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Biology版 - 怎样少做实验又获得尽可能多的data?
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求助个qPCR 问题:载体有扩增, 基因组DNA上没扩增EMSA 的问题
qPCR with genomic DNA backgroundssDNA怎么作成dsDNA
不转行的原因是念旧“我国自主研发的DNA测序仪”
问一个学术问题: 怎样高通量地测量基因表达水平?DNA高通量测序发展那么快,蛋白质怎么没进步?
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俺来介绍一把Re: what is DNA shaffling?请推荐好的DNase
高通量DNA测序技术在生物学研究的应用超微量DNA模板PCR ,0.01 pg 以下
how to make biology to become more quantitative再问两个关于ChIP的问题
相关话题的讨论汇总
话题: 实验话题: data话题: 获得话题: 尽可能话题: dna
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V******t
发帖数: 444
1
感觉生物实验没办法啊,光凭讨论是不可能有结论的,没有做那个western、qPCR,你
就是不知道这个基因的变化。要做这个实验吧,你就得处理细胞,打老鼠,就得仔细分
细胞、换液,稍微不注意就状态不好了。然后忙忙碌碌提蛋白、跑胶做western,一次
加样几十个,等等。
忙忙碌碌中,一天一个星期一个月就这个过去了。根本没有时间读文献思考,也没有时
间出去玩耍,也没有时间看闲书看电影逛街美食,人生就这么荒废了。
有没有什么办法,少做实验,尽可能多的获得data?
我觉得一个可能是做deep seq,简单的实验就获得一些DNA,拿去测序,就能得到花花
绿绿一堆分析。
还有什么办法,可以尽可能地少做实验,但是却获得很多data吗?
V******t
发帖数: 444
2
我想来想去,解决方案:
1. 需要自己努力方面:
做一个实验前要仔细设计,准备好,要准确,每个结论不管是positive还是negative,
保证都是可靠的。工作要有很好的时间计划。
2. 需要外部环境:
要去有钱的地方,能买就买,花钱换时间。比如做一个shRNA,我得去查了序列,合成
DNA,annealing,切载体,跑胶回收,连接转化,鉴定测序,前后一个星期,劳动时间
7个小时;而有钱的实验室直接就买了,剩下6个小时就可以逛街愉快滴玩耍了。
再比如配buffer,LB,SDS胶等等,有钱的地方都是买预制的,也能节约一些劳动,一
周节约3个小时吧。还有像数细胞仪、mini prep、western洗膜、immunoprecipitation
等等,都有自动化的仪器,有钱的实验室都会配上这些自动器。平均每天也能省1小时
出来。还有维护老鼠等等,有钱的地儿也统统不用自己管。每周能节约7个小时,去看
文献,去炒股、去代购、去逛街玩耍,都可以。
3. 自己和外部环境都需要:
千万别做耗费劳动力的实验课题,一次做几十个western,十几板qPCR之类的。
而是尽量做能高通量的课题,比如自动化筛选、简单实验获得点DNA就上deep seq,MS
/MS之类的。可以很少的实验,然后下面做生物信息分析,很快就获得很多data。几个
月就有很多data,组会show完,就可以去海边度假了。
a*********n
发帖数: 2526
3
编数据

【在 V******t 的大作中提到】
: 感觉生物实验没办法啊,光凭讨论是不可能有结论的,没有做那个western、qPCR,你
: 就是不知道这个基因的变化。要做这个实验吧,你就得处理细胞,打老鼠,就得仔细分
: 细胞、换液,稍微不注意就状态不好了。然后忙忙碌碌提蛋白、跑胶做western,一次
: 加样几十个,等等。
: 忙忙碌碌中,一天一个星期一个月就这个过去了。根本没有时间读文献思考,也没有时
: 间出去玩耍,也没有时间看闲书看电影逛街美食,人生就这么荒废了。
: 有没有什么办法,少做实验,尽可能多的获得data?
: 我觉得一个可能是做deep seq,简单的实验就获得一些DNA,拿去测序,就能得到花花
: 绿绿一堆分析。
: 还有什么办法,可以尽可能地少做实验,但是却获得很多data吗?

V******t
发帖数: 444
4
不包括歪门邪道的。

【在 a*********n 的大作中提到】
: 编数据
x********e
发帖数: 35261
5
前两条认同,而且现在有很多节约时间的新技术新试剂,应该多关注多应用
最后高通量不合理。高通量看着data多,但实际意义不一定大。而且data mining也是
非常耗时耗精力的,你还不一定能做。如果实验室里有专门的bioinformatist那就另说

immunoprecipitation

【在 V******t 的大作中提到】
: 我想来想去,解决方案:
: 1. 需要自己努力方面:
: 做一个实验前要仔细设计,准备好,要准确,每个结论不管是positive还是negative,
: 保证都是可靠的。工作要有很好的时间计划。
: 2. 需要外部环境:
: 要去有钱的地方,能买就买,花钱换时间。比如做一个shRNA,我得去查了序列,合成
: DNA,annealing,切载体,跑胶回收,连接转化,鉴定测序,前后一个星期,劳动时间
: 7个小时;而有钱的实验室直接就买了,剩下6个小时就可以逛街愉快滴玩耍了。
: 再比如配buffer,LB,SDS胶等等,有钱的地方都是买预制的,也能节约一些劳动,一
: 周节约3个小时吧。还有像数细胞仪、mini prep、western洗膜、immunoprecipitation

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