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Biology版 - 生物技术各方向,哪些是坑,哪些有未来?请行家进来讲一讲
相关主题
中国将可“无限生产 ”一种稀缺抗癌药 (转载)微生物博士毕业后,从事 分子诊断 行业,靠谱吗?
大家交流一下作大载体的经验吧。问一下,non-GMO的微生物产品是如何保护知识产权的?
求教:我这个E.coli菌株能否用Lambda噬菌体转染CRISPR英雄谱
请教各位如何给国内邮寄菌种?公司招聘微生物发酵生产Manager
快被噬菌体污染搞死了,计将安出?麻省理工张锋最担心的事情发生了
请问有没有人知道“微生物肥料”, 英文名称Microbial fertilizer 的?诺奖事件证明举国攻关是我国的唯一道路
求助-微生物菌株怎么寄回国生物科研方向和技术鄙视链
微生物,bacteria 试验 容易上手吗,前途如何[bssd] 流水账:我在那战斗的7年里(4)
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话题: 生物话题: 模式话题: 微生物话题: 菌种话题: 发酵
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1 (共1页)
x****6
发帖数: 4339
1
nature biotech找来几十个生物技术各个方向前沿的科学家给大家画饼。感觉没有一个
靠谱: http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n3/full/nbt.3502.html
医学相关的red biotech基本上还是daunting,crispr/cas9感觉有点雷声大,雨点小。
因为基因修饰结果的不可预测性,除非是只要有一小部分目标细胞获得正确修改就可以
了,不然这个技术也是很有局限的。
里面很多砖家提到了大数据的作用,问题是生物的大数据除了在遗传病咨询的时候,提
供一些的病的概率,还有什么用?我不是做大数据的,还请行家来解读一下。
工业相关的white biotech应该是受益于迅猛发展的合成生物学最多的。但是第一个商
业化的例子:用酵母生产青蒿素前体,生产线也因为成本太高已经停产一段时间了。
生物技术的工业化未来在哪里?小弟在此作一个引子,请业内人士来和大家分享!
g********0
发帖数: 6201
2
相信你自己的感觉就好。
z*h
发帖数: 773
3
Apply enzyme engineering and synthetic enzymatic systems for
biomanufacturing, especially for white biotechnology. Making first money (
profit) within several years, creating millions of jobs within 20 years.
x****6
发帖数: 4339
4
因为相信感觉和被别人忽悠才跳了生物的坑,直觉固然重要,但是对行业的了解(干货
)更加重要。

【在 g********0 的大作中提到】
: 相信你自己的感觉就好。
c*********r
发帖数: 1312
5
我觉得microbiome可以持续一段时间的热度
测序会在各个领域得到更深入的应用
个人比较喜欢这两个领域,仅供参考。
x****6
发帖数: 4339
6
这两样在学术界确实很热门,请问具体在医学和工业的应用有哪些?

【在 c*********r 的大作中提到】
: 我觉得microbiome可以持续一段时间的热度
: 测序会在各个领域得到更深入的应用
: 个人比较喜欢这两个领域,仅供参考。

h*****4
发帖数: 1158
7
技术太难的难普及,各种疾病的gene检测试剂盒,技术门槛低,但是是精准治疗的前提
,看好混战
x****6
发帖数: 4339
8
基因诊断有breakthrough吗?
之前有个Elizabeth Holmes的一滴血测验结束吵得沸沸扬扬,结果是个笑话。

【在 h*****4 的大作中提到】
: 技术太难的难普及,各种疾病的gene检测试剂盒,技术门槛低,但是是精准治疗的前提
: ,看好混战

j****n
发帖数: 3370
9
看好合成生物学
青蒿素作为目前最成功的例子 主要问题是产品价格太低 主要卖到非洲的 能有几个钱
貌似现在很多大实验室再搞taxol 这个或者重要前体要是成了 市场/命运完全不一样
目前用合成生物学产能源或者大宗化学品 感觉不靠谱 不看好
a****d
发帖数: 1919
10
Monoclonal antibody therapy
相关主题
请问有没有人知道“微生物肥料”, 英文名称Microbial fertilizer 的?微生物博士毕业后,从事 分子诊断 行业,靠谱吗?
求助-微生物菌株怎么寄回国问一下,non-GMO的微生物产品是如何保护知识产权的?
微生物,bacteria 试验 容易上手吗,前途如何CRISPR英雄谱
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x****6
发帖数: 4339
11
我跟你的观点类似。但貌似生物能源这个坑因为政府的扶持一直火到现在。可能是因为
这个关系到国家的战略发展,政府不遗余力、不计成本的砸钱。

【在 j****n 的大作中提到】
: 看好合成生物学
: 青蒿素作为目前最成功的例子 主要问题是产品价格太低 主要卖到非洲的 能有几个钱
: 貌似现在很多大实验室再搞taxol 这个或者重要前体要是成了 市场/命运完全不一样
: 目前用合成生物学产能源或者大宗化学品 感觉不靠谱 不看好

x****6
发帖数: 4339
12
可否稍微展开?

【在 a****d 的大作中提到】
: Monoclonal antibody therapy
j****n
发帖数: 3370
13
单抗是不是主要由hybridoma或者mouse生产的?
人体免疫会不会一个问题?
虽然做antibody humanization的很多 这个问题解决到什么程度了?还是基本都解决了?

【在 a****d 的大作中提到】
: Monoclonal antibody therapy
a****d
发帖数: 1919
14
http://www.bptc.com/sites/default/files/articles/ecker-2015-the

【在 x****6 的大作中提到】
: 可否稍微展开?
z*h
发帖数: 773
15
taxol is a dead end and product, too. Its overall market size of rare
materials is only 2,000,000,000 RMB per year. It is not as important as
thought. A lot of things have market size of far bigger.
Market size will decide what product is important.
Antibody humanization is one of the most important directions.
z*h
发帖数: 773
16
The major stream of 合成生物学产能源或者大宗化学品 go to wrong directions,
Jay Keasling is a cheater or moron. Picking up right products are the key to
success. 99% of academic research activities are non-sense at all.
x****6
发帖数: 4339
17
谢谢分享干货!

【在 a****d 的大作中提到】
: http://www.bptc.com/sites/default/files/articles/ecker-2015-the
x****6
发帖数: 4339
18
我站在学术圈里看,也觉得大部分研究没用,事实上,绝大部分的文章也就是一发表就
沉入浩瀚的文献大海,没有下游的动静了。但我也说不出个所以然,为什么会出现学术
界和工业界几乎完全脱轨这种荒谬的现象。我自己研究的感受是:找不到工业界想要什
么,实际应用的瓶颈是什么:网上和公共数据库自然是找不到;跟工业界的人聊,他们
也不会告诉你。
您认为原因是什么?

to

【在 z*h 的大作中提到】
: The major stream of 合成生物学产能源或者大宗化学品 go to wrong directions,
: Jay Keasling is a cheater or moron. Picking up right products are the key to
: success. 99% of academic research activities are non-sense at all.

c*********r
发帖数: 1312
19
我说一个方向,说的不好,欢迎大家讨论。
我也觉得很多工业界的有价值的东西在学术界是看不到的。比如说现在学术界很少有实
验研究微生物发酵酿造。但在工业界微生物发酵在制药、食品、生产某些原材料等方面
都是至关重要,某些特殊的菌种和发酵工艺都是保密级别的,不可能在公共数据库和文
章里找到的。
现在随着测序、合成生物学、CRISPR等技术的发展,越来越多的微生物资源被测序,所
以就有希望能改良现有菌种和开发新的菌种。如果能把这些技术应用到发酵上,哪怕能
提高生产效率1个百分点或者减少损失的频率,都意味着巨大的利润空间。当年对
CRISPR的发现做出很大贡献的就有欧洲的一个生产酸奶的公司,他们利用对噬菌体有免
疫的菌种来抵御噬菌体对细菌的伤害避免酸奶变坏。
说到酸奶,不知道大家有没有吃过Chobani Greek Yogurt。这是美国销量第一的Greek
Yogurt,这个公司每年销售额有1 billion以上,43岁的owner兼CEO就靠做酸奶身价有
将近2 billion。当然他的成功更多是商业上的成功,但是好的发酵菌株和工艺也是必
不可少的。
再举个例子,八九年前本科时候,国内我们微生物遗传实验室和一些企业合作解决一些
食品发酵生产中的问题,主要是因为菌株污染对生产危害太大。那时候的方案往往有两
个:1.继续采用原有的菌种种子培养,但是发酵几代之后有退化,产量和质量都不稳定
。2.采用单一的纯的优势菌种或者几种优势菌种的培养物来发酵,这样的结果比较好控
制不容易有污染,但是发酵产物的风味单一,没有以前的好。其实风味越好的食物,原
始菌种种类越多,产物里的各种代谢物也越丰富。前段时间还看到新闻说通过测序研究
了老窖产好酒就是因为微生物种类丰富。不过我们那时候二代测序还没有太多应用,很
多微生物又没办法培养,做实验只能靠经验和运气,很多时候分离鉴定没什么结果。和
企业合作的好几个月,最后无果而终。
现在有了二代三代测序和很多分子生物学技术,以前没办法解决的很多重要的微生物发
酵问题肯定会多了很多解决思路,发掘有效的发酵菌株、鉴别污染菌株或者噬菌体、对
污染菌株的防治、对噬菌体免疫、改良改造发酵菌株。。。如果能应用到发酵生产上,
比如老干妈什么的,再添加一些时髦的概念,增加益生菌、促进肠道微生物健康、改善
免疫系统什么的,肯定会有前途/钱途的。
生物的出路和应用其实很广的,但是有个很大的问题,这些方向没有蜂拥而去的制药、
biotech看起来那么高大上,有几个生物PhD会看得上这个方向?有几个生物PhD愿意去
发酵豆豉酿酸奶? ^_^
s******r
发帖数: 1245
20
菌株改良有人做的,我以前也跟着做过一点,问题是你不知道怎么改良,就算把菌株序
列都测出来了也不一定有多大帮助,在学校可以瞎折腾,折腾出来的东西也不一定是业
界需要的一般也发不了什么好paper。
而且改菌株这种事情对企业来说是伤筋动骨的,原有的菌株用着只要不出大问题,一般
企业都不会想着升级啥的,即便要做也是内部几个人搞或者找认识的教授,圈子很窄。

【在 c*********r 的大作中提到】
: 我说一个方向,说的不好,欢迎大家讨论。
: 我也觉得很多工业界的有价值的东西在学术界是看不到的。比如说现在学术界很少有实
: 验研究微生物发酵酿造。但在工业界微生物发酵在制药、食品、生产某些原材料等方面
: 都是至关重要,某些特殊的菌种和发酵工艺都是保密级别的,不可能在公共数据库和文
: 章里找到的。
: 现在随着测序、合成生物学、CRISPR等技术的发展,越来越多的微生物资源被测序,所
: 以就有希望能改良现有菌种和开发新的菌种。如果能把这些技术应用到发酵上,哪怕能
: 提高生产效率1个百分点或者减少损失的频率,都意味着巨大的利润空间。当年对
: CRISPR的发现做出很大贡献的就有欧洲的一个生产酸奶的公司,他们利用对噬菌体有免
: 疫的菌种来抵御噬菌体对细菌的伤害避免酸奶变坏。

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公司招聘微生物发酵生产Manager生物科研方向和技术鄙视链
麻省理工张锋最担心的事情发生了[bssd] 流水账:我在那战斗的7年里(4)
诺奖事件证明举国攻关是我国的唯一道路生物科研的歧途
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x****6
发帖数: 4339
21
谢谢,分享。我觉得你说得很对。我想补充一下,发酵是有一个专门的领域在研究的,
叫代谢通路,一般在化工系下面。不过在实验室里,主要关注的尺度是几个到几十个基
因组成的代谢通路,现在也结合大规模测序,在从食物、环境中采样的菌落中寻找合成
次级代谢产物的基因簇,并在模式微生物中异源表达以期生产化学产品。
去年科学杂志全球十大进展之首就是这样一个课题:在酵母中表达23个基因来生产吗啡
前体,不过生产浓度要提高十万倍才能实现经济价值。
有几个组开始研究由多个菌种组成的菌落了,跟你描述的更加接近,过两年应该会出有
意思的结果。

【在 c*********r 的大作中提到】
: 我说一个方向,说的不好,欢迎大家讨论。
: 我也觉得很多工业界的有价值的东西在学术界是看不到的。比如说现在学术界很少有实
: 验研究微生物发酵酿造。但在工业界微生物发酵在制药、食品、生产某些原材料等方面
: 都是至关重要,某些特殊的菌种和发酵工艺都是保密级别的,不可能在公共数据库和文
: 章里找到的。
: 现在随着测序、合成生物学、CRISPR等技术的发展,越来越多的微生物资源被测序,所
: 以就有希望能改良现有菌种和开发新的菌种。如果能把这些技术应用到发酵上,哪怕能
: 提高生产效率1个百分点或者减少损失的频率,都意味着巨大的利润空间。当年对
: CRISPR的发现做出很大贡献的就有欧洲的一个生产酸奶的公司,他们利用对噬菌体有免
: 疫的菌种来抵御噬菌体对细菌的伤害避免酸奶变坏。

c*********r
发帖数: 1312
22
我不了解这个行业内部的真实情况和企业的想法,不过我猜也是,绝大多数中小企业都
不会愿意去折腾的。有能力做的大多都是有实力的大企业或是竞争很激烈的行业吧。就
像制药公司,不开发新药还有活头吗?
如果企业大多不愿意折腾,我看到的反而是更多的发展空间、更大的市场和更小的竞争
压力。至于能不能做出来、怎么改良,那就是体现水平和积累,加上一些运气的事情了
。很多事情,在做出来之前,也没有多少人会预计出来啊。

【在 s******r 的大作中提到】
: 菌株改良有人做的,我以前也跟着做过一点,问题是你不知道怎么改良,就算把菌株序
: 列都测出来了也不一定有多大帮助,在学校可以瞎折腾,折腾出来的东西也不一定是业
: 界需要的一般也发不了什么好paper。
: 而且改菌株这种事情对企业来说是伤筋动骨的,原有的菌株用着只要不出大问题,一般
: 企业都不会想着升级啥的,即便要做也是内部几个人搞或者找认识的教授,圈子很窄。

c*********r
发帖数: 1312
23
很久没有关注微生物代谢了,谢谢你的分享!原来这个和楼上提到的用酵母表达青蒿素
都是一类的突破,又学习到了很多!
不过我的想法和酵母表达青蒿素、吗啡前体还有点不太一样。这一类的项目是表达酵母
本身不具备的外源产物,让酵母做一些它原本不做的事情。好处是一旦成功,前景和市
场巨大。但是缺点是这些东西都是外源的,每一个中间物是否适合这个细胞环境、是否
对细胞有影响、有没有更好的系统,就像你说的,可能需要很多工作才能(也许不能)
达到实现经济价值。但是肯定是很有前景的。另外瞎扯几句,有没有人试过把这些表达
吗啡前体和青蒿素的基因试着在其它微生物里表达筛选一下,也许有其它更好的微生物
来作为表达宿主。
我的想法是,把各种用于发酵的菌株,我们不让它们做别的事情,就让它们能更好更有
效率地做它们擅长的事情。以前有很多突变育种什么的,筛选出很多高产菌株,但是没
有测序技术,也不知道是哪里突变了。现在完全可以研究是什么代谢通路改变了让产物
效率更高?是哪些代谢通路让某些食物的风味更独特?进一步让这些菌种发挥它们的特
长,从而也会丰富我们对微生物资源、微生物代谢的认识。
微生物是个宝,里边好东西太多了。

【在 x****6 的大作中提到】
: 谢谢,分享。我觉得你说得很对。我想补充一下,发酵是有一个专门的领域在研究的,
: 叫代谢通路,一般在化工系下面。不过在实验室里,主要关注的尺度是几个到几十个基
: 因组成的代谢通路,现在也结合大规模测序,在从食物、环境中采样的菌落中寻找合成
: 次级代谢产物的基因簇,并在模式微生物中异源表达以期生产化学产品。
: 去年科学杂志全球十大进展之首就是这样一个课题:在酵母中表达23个基因来生产吗啡
: 前体,不过生产浓度要提高十万倍才能实现经济价值。
: 有几个组开始研究由多个菌种组成的菌落了,跟你描述的更加接近,过两年应该会出有
: 意思的结果。

x****6
发帖数: 4339
24
用模式生物的好处是基因改造很容易,特别是要调度23个基因来生产一样东西。另外细
胞本身的毒性,副产物研究透彻,对于下游(特别是食品、药物)的安全至关重要。
所以绝大多数的生物药、包括单克隆抗体是模式生物生产的。
你关注的非模式生物生产其天然产物,这个在食品加工等发酵的工业界是主流,开发过
程叫作“菌种开发”,一般也就是大规模系统性的尝试各种条件、筛选突变子以期获得
想要的。但是工业界的人一般也不会告诉你他们具体是怎么弄的,属于商业秘密。

【在 c*********r 的大作中提到】
: 很久没有关注微生物代谢了,谢谢你的分享!原来这个和楼上提到的用酵母表达青蒿素
: 都是一类的突破,又学习到了很多!
: 不过我的想法和酵母表达青蒿素、吗啡前体还有点不太一样。这一类的项目是表达酵母
: 本身不具备的外源产物,让酵母做一些它原本不做的事情。好处是一旦成功,前景和市
: 场巨大。但是缺点是这些东西都是外源的,每一个中间物是否适合这个细胞环境、是否
: 对细胞有影响、有没有更好的系统,就像你说的,可能需要很多工作才能(也许不能)
: 达到实现经济价值。但是肯定是很有前景的。另外瞎扯几句,有没有人试过把这些表达
: 吗啡前体和青蒿素的基因试着在其它微生物里表达筛选一下,也许有其它更好的微生物
: 来作为表达宿主。
: 我的想法是,把各种用于发酵的菌株,我们不让它们做别的事情,就让它们能更好更有

c*********r
发帖数: 1312
25
对,我觉得“菌种开发”会很有前途,尤其是结合测序、合成生物学、Crispr等技术,
可以更好的研究优势菌种和改良菌种。
关于模式生物,我的看法是,当年因为技术手段、对生物的理解、成本等因素的局限,
很多东西不得不在少数模式生物里做。但是每种模式生物之所以是模式生物,因为有它
足够多的优点,同时也意味着着有足够多的缺点。模式生物能解决部分问题,但是科研
和工业发展到现在这个阶段,已经足够有能力同时也需要开发更多的“非模式生物”了。
就在我现在所在的发育领域,由于测序技术的发展,各种有意思“非模式动物”真的就
是雨后春笋般的涌现出来:海葵nematostella, 栉水母ctenophore, 蜗牛,青鳉鱼,
acoel worm, polychaete worm,nemertean worm,等等等等。每种“非模式生物”都
能解决很多有意思的生物问题。
世界那么大,局限在几种模式生物里就太没意思了。

【在 x****6 的大作中提到】
: 用模式生物的好处是基因改造很容易,特别是要调度23个基因来生产一样东西。另外细
: 胞本身的毒性,副产物研究透彻,对于下游(特别是食品、药物)的安全至关重要。
: 所以绝大多数的生物药、包括单克隆抗体是模式生物生产的。
: 你关注的非模式生物生产其天然产物,这个在食品加工等发酵的工业界是主流,开发过
: 程叫作“菌种开发”,一般也就是大规模系统性的尝试各种条件、筛选突变子以期获得
: 想要的。但是工业界的人一般也不会告诉你他们具体是怎么弄的,属于商业秘密。

c*********r
发帖数: 1312
26
“有几个组开始研究由多个菌种组成的菌落了,跟你描述的更加接近,过两年应该会出有
意思的结果。”
这个能介绍一下是哪几个组吗?很想了解一下。^_^

【在 x****6 的大作中提到】
: 谢谢,分享。我觉得你说得很对。我想补充一下,发酵是有一个专门的领域在研究的,
: 叫代谢通路,一般在化工系下面。不过在实验室里,主要关注的尺度是几个到几十个基
: 因组成的代谢通路,现在也结合大规模测序,在从食物、环境中采样的菌落中寻找合成
: 次级代谢产物的基因簇,并在模式微生物中异源表达以期生产化学产品。
: 去年科学杂志全球十大进展之首就是这样一个课题:在酵母中表达23个基因来生产吗啡
: 前体,不过生产浓度要提高十万倍才能实现经济价值。
: 有几个组开始研究由多个菌种组成的菌落了,跟你描述的更加接近,过两年应该会出有
: 意思的结果。

L*******s
发帖数: 59
27
我觉得最不坑也就是说最接近工业界的就是微生物学方向。
一方面 发酵很容易规模化,这个前面的评论也说了
另一方面,合成生物学可以设计生产high value compounds,这个方面可以参考一下
Evolva公司,我听过他们头的讲座,非常promising。他们已经有几十个产品卖出去了
。。。
c*********r
发帖数: 1312
28
刚看了楼主的另一个帖子,才发现楼主是微生物专业的牛人,我的表现真是班门弄斧。
。。
我觉得工业界很好的。有很多很有“未来”的方向和实际的问题要解决。我这种门外汉
了解有限,只能瞎掰。楼主有这么多相关科研经历,多包装包装,公司肯定都是抢着要
呢。
而且一旦进去了,各种信息接触多了,自然会发现更多更好的机会和方向。
x****6
发帖数: 4339
29
我知道有两个组:
一个是研究奶酪的微生物群落:
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867414007
另外一个还没出paper,是MIT/哈佛的几个合成生物学家:timothy lu, pamela silver,
chris voigt等人合作的项目,研究合成菌落,目的是在线虫甚至人的肠道内接种菌落
让宿主吃草就能生存:将来天朝和美帝要是干起仗来,说不定就能用上这个技术。

出有

【在 c*********r 的大作中提到】
: “有几个组开始研究由多个菌种组成的菌落了,跟你描述的更加接近,过两年应该会出有
: 意思的结果。”
: 这个能介绍一下是哪几个组吗?很想了解一下。^_^

x****6
发帖数: 4339
30
我的观点和你在这里有些不一样,我倾向于认同Jacques Monod的观点
What is true for e coli is true for elephant.
模式生物对透彻了解基本的生命机理很重要,非模式生物达不到这个深度,特别是如果
你要驾驭生命以创造社会价值的话。但是生命又和物理不同,具有pluralism,所以确实
需要研究非模式生物,但是应该从模式生物出发,让那些在模式生物开发的技术和知识
变得更加丰满。
我倒是好奇,能不能简单总结一些,在非模式生物中,我们学到了关于发育的什么样的
新知识?

了。

【在 c*********r 的大作中提到】
: 对,我觉得“菌种开发”会很有前途,尤其是结合测序、合成生物学、Crispr等技术,
: 可以更好的研究优势菌种和改良菌种。
: 关于模式生物,我的看法是,当年因为技术手段、对生物的理解、成本等因素的局限,
: 很多东西不得不在少数模式生物里做。但是每种模式生物之所以是模式生物,因为有它
: 足够多的优点,同时也意味着着有足够多的缺点。模式生物能解决部分问题,但是科研
: 和工业发展到现在这个阶段,已经足够有能力同时也需要开发更多的“非模式生物”了。
: 就在我现在所在的发育领域,由于测序技术的发展,各种有意思“非模式动物”真的就
: 是雨后春笋般的涌现出来:海葵nematostella, 栉水母ctenophore, 蜗牛,青鳉鱼,
: acoel worm, polychaete worm,nemertean worm,等等等等。每种“非模式生物”都
: 能解决很多有意思的生物问题。

相关主题
请教行家:Feng Zhang的genome-wide Screening(CRISPR)后面的deep sequencing大家交流一下作大载体的经验吧。
听说韩春雨的工作已经重复出来了求教:我这个E.coli菌株能否用Lambda噬菌体转染
中国将可“无限生产 ”一种稀缺抗癌药 (转载)请教各位如何给国内邮寄菌种?
进入Biology版参与讨论
c*********r
发帖数: 1312
31
哈哈,还真有人把奶酪微生物测了序啊。最喜欢吃Brie了,每周都要吃一盒放熟了的。
Brie外边毛茸茸的一层,各种霉菌,原来叫做Bloomy rind。
后边这个如果真做出来的话真牛!10年就有nature报道,日本人肠道微生物消化吸收海
带能力就特别强,估计出海时候吃海带就像吃菜一样。。。

silver,

【在 x****6 的大作中提到】
: 我知道有两个组:
: 一个是研究奶酪的微生物群落:
: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867414007
: 另外一个还没出paper,是MIT/哈佛的几个合成生物学家:timothy lu, pamela silver,
: chris voigt等人合作的项目,研究合成菌落,目的是在线虫甚至人的肠道内接种菌落
: 让宿主吃草就能生存:将来天朝和美帝要是干起仗来,说不定就能用上这个技术。
:
: 出有

c*********r
发帖数: 1312
32
在发育领域,通过对非模式生物的学习,一个最大的收获就是,你能知道哪些东西是所
有动物里都是在进化上功能一致的、保守的,而不是某个动物所特有的。比如果蝇是胚
胎发育的一个最经典模型,很多基因都是最早在果蝇胚胎发育的突变中鉴定出来并命名
的。但是果蝇早期胚胎发育是合胞体,主要通过细胞核之间的转录因子扩散作用来进行
基因表达调控,而很少涉及到胞外的信号通路。这和绝大多数其它动物都不一样,其它
动物里保守的Wnt/beta-catenin,在果蝇早期就不是相同的作用。如果只通过研究果蝇
胚胎发育就推断出其它物种的胚胎发育也是这样的,那就要闹笑话了。类似的例子有好
多,尤其是果蝇和线虫,都是highly derived的生物,很多问题其实不适合在这两种动
物里做。当然他们也有很多优势和可以解决的问题。
E coli和大象,他们之间相同的东西是相同的,不同的东西是不同的。
你需要把两个动物都研究了,才能知道哪些是相同的,哪些是不同的。只研究E coli,
你是不可能知道有哪些是同样可以应用到大象上的。
我觉得模式动物和非模式动物都得研究,而且是相辅相成相得益彰的。只局限于模式生
物和找相同,是可以找到很多大一统的unified理论和现象,但是那样往往忽视了好多
各个系统独特的属性。而且很多应用都是来自于这些独特的属性。以前之所以专注模式
生物,很大一个原因是开发非模式生物的成本太高、技术有限。现在有了测序等技术技
术、成本也低了,不断开发出新的研究体系肯定是趋势,以后模式生物和非模式生物的
界限肯定越来越模糊。
一点个人拙见。

【在 x****6 的大作中提到】
: 我的观点和你在这里有些不一样,我倾向于认同Jacques Monod的观点
: What is true for e coli is true for elephant.
: 模式生物对透彻了解基本的生命机理很重要,非模式生物达不到这个深度,特别是如果
: 你要驾驭生命以创造社会价值的话。但是生命又和物理不同,具有pluralism,所以确实
: 需要研究非模式生物,但是应该从模式生物出发,让那些在模式生物开发的技术和知识
: 变得更加丰满。
: 我倒是好奇,能不能简单总结一些,在非模式生物中,我们学到了关于发育的什么样的
: 新知识?
:
: 了。

x****6
发帖数: 4339
33
如果胚胎发育受外界信号刺激,那么是如何保证canalisation的不呢?

【在 c*********r 的大作中提到】
: 在发育领域,通过对非模式生物的学习,一个最大的收获就是,你能知道哪些东西是所
: 有动物里都是在进化上功能一致的、保守的,而不是某个动物所特有的。比如果蝇是胚
: 胎发育的一个最经典模型,很多基因都是最早在果蝇胚胎发育的突变中鉴定出来并命名
: 的。但是果蝇早期胚胎发育是合胞体,主要通过细胞核之间的转录因子扩散作用来进行
: 基因表达调控,而很少涉及到胞外的信号通路。这和绝大多数其它动物都不一样,其它
: 动物里保守的Wnt/beta-catenin,在果蝇早期就不是相同的作用。如果只通过研究果蝇
: 胚胎发育就推断出其它物种的胚胎发育也是这样的,那就要闹笑话了。类似的例子有好
: 多,尤其是果蝇和线虫,都是highly derived的生物,很多问题其实不适合在这两种动
: 物里做。当然他们也有很多优势和可以解决的问题。
: E coli和大象,他们之间相同的东西是相同的,不同的东西是不同的。

c*********r
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我说的这个胞外的信号还是由胚胎自身不同区域发出的,分泌到细胞外调控相邻细胞的
基因表达。还是来自胚胎自身的信号,不是外界,只不过是要到细胞外。当然也有受外
界影响的例子。还有就是哺乳动物体内发育,胚胎和母体相互作用很多,有受到母体的
信号诱导。果蝇的早期胚胎发育,大多基因表达调控不通过胞外的信号传递,因为是一
个大的合胞体,细胞质都是连在一起的,有很多细胞核,转录因子就在细胞质中扩散就
能调控周围的“细胞”的基因表达。

【在 x****6 的大作中提到】
: 如果胚胎发育受外界信号刺激,那么是如何保证canalisation的不呢?
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