以很快补上。所以我想加强计算
: 机方面的知识,掌握这个工具,然后做起事情来就会顺手的多。
: 因为我现在做的是Neurodegerative diseases (Huntington's Disease),这是一种
: protein misfolding 引起的疾病。因为疾病的发病机制非常复杂,现在的生物研究感
: 觉有点小打小闹的感觉,研究某个或者几个蛋白或者基因的功能试图攻克某个疾病,个
: 人感觉不太可能,有点带着运气的成分。疾病的攻克需要很强大的计算机等信息技术才

o********r
发帖数: 775
19
clinical informatics中的predictive model基本上就是AI/ML在医用领域的一个应用
,其他方面也更象CS在医院的应用。

GENOMICS
,

【在 v**********h 的大作中提到】
: 就我这里的说法来讲,Department of Biomedical Informatics一般有两个分支,一个
: 是传统的bioinformatics,主要囊括genomics & proteomics;另一个主要的方向其实
: 是clinical informatics,主要是跟医院合作的。前者跟临床也有交叉,比如GENOMICS
: 分析来预测癌症的发生的可能性(似乎有一个预测的东东已经被批准使用,乳腺癌相关
: 的吧),但总的来说是局限于研究性的;而后者则应归类为health care,跟医院直接
: 密切相关,服务于医院系统,这个方面的专业在全美要少很多。这一领域包含了很多的
: 东西,比如HUMAN FACTOR, PRIVACY, INFORMATION RETRIEVAL,NURSING INFORMATICS,
: HEALTH INFORMATICS EXCHANGE,STANDARDS AND INTEROPERABILITY...我见过的一个很
: COOL的软件用来帮助医生预测疾病的发生或者药物使用,可以大大降低各种因素带来的
: 误判和误用。其实这个东西原理上讲很简单,就是有足够的TRAINING DATA SETS,美国

K****n
发帖数: 5970
20
我最喜欢个性好的人了

【在 d******t 的大作中提到】
: 非常谢谢你的解答和进一步确认。
: 最近了解了一下,就业市场确实比较好!个人对这个非常感兴趣。本人个性比较好,非
: 常容易和人相处,打成一片。就个人而言,无论在学术界或者工业局或者医院发展都可
: 以。
: 最自己想做的,有个幸福美满的家庭和几个天真可爱的孩子,比什么都重要!个人今后
: 的前途和命运要看机遇了,现在做好准备就是。
: 非常谢谢!
:
: It'
: much

相关主题
请问Genome Biology的投稿有啥要注意的资深千老想学个Online Master of health informatics
MS/PhD in Life Sciences (bioinformatics) UNLV Spring 2015bioinfo在industry的机会?
一个35B的药厂在招Sr Director of Bioinformaticsbioinformatics前途问题
进入Biology版参与讨论
K****n
发帖数: 5970
21
搞了一堆外包吧

【在 B********g 的大作中提到】
: Biomedical informatics 与Bioinformatics应该有区别的. 微软就新设立了Health
: Solutions Group, 与Biomedical Informatics相关 , 在北京也有分部.

K****n
发帖数: 5970
22
美国的data由于privacy而不充分这个说法能confirm吗?我怎么记得只要不用personal
identifiable information就可以了

GENOMICS
,

【在 v**********h 的大作中提到】
: 就我这里的说法来讲,Department of Biomedical Informatics一般有两个分支,一个
: 是传统的bioinformatics,主要囊括genomics & proteomics;另一个主要的方向其实
: 是clinical informatics,主要是跟医院合作的。前者跟临床也有交叉,比如GENOMICS
: 分析来预测癌症的发生的可能性(似乎有一个预测的东东已经被批准使用,乳腺癌相关
: 的吧),但总的来说是局限于研究性的;而后者则应归类为health care,跟医院直接
: 密切相关,服务于医院系统,这个方面的专业在全美要少很多。这一领域包含了很多的
: 东西,比如HUMAN FACTOR, PRIVACY, INFORMATION RETRIEVAL,NURSING INFORMATICS,
: HEALTH INFORMATICS EXCHANGE,STANDARDS AND INTEROPERABILITY...我见过的一个很
: COOL的软件用来帮助医生预测疾病的发生或者药物使用,可以大大降低各种因素带来的
: 误判和误用。其实这个东西原理上讲很简单,就是有足够的TRAINING DATA SETS,美国

v**********h
发帖数: 230
23
我说的不准确。简单来说,很多DATA只能是MD才能触及的,RESEARCHER要直接接触需要
一些复杂的手续;但是如果数据de-identified的话,是可以直接release给研究者的。
我这里做simulation的一些研究人员苦于没有临床数据研究无法进展,具体的规定我说
不清楚,总之还是限制挺大的吧。希望版上有医生出来指点一二。

personal

【在 K****n 的大作中提到】
: 美国的data由于privacy而不充分这个说法能confirm吗?我怎么记得只要不用personal
: identifiable information就可以了
:
: GENOMICS
: ,

K****n
发帖数: 5970
24
也有可能是找participant和申IRB比较麻烦,中国这方面确实有优势
话说有啥好idea好model的是不是可以开个公司。那时候如果data都是医院的或者学校
的就太不爽
了,回国去收数据实在是很有吸引力啊

【在 v**********h 的大作中提到】
: 我说的不准确。简单来说,很多DATA只能是MD才能触及的,RESEARCHER要直接接触需要
: 一些复杂的手续;但是如果数据de-identified的话,是可以直接release给研究者的。
: 我这里做simulation的一些研究人员苦于没有临床数据研究无法进展,具体的规定我说
: 不清楚,总之还是限制挺大的吧。希望版上有医生出来指点一二。
:
: personal

v**********h
发帖数: 230
25
开公司或许真的是一条好路子啊,医院有钱,不缺用户。恩。就朝这个方向努力了。呵
呵。

【在 K****n 的大作中提到】
: 也有可能是找participant和申IRB比较麻烦,中国这方面确实有优势
: 话说有啥好idea好model的是不是可以开个公司。那时候如果data都是医院的或者学校
: 的就太不爽
: 了,回国去收数据实在是很有吸引力啊

S*********a
发帖数: 10
26
这个专业我读过硕士,随便说说。
1.奖学金很难拿,因为要绿卡才能拿项目的钱,大部分中国人是,工作的时候parttime
读书。
2.专业方向有很多,大的分bioinfo 和 clinical info,还有就是计算机(数据库,网
络安全,语音识别。。。),还有就是管理(推广评估现有软件)。
3. bioinfo 我就不提了,计算机的,统计的,生物的都在搞这个,分析各种各样的数
据;clinical info,这个东东你最好有和美国医疗系统临床紧密接触的机会,你才能了
解医生想要什么,平时都在用什么系统,你才能知道人家在说啥,有啥改进,这个方向
你的编程基础也要不错,写写web programming,建数据库,database communication;例
如改进cpoe,ER system, imaging storage...;计算机,语音识别--医生懒得写,录音
,你们识别出来记下来,网络安全保护病人隐私等等,再者就是,管理方向的就像商学
院的strategy内容了。
4.上课,有的学校要求你各个方向的课都要上,包括生理,解剖,组织胚胎学。。。,
计算机的数据库,编程,ai,ml;还有一帮MD的吹牛逼的课,都有可能是必修。
感觉和biomedical engineering 挺像的虽然是一个部门,但是来自各个领域做不同的
事情。
S*********a
发帖数: 10
27
lz HIT的?数学和计算机外的工程背景不是很有帮助。学医的有点用,但是重要的是
practice过的,practice的时候用过软件的。
如果你想回国发展做EMR,不如学计算机,然后在这个领域工作。自己参与和医生一起写
几个系统,并在大医学中心应用,积累经验回国。
等你在这个领域工作了,再决定念不念这个program.
个人认为,这个行业的主要方向是clinical info,真正牛人应该有MD经过住院医培训,
在来一个CS major, ph.d or master,然后参与写写改改系统提高实战,才能找到感觉
,但是几个MD做完了住院医还搞这个?outliers...
再者,你搞bioinfo... 和计算机,统计的,应数的,生物的等等一起high...
d******t
发帖数: 65
28
呵呵,非常谢谢!
个人只是脾气非常好,心地比较软,不含怒到日落!很少有事情让我能够生气的。也不
是很Picky.

【在 K****n 的大作中提到】
: 我最喜欢个性好的人了
d******t
发帖数: 65
29
hehe, 非常谢谢!
讲的非常清晰。跟我了解的差不多,不过加深了认识。

GENOMICS
,

【在 v**********h 的大作中提到】
: 就我这里的说法来讲,Department of Biomedical Informatics一般有两个分支,一个
: 是传统的bioinformatics,主要囊括genomics & proteomics;另一个主要的方向其实
: 是clinical informatics,主要是跟医院合作的。前者跟临床也有交叉,比如GENOMICS
: 分析来预测癌症的发生的可能性(似乎有一个预测的东东已经被批准使用,乳腺癌相关
: 的吧),但总的来说是局限于研究性的;而后者则应归类为health care,跟医院直接
: 密切相关,服务于医院系统,这个方面的专业在全美要少很多。这一领域包含了很多的
: 东西,比如HUMAN FACTOR, PRIVACY, INFORMATION RETRIEVAL,NURSING INFORMATICS,
: HEALTH INFORMATICS EXCHANGE,STANDARDS AND INTEROPERABILITY...我见过的一个很
: COOL的软件用来帮助医生预测疾病的发生或者药物使用,可以大大降低各种因素带来的
: 误判和误用。其实这个东西原理上讲很简单,就是有足够的TRAINING DATA SETS,美国

v**********h
发帖数: 230
30
赞!总结的全面多了。
另问:就业前景如何?就业方向怎么样呢?

parttime

【在 S*********a 的大作中提到】
: 这个专业我读过硕士,随便说说。
: 1.奖学金很难拿,因为要绿卡才能拿项目的钱,大部分中国人是,工作的时候parttime
: 读书。
: 2.专业方向有很多,大的分bioinfo 和 clinical info,还有就是计算机(数据库,网
: 络安全,语音识别。。。),还有就是管理(推广评估现有软件)。
: 3. bioinfo 我就不提了,计算机的,统计的,生物的都在搞这个,分析各种各样的数
: 据;clinical info,这个东东你最好有和美国医疗系统临床紧密接触的机会,你才能了
: 解医生想要什么,平时都在用什么系统,你才能知道人家在说啥,有啥改进,这个方向
: 你的编程基础也要不错,写写web programming,建数据库,database communication;例
: 如改进cpoe,ER system, imaging storage...;计算机,语音识别--医生懒得写,录音

相关主题
口头的offer已经来了,薪水还在扯皮转专业方向
谁来谈谈现在bioinformatics的情况啊请问下 bioinformatics 好找工作么
zt 去年 Gerstein 在 GB 发的牢骚文章大家有没有看看迷茫啊,各位给点建议吧
进入Biology版参与讨论
d******t
发帖数: 65
31
呵呵,这位前辈说得很在理。我想在读博期间多掌握些计算机技能,如果方向能够是我
想做的,那是更好了。就目前的bioinformatics来说,还处于比较初始的发展阶段,以
应用为主,如果想在这个领域做得比较出色,有重大突破,掌握比较深的计算机理论基
础会比较好些。不过很多事情计划不如变化。
谢谢前辈的建议,申请CMU和Pitt合作的program。不知道从那个学校申请进入这个
program相对会容易些,应该是pitt吧!

【在 o********r 的大作中提到】
: 个人看法是短期内这些complex disease基本上没啥希望可以有直截了当的医疗上的突
: 破,更多的是致病机理之类的了解,为治疗上的突破打下基础。
: 读博以及千老过程中的方向,如果以后做faculty会有些影响,去industry的话基本没
: 啥区别,他们需要的是你可以运用你掌握的技能来解决问题,因此在读博期间多掌握些
: 计算机技能更重要。毕竟目前bioinfo的问题更大程度上是一些简单但是海量的运算问
: 题,还不需要十分高深的计算机理论基础。Bioinfo更多追求的是实用方案,而不是理
: 论上的最佳方案 (again, personal opinion)。
: 如果你的目标是加强计算机方面的知识,我建议你申请CMU那个和Pitt合作的program,
: CMU在生物/医学上远不及Pitt,不过说到计算机两个学校的差别可能更大,进了CMU你
: 可以随便选CS的课。

k***x
发帖数: 34
32
不要申UCSF,UCSD和UW的bioinfo了,一般收的都是美国人而且还是MIT,Stanford这类学校毕业的。我个人觉得cmu/upitt和washu的不错,也可以申uc其他学校。Columbia的translational bioinformatics,就是你们说的clinical informatics,很好规模也大。纽约有几个医学院(cornell,mskcc,mount sinai)都有这种的phd项目应该都不错。
w******a
发帖数: 1527
33
大家有没有看到northwestern的这个专业?看过去好像满好玩的~~~~
http://www.medinformatics.northwestern.edu/?gclid=CMOri-Wq9qQCFYL75wodkWsTzA
o********r
发帖数: 775
34
如果你想修的是计算机的课程,就从CMU申请,毕竟校内方便。而且CMU这一侧的
Bioinfo的老师基本上也都是CS的faculty,如果你真能折腾要搞个CS的MS也可能,我认
识不少人都顺手拿了一个CS的MS。

【在 d******t 的大作中提到】
: 呵呵,这位前辈说得很在理。我想在读博期间多掌握些计算机技能,如果方向能够是我
: 想做的,那是更好了。就目前的bioinformatics来说,还处于比较初始的发展阶段,以
: 应用为主,如果想在这个领域做得比较出色,有重大突破,掌握比较深的计算机理论基
: 础会比较好些。不过很多事情计划不如变化。
: 谢谢前辈的建议,申请CMU和Pitt合作的program。不知道从那个学校申请进入这个
: program相对会容易些,应该是pitt吧!

w********e
发帖数: 944
35
mark!
m***T
发帖数: 11058
36
Medical(clinical) informatics还是不错的,诸如电子病历,远程医疗,针对Doc及
nursing的不同的系统而优化的UI等等很多方面。前面有人已经提到医生现在不是自己
手写病历,主要并不是因为懒,而是以医生的收入来花大量时间写病历,可以想象成本
会有多高。所以在语音识别软件应用在临床上之前,多数都是医生做dictation录下音
来,然后由秘书们一边听一边输入到电脑中,然后再让医生们审查签名等。
Medical informatics方向的工作一般是所在医院support,不需要外来的funding,所
以job security应该不错。
看看下面American Medical Informatics Association的job listing及description,
自己感觉感觉吧。
https://www.amia.org/jobex/job_listings
d******t
发帖数: 65
37
呵呵,说得非常详细,非常有指导意义。
我的想法和看法跟你差不多。现在我已经进入这个program读博,拿到全奖,现在是第
二个学期了。感觉短短的一个多学期学习到了很多东西,比我以前两年多时间内学到的
东西还多。
现在做的project主要是应用Natural Language Processing(NLP)医学文献的数据挖掘
,以及利用NGS技术找Cancer的driver mutation.

parttime

【在 S*********a 的大作中提到】
: 这个专业我读过硕士,随便说说。
: 1.奖学金很难拿,因为要绿卡才能拿项目的钱,大部分中国人是,工作的时候parttime
: 读书。
: 2.专业方向有很多,大的分bioinfo 和 clinical info,还有就是计算机(数据库,网
: 络安全,语音识别。。。),还有就是管理(推广评估现有软件)。
: 3. bioinfo 我就不提了,计算机的,统计的,生物的都在搞这个,分析各种各样的数
: 据;clinical info,这个东东你最好有和美国医疗系统临床紧密接触的机会,你才能了
: 解医生想要什么,平时都在用什么系统,你才能知道人家在说啥,有啥改进,这个方向
: 你的编程基础也要不错,写写web programming,建数据库,database communication;例
: 如改进cpoe,ER system, imaging storage...;计算机,语音识别--医生懒得写,录音

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