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Biology版 - (包子问)ex vivo培养的组织提RNA后,用什么内参比较靠谱?
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18S rRNA做内参的问题请问real-time PCR negative control的Ct值的问题
用细胞核蛋白做WB,可以用b-actin做内参不?qPCR amplication curve- does anyone see this before?
请问一个WB的内参问题请教stromal vascular fraction (SVF) from white adipose tissue 的几个问题
完全的外行问一个NGS的问题。。。GAPDH的Ct值在30以上,这结果还可靠不?
Dual luciferase的内参问题ChIP –HA/IgG binding在不同样品间有差异怎么消除?
Re: northern blotting problem作array cluster analysis的时候 用Pearson correlation和Euclidean Distance有什么区别?
土问:能不能在一个RT里放多个primer?再问两个关于ChIP的问题
real time pcr RNA起始浓度或者cDNA起始浓度求教qPCR normalization gene 选择
相关话题的讨论汇总
话题: rna话题: 内参话题: vivo话题: ex话题: 靠谱
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l******g
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1
我现在在做些ex vivo的实验,就是把mouse的主动脉分离出来后,放在培养基里养三天
,同时加药。三天后收集样品提rna,然后profiling下各基因的表达,看是否和in
vitro的结果一致。
如果分离主动脉后立刻提rna,结果一直很好。但现在ex vivo养了几天后,碰到了些问
题。
1,培养几天后,能提出来的rna量急剧减少,感觉养几天后组织不是很健康的原因。少
归少,但还是够做rt之类的后续。
2,我通常用18S和gapdh做realtime pcr的内参。但郁闷的是,在加药处理的样品里,这
两个基因的表达也呼呼的往上升,甚至比要检测的其他基因升得都要高。以至于
normalize后,根本看不到变化,甚至是相反的变化。ps,在做rt的时候,每个样品我
都加了相同量的rna,按经验来说,内参应该非常接近,曲线几乎都重合在一起才对。
现求问怎么破?
我感觉技术上没什么问题,最简单的就是换一个比较stable的内参(尤其是心血管系统
内的)。
求有经验的推荐!一经验证work的话,双黄包奉上!
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求教qPCR normalization gene 选择Dual luciferase的内参问题
请教一下WB蛋白定量的统计学分析Re: northern blotting problem
请教个QPCR的问题土问:能不能在一个RT里放多个primer?
关于qRT-PCRreal time pcr RNA起始浓度或者cDNA起始浓度
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