I*****h
发帖数: 470 | 1 纤维素有内切酶
DNA有内切酶
为啥脂肪酸没有内切酶？
是因为惰性碳碳键？
有没有可能有这种酶？
如果不可能，为什么？ |
g******r
发帖数: 204 | 2 你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶，各种membrane 得有多不稳定？ |
I*****h
发帖数: 470 | 3 嗯，有道理
能人工设计这种酶吗？
【在 g******r 的大作中提到】
: 你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶，各种membrane 得有多不稳定？
|
g******r
发帖数: 204 | 4 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
haloperoxidase或halogenase。 |
I*****h
发帖数: 470 | 5 谢谢！
这种酶是不是理论上不可能在细胞里表达？只能体外合成？
【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。
|
I*****h
发帖数: 470 | 6 你的头像是谁？
【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。
|
l*********d
发帖数: 315 | 7 酶学告诉我们，妹只能加快反应速度，降低能量壁垒，不会改变反应能级。
靠妹砍断碳碳键这种事情还是比较不靠谱，所以有β-oxidation这种天才的方法。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 你的头像是谁？
|
g******r
发帖数: 204 | 8 energy barrier并不是最主要的问题，因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
存在，它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。 |
b*******H
发帖数: 830 | 9 生物的本质是化学，化学的本质是物理。
很多规律是不能违背的。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
|
I*****h
发帖数: 470 | 10 没有进化上的意义，所以没有出现这种酶
【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题，因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在，它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。
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l*********d
发帖数: 315 | 11 这种观点比较拉马克化。
【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题，因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在，它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。
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g******r
发帖数: 204 | 12 并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要cofactor
,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/inhibitor制约。 |
H*******i
发帖数: 196 | 13 有氧化烃类的微生物，随便搜了搜有直接切开苯环的机制，氧化烷烃似乎也是末端或者
倒数第二个碳氧化，这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
不过肯定不是水解。 |
j*********g
发帖数: 463 | 14 细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
[在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到：]
:并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要
cofactor,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/
inhibitor制约。 |
g******r
发帖数: 204 | 15 记不清楚了。它切的是CH键不是CC键吧
【在 j*********g 的大作中提到】
: 细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
: [在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到：]
: :并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
: 。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要
: cofactor,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/
: inhibitor制约。
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I*****h
发帖数: 470 | 16 拉马克?
【在 l*********d 的大作中提到】
: 这种观点比较拉马克化。
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l*********d
发帖数: 315 | 17 用进废退。
通俗地说， 就是哥需要它长，它就进化的长啦。
（不要想歪了！！）
【在 I*****h 的大作中提到】
: 拉马克?
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l*********d
发帖数: 315 | 18 苯环本质上是个C=C键。
【在 H*******i 的大作中提到】
: 有氧化烃类的微生物，随便搜了搜有直接切开苯环的机制，氧化烷烃似乎也是末端或者
: 倒数第二个碳氧化，这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
: 不过肯定不是水解。
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j****n
发帖数: 3370 | 19 有没切双键的酶？感觉会有 hehe
那就通过desaturase引入double bond
然后再切？
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
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t********e
发帖数: 107 | |
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I*****h
发帖数: 470 | 21 对头
【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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I*****h
发帖数: 470 | 22 不算
【在 t********e 的大作中提到】
: Beta-oxidation 算吗？
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g*****x
发帖数: 3283 | 23 C-C bond稳定性很高，如果有能直接切C-C的酶，基本上就见啥杀啥了。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
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g*****x
发帖数: 3283 | 24 胡扯。
【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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t********e
发帖数: 107 | 25 就是共轭大 π键。也是sp2 杂化。不能说就是双键，比较像双键。
【在 g*****x 的大作中提到】
: 胡扯。
|
t********e
发帖数: 107 | 26 酶的能力也很高，氧化还原都没问题的。他有选择性。
【在 g*****x 的大作中提到】
: C-C bond稳定性很高，如果有能直接切C-C的酶，基本上就见啥杀啥了。
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t********e
发帖数: 107 | 27 细胞花费大量ATP合成脂肪酸或者蛋白。是为了储存能量将来释放的。这个角度理解可
以吗？如果只是酶切的话，有需要大量能量去做。
cofactor
【在 g******r 的大作中提到】
: 并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
: 或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要cofactor
: ,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/inhibitor制约。
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I*****h
发帖数: 470 | 28 纤维素有内切酶
DNA有内切酶
为啥脂肪酸没有内切酶？
是因为惰性碳碳键？
有没有可能有这种酶？
如果不可能，为什么？ |
g******r
发帖数: 204 | 29 你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶，各种membrane 得有多不稳定？ |
I*****h
发帖数: 470 | 30 嗯，有道理
能人工设计这种酶吗？
【在 g******r 的大作中提到】
: 你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶，各种membrane 得有多不稳定？
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g******r
发帖数: 204 | 31 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
haloperoxidase或halogenase。 |
I*****h
发帖数: 470 | 32 谢谢！
这种酶是不是理论上不可能在细胞里表达？只能体外合成？
【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。
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I*****h
发帖数: 470 | 33 你的头像是谁？
【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。
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l*********d
发帖数: 315 | 34 酶学告诉我们，妹只能加快反应速度，降低能量壁垒，不会改变反应能级。
靠妹砍断碳碳键这种事情还是比较不靠谱，所以有β-oxidation这种天才的方法。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 你的头像是谁？
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g******r
发帖数: 204 | 35 energy barrier并不是最主要的问题，因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
存在，它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。 |
b*******H
发帖数: 830 | 36 生物的本质是化学，化学的本质是物理。
很多规律是不能违背的。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
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I*****h
发帖数: 470 | 37 没有进化上的意义，所以没有出现这种酶
【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题，因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在，它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。
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l*********d
发帖数: 315 | 38 这种观点比较拉马克化。
【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题，因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在，它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。
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g******r
发帖数: 204 | 39 并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要cofactor
,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/inhibitor制约。 |
H*******i
发帖数: 196 | 40 有氧化烃类的微生物，随便搜了搜有直接切开苯环的机制，氧化烷烃似乎也是末端或者
倒数第二个碳氧化，这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
不过肯定不是水解。 |
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j*********g
发帖数: 463 | 41 细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
[在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到：]
:并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要
cofactor,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/
inhibitor制约。 |
g******r
发帖数: 204 | 42 记不清楚了。它切的是CH键不是CC键吧
【在 j*********g 的大作中提到】
: 细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
: [在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到：]
: :并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
: 。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要
: cofactor,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/
: inhibitor制约。
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I*****h
发帖数: 470 | 43 拉马克?
【在 l*********d 的大作中提到】
: 这种观点比较拉马克化。
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l*********d
发帖数: 315 | 44 用进废退。
通俗地说， 就是哥需要它长，它就进化的长啦。
（不要想歪了！！）
【在 I*****h 的大作中提到】
: 拉马克?
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l*********d
发帖数: 315 | 45 苯环本质上是个C=C键。
【在 H*******i 的大作中提到】
: 有氧化烃类的微生物，随便搜了搜有直接切开苯环的机制，氧化烷烃似乎也是末端或者
: 倒数第二个碳氧化，这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
: 不过肯定不是水解。
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j****n
发帖数: 3370 | 46 有没切双键的酶？感觉会有 hehe
那就通过desaturase引入double bond
然后再切？
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
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t********e
发帖数: 107 | |
I*****h
发帖数: 470 | 48 对头
【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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I*****h
发帖数: 470 | 49 不算
【在 t********e 的大作中提到】
: Beta-oxidation 算吗？
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g*****x
发帖数: 3283 | 50 C-C bond稳定性很高，如果有能直接切C-C的酶，基本上就见啥杀啥了。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
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g*****x
发帖数: 3283 | 51 胡扯。
【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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t********e
发帖数: 107 | 52 就是共轭大 π键。也是sp2 杂化。不能说就是双键，比较像双键。
【在 g*****x 的大作中提到】
: 胡扯。
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t********e
发帖数: 107 | 53 酶的能力也很高，氧化还原都没问题的。他有选择性。
【在 g*****x 的大作中提到】
: C-C bond稳定性很高，如果有能直接切C-C的酶，基本上就见啥杀啥了。
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t********e
发帖数: 107 | 54 细胞花费大量ATP合成脂肪酸或者蛋白。是为了储存能量将来释放的。这个角度理解可
以吗？如果只是酶切的话，有需要大量能量去做。
cofactor
【在 g******r 的大作中提到】
: 并不是断言有类似功能的酶不可能存在，只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
: 或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶，只是尚未发现。条件例如：需要cofactor
: ,只能作用于特异长度/位点，存在pH或温度要求，严格受regulator/inhibitor制约。
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j*********g
发帖数: 463 | 55 AlkB and CYP153 are important alkane hydroxylases responsible for aerobic
alkane degradation in bioremediation of oil-polluted environments and
microbial enhanced oil recovery.
【在 g******r 的大作中提到】
: 记不清楚了。它切的是CH键不是CC键吧
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I*****h
发帖数: 470 | 56 您在这个领域？
【在 j*********g 的大作中提到】
: AlkB and CYP153 are important alkane hydroxylases responsible for aerobic
: alkane degradation in bioremediation of oil-polluted environments and
: microbial enhanced oil recovery.
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I*****h
发帖数: 470 | 57 AlkB是烷烃氧化第一步，负责从一头把-CH3变成-CH2-OH的
算不上内切酶
这里讨论的是内切酶的可能性
【在 j*********g 的大作中提到】
: AlkB and CYP153 are important alkane hydroxylases responsible for aerobic
: alkane degradation in bioremediation of oil-polluted environments and
: microbial enhanced oil recovery.
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w*****k
发帖数: 177 | 58 有酶可以氧化烷烃到烯烃
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶？
: 是因为惰性碳碳键？
: 有没有可能有这种酶？
: 如果不可能，为什么？
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l*********d
发帖数: 315 | 59 鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
鱼要的是能切金刚石的妹。
【在 w*****k 的大作中提到】
: 有酶可以氧化烷烃到烯烃
|
w*****k
发帖数: 177 | 60 他不怎么懂化学估计
鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
【在 l*********d 的大作中提到】
: 鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
: 鱼要的是能切金刚石的妹。
|
|
|
I*****h
发帖数: 470 | 61 忘的差不多了
【在 w*****k 的大作中提到】
: 他不怎么懂化学估计
:
: 鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
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I*****h
发帖数: 470 | 62 狮心，你也太夸张了
金刚石能和烷烃比吗？金刚石能被乳化吗？
鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
【在 l*********d 的大作中提到】
: 鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
: 鱼要的是能切金刚石的妹。
|
g*****x
发帖数: 3283 | 63 oxidase一般是切C-H，不是直接切sp3的C-C
【在 t********e 的大作中提到】
: 酶的能力也很高，氧化还原都没问题的。他有选择性。
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g*****x
发帖数: 3283 | 64 你只学过初中化学？根本不像。普通C=C很容易发生加成反应，aromatic体系加成极难
，容易取代。
【在 t********e 的大作中提到】
: 就是共轭大 π键。也是sp2 杂化。不能说就是双键，比较像双键。
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l*********d
发帖数: 315 | 65 哈，让你的帖子热闹点啊！别当真啦。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 狮心，你也太夸张了
: 金刚石能和烷烃比吗？金刚石能被乳化吗？
:
: 鱼的意思是说，加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
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I*****h
发帖数: 470 | 66 :) 我知道，木当真
【在 l*********d 的大作中提到】
: 哈，让你的帖子热闹点啊！别当真啦。
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w*****k
发帖数: 177 | 67 今天就来回复一下
关于切CC键比较难 其实是一个很有意思的问题 如果看CC键的键能 从能量上来说是比
CH键要低的 切CC键的困难是CC键被CH键包裹着 主要是一个动力学的问题 这也是为什
么很多CC键的活化 要么是活化有张力的CC键 要么是活化极性的CC键 都是为了克服动
力学的问题 这也说明了 很多所谓的CC键活化 是经过了CH键活化 然后再CC键活化的一
个分步的过程 如果可以实现给定烷基的选择性卤化 氧化或者脱氢 接下来的CC活化并
不是那么的困难
【在 I*****h 的大作中提到】
: :) 我知道，木当真
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c****6
发帖数: 1550 | 68 你这么比较C-C和C-H的离解能有点不对头。那是两种不同类型的键呀，C-C那是sp3-sp3
成键，而C-H是sp3-s成键，当然后者的离解能更大。
【在 w*****k 的大作中提到】
: 今天就来回复一下
: 关于切CC键比较难 其实是一个很有意思的问题 如果看CC键的键能 从能量上来说是比
: CH键要低的 切CC键的困难是CC键被CH键包裹着 主要是一个动力学的问题 这也是为什
: 么很多CC键的活化 要么是活化有张力的CC键 要么是活化极性的CC键 都是为了克服动
: 力学的问题 这也说明了 很多所谓的CC键活化 是经过了CH键活化 然后再CC键活化的一
: 个分步的过程 如果可以实现给定烷基的选择性卤化 氧化或者脱氢 接下来的CC活化并
: 不是那么的困难
|
C*********n
发帖数: 1032 | 69 因为脂肪链不想蛋白质或者核酸有序列，没有序列就没必要有特定的内切酶 |
I*****h
发帖数: 470 | 70 纤维素有内切酶，纤维素有序列吗？
【在 C*********n 的大作中提到】
: 因为脂肪链不想蛋白质或者核酸有序列，没有序列就没必要有特定的内切酶
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C*********n
发帖数: 1032 | 71
有道理，呵呵。多谢提醒，赞一个。
【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶，纤维素有序列吗？
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w*****k
发帖数: 177 | 72 我是说cc难切不是因为cc键能高
sp3
【在 c****6 的大作中提到】
: 你这么比较C-C和C-H的离解能有点不对头。那是两种不同类型的键呀，C-C那是sp3-sp3
: 成键，而C-H是sp3-s成键，当然后者的离解能更大。
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I*****h
发帖数: 470 | |
h**********r
发帖数: 671 | 74 不知道lipoxygenase算不算？其实也是分好几步，还有副反应。
将脂肪酸切成一个短的烷烃加上一个一头是醛基的短的脂肪酸
Biochemistry. 1996 Aug 20;35(33):10687-701.
Crystal structure of soybean lipoxygenase L-1 at 1.4 A resolution.
Minor W, Steczko J, Stec B, Otwinowski Z, Bolin JT, Walter R, Axelrod B. |
I*****h
发帖数: 470 | 75 不算
这个好像是攻击的不饱和碳键吧
【在 h**********r 的大作中提到】
: 不知道lipoxygenase算不算？其实也是分好几步，还有副反应。
: 将脂肪酸切成一个短的烷烃加上一个一头是醛基的短的脂肪酸
: Biochemistry. 1996 Aug 20;35(33):10687-701.
: Crystal structure of soybean lipoxygenase L-1 at 1.4 A resolution.
: Minor W, Steczko J, Stec B, Otwinowski Z, Bolin JT, Walter R, Axelrod B.
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