i*S
发帖数: 175 | 1 做realtime处理数据时遇上了些想不通的东西，情况如下：
相对定量的，对于某个基因的表达量，
1.我有在Day1 day2 day3 ……day 10 每个特定日期 treated 和 untreated比较的两
组数据.
(例如，在day2， untreated的样本此基因表达是treated的50%；在day3，untreated的
样本此基因表达是treated的60%）
2.同时有day 1 day2，day3……day10 中untreated的样本此基因表达随着发育时间变
化数据。
（比如，都normalize到day10，day1基因表达是day10的5%； day2 基因表达是day10的
10%; day3是 15%）
现在我想把这些数据合并，做成一个图，既表现发育时基因表达的变化，又显示
treated和untreated的差异。
问题是对于上述的1和2两组数据，各自有自己的标准偏差/误差，我在作图的时候应该
怎样处理这些标准差才是合法的呢? 是把他们相加/相乘么？ |
i***l
发帖数: 1656 | 2 have another run, put them together, day 1 to 10 , treated and untreated,
normalized with house keeping gene, say, actin
【在 i*S 的大作中提到】
: 做realtime处理数据时遇上了些想不通的东西，情况如下：
: 相对定量的，对于某个基因的表达量，
: 1.我有在Day1 day2 day3 ……day 10 每个特定日期 treated 和 untreated比较的两
: 组数据.
: (例如，在day2， untreated的样本此基因表达是treated的50%；在day3，untreated的
: 样本此基因表达是treated的60%）
: 2.同时有day 1 day2，day3……day10 中untreated的样本此基因表达随着发育时间变
: 化数据。
: （比如，都normalize到day10，day1基因表达是day10的5%； day2 基因表达是day10的
: 10%; day3是 15%）
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t**a
发帖数: 255 | 3 First normalize each sample to houskeeping gene, then normalize al the
samples to day 1 control,that is to set day1 control as "1".
【在 i*S 的大作中提到】
: 做realtime处理数据时遇上了些想不通的东西，情况如下：
: 相对定量的，对于某个基因的表达量，
: 1.我有在Day1 day2 day3 ……day 10 每个特定日期 treated 和 untreated比较的两
: 组数据.
: (例如，在day2， untreated的样本此基因表达是treated的50%；在day3，untreated的
: 样本此基因表达是treated的60%）
: 2.同时有day 1 day2，day3……day10 中untreated的样本此基因表达随着发育时间变
: 化数据。
: （比如，都normalize到day10，day1基因表达是day10的5%； day2 基因表达是day10的
: 10%; day3是 15%）
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i*S
发帖数: 175 | 4 谢谢LS，我也是这么想的，可是这样标准偏差就不好处理了吧 |
t**a
发帖数: 255 | 5 I guess you first normalize each sample with housekeeping gene, then you
calculate the Mean and SD of several samples of each condition. After that
no matter how you want to normalize the Mean,just do the same thing to SD,
eg. divided by the Mean of day10 control. SD is always proportional to Mean. |
