c******i
发帖数: 137 | 1 我们文章里面一个图是bar graph，比较的是不同模型小鼠发病率，如组a是80%， 组b
是40%,所以没有error bar, 有两个reviewer都指出这个问题。求教高手，对这类发生
率的统计图，好像用bar graph不太对，怎样present? 用什么test来比较各组差异？能
举个文章figure的例子就最好了(小鼠实验研究的）。多谢了。 |
D*a
发帖数: 6830 | |
c******i
发帖数: 137 | 3 谢谢，我也想到过，chi square 临床研究用的很多，但不知道怎么作图present到
figure里，好像做小鼠的很少见这种分析，如果能找到研究论文的例子就好了 |
s******s
发帖数: 13035 | 4 如果每组样本比较多， 编个error bar出来画bar graph就行了，
se = sqrt(np(1-p)), bionormial to normal distribution, 就是
把每个小鼠看成一个实验，那就是有重复啦。唬弄小编足够了。
b
【在 c******i 的大作中提到】
: 我们文章里面一个图是bar graph，比较的是不同模型小鼠发病率，如组a是80%， 组b
: 是40%,所以没有error bar, 有两个reviewer都指出这个问题。求教高手，对这类发生
: 率的统计图，好像用bar graph不太对，怎样present? 用什么test来比较各组差异？能
: 举个文章figure的例子就最好了(小鼠实验研究的）。多谢了。
|
q****k
发帖数: 1023 | 5 把每组的样本量也标上（在x-axis），有些帮助。
两组数据是来自独立的不同小鼠么？如果是， Chi-squared， 或者Fisher‘s Exact
Test。
如果两组数据是相干的（这种情况也是有可能的），也即同一个小鼠产生a组的数据，
也产生b组的数据, McNemar's test.
b
【在 c******i 的大作中提到】
: 我们文章里面一个图是bar graph，比较的是不同模型小鼠发病率，如组a是80%， 组b
: 是40%,所以没有error bar, 有两个reviewer都指出这个问题。求教高手，对这类发生
: 率的统计图，好像用bar graph不太对，怎样present? 用什么test来比较各组差异？能
: 举个文章figure的例子就最好了(小鼠实验研究的）。多谢了。
|
c******i
发帖数: 137 | 6 谢谢几位的回复，@shakuras: 这是个好办法，就是愁没有error bar, 我对chi squre
不太熟悉，您能否给个这个方法的链接？我好说服老板（她很叫针）;@qquick: 我觉得
我们的数据应该是不相关的，chi square 和 fisher's 有什么区别呢？有没有网站可
以做这个test?多谢了 |
l**********1
发帖数: 5204 | 7 >chi square 和 fisher's 有什么区别呢？
pls go to
http://www.talkstats.com/showthread.php/4669-Chi-square-Vs.-Fis
13th floor
有没有网站可以做这个test?
http://statpages.org/pdfs.html
more about
chi square test:
pls go to,
http://www.fmi.uni-sofia.bg/vesta/Virtual_Labs/special/special3
about
>The Sample Mean
Contents
>Estimation
>The Sample Mean and the Law of Large Numbers
>Relative Frequency and Empirical Distributions
>The Sample Variance
>The Central Limit Theorem
The Sample Mean and Variance from a Normal Sample
http://www.fmi.uni-sofia.bg/vesta/Virtual_Labs/sample/sample0.h
more online E-books about Statistics,
http://www.fmi.uni-sofia.bg/vesta
squre
【在 c******i 的大作中提到】
: 谢谢几位的回复，@shakuras: 这是个好办法，就是愁没有error bar, 我对chi squre
: 不太熟悉，您能否给个这个方法的链接？我好说服老板（她很叫针）;@qquick: 我觉得
: 我们的数据应该是不相关的，chi square 和 fisher's 有什么区别呢？有没有网站可
: 以做这个test?多谢了
|
s******s
发帖数: 13035 | 8 我说的不是chi-square.
你原来的理解是做了两个实验，一个是a组，结果是80%；
另一个是B组，结果是40%, 相当于两个normal在比较，当然
没有repeat, 没有error bar.
但是同样的实验也可以这样理解。a组一共m只老鼠，每只老鼠
相当于一次扔硬币的实验，结果是0或者1，也就是m个binormial
的实验，同样也有n个b组的实验。那就有repeat和error bar了。
m个binormial计算上用normal来近似，google binormial to
normal approximation，就是我给出来的error bar.
有paper这样用的，比如这个http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2733793
/table/T1/
squre
【在 c******i 的大作中提到】
: 谢谢几位的回复，@shakuras: 这是个好办法，就是愁没有error bar, 我对chi squre
: 不太熟悉，您能否给个这个方法的链接？我好说服老板（她很叫针）;@qquick: 我觉得
: 我们的数据应该是不相关的，chi square 和 fisher's 有什么区别呢？有没有网站可
: 以做这个test?多谢了
|
s******y
发帖数: 28562 | 9 你的老鼠是分多少批做的？每批次之间的数据应该看成是独立重复来求平均值和error
bar.
如果你是一次性只做了一批，其实严格来说是不对的，应该独立的重复至少三批。但是
如果你们那个实验非常难做，而且你们第一次已经做了比较大的数量（比方说超过30只
），那么可以把那些老鼠内部随机的分开（比方说不同的笼子当成一个重复），然后用
来算平均值和error bar。
b
【在 c******i 的大作中提到】
: 我们文章里面一个图是bar graph，比较的是不同模型小鼠发病率，如组a是80%， 组b
: 是40%,所以没有error bar, 有两个reviewer都指出这个问题。求教高手，对这类发生
: 率的统计图，好像用bar graph不太对，怎样present? 用什么test来比较各组差异？能
: 举个文章figure的例子就最好了(小鼠实验研究的）。多谢了。
|
c******i
发帖数: 137 | 10 谢谢几位大侠的回复，尤其是lotkaeuler11，资料非常详细，终于被扫盲了。针对我们
的数据，由于有一组数据量小于5，适合用fisher's exact test，已经在处理数据了，
现在只是对error bar还没太搞清楚，不过想直接采用shakuras的建议，就说 Standard
errors are estimated as (percentage x (1-percentage) / n) 1/2，不知道
reviewer给不给放，先试试看，多谢了。Acknowledgements list: Dua, shakuras,
qquick, lotkaeuler11, and sunnyday. |
z*******6
发帖数: 679 | 11 这是不是应该用contingency table做啊？不用bar graph了... 然后chi square... |
