A***a 发帖数: 255 | 1 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上,而
Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢?此small ncRNA不曾被研究,功能一无所
知。 |
s******s 发帖数: 13035 | 2 找一堆RNA类似物把这玩意儿block了看phenotype?
【在 A***a 的大作中提到】 : 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上,而 : Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢?此small ncRNA不曾被研究,功能一无所 : 知。
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x*****d 发帖数: 704 | 3 next: miRNA structure prediction and targets prediction. |
s******s 发帖数: 13035 | 4 人家没说是mirna吧
【在 x*****d 的大作中提到】 : next: miRNA structure prediction and targets prediction.
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a***l 发帖数: 32 | 5 clip-seq研究的是此蛋白bind small RNA,这个数据太表象了.......你要做此蛋白还是
做small RNA啊.....还是要做蛋白结合small RNA的function significance....
若此small rna功能都未知,建议先做small rna classification/function, RNAi,
overexpression study function et al...
但你做clip-seq很明显侧重点是你那个RNA binding protein而不是small rna, 如果此
small rna功能都未知,这种superficial binding data不值得深入,........that's my
suggestion... |
A***a 发帖数: 255 | 6 this is what i tried first.
only found one miRNA homolog,but no targets found
【在 x*****d 的大作中提到】 : next: miRNA structure prediction and targets prediction.
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A***a 发帖数: 255 | 7 开始是做这个RBP,是个splicing factor,可做了几年都没有大突破,发现这个binding
,想着能不能有些新东西。
my
【在 a***l 的大作中提到】 : clip-seq研究的是此蛋白bind small RNA,这个数据太表象了.......你要做此蛋白还是 : 做small RNA啊.....还是要做蛋白结合small RNA的function significance.... : 若此small rna功能都未知,建议先做small rna classification/function, RNAi, : overexpression study function et al... : 但你做clip-seq很明显侧重点是你那个RNA binding protein而不是small rna, 如果此 : small rna功能都未知,这种superficial binding data不值得深入,........that's my : suggestion...
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c********b 发帖数: 363 | 8 说不定是别人已经报导过的这种现象
http://www.nature.com/nrm/journal/v14/n4/full/nrm3557.html
【在 A***a 的大作中提到】 : 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上,而 : Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢?此small ncRNA不曾被研究,功能一无所 : 知。
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