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Biology版 - 请教一个抗体epitope mapping的问题
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E*C
发帖数: 1629
1
我自己画了个图,不知道能不能看清楚。
抗体XX是针对蛋白片断AD得到的。ELISA检测XX和AD结合值很高。
把这段蛋白重组成2个片段AC,BD (中间有重复片段BC)。 ELISA检测XX和这2个片段
都有结合。
把这段蛋白重组成3个片断AC,BC,CD,ELISA检测,XX和他们都不结合。
现在问题是:
1, 怎么找到最可能的抗体表位?
2, 怎么解释XX和3个片段都不结合?
各位大人请赐教
W****C
发帖数: 1937
2
没看懂。。。是不是3个片段的那里打错了?怎么跟两个片段的一样
E*C
发帖数: 1629
3
yes,corrected right now

【在 W****C 的大作中提到】
: 没看懂。。。是不是3个片段的那里打错了?怎么跟两个片段的一样
H****s
发帖数: 301
4
一个比较简单的法子,把这段蛋白的基因随机片段化(最好是50-100bp大小)。然后把
片段文库克隆到噬菌体展示载体(phage display vector)上去,用你的抗体来筛。把
筛到的克隆测序,除去假阳性,然后做序列比较,(一般来说)你就可以找到抗原表位
了。

【在 E*C 的大作中提到】
: 我自己画了个图,不知道能不能看清楚。
: 抗体XX是针对蛋白片断AD得到的。ELISA检测XX和AD结合值很高。
: 把这段蛋白重组成2个片段AC,BD (中间有重复片段BC)。 ELISA检测XX和这2个片段
: 都有结合。
: 把这段蛋白重组成3个片断AC,BC,CD,ELISA检测,XX和他们都不结合。
: 现在问题是:
: 1, 怎么找到最可能的抗体表位?
: 2, 怎么解释XX和3个片段都不结合?
: 各位大人请赐教

E*C
发帖数: 1629
5
是啊,噬菌体展示可能是最好的办法了.
谁能解释一下第二个问题吗

【在 H****s 的大作中提到】
: 一个比较简单的法子,把这段蛋白的基因随机片段化(最好是50-100bp大小)。然后把
: 片段文库克隆到噬菌体展示载体(phage display vector)上去,用你的抗体来筛。把
: 筛到的克隆测序,除去假阳性,然后做序列比较,(一般来说)你就可以找到抗原表位
: 了。

H****s
发帖数: 301
6
There is good possibility that the epitope is a conformational epitope, not
a linear one. Swapping polypeptides might disrupt the conformational epitope.

【在 E*C 的大作中提到】
: 是啊,噬菌体展示可能是最好的办法了.
: 谁能解释一下第二个问题吗

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