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Biology版 - 我想自学R。 有那位高手指点一下如何入手呢?
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问个很幼稚的关于统计里 "n" 的问题怎样将 Go 的 基因 转换到 affymetrix ID
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请教如何处理novel genes的GO enrichment analysisSignal pathway制作
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1 (共1页)
z***0
发帖数: 333
1
先谢谢了!!
b***g
发帖数: 516
2
帮顶,我也想学,高人指点一下吧,谢谢!
k****u
发帖数: 3454
3
我们学校统计系每年有小的R workshop,我准备去听一个先熟悉下

【在 z***0 的大作中提到】
: 先谢谢了!!
s******s
发帖数: 13035
4
读一遍an introduction to R,大概一两天。然后找个程序
对照着读读,就差不多了。如果有自己的project就更好了

【在 b***g 的大作中提到】
: 帮顶,我也想学,高人指点一下吧,谢谢!
a****m
发帖数: 693
5
这样学
好像用处不大,其实你就是学点符号,而且R 有不同的package,如果你不在Project的
话,根本理解不了其中的含义。
c*********t
发帖数: 340
6
通过做project来学。。。
做microarray的话推荐bioconductor case studies这本书
当然之前要看一下an introduction to r 之类的讲基础的书:)
r一开始有个learning curve,上手了以后就会越来越容易的,mm别担心
g**********t
发帖数: 475
7
看过R in a nutshell,感觉讲的还可以,对语法的解释比较好,可以参考一下。R的文
档不是很好看懂。
关键还是多练。
e*****t
发帖数: 642
8
R的语法是常用的语言中,最好懂的。要是初学perl,估计要郁闷一会。
而且很少有人用R做oop,所以基本就是学一个一个command
b*****l
发帖数: 9499
9
不得不说,R 自己的 manual 比较烂。。。要说到文档,matlab 那叫一个强啊。

【在 e*****t 的大作中提到】
: R的语法是常用的语言中,最好懂的。要是初学perl,估计要郁闷一会。
: 而且很少有人用R做oop,所以基本就是学一个一个command

e*****t
发帖数: 642
10
R不要钱啦,还能怎样?
SAS document作的最好,但那还是编程吗?

【在 b*****l 的大作中提到】
: 不得不说,R 自己的 manual 比较烂。。。要说到文档,matlab 那叫一个强啊。
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M*****n
发帖数: 16729
11
吃一堑,长一智
take it easy.
l******n
发帖数: 520
12
我怎么觉得Perl比R好学多了,我学Perl只用了几个小时就开始写写小脚本处理基因组
数据,慢慢很自然的就写点比较复杂的。可是学R有一段时间了,总觉得没有学进去啊
,可能是我统计基础太差了吧,而且平时用的少,所以就学到也慢。还是学以致用来得
s*********s
发帖数: 110
13
http://dl.dropbox.com/u/2383040/bioonductor%20case%20studies.pdf
bioonductor case studies
nice book to start

【在 z***0 的大作中提到】
: 先谢谢了!!
e****l
发帖数: 204
14
可以到下面的网站看一下:
http://zoonek2.free.fr/UNIX/48_R/all.html
Statics with R
这个教程包含了很多应用的例子。基本上只要看了里面的前四章,就对R有了个大概的感
觉了。
1. Introduction to R
2. Programming in R
3. From Data to Graphics
4. Customizing graphics
后面的十来章就是具体的统计应用方法。看起来有点困难。等有时间在慢慢看吧。
5. Factorial methods: Around Principal Component Analysis (PCA)
6. Clustering
7. Probability Distributions
8. Estimators and Statistical Tests
9. Regression
10. Other regressions
11. Regression Problems -- and their Solutions
12. Generalized Linear Models: logistic regression, Poisson regression, etc.
13. Analysis of Variance (Anova)
14. Mixed Models
15. Time series
16. Miscellaneous
17. Applications

【在 z***0 的大作中提到】
: 先谢谢了!!
p***a
发帖数: 6202
15
上统计课的时候学了一点儿r,基本上忘光了。
跟风问一下,r和matlab哪个好学,好用(powerful)? 我处理text比较多,会python
和一点儿mysql.

的感

【在 e****l 的大作中提到】
: 可以到下面的网站看一下:
: http://zoonek2.free.fr/UNIX/48_R/all.html
: Statics with R
: 这个教程包含了很多应用的例子。基本上只要看了里面的前四章,就对R有了个大概的感
: 觉了。
: 1. Introduction to R
: 2. Programming in R
: 3. From Data to Graphics
: 4. Customizing graphics
: 后面的十来章就是具体的统计应用方法。看起来有点困难。等有时间在慢慢看吧。

c*******n
发帖数: 300
16
可以先看些R基础的书,有几本书带练习题。
然后最好能实践,比如上一门统计系machine learning,data mining,modeling这种编程较多的统计课。上课对于学习R的好处在于有目标,有动力,作业比较简单,容易上手,还可以和别人讨论。
接下来,自己就可以独立做project了。

【在 z***0 的大作中提到】
: 先谢谢了!!
s*****0
发帖数: 357
17
message me in private your personal email address, and I will send you an
EBOOK:
"A Handbook of Statistical Analysis Using R"
Examples contain many biomedical problems, such as survival analysis in
oncology.

【在 z***0 的大作中提到】
: 先谢谢了!!
H*******g
发帖数: 321
18
mark
h******3
发帖数: 190
19
I also think taking a course in statistics is the most helpful. If you
cannot do that, maybe you can read in data from the lab, and do t test,
anova etc. or plot graphs. and start from there.
z***0
发帖数: 333
20
感谢大家的建议!!!
祝各位圣诞快乐,心想事成!
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话题: analysis话题: regression话题: models