s*****n
发帖数: 741 | 1 最近做的一个六肽意外的自组装成 纤维了。初步作了 SEM。（说意外是因为我们不做
自组装，而且这个肽上有四个大的芳香环，位阻很大，不利于自组装）
现在我们想知道这个东西到底怎么自组装的，试了 CD， 没有观察到任何 白塔（B，
这个字母打不出来） sheet的信号。
我怀疑可能因为我不懂CD， 所以做的不对了。我在 二氯甲烷，甲醇里面 各种浓度都
试了试，都不行。我看文献里面有做几十个 mM 浓度的，可是为什么那个搞CD的小白告
诉我这么高浓度的时候看不到任何有用的信号。要我做很低的浓度，我自己也偷偷的试
了试高浓度，的确是不行。
请问各位大哥大姐，这个自组装如果不是组装成白塔（B， 这个字母打不出来） sheet
， 还有什么机理？
我做合成的，以前没接触过自组装的东西，希望大家给我点一下机理可能都有哪些？
先拜谢了 |
M****d
发帖数: 131 | 2 自组装不一定要成b sheet呀，要成b sheet的话六个肽有点太短了
CD看不出来就用NMR看，NMR看不出来就用MS看
因为氢键自组装的话，就在低极性溶剂里面做
hydrophobic interaction导致自组装的话，就在极性溶剂里面做
CD 几十个mM必然是不行的了，透过率太低了仪器误差超高
sheet
【在 s*****n 的大作中提到】
: 最近做的一个六肽意外的自组装成 纤维了。初步作了 SEM。（说意外是因为我们不做
: 自组装，而且这个肽上有四个大的芳香环，位阻很大，不利于自组装）
: 现在我们想知道这个东西到底怎么自组装的，试了 CD， 没有观察到任何 白塔（B，
: 这个字母打不出来） sheet的信号。
: 我怀疑可能因为我不懂CD， 所以做的不对了。我在 二氯甲烷，甲醇里面 各种浓度都
: 试了试，都不行。我看文献里面有做几十个 mM 浓度的，可是为什么那个搞CD的小白告
: 诉我这么高浓度的时候看不到任何有用的信号。要我做很低的浓度，我自己也偷偷的试
: 了试高浓度，的确是不行。
: 请问各位大哥大姐，这个自组装如果不是组装成白塔（B， 这个字母打不出来） sheet
: ， 还有什么机理？
|
s*****n
发帖数: 741 | 3 Thanks
How MS works on self-assembly?
【在 M****d 的大作中提到】
: 自组装不一定要成b sheet呀，要成b sheet的话六个肽有点太短了
: CD看不出来就用NMR看，NMR看不出来就用MS看
: 因为氢键自组装的话，就在低极性溶剂里面做
: hydrophobic interaction导致自组装的话，就在极性溶剂里面做
: CD 几十个mM必然是不行的了，透过率太低了仪器误差超高
:
: sheet
|
K****N
发帖数: 10783 | 4 可以试试IR
如果结构很稳定，可以加银离子，测ESI，即使可以，但没有结构信息 |
c***r
发帖数: 3965 | 5 为啥不能缩短光程?
【在 M****d 的大作中提到】
: 自组装不一定要成b sheet呀，要成b sheet的话六个肽有点太短了
: CD看不出来就用NMR看，NMR看不出来就用MS看
: 因为氢键自组装的话，就在低极性溶剂里面做
: hydrophobic interaction导致自组装的话，就在极性溶剂里面做
: CD 几十个mM必然是不行的了，透过率太低了仪器误差超高
:
: sheet
|
g*****r
发帖数: 4444 | 6 自组装有几个level的，要看你的组装到了什么level. 初级level, 只有几个分子胡乱
粘在一起，你可能什么都看不到。到了later level, 二级和三级结构都出来了，你大
概就能看见beta sheet的形状了。不过六肽自组装的几率比较小啊。
另外，你这个小分子要用100-200 uM 的浓度。要看自组装的产物，是不是要先配高浓
度的，确信有自组装产物了再稀释。
sheet
【在 s*****n 的大作中提到】
: 最近做的一个六肽意外的自组装成 纤维了。初步作了 SEM。（说意外是因为我们不做
: 自组装，而且这个肽上有四个大的芳香环，位阻很大，不利于自组装）
: 现在我们想知道这个东西到底怎么自组装的，试了 CD， 没有观察到任何 白塔（B，
: 这个字母打不出来） sheet的信号。
: 我怀疑可能因为我不懂CD， 所以做的不对了。我在 二氯甲烷，甲醇里面 各种浓度都
: 试了试，都不行。我看文献里面有做几十个 mM 浓度的，可是为什么那个搞CD的小白告
: 诉我这么高浓度的时候看不到任何有用的信号。要我做很低的浓度，我自己也偷偷的试
: 了试高浓度，的确是不行。
: 请问各位大哥大姐，这个自组装如果不是组装成白塔（B， 这个字母打不出来） sheet
: ， 还有什么机理？
|
o*****o
发帖数: 113 | |
d*****n
发帖数: 196 | 8 配D2O溶液，测FTIR, beta sheet 在有特征吸收峰（e.g. 1610~1635），
短的多肽，就判断2nd 结构而言， CD 有可能不如FTIR 有效。 |
