e*****n
发帖数: 15 | 1 已经有了whole genome的DNA，要送去测序，测序那边说我要给他们300bp的DNA
fragment, 这样他们才能做library
看了别人，都是sonication来得到DNA fragment的了
可是要怎样的conditions才能得到300bp的呢？
多谢板上大侠指导 |
C*******e
发帖数: 4348 | 2 你们是测基因组么？
奇怪了，这种测序服务的地方难道不自己弄么？
一般不是都是只接受high MW gDNA
后面的步骤他们自己做么？
送到我们这里吧：）提交proposal，免费测
呵呵
【在 e*****n 的大作中提到】
: 已经有了whole genome的DNA，要送去测序，测序那边说我要给他们300bp的DNA
: fragment, 这样他们才能做library
: 看了别人，都是sonication来得到DNA fragment的了
: 可是要怎样的conditions才能得到300bp的呢？
: 多谢板上大侠指导
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e*****n
发帖数: 15 | 3 我这个应该是DNA methylome sequencing吧
whole genome 的DNA，用invitrogen的那个methyMiner kit enrich methylated DNA，
但是这个kit上说要根据下游的实验用fragment DNA 和bead incubate
测序那边要300bp的DNA fragment，所以我enrich这步就得要300bp的啊
【在 C*******e 的大作中提到】
: 你们是测基因组么？
: 奇怪了，这种测序服务的地方难道不自己弄么？
: 一般不是都是只接受high MW gDNA
: 后面的步骤他们自己做么？
: 送到我们这里吧：）提交proposal，免费测
: 呵呵
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l*******0
发帖数: 222 | 4 随便那个什么GENOMIC DNA试一下条件不就可以了
【在 e*****n 的大作中提到】
: 已经有了whole genome的DNA，要送去测序，测序那边说我要给他们300bp的DNA
: fragment, 这样他们才能做library
: 看了别人，都是sonication来得到DNA fragment的了
: 可是要怎样的conditions才能得到300bp的呢？
: 多谢板上大侠指导
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h****n
发帖数: 92 | 5 我拿染色质做超声，能切到从100bp一直到500bp一条长长的拖尾带，再短也下不去了 |
m***T
发帖数: 11058 | 6 用Covaris S2可以shear到300bp。具体的查它家的protocol
【在 e*****n 的大作中提到】
: 已经有了whole genome的DNA，要送去测序，测序那边说我要给他们300bp的DNA
: fragment, 这样他们才能做library
: 看了别人，都是sonication来得到DNA fragment的了
: 可是要怎样的conditions才能得到300bp的呢？
: 多谢板上大侠指导
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e*****n
发帖数: 15 | 7 好的，多谢前辈~~我查查看
【在 m***T 的大作中提到】
: 用Covaris S2可以shear到300bp。具体的查它家的protocol
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