x*******6
发帖数: 6 | 1 小弟最近在申请博后，博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析，
主要是细菌的，博士组里的强项是phylogenetic network，个人的生信背景偏
phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
同学发了一水的牛paper，很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能，比如
assembly，resequencing，structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
分析。现在对这方面了解甚少。
个人觉得comparative genomics还是有很多可做，但是至今个人的paper档次很低，都
是bmc之类。而且comparative genomics做多了，觉得不是很有motivation，NGS感觉可
是说出不少临床的应用来，觉得工作更有价值些，呵呵。
一直在单枪匹马干（老板是放羊型），觉得特别吃力。工作不系统，打一枪换个地方。
老板也推荐了几个博后的组，方向都和博士比较接近，中等学校（top 10~20），4，5
个人，平均每年能搞一篇5到10的中游文章，没有啥collaboration（自然也不会有
coauthor的文章），觉得这样下来博后做完也没啥竞争力。
另外和一个做metabolomics湿实验的老板也谈了下，他貌似很反对去sequencing
center。觉得那个东西不能持久。但是感觉他有点偏激，貌似对NGS也不是很了解。
请牛人们指点下哪个方向比较有前途？个人想呆在学术界。谢谢！！ |
g*****n
发帖数: 250 | 2 这是个技术型工作，没有很多“科学”成分。前景就是到中心实验室敲键盘，为别人的
科学服务。 |
u*********1
发帖数: 2518 | 3 我觉得这都算一个大方向吧
comparative genomics或许是更偏evolution？但估计也是和sequence打交道吧？
你说的好发paper的，估计都是和人类疾病有关的把？
所以我觉得你的phd training的东西肯定也可以用上的，只不过evolution是冷门，更
理论。。。
【在 x*******6 的大作中提到】
: 小弟最近在申请博后，博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析，
: 主要是细菌的，博士组里的强项是phylogenetic network，个人的生信背景偏
: phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
: 同学发了一水的牛paper，很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能，比如
: assembly，resequencing，structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
: 分析。现在对这方面了解甚少。
: 个人觉得comparative genomics还是有很多可做，但是至今个人的paper档次很低，都
: 是bmc之类。而且comparative genomics做多了，觉得不是很有motivation，NGS感觉可
: 是说出不少临床的应用来，觉得工作更有价值些，呵呵。
: 一直在单枪匹马干（老板是放羊型），觉得特别吃力。工作不系统，打一枪换个地方。
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x*******6
发帖数: 6 | 4 其实我觉得为别人的科学服务也算是为科学做贡献啦，我特佩服那些搞出几个方法/软
件n多人使用的。现在自己搞的东西有点自弹自唱的感觉，唉。
【在 g*****n 的大作中提到】
: 这是个技术型工作，没有很多“科学”成分。前景就是到中心实验室敲键盘，为别人的
: 科学服务。
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x*******6
发帖数: 6 | 5 你说的对，我们也和sequence打交道，不过都是下载NCBI人家注解好的全序列。我们其
实主要做的就是evolution，物种树基因树reconciliation啥的。
觉得人类疾病是个大picture，想上个大船，将来拉钱找工作比纯evolution容易些。
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我觉得这都算一个大方向吧
: comparative genomics或许是更偏evolution？但估计也是和sequence打交道吧？
: 你说的好发paper的，估计都是和人类疾病有关的把？
: 所以我觉得你的phd training的东西肯定也可以用上的，只不过evolution是冷门，更
: 理论。。。
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O******e
发帖数: 4845 | 6 现在对NGS data analysis的需求比较大。你可以试着找找比较大的实验室有没有机会。
【在 x*******6 的大作中提到】
: 小弟最近在申请博后，博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析，
: 主要是细菌的，博士组里的强项是phylogenetic network，个人的生信背景偏
: phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
: 同学发了一水的牛paper，很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能，比如
: assembly，resequencing，structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
: 分析。现在对这方面了解甚少。
: 个人觉得comparative genomics还是有很多可做，但是至今个人的paper档次很低，都
: 是bmc之类。而且comparative genomics做多了，觉得不是很有motivation，NGS感觉可
: 是说出不少临床的应用来，觉得工作更有价值些，呵呵。
: 一直在单枪匹马干（老板是放羊型），觉得特别吃力。工作不系统，打一枪换个地方。
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