r**********e
发帖数: 587 | 1 PhD临近毕业。老板MD，主要做disease genetics,PhD前半部分是纯bioinformatics，
寻找疾病mutation或者risk lock；后半部分就是研究这些位点的功能，做了很多实验
分子细胞RNA等等基础研究（已后悔）。好处是啥都懂一些，坏处是不精通。
未来的事业方向我非常非常清楚和坚定，就是clinical genetics，只想做临床or疾病
的基因组分析，坚决不做基础生物研究。但有个选择问题是继续一半实验+一半生物信
息的模式，还是下定决心彻底做生物信息
1. 一半实验+一半生物信息：还是对有实际应用价值的医学基因组学很有热情，而且很
看好未来personalized medicine的市场。不是很希望变成完成的纯bioinformatician
然后彻底往CS转。如果选择这条路，是不是American Board of Medical Genetics是最
好归宿？又要NGS分析又要做些实验又有临床价值。
2. 彻底生物信息：好处是可以彻底告别bench，不用为做不出实验而烦恼。但我毕竟只
有半个phd是搞NGS的，觉得跟那些纯bioinformatics的phd竞争没有竞争力。
另外还有一个问题：类似我这样的fresh PhD找公司有戏吗？
我个人倒是想继续去大MD老板那儿做postdoc再学习学习，当然也是过渡（同时也是为
了先拿到身份？），为以后考ABMG或者去公司做铺垫。。。
真心求建议。谢谢大家。 |
d***s
发帖数: 1062 | 2 直接bioinformatics吧，别纠结了。
真羡慕你～ |
r**********e
发帖数: 587 | 3 可问题是，我现在只有半个PhD算bioinformatics，我现在去申请大MD lab的纯
bioinformatician position，您觉得我会有offer吗？如何竞争得过那些pure
bioinformatician？
【在 d***s 的大作中提到】
: 直接bioinformatics吧，别纠结了。
: 真羡慕你～
|
d***s
发帖数: 1062 | |
r**********1
发帖数: 1004 | 5 你在做bioinformatics的时候，是就用一些现成的software, package呢（比如
alignment）, 还是自己写一些algorithm? 你是用 perl , R， python，matlab C++写
程序吗？ 做一些统计分析吗， 比如 model such as mixed model etc, hypothesis
test, parameter estimations? 这些应该在工作中会有用到。 |
r**********e
发帖数: 587 | 6 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
structural variation）
会一些python perl R，但都是皮毛
完全没做过统计分析
我的工作主要就是寻找 genetic variation....
这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
【在 r**********1 的大作中提到】
: 你在做bioinformatics的时候，是就用一些现成的software, package呢（比如
: alignment）, 还是自己写一些algorithm? 你是用 perl , R， python，matlab C++写
: 程序吗？ 做一些统计分析吗， 比如 model such as mixed model etc, hypothesis
: test, parameter estimations? 这些应该在工作中会有用到。
|
j*******u
发帖数: 81 | 7 楼主bioinfomatic和bench这样看来都弱得可以
这个bioinfomatics和大多数学bench的要用到自学的差不多
bench按楼主形容的也基本没什么训练
【在 r**********e 的大作中提到】
: 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）
: 会一些python perl R，但都是皮毛
: 完全没做过统计分析
: 我的工作主要就是寻找 genetic variation....
: 这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
|
r**********e
发帖数: 587 | 8 所以应该咋办
【在 j*******u 的大作中提到】
: 楼主bioinfomatic和bench这样看来都弱得可以
: 这个bioinfomatics和大多数学bench的要用到自学的差不多
: bench按楼主形容的也基本没什么训练
|
r**********1
发帖数: 1004 | 9 千万不要气馁， 你可以自己学一些programming, 也可以上一些课， 不过一定要做一
些projects来practice.我是纯粹的bench出来的， 发了些JBC, cancer research。 当
年就是cell culture, electrophoresis, design plasmid, PCR。后来实在对bench
work不感兴趣， 转到statistics, 硬着头皮读了个 Ph.D. 我一开始连p value都不是
很清楚。 Programming一开始头大得不行。 经常在网上问一些我都觉得幼稚的
programming
问题（e.g Stack overflow）. 但是经过做了几个projects， 我写了 1.5个 R
package (有半个其实是debug性质) 也用perl python做了一个大project(就是鄙人的
Ph.D dissertation). 也用matlab帮导师做了一个engineering的project。 所以你只
要肯学， 肯定没问题。 一定要有信心。 过程痛苦， 但是是值得的。 与君共勉
【在 r**********e 的大作中提到】
: 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）
: 会一些python perl R，但都是皮毛
: 完全没做过统计分析
: 我的工作主要就是寻找 genetic variation....
: 这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
|
i***l
发帖数: 1656 | 10 没做过不等于学不会也不等于一学就会。看自己对自己的评价了。的确有写的程序连编
译都过不了的人。
博后Offer总能拿到的。关键是你想往哪走。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 所以应该咋办
|
|
|
r**********e
发帖数: 587 | 11 这个我也绝对相信。
你说的programming，stack overflow，perl的过程我都已经经历过了。
但因为project需求，我做了一般就跑去做benchwork了
现在面临毕业，，，找工作。。。都没有时间机会去做纯生物信息的project了
怪我天真幼稚的希望bench和计算，生物和医学疾病都沾到，最后反而大而不精
所以，现在咋办呢？如果我现在去申请bioinformatics的postdoc的position，估计没
人要。。。
programming
【在 r**********1 的大作中提到】
: 千万不要气馁， 你可以自己学一些programming, 也可以上一些课， 不过一定要做一
: 些projects来practice.我是纯粹的bench出来的， 发了些JBC, cancer research。 当
: 年就是cell culture, electrophoresis, design plasmid, PCR。后来实在对bench
: work不感兴趣， 转到statistics, 硬着头皮读了个 Ph.D. 我一开始连p value都不是
: 很清楚。 Programming一开始头大得不行。 经常在网上问一些我都觉得幼稚的
: programming
: 问题（e.g Stack overflow）. 但是经过做了几个projects， 我写了 1.5个 R
: package (有半个其实是debug性质) 也用perl python做了一个大project(就是鄙人的
: Ph.D dissertation). 也用matlab帮导师做了一个engineering的project。 所以你只
: 要肯学， 肯定没问题。 一定要有信心。 过程痛苦， 但是是值得的。 与君共勉
|
r**********e
发帖数: 587 | 12 bioinformatics的博后offer也能拿到么
【在 i***l 的大作中提到】
: 没做过不等于学不会也不等于一学就会。看自己对自己的评价了。的确有写的程序连编
: 译都过不了的人。
: 博后Offer总能拿到的。关键是你想往哪走。
|
i***l
发帖数: 1656 | 13 能，怎么不能，博后而已，多金贵么？
多申 别太挑地方学校
【在 r**********e 的大作中提到】
: bioinformatics的博后offer也能拿到么
|
m***T
发帖数: 11058 | 14 如果真能走通ABMG，会比纯bioinfo好很多
bioinformatician
【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD临近毕业。老板MD，主要做disease genetics,PhD前半部分是纯bioinformatics，
: 寻找疾病mutation或者risk lock；后半部分就是研究这些位点的功能，做了很多实验
: 分子细胞RNA等等基础研究（已后悔）。好处是啥都懂一些，坏处是不精通。
: 未来的事业方向我非常非常清楚和坚定，就是clinical genetics，只想做临床or疾病
: 的基因组分析，坚决不做基础生物研究。但有个选择问题是继续一半实验+一半生物信
: 息的模式，还是下定决心彻底做生物信息
: 1. 一半实验+一半生物信息：还是对有实际应用价值的医学基因组学很有热情，而且很
: 看好未来personalized medicine的市场。不是很希望变成完成的纯bioinformatician
: 然后彻底往CS转。如果选择这条路，是不是American Board of Medical Genetics是最
: 好归宿？又要NGS分析又要做些实验又有临床价值。
|
o*****p
发帖数: 2977 | 15 申请bioinformatics 博后绝对够了。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）
: 会一些python perl R，但都是皮毛
: 完全没做过统计分析
: 我的工作主要就是寻找 genetic variation....
: 这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
|
r**********e
发帖数: 587 | 16 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
等都非常fit这个ABMG
但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
【在 m***T 的大作中提到】
: 如果真能走通ABMG，会比纯bioinfo好很多
:
: bioinformatician
|
r**********e
发帖数: 587 | 17 不知道能否展开说说。。
谢谢
【在 o*****p 的大作中提到】
: 申请bioinformatics 博后绝对够了。
|
o*****p
发帖数: 2977 | 18 申请一下就知道了。大部分bioinfor的工作不是为了研究新的算法而是为了研究生物
问题。你这背景直接就能上手。所以大部分bioinfor你的情况都够了。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 不知道能否展开说说。。
: 谢谢
|
m***T
发帖数: 11058 | 19 ABMG过了培训期基本上也不太用自己做bench实验了，一般的position多是director of
clinical lab，不管是在academic hospitals或是reference labs，还有一些
community hospitals也有类似的实验室。
好点儿的专业竞争都会很激烈，有心理准备就好
皮了
【在 r**********e 的大作中提到】
: 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
: 但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
: 不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
: 等都非常fit这个ABMG
: 但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
: 而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
: 们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
|
D*a
发帖数: 6830 | 20 大环境你也看到了，我就不说了。
从另一个角度说，你是更喜欢刷CS题，还是刷杀老鼠养细胞技能？这不就得了。
确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗。什么东西不是学的 |
|
|
r**********e
发帖数: 587 | 21 确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗
狂刷.... You mean go for bioinformatics postdoc position, or transfer to CS
degree?
【在 D*a 的大作中提到】
: 大环境你也看到了，我就不说了。
: 从另一个角度说，你是更喜欢刷CS题，还是刷杀老鼠养细胞技能？这不就得了。
: 确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗。什么东西不是学的
|
s******y
发帖数: 17729 | 22 她自己都不会你问她跟没问一样
CS
【在 r**********e 的大作中提到】
: 确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗
: 狂刷.... You mean go for bioinformatics postdoc position, or transfer to CS
: degree?
|
D*a
发帖数: 6830 | 23 注意你新改的ID。。。
【在 s******y 的大作中提到】
: 她自己都不会你问她跟没问一样
:
: CS
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s******y
发帖数: 17729 | 24 等你不干博士后了或者干生物信息的博士后也行，我就信你给别人说的建议
【在 D*a 的大作中提到】
: 注意你新改的ID。。。
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c***y
发帖数: 615 | 25 有关这个ABMG,愿闻其详, 谢谢了
【在 m***T 的大作中提到】
: 如果真能走通ABMG，会比纯bioinfo好很多
:
: bioinformatician
|
i***l
发帖数: 1656 | 26 http://www.abmgg.org/pages/training_accredprog.shtml
GOOGLE一下，读一下就知道了，以前版上好像也有人价绍过。不过这种Program一般不
好申请，竞争比博后大多了，也看运气。有认识人推荐最好。
有的地方可能更偏向MD，但其实有MD的反而不愿意第一志愿就去，都是当备胎。
【在 c***y 的大作中提到】
: 有关这个ABMG,愿闻其详, 谢谢了
|
s******s
发帖数: 13035 | 27 我说一句。
做科研最忌讳一个人做，累死。啥分析实验一把抓，那是脑子坏掉才这样想，嗯，个人
经验。
你的生物信息是弱点，不过那是参照系太高。其实你还没毕业，博士后还有的是训练，
一两年就够了。其实就你现在的水品，其实也不算差了，你如果不做科研想往业界走，
其实水平不用太高哈，主要是方向要对路。担心找不到薄厚那是瞎操心，现在ngs正火。
其实会做实验也有好处，生物出身的和计算机出身的bioinformatician想东西很不一样。
bioinformatician
【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD临近毕业。老板MD，主要做disease genetics,PhD前半部分是纯bioinformatics，
: 寻找疾病mutation或者risk lock；后半部分就是研究这些位点的功能，做了很多实验
: 分子细胞RNA等等基础研究（已后悔）。好处是啥都懂一些，坏处是不精通。
: 未来的事业方向我非常非常清楚和坚定，就是clinical genetics，只想做临床or疾病
: 的基因组分析，坚决不做基础生物研究。但有个选择问题是继续一半实验+一半生物信
: 息的模式，还是下定决心彻底做生物信息
: 1. 一半实验+一半生物信息：还是对有实际应用价值的医学基因组学很有热情，而且很
: 看好未来personalized medicine的市场。不是很希望变成完成的纯bioinformatician
: 然后彻底往CS转。如果选择这条路，是不是American Board of Medical Genetics是最
: 好归宿？又要NGS分析又要做些实验又有临床价值。
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D*a
发帖数: 6830 | 28 那你再等几个月吧。
【在 s******y 的大作中提到】
: 等你不干博士后了或者干生物信息的博士后也行，我就信你给别人说的建议
|
s******y
发帖数: 17729 | 29 好的，记得告诉我，站内也行哦
【在 D*a 的大作中提到】
: 那你再等几个月吧。
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v*********0
发帖数: 941 | 30 负责任的说，你的背景申bioinfor博后没有问题，很多老板都会喜欢要的 |
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T*G
发帖数: 600 | 31 ABMG program 都喜欢做点research的，你的wet lab experience 是强项，因为
interview时要说个research project.
皮了
【在 r**********e 的大作中提到】
: 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
: 但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
: 不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
: 等都非常fit这个ABMG
: 但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
: 而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
: 们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
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h****n
发帖数: 333 | 32 你的背景申请abmg挺合适的，为什么不试试呢？试了不一定成，但是不试肯定没戏
abmg不要求一定要有postdoc经历，很多phd毕业直接进abmg的
皮了
【在 r**********e 的大作中提到】
: 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
: 但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
: 不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
: 等都非常fit这个ABMG
: 但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
: 而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
: 们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
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c********e
发帖数: 598 | 33 计算机要刷题，和刷试管不是一个级别的。能有刷题的智商，offer很容易的，但很可能
成为终生吗工了。
如果你不行， 可以试试abmg。
abmg以后要发文章的，尤其医学院，但不用写grant. 小医院如果不挣啥钱，是个鸡肋
。 有molecular 很难进的，很多千老来竞争的。有十年遗传工作经验的人要来竞争，
你就不会被
选上。最好选家标本量大的医院，全国就几家。
bioinform 现在会用软件的也太多了。这领域需要的是创新性人才推动行业的发展。你
如果觉得你能找到个niche, 可以玩一下。
|
v**********m
发帖数: 5516 | 34 刷题对大部分985毕业的生物千老来说都不是难题，只要下点决心，毕竟高考筛过一遍
智商和逻辑分析能力。转行马工看起来是比去制药企业上班还更靠谱的职业途径。制药
行业总体上雇佣规模也再缩减，更别提学界的人均经费紧张的问题。
可能
【在 c********e 的大作中提到】
: 计算机要刷题，和刷试管不是一个级别的。能有刷题的智商，offer很容易的，但很可能
: 成为终生吗工了。
: 如果你不行， 可以试试abmg。
: abmg以后要发文章的，尤其医学院，但不用写grant. 小医院如果不挣啥钱，是个鸡肋
: 。 有molecular 很难进的，很多千老来竞争的。有十年遗传工作经验的人要来竞争，
: 你就不会被
: 选上。最好选家标本量大的医院，全国就几家。
: bioinform 现在会用软件的也太多了。这领域需要的是创新性人才推动行业的发展。你
: 如果觉得你能找到个niche, 可以玩一下。
:
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r**********e
发帖数: 587 | 35 PhD临近毕业。老板MD，主要做disease genetics,PhD前半部分是纯bioinformatics，
寻找疾病mutation或者risk lock；后半部分就是研究这些位点的功能，做了很多实验
分子细胞RNA等等基础研究（已后悔）。好处是啥都懂一些，坏处是不精通。
技能方面，不会自己写package，从来就只用现成的package （alignment, GATK,
haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
structural variation）,会一些python perl R，但都是皮毛,完全没做过统计分析
bioinformatics方面我的工作主要就是寻找 genetic variation....这也是为什么我觉
得自己bioinformatics其实很弱。。
未来的事业方向我非常非常清楚和坚定，就是clinical genetics，只想做临床or疾病
的基因组分析，坚决不做基础生物研究。但有个选择问题是继续一半实验+一半生物信
息的模式，还是下定决心彻底做生物信息
1. 一半实验+一半生物信息：还是对有实际应用价值的医学基因组学很有热情，而且很
看好未来personalized medicine的市场。不是很希望变成完成的纯bioinformatician
然后彻底往CS转。如果选择这条路，是不是American Board of Medical Genetics是最
好归宿？又要NGS分析又要做些实验又有临床价值。
2. 彻底生物信息：好处是可以彻底告别bench，不用为做不出实验而烦恼。但我毕竟只
有半个phd是搞NGS的，觉得跟那些纯bioinformatics的phd竞争没有竞争力。
另外还有一个问题：类似我这样的fresh PhD找公司有戏吗？
我个人倒是想继续去大MD老板那儿做postdoc再学习学习，当然也是过渡（同时也是为
了先拿到身份？），为以后考ABMG或者去公司做铺垫。。。
真心求建议。谢谢大家。 |
d***s
发帖数: 1062 | 36 直接bioinformatics吧，别纠结了。
真羡慕你～ |
r**********e
发帖数: 587 | 37 可问题是，我现在只有半个PhD算bioinformatics，我现在去申请大MD lab的纯
bioinformatician position，您觉得我会有offer吗？如何竞争得过那些pure
bioinformatician？
【在 d***s 的大作中提到】
: 直接bioinformatics吧，别纠结了。
: 真羡慕你～
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d***s
发帖数: 1062 | |
r**********1
发帖数: 1004 | 39 你在做bioinformatics的时候，是就用一些现成的software, package呢（比如
alignment）, 还是自己写一些algorithm? 你是用 perl , R， python，matlab C++写
程序吗？ 做一些统计分析吗， 比如 model such as mixed model etc, hypothesis
test, parameter estimations? 这些应该在工作中会有用到。 |
r**********e
发帖数: 587 | 40 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
structural variation）
会一些python perl R，但都是皮毛
完全没做过统计分析
我的工作主要就是寻找 genetic variation....
这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
【在 r**********1 的大作中提到】
: 你在做bioinformatics的时候，是就用一些现成的software, package呢（比如
: alignment）, 还是自己写一些algorithm? 你是用 perl , R， python，matlab C++写
: 程序吗？ 做一些统计分析吗， 比如 model such as mixed model etc, hypothesis
: test, parameter estimations? 这些应该在工作中会有用到。
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j*******u
发帖数: 81 | 41 楼主bioinfomatic和bench这样看来都弱得可以
这个bioinfomatics和大多数学bench的要用到自学的差不多
bench按楼主形容的也基本没什么训练
【在 r**********e 的大作中提到】
: 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）
: 会一些python perl R，但都是皮毛
: 完全没做过统计分析
: 我的工作主要就是寻找 genetic variation....
: 这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
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r**********e
发帖数: 587 | 42 所以应该咋办
【在 j*******u 的大作中提到】
: 楼主bioinfomatic和bench这样看来都弱得可以
: 这个bioinfomatics和大多数学bench的要用到自学的差不多
: bench按楼主形容的也基本没什么训练
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r**********1
发帖数: 1004 | 43 千万不要气馁， 你可以自己学一些programming, 也可以上一些课， 不过一定要做一
些projects来practice.我是纯粹的bench出来的， 发了些JBC, cancer research。 当
年就是cell culture, electrophoresis, design plasmid, PCR。后来实在对bench
work不感兴趣， 转到statistics, 硬着头皮读了个 Ph.D. 我一开始连p value都不是
很清楚。 Programming一开始头大得不行。 经常在网上问一些我都觉得幼稚的
programming
问题（e.g Stack overflow）. 但是经过做了几个projects， 我写了 1.5个 R
package (有半个其实是debug性质) 也用perl python做了一个大project(就是鄙人的
Ph.D dissertation). 也用matlab帮导师做了一个engineering的project。 所以你只
要肯学， 肯定没问题。 一定要有信心。 过程痛苦， 但是是值得的。 与君共勉
【在 r**********e 的大作中提到】
: 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）
: 会一些python perl R，但都是皮毛
: 完全没做过统计分析
: 我的工作主要就是寻找 genetic variation....
: 这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
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i***l
发帖数: 1656 | 44 没做过不等于学不会也不等于一学就会。看自己对自己的评价了。的确有写的程序连编
译都过不了的人。
博后Offer总能拿到的。关键是你想往哪走。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 所以应该咋办
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r**********e
发帖数: 587 | 45 这个我也绝对相信。
你说的programming，stack overflow，perl的过程我都已经经历过了。
但因为project需求，我做了一般就跑去做benchwork了
现在面临毕业，，，找工作。。。都没有时间机会去做纯生物信息的project了
怪我天真幼稚的希望bench和计算，生物和医学疾病都沾到，最后反而大而不精
所以，现在咋办呢？如果我现在去申请bioinformatics的postdoc的position，估计没
人要。。。
programming
【在 r**********1 的大作中提到】
: 千万不要气馁， 你可以自己学一些programming, 也可以上一些课， 不过一定要做一
: 些projects来practice.我是纯粹的bench出来的， 发了些JBC, cancer research。 当
: 年就是cell culture, electrophoresis, design plasmid, PCR。后来实在对bench
: work不感兴趣， 转到statistics, 硬着头皮读了个 Ph.D. 我一开始连p value都不是
: 很清楚。 Programming一开始头大得不行。 经常在网上问一些我都觉得幼稚的
: programming
: 问题（e.g Stack overflow）. 但是经过做了几个projects， 我写了 1.5个 R
: package (有半个其实是debug性质) 也用perl python做了一个大project(就是鄙人的
: Ph.D dissertation). 也用matlab帮导师做了一个engineering的project。 所以你只
: 要肯学， 肯定没问题。 一定要有信心。 过程痛苦， 但是是值得的。 与君共勉
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r**********e
发帖数: 587 | 46 bioinformatics的博后offer也能拿到么
【在 i***l 的大作中提到】
: 没做过不等于学不会也不等于一学就会。看自己对自己的评价了。的确有写的程序连编
: 译都过不了的人。
: 博后Offer总能拿到的。关键是你想往哪走。
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i***l
发帖数: 1656 | 47 能，怎么不能，博后而已，多金贵么？
多申 别太挑地方学校
【在 r**********e 的大作中提到】
: bioinformatics的博后offer也能拿到么
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m***T
发帖数: 11058 | 48 如果真能走通ABMG，会比纯bioinfo好很多
bioinformatician
【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD临近毕业。老板MD，主要做disease genetics,PhD前半部分是纯bioinformatics，
: 寻找疾病mutation或者risk lock；后半部分就是研究这些位点的功能，做了很多实验
: 分子细胞RNA等等基础研究（已后悔）。好处是啥都懂一些，坏处是不精通。
: 技能方面，不会自己写package，从来就只用现成的package （alignment, GATK,
: haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）,会一些python perl R，但都是皮毛,完全没做过统计分析
: bioinformatics方面我的工作主要就是寻找 genetic variation....这也是为什么我觉
: 得自己bioinformatics其实很弱。。
: 未来的事业方向我非常非常清楚和坚定，就是clinical genetics，只想做临床or疾病
: 的基因组分析，坚决不做基础生物研究。但有个选择问题是继续一半实验+一半生物信
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o*****p
发帖数: 2977 | 49 申请bioinformatics 博后绝对够了。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 从来就只用现成的package （alignment, GATK, haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）
: 会一些python perl R，但都是皮毛
: 完全没做过统计分析
: 我的工作主要就是寻找 genetic variation....
: 这也是为什么我觉得自己bioinformatics其实很弱。。
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r**********e
发帖数: 587 | 50 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
等都非常fit这个ABMG
但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
【在 m***T 的大作中提到】
: 如果真能走通ABMG，会比纯bioinfo好很多
:
: bioinformatician
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r**********e
发帖数: 587 | 51 不知道能否展开说说。。
谢谢
【在 o*****p 的大作中提到】
: 申请bioinformatics 博后绝对够了。
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o*****p
发帖数: 2977 | 52 申请一下就知道了。大部分bioinfor的工作不是为了研究新的算法而是为了研究生物
问题。你这背景直接就能上手。所以大部分bioinfor你的情况都够了。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 不知道能否展开说说。。
: 谢谢
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m***T
发帖数: 11058 | 53 ABMG过了培训期基本上也不太用自己做bench实验了，一般的position多是director of
clinical lab，不管是在academic hospitals或是reference labs，还有一些
community hospitals也有类似的实验室。
好点儿的专业竞争都会很激烈，有心理准备就好
皮了
【在 r**********e 的大作中提到】
: 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
: 但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
: 不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
: 等都非常fit这个ABMG
: 但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
: 而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
: 们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
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D*a
发帖数: 6830 | 54 大环境你也看到了，我就不说了。
从另一个角度说，你是更喜欢刷CS题，还是刷杀老鼠养细胞技能？这不就得了。
确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗。什么东西不是学的 |
r**********e
发帖数: 587 | 55 确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗
狂刷.... You mean go for bioinformatics postdoc position, or transfer to CS
degree?
【在 D*a 的大作中提到】
: 大环境你也看到了，我就不说了。
: 从另一个角度说，你是更喜欢刷CS题，还是刷杀老鼠养细胞技能？这不就得了。
: 确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗。什么东西不是学的
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s******y
发帖数: 17729 | 56 她自己都不会你问她跟没问一样
CS
【在 r**********e 的大作中提到】
: 确定了之后就趁这几个月狂刷一下呗
: 狂刷.... You mean go for bioinformatics postdoc position, or transfer to CS
: degree?
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D*a
发帖数: 6830 | 57 注意你新改的ID。。。
【在 s******y 的大作中提到】
: 她自己都不会你问她跟没问一样
:
: CS
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s******y
发帖数: 17729 | 58 等你不干博士后了或者干生物信息的博士后也行，我就信你给别人说的建议
【在 D*a 的大作中提到】
: 注意你新改的ID。。。
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c***y
发帖数: 615 | 59 有关这个ABMG,愿闻其详, 谢谢了
【在 m***T 的大作中提到】
: 如果真能走通ABMG，会比纯bioinfo好很多
:
: bioinformatician
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i***l
发帖数: 1656 | 60 http://www.abmgg.org/pages/training_accredprog.shtml
GOOGLE一下，读一下就知道了，以前版上好像也有人价绍过。不过这种Program一般不
好申请，竞争比博后大多了，也看运气。有认识人推荐最好。
有的地方可能更偏向MD，但其实有MD的反而不愿意第一志愿就去，都是当备胎。
【在 c***y 的大作中提到】
: 有关这个ABMG,愿闻其详, 谢谢了
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s******s
发帖数: 13035 | 61 我说一句。
做科研最忌讳一个人做，累死。啥分析实验一把抓，那是脑子坏掉才这样想，嗯，个人
经验。
你的生物信息是弱点，不过那是参照系太高。其实你还没毕业，博士后还有的是训练，
一两年就够了。其实就你现在的水品，其实也不算差了，你如果不做科研想往业界走，
其实水平不用太高哈，主要是方向要对路。担心找不到薄厚那是瞎操心，现在ngs正火。
其实会做实验也有好处，生物出身的和计算机出身的bioinformatician想东西很不一样。
bioinformatician
【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD临近毕业。老板MD，主要做disease genetics,PhD前半部分是纯bioinformatics，
: 寻找疾病mutation或者risk lock；后半部分就是研究这些位点的功能，做了很多实验
: 分子细胞RNA等等基础研究（已后悔）。好处是啥都懂一些，坏处是不精通。
: 技能方面，不会自己写package，从来就只用现成的package （alignment, GATK,
: haplotype, WGS, exome, RNA-seq,
: structural variation）,会一些python perl R，但都是皮毛,完全没做过统计分析
: bioinformatics方面我的工作主要就是寻找 genetic variation....这也是为什么我觉
: 得自己bioinformatics其实很弱。。
: 未来的事业方向我非常非常清楚和坚定，就是clinical genetics，只想做临床or疾病
: 的基因组分析，坚决不做基础生物研究。但有个选择问题是继续一半实验+一半生物信
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D*a
发帖数: 6830 | 62 那你再等几个月吧。
【在 s******y 的大作中提到】
: 等你不干博士后了或者干生物信息的博士后也行，我就信你给别人说的建议
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s******y
发帖数: 17729 | 63 好的，记得告诉我，站内也行哦
【在 D*a 的大作中提到】
: 那你再等几个月吧。
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v*********0
发帖数: 941 | 64 负责任的说，你的背景申bioinfor博后没有问题，很多老板都会喜欢要的 |
T*G
发帖数: 600 | 65 ABMG program 都喜欢做点research的，你的wet lab experience 是强项，因为
interview时要说个research project.
皮了
【在 r**********e 的大作中提到】
: 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
: 但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
: 不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
: 等都非常fit这个ABMG
: 但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
: 而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
: 们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
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h****n
发帖数: 333 | 66 你的背景申请abmg挺合适的，为什么不试试呢？试了不一定成，但是不试肯定没戏
abmg不要求一定要有postdoc经历，很多phd毕业直接进abmg的
皮了
【在 r**********e 的大作中提到】
: 说实在话，bioinfor对我就是一个混饭吃的。以后可以往CS转
: 但如果走通ABMG，那是我心目中的理想。毕竟我是希望可以真正为病人服务检测的，而
: 不是做一个只能分析数据的programmer。而且我觉得我的背景兴趣和MD大老板的关系等
: 等都非常fit这个ABMG
: 但bioinfor的好处是可以彻底不用做实验了，在家里敲敲键盘就可以舒服的拿点小钱了
: 而ABMG，第一申请起来就极其competitive，一堆经历背景丰富的postdoc都等着呢；我
: 们这种fresh phd不知道是否有戏，第二纵然被录取了估计也是要跟高考一样掉一层皮了
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c********e
发帖数: 598 | 67 计算机要刷题，和刷试管不是一个级别的。能有刷题的智商，offer很容易的，但很可能
成为终生吗工了。
如果你不行， 可以试试abmg。
abmg以后要发文章的，尤其医学院，但不用写grant. 小医院如果不挣啥钱，是个鸡肋
。 有molecular 很难进的，很多千老来竞争的。有十年遗传工作经验的人要来竞争，
你就不会被
选上。最好选家标本量大的医院，全国就几家。
bioinform 现在会用软件的也太多了。这领域需要的是创新性人才推动行业的发展。你
如果觉得你能找到个niche, 可以玩一下。
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v**********m
发帖数: 5516 | 68 刷题对大部分985毕业的生物千老来说都不是难题，只要下点决心，毕竟高考筛过一遍
智商和逻辑分析能力。转行马工看起来是比去制药企业上班还更靠谱的职业途径。制药
行业总体上雇佣规模也再缩减，更别提学界的人均经费紧张的问题。
可能
【在 c********e 的大作中提到】
: 计算机要刷题，和刷试管不是一个级别的。能有刷题的智商，offer很容易的，但很可能
: 成为终生吗工了。
: 如果你不行， 可以试试abmg。
: abmg以后要发文章的，尤其医学院，但不用写grant. 小医院如果不挣啥钱，是个鸡肋
: 。 有molecular 很难进的，很多千老来竞争的。有十年遗传工作经验的人要来竞争，
: 你就不会被
: 选上。最好选家标本量大的医院，全国就几家。
: bioinform 现在会用软件的也太多了。这领域需要的是创新性人才推动行业的发展。你
: 如果觉得你能找到个niche, 可以玩一下。
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r**********e
发帖数: 587 | 69 可问题是，身份很重要啊。。我很confused，到底是不是在学术界在学校拿绿卡的几率
要比industry大的多？
那些CS的还要担心H1B是否抽得到。晕
【在 v**********m 的大作中提到】
: 刷题对大部分985毕业的生物千老来说都不是难题，只要下点决心，毕竟高考筛过一遍
: 智商和逻辑分析能力。转行马工看起来是比去制药企业上班还更靠谱的职业途径。制药
: 行业总体上雇佣规模也再缩减，更别提学界的人均经费紧张的问题。
:
: 可能
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d***s
发帖数: 1062 | 70
看你的文章吧。
opt是fresh PhD找工业界工作的优势。
从学术界找工作去工业界，办H1B的时候比较tricky，公司可能要等你几个月。除非你
很牛，公司招不到像你这样的人才，愿意等你。
【在 r**********e 的大作中提到】
: 可问题是，身份很重要啊。。我很confused，到底是不是在学术界在学校拿绿卡的几率
: 要比industry大的多？
: 那些CS的还要担心H1B是否抽得到。晕
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