w******y
发帖数: 2504 | 1 请问大家都是怎么计算P value的？我用的GRAPHPAD PRISM软件统计各组的差异，
REVIERER要求我把P VALUE也SHOW出来，可是这个软件只告诉我各组是否有统计学差异
（P< 0.05）。请问大家都是用什么软件、怎么算的？ |
p*****m
发帖数: 7030 | 2 prism显示了p value的啊
【在 w******y 的大作中提到】
: 请问大家都是怎么计算P value的？我用的GRAPHPAD PRISM软件统计各组的差异，
: REVIERER要求我把P VALUE也SHOW出来，可是这个软件只告诉我各组是否有统计学差异
: （P< 0.05）。请问大家都是用什么软件、怎么算的？
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w******y
发帖数: 2504 | 3 我先用1WAY ANOVA，然后用的是TURKEY'S MULTIPLE COMPARISON，它只告诉我是不是
SIGNIFICANT (p < 0.05)。难道是我选的分析的PROGRAM错了？我有4组：WT, WT +
TREATMENT, TRANSGENIC, TRANSGENIC +TREATMENT。
还请PEOPLEM指点一下。
【在 p*****m 的大作中提到】
: prism显示了p value的啊
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p*****m
发帖数: 7030 | 4 哦哦 如果说的是ANOVA post hoc那确实没有的，而且他们还有解释
http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=189
如果你非要结果不可，那有两个办法，一是算两两比较的p value,直接乘以总共做了多
少个比较(=n*(n-1)/2) 这是最stringent的避免type i error的办法
另外我记得spss里面会给你算，这时候你就可以选一些less stringent的办法算
【在 w******y 的大作中提到】
: 我先用1WAY ANOVA，然后用的是TURKEY'S MULTIPLE COMPARISON，它只告诉我是不是
: SIGNIFICANT (p < 0.05)。难道是我选的分析的PROGRAM错了？我有4组：WT, WT +
: TREATMENT, TRANSGENIC, TRANSGENIC +TREATMENT。
: 还请PEOPLEM指点一下。
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w******y
发帖数: 2504 | 5 太详尽了，非常感谢。这个N是指组数，在我这是4，对吗？
【在 p*****m 的大作中提到】
: 哦哦 如果说的是ANOVA post hoc那确实没有的，而且他们还有解释
: http://www.graphpad.com/faq/viewfaq.cfm?faq=189
: 如果你非要结果不可，那有两个办法，一是算两两比较的p value,直接乘以总共做了多
: 少个比较(=n*(n-1)/2) 这是最stringent的避免type i error的办法
: 另外我记得spss里面会给你算，这时候你就可以选一些less stringent的办法算
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S*M
发帖数: 10832 | 6 我没用过prism
不过你如果做的是Tukey's HSD
应该得到两两比较的p-value,adjusted for multiple comparison
没有的话就是prism这个软件太弱了
【在 w******y 的大作中提到】
: 我先用1WAY ANOVA，然后用的是TURKEY'S MULTIPLE COMPARISON，它只告诉我是不是
: SIGNIFICANT (p < 0.05)。难道是我选的分析的PROGRAM错了？我有4组：WT, WT +
: TREATMENT, TRANSGENIC, TRANSGENIC +TREATMENT。
: 还请PEOPLEM指点一下。
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p*****m
发帖数: 7030 | 7 没什么弱的 这个adjusted p value本来绝对值就没什么意义 pass你指定的threshold
就是了
【在 S*M 的大作中提到】
: 我没用过prism
: 不过你如果做的是Tukey's HSD
: 应该得到两两比较的p-value,adjusted for multiple comparison
: 没有的话就是prism这个软件太弱了
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p*****m
发帖数: 7030 | 8 是的 因为4组数你两两比较一共有6个pair wise comparison.因此犯type i error的可
能性就大了6倍。这是bonferroni correction的基本思想，这个处理方法以type ii
error为代价极小化了type i error 因此可以考虑成最严格的对null hypothesis的检验
【在 w******y 的大作中提到】
: 太详尽了，非常感谢。这个N是指组数，在我这是4，对吗？
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