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Joke版 - 刚看到一篇有关新冠病毒分析的文章,看有没道理 (转载)
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话题: 冠状病毒话题: ratg13话题: 序列话题: 病毒话题: 突变
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d********f
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1
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: manchester9 (GodWatching2020), 信区: Biology
标 题: 刚看到一篇有关新冠病毒分析的文章,看有没道理
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 12 10:10:43 2020, 美东)
https://nerdhaspower.weebly.com/34987254233689630340-ratg13.html
​武汉冠状病毒(SARS-CoV-2, 2019nCoV, the CCP virus)到底源自哪里?很多
的科研文章似乎都认可它来自于大自然,是进化的结果。事实真的是这样吗?这些科研
成果真的可靠吗?我先不说我的看法,只提醒大家先注意一点,所有持这个观点的论文
其判断都是基于一个证据: 一个名为RaTG13的病毒序列。
从病毒的“血缘”上讲,RaTG13是最接近武汉冠状病毒的,两者的全基因序列的96%完
全相同。如果说RaTG13是自然产生的病毒,那么武汉冠状病毒当然也完全可能出于自然
,而且两者之间必然在不久之前有一个共同的祖先。
问题是,这个RaTG13病毒并不存在。关于它存在的证据 --- 它的基因序列 --- 是伪造
的。
这么说的根据在哪儿?基因序列也能伪造吗?谁这么大胆敢瞒天过海?这些问题都合情
合理。咱们去每个问题上深究一下,然后看看这个说法到底靠不靠谱儿。
谁敢在这个问题上撒谎?
RaTG13的序列是由武汉病毒所和P4实验室的石正丽博士发现并报道的。石博士是中国首
屈一指的冠状病毒专家。她有个众所周知的外号,叫“蝙蝠女侠”。这是因为她的团队
一直以来经常去偏远的山洞里捕捉蝙蝠,然后从蝙蝠身上检测甚至分离出冠状病毒。按
照公开的说法,她们研究的目的是希望能提早发现可能感染人的冠状病毒,从而帮助人
们在未来避免像SARS那样的健康灾难。
然而,具有讽刺意味的是,现实中所发生的似乎与之正好相反。从武汉疫情爆发刚一开
始,就不停的有人怀疑是石正丽人工制造了这个病毒,并有意或无意地把它释放了出去
。石一直是最大的,甚至唯一的嫌疑人。有意思的是,在一月23日,当这样的质疑声马
上要冲破屋顶的时候,石向自然杂志(Nature)投稿并最终发表了一篇论文(1)。在
文章里她将当时刚刚公开不久的武汉冠状病毒的序列与其它beta类冠状病毒的序列做了
比较,并由此描绘了武汉冠状病毒的可能进化路径。文章里同时报道了一个全新的蝙蝠
的冠状病毒,就是我们前面提到的RaTG13。因为RaTG13与武汉冠状病毒有非常之高的一
致性,石的这一“发现”可以说在很大程度上压制了,或者说缓和了,外界对病毒为人
造的质疑。
论文中描述说,RaTG13是早在2013年在云南发现的。根据可靠的消息来源,石正丽跟几
个人分别承认过,她手中并没有真正的RaTG13的毒株。据她说,她的实验室当年是从云
南的蝙蝠的粪便中分析基因片段,从而寻找可能存在的冠状病毒时发现的这个RaTG13的
基因。用稍微通俗点儿的话说,事实上她是没有实物证据能证明RaTG13存在的,她只有
这个病毒的基因序列,也就是一个由ATCG四个字母以各种方式组合出来的长链。
这个序列可不可能被伪造呢?这个其实再容易不过了。让一个人坐那儿往一个word文档
里打字就可以了。一共不到3万个字母,不到一天就完活儿了。要是你还有一个模版序
列,它和你想要得到的序列有96%是一模一样的,那这个工作就要更容易一千倍了。新
序列打完之后,只要上传到网上公开的基因数据库就可以了。和大众对这件事的印象不
同,序列上传的过程中并没有什么严格的审核。这方面完全依赖科学家们的职业操守,
或者说良知。成功上传了的序列就可以被公开引用,并拿来分析数据和发表文章了。
那么,现在的问题就是,这样一个RaTG13的序列能不能拿来当作证据呢?别忘了,这个
事很核心的一点就是到底是不是石正丽本人制造了这个病毒。假如真是人为制造的话,
那么这可以说是人类有史以来最大的犯罪,而石是这里唯一最大的嫌疑人。这种情况下
,石是不是有为自己掩盖罪行的动机呢?假如她在自证清白时所用的证据不过是她刚刚
在word文档中打出来的一连串字母,法官,陪审团,受害者,或者任何人应不应该认可
这样的证据呢?
RaTG13如果真实存在的话绝不应该被石正丽忽视七年之久
好,我们现在再换一个角度看。这个RaTG13病毒的序列是很震撼的:它显示这个病毒完
全具有感染人类的可能。
在beta类冠状病毒的spike蛋白的前半段(S1)中有一段关键序列,叫做RBD。这个RBD
就决定了次病毒的spike能否结合人体受体蛋白ACE2以及此病毒能否侵染人类。石正丽
团队的一个常规流程是,当样本采集完成并确定有冠状病毒存在之后,他们会第一时间
检查这个病毒的RBD序列。假如发现这个新病毒的RBD序列与SARS的RBD序列有高的相似
性(这个情况其实很罕见),团队就激动甚至热血沸腾了。这是因为他们发现了真有可
能侵染人的动物病毒。当然,这也意味着高影响因子的科研论文已经在向他们招手了。
在2013年,也就是RaTG13被发现的同一年,石正丽成为了冠状病毒领域的科研明星。原
因就是她发现了两个蝙蝠冠状病毒(Rs3367,SHC014),其RBD序列与SARS病毒的RBD非
常相似。这个发现首次揭示,2003年肆虐的SARS冠状病毒其实源自蝙蝠。文章被发表在
了学术界至高无上的《自然》(Nature)杂志(2)。在那之后,石的团队又陆续发表
了其他的文章,介绍了他们后期发现的,含有类似RBD序列的蝙蝠冠状病毒(3,4)。
这个RBD序列长什么样呢?图1是SARS冠状病毒的RBD和石正丽发表在顶级杂志上的蝙蝠
冠状病毒的RBD序列的比对(2-4)。相对于SARS(最上面的序列),很多蝙蝠冠状病毒
(图1的下半部分)的RBD中有相当的序列缺失。这种差异也决定了这些蝙蝠冠状病毒很
可能不会感染人。与之相对的是,图1中上半部分的病毒不但没有序列缺失,而且在与
ACE2结合的五个关键位点上与SARS有一定程度的相似。这组“光鲜亮丽”的病毒是被业
界公认的突破性的发现。

Picture
​图1. SARS(SARS_GZ02),RaTG13,和石正丽在2013-2017年间发表在顶级杂志
(2-4)中的蝙蝠冠状病毒的RBD序列的比对。上方红色数字标示的是被石正丽特别关注
的,与ACE2结合至关重要的五个位点(2)。序列比对用的是MultAlin webserver http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/
那么,2013年发现的RaTG13和这些石正丽的宝贝病毒们比怎么样?
从序列上看,RaTG13无疑是属于“光鲜亮丽”那一组的,甚至是出类拔萃的。在长度上
,它非常完整。虽然有一个氨基酸的插入,但其插入的是对序列变化容忍度较高的位置
,理论上不影响功能。更重要的一点是,RaTG13在关键位置上的氨基酸的“保存”上做
的好于大多数,甚至是所有的其他蝙蝠冠状病毒。在442位,RaTG13的“L”应该是最接
近SARS的“Y”的(两者都是疏水的)。在472位,RaTG13是唯一一个拥有和SARS一样的
“L”的蝙蝠病毒。虽然在另外三个位置上,RaTG13和SARS的氨基酸并不完全一致,但
氨基酸的性质也都相近,理论上不会对功能产生过于负面的影响(事实上,最近刚刚发
表的一篇文章通过实验印证了RaTG13的RBD确实能结合人体的ACE2(5)。注:这个工作
中所用的RaTG13基因是化学合成出来的)。
作为一个冠状病毒领域的顶级专家,石正丽只要瞥一眼RaTG13的RBD序列就会立马意识
到这个病毒和SARS很像,很可能可以结合人体ACE2,所以它非常可能具有感染人的能力
。如果石正丽实验室真如她们自我标榜的那样,其研究的目的就是希望通过对蝙蝠的冠
状病毒的充分了解达到能够预警人类的作用,防止类似SARS那样的健康灾难的发生,那
么本着这样的心态,石正丽怎么会在七年之间似乎完全忽视了一个像RaTG13这样的病毒
呢?她怎么能忍七年而不发表这个惊人的发现,反而去发表很多“相貌”不如RaTG13的
病毒呢?为什么只是在武汉疫情爆发之后,当人们开始怀疑武汉病毒的来源的时候,石
突然决定发表这个RaTG13的序列呢?
所有这些都不符合常理。这些事实放在一块儿只能让人更加地怀疑石正丽。她或者直接
参与了制造这个病毒,或者在帮忙掩盖真相,或是两者兼而有之。
当然,这些事实也极大地支持了我们的判断:这个RaTG13病毒是捏造的;它只在《自然
》中存在,而在真实的大自然中并不存在。
RaTG13的spike的基因序列中留有人为操作的明显证据
在仔细分析这一点之前,我们需要先了解一下自然进化中的一个特点。
在基因(由碱基组成)被翻译成蛋白(由氨基酸组成)时,每三个连续的碱基形成一个
密码子(codon),而每一个位置上的密码子决定了在对应的蛋白位置上是哪一个氨基
酸(图2)。反过来说,一个氨基酸一般对应四个密码子,有的氨基酸会对应的多点儿
个,有的少一两个(这里有更细致的解释:https://passel2.unl.edu/view/lesson/
3ccee8500ac8/6)。怎么理解呢?这就是说,假如基因里有一个碱基出现单点突变的话
,它所在的密码子肯定变了,但是这个密码子所对应的氨基酸不是一定发生变化,因为
新的密码子也许对应的还是原来的氨基酸。氨基酸不发生变化的碱基突变被称作同义突
变(synonymous mutation),而导致氨基酸变化的碱基突变被称作非同义突变(non-
synonymous mutation)。当自然进化以随机变异的方式进行时,平均来说,每6个碱基
突变会导致1个氨基酸的变化。或者说,同义突变与非同义突变的比例大概是5:1。

Picture
​图2. 密码子与氨基酸对应关系 (原图来自: https://passel2.unl.edu/view
/lesson/3ccee8500ac8/6)
了解了这个进化的特点之后,我们先来看一个自然进化的例子。在图3A里,我们比较了
亲缘关系很近的两个蝙蝠冠状病毒,ZC45和ZXC21(6),从它们的spike的基因序列比
对中得到了同义突变和非同义突变的情况。绿线所显示的是,当按着序列顺序检查每个
密码子的时候,同义突变的增加情况。红线显示的是非同义突变随序列顺序而增加的情
况。和预期的一样,同义变异明显多于非同义变异。很关键的一点是,两个曲线有明显
的相关性:它们差不多同时上升也同时趋于平缓。而且,在序列的差不多任意一个位置
,累计的同义突变与非同义突变的比例基本都在5:1左右。就像我们在上面提到的,这
样的特点是与两个病毒为近亲而序列间之不同来源于自然变异的事实相一致的。
Picture
​图3. 不同病毒的spike序列比对和同义突变(绿线)/非同义突变(红线)分析
揭示出人为操作的明显痕迹。A. 比较两个出于自然的,有近亲关系的蝙蝠冠状病毒,
ZC45(MG772933)和ZXC21(MG772934)。B. 比较武汉冠状病毒(NC_045512)和
RaTG13(MN996532)。此两者间的突变情况明显违背自然进化的规律。序列比对由
EMBOSS Needle完成。同义和非同义突变的分析采用了来自 www.hiv.lanl.gov的SNAP软
件(7)。
同样的比较如果发生在RaTG13和武汉冠状病毒之间呢?这个自然进化的特征是否也存在
呢?答案是不存在。
图3B就是这样的比较。你首先可能会注意到的一点就是,在序列的后半段,当绿线还在
稳定上升的时候,红线基本持平。注意,这段序列有700多个氨基酸(相当于2100多碱
基),其长度是有绝对的统计意义的。而在这一区间内,两条曲线的协同性完全消失了
。神奇的是,假如你只看最终的同义突变数和非同义突变数的话,其比例居然还是基本
符合5:1这个自然进化的规律的。
好,我们再拿出一些更具体的数字,来更好的感受一下这里面的特异之处。现在我们只
看spike的后半段,就是S2蛋白,其区间是从684左右到1273(按照武汉冠状病毒的序列
)。仔细分析之后我们可以发现,在ZC45和ZXC21之间,S2上有32个碱基突变,其中5个
导致了蛋白突变。或者说碱基序列中有27个同义突变和5个非同义突变。如前所述,这
是与自然进化相一致的:每6个碱基变化导致1个氨基酸突变,或者说同义突变和非同义
突变的比例为5:1。于此形成强烈对比的是,在同样的S2上,武汉冠状病毒和RaTG13之
间有90个碱基突变,却仅有2个氨基酸突变。这里,每45个碱基突变对应1个氨基酸突变
,同义突变和非同义突变的比例为44:1。
需要强调一下,ZC45和ZXC21之间全序列一致性为~97%,其程度与武汉冠状病毒和
RaTG13之间的全序列一致性基本一样。所以,以上的对比是非常合适的,其结果也是很
有说服力的。
假如一个人在研究武汉冠状病毒和RaTG13病毒间序列的差异时仅仅计算了spike序列的
整体的同义突变和非同义突变的比例,那么他/她会发现这里似乎一切正常,并无可疑
之处。可是,假如他/她分析出如图3中那样的细节的话,那任何有头脑的人都会得出同
一个结论:这绝对不正常。
怎么解释这个发现呢?一个符合逻辑的说法就是,武汉冠状病毒和RaTG13病毒两者之间
至少有一个是非天然的。假如一个天然的,那另一个一定不是。当然,也有可能两者都
不是。
假如武汉冠状病毒是非天然的,那咱们的结论就出来了,不必进一步推理了。
事实上,作为生物武器的武汉冠状病毒也完全可能“看”起来是天然的,因为它最有可
能就是在一个天然的冠状病毒的模版上做了细微的改造后而制成的。这样的一来的话,
我们就可以推断:RaTG13是非天然的。这也就和我们这篇文章的其他分析吻合了:这个
RaTG13病毒并不存在,它的序列是捏造的。
石正丽在伪造RaTG13的序列的时候怎么会出现这样的败笔呢?我在前面说,照着一个模
版序列可以很容易编造出一个96%一致性的新病毒序列。但是,在整个基因组里完美地
呈现合理的同义突变和非同义突变的比例不是容易做到的。在这个过程中不出现纰漏应
该是很难的。从石的角度来说,她必须先照顾spike的前半段,就是S1,因为里面有最
关键的RBD。她必须在里面做足够的文章,因为那是会被人们最仔细检查的。可是她很
可能在改编S1序列的过程中“消耗”了太多的非同义突变,所以为了给整个spike基因
维持一个合理的同义突变和非同义突变的比例,她不得不严格限制了S2里非同义突变的
数目以致“拉平”了图3B中的红色曲线。造假最后一定会露馅儿的。
石正丽和中共捏造这个RaTG13的更深一层原因
希望读到这儿的朋友现在和我一样确信这个RaTG13的序列是伪造的。在这个前提下,我
们第一个要做的就是把所有以它为论据而宣扬武汉冠状病毒来源于自然的科研论文扔进
垃圾桶。经过这么清理之后,你会发现最后一个也没剩下。
然后,我们可以回过头看一看,在RaTG13之外,其它的病毒哪个与武汉冠状病毒最相似
。事实上,最接近武汉冠状病毒的就是我们在前面图3里提到的ZC45和ZXC21,或者叫舟
山蝙蝠病毒(发现于浙江舟山)。两者都和武汉冠状病毒有非常高的相似性:蛋白序列
95%一致,基因序列89%一致。这个一致性中有一点尤其令人生疑,就是当几乎所有蛋白
间的一致性都达到95%,甚至100%时,决定病毒宿主S1蛋白的一致性却只有69%。我在之
前的一篇文章里仔细分析了这里面的细节,揭示了这个诡异的一致性分布为什么说明武
汉冠状病毒一定是用舟山蝙蝠病毒为模版而制造的生物武器(https://nerdhaspower.
weebly.com/article-in-chinese; 另:“冠军的亲爹”对此原文的解读:https://
gnews.org/zh-hans/169331/)。
需要提到的是,舟山蝙蝠病毒是由中共的一个军事实验室发现并发表的(6)。就是说
全世界只有中共手里有这个模版病毒。知道了这一点之后你也许就能更充分地理解中共
捏造RaTG13的良苦用心了。揭掉了RaTG13这层画皮之后,一切不是过于明显了吗?
最后,我要再补充一个很重要的,我之前的文章里没有的证据。这是一位在我的文章后
留言的朋友发现和分析的,我认为是证明武汉冠状病毒为人造的有力证据。
Beta类冠状病毒的E蛋白是一个结构蛋白,参与构造病毒的表膜。E蛋白是完全可以接受
氨基酸变异的,这点在SARS和蝙蝠冠状病毒中都被验证了。然而,从疫情爆发之初分离
到的武汉冠状病毒序列来看,它的E蛋白的氨基酸序列与舟山蝙蝠病毒的E蛋白序列100%
一致(图4)。而最近得到的武汉冠状病毒的序列显示,在一些新病毒中,E蛋白已经出
现变异了。如图4所示,在4月份上传的某些序列里已经观察到在四个不同位点的突变。
需要说明的一点是,E蛋白基本不需要和宿主蛋白作用,因此不存在为了适应新宿主而
必须变异的压力。所以E蛋白不但能够容忍突变,而且它的突变频率在不同宿主间是基
本恒定的。可以说,目前武汉冠状病毒在经过短短两个月的人传人之后,E蛋白出现变
异的现象是符合它本身的特点的。与此对照,两个遗传上明显距离更远的舟山蝙蝠病毒
和武汉冠状病毒,它们的E蛋白却100%一致,一个点的变异都没发生。可以非常肯定地
说,这不可能是自然进化的结果。
最合理的解释:武汉冠状病毒是用舟山蝙蝠病毒为模版而制造的生物武器。
Picture
图4. 舟山蝙蝠病毒和武汉冠状病毒的E蛋白序列比对揭示武汉冠状病毒来自人造。早期
的武汉冠状病毒的E蛋白与舟山蝙蝠病毒的E蛋白100%一致,而近期分离的样本显示病毒
的E蛋白在人体中已经在四个位点出现变异。病毒的Genbank序列编号:Feb_11:
MN997409, April_9: MT300186, Apr_13: MT326139, Apr_15_A: MT263389, Apr_15_B:
MT293206, Apr_17: MT350246。

补充(5月10日):
这个补充是由Viennah K. Erchus朋友建议的,目的是进一步的佐证E蛋白是容易并普遍
地接纳氨基酸变异的。如图5中所示,在E蛋白的序列的不同位点上都可以出现变化,有
的是单个氨基酸的变异,有的是插入/缺失。此种现象既在SARS中存在,也在蝙蝠冠状
病毒中存在。这明确地显示了E蛋白对氨基酸变异有相当的倾向性和包容性,以及这些
特性在不同beta类冠状病毒中的普遍存在。与此特性相悖的就是,尽管舟山蝙蝠病毒和
武汉冠状病毒在遗传上明显相距更远,两者却在E蛋白上100%一致。就像上面说到的那
样,这不可能是天然进化的结果。这进一步支持我们通过其他证据而得到的结论:武汉
冠状病毒是以舟山蝙蝠病毒为模版而人工制造的。
Picture
图5. 武汉冠状病毒(Wuhan-Hu-1)、SARS冠状病毒(SARS_GD01, SARS_ExoN1, SARS_
TW_GD1, SARS_Sino1_11)以及蝙蝠冠状病毒(Bat_AP040581.1, RsSHC014, SC2018,
Bat_NP_828854.1, BtRs-BetaCoV/HuB2013, BM48-31/BGR/2008)的E蛋白序列比对。
Viennah K. Erchus提供并细致地准备了这些序列。


作者注释和致谢:
本文是对我之前的一个文章中有关的RaTG13部分的重塑(https://nerdhaspower.
weebly.com/article-in-chinese),其中增加了两处重要的分析。第一处新增的是对
RaTG13的spike的基因序列中同义突变和非同义突变的分析。这个现象最早由Elannor D
. Allens发现并分析的,Elannor把这个发现分享在了我之前文章的留言区。用两个舟
山蝙蝠病毒间的同义突变和非同义突变作为自然变异的例子是由“冠军的亲爹”建议的
。第二处新增的是对新近武汉冠状病毒中E蛋白出现变异的分析。这最早是由 John F.
Signus发现并细致分析的,他同样把这个发现发布在了我的文章的留言区。本文在这几
位朋友的身上获益良多。“冠军的亲爹”尤其建议和鼓励了我的写作。尽管我知道这些
名字都只是大家的网名,但是我还是觉得可以用这些名字致谢,我相信每个名字的背后
都是一个好人和非常有能力的科研工作者。
* 才发现我用错了页面格式,导致这个页面不能留言。如果您想要用中文留言,请去旁
边的 ARTICLE IN CHINESE 版面。谢谢!
引文出处:
1. Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. A
pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin.
Nature. 2020.
2. Ge XY, Li JL, Yang XL, Chmura AA, Zhu G, Epstein JH, et al.
Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the
ACE2 receptor. Nature. 2013;503(7477):535-8.
3. Zeng LP, Gao YT, Ge XY, Zhang Q, Peng C, Yang XL, et al. Bat
Severe Acute Respiratory Syndrome-Like Coronavirus WIV1 Encodes an Extra
Accessory Protein, ORFX, Involved in Modulation of the Host Immune Response.
J Virol. 2016;90(14):6573-82.
4. Hu B, Zeng LP, Yang XL, Ge XY, Zhang W, Li B, et al. Discovery of
a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights
into the origin of SARS coronavirus. PLoS Pathog. 2017;13(11):e1006698.
5. Shang J, Ye G, Shi K, Wan Y, Luo C, Aihara H, et al. Structural
basis of receptor recognition by SARS-CoV-2. Nature. 2020.
6. Hu D, Zhu C, Ai L, He T, Wang Y, Ye F, et al. Genomic
characterization and infectivity of a novel SARS-like coronavirus in Chinese
bats. Emerg Microbes Infect. 2018;7(1):154.
7. Korber B. HIV Signature and Sequence Variation Analysis.
Computational Analysis of HIV Molecular Sequences. 2000;Chapter 4:55-72.
d********f
发帖数: 43471
2
蝗虫兄弟你来评价下这片

【在 d********f 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
: 发信人: manchester9 (GodWatching2020), 信区: Biology
: 标 题: 刚看到一篇有关新冠病毒分析的文章,看有没道理
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: https://nerdhaspower.weebly.com/34987254233689630340-ratg13.html
: ​武汉冠状病毒(SARS-CoV-2, 2019nCoV, the CCP virus)到底源自哪里?很多
: 的科研文章似乎都认可它来自于大自然,是进化的结果。事实真的是这样吗?这些科研
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: 其判断都是基于一个证据: 一个名为RaTG13的病毒序列。
: 从病毒的“血缘”上讲,RaTG13是最接近武汉冠状病毒的,两者的全基因序列的96%完

H********g
发帖数: 43926
3
这个得等我有时间自己看看序列
文章里中共中共地叫 光这个我就对作者失去80%的信任了

【在 d********f 的大作中提到】
: 蝗虫兄弟你来评价下这片
l*h
发帖数: 4124
4
一月份我还是有些崇拜蝗虫妹的

【在 d********f 的大作中提到】
: 蝗虫兄弟你来评价下这片
T*U
发帖数: 22634
5
很民科,直接pass
H********g
发帖数: 43926
6
S2的氨基酸保守性远高于S1 RBD(300-500左右)的突变率远高于其他地方 这
在冠毒里是常例 图三右边的情况是完全符合预期的 左边之所以看不出这个现象
可能是因为这俩病毒亲缘关系太近 变异数目不多 所以整个曲线的对比不强烈
后面 S基因保守性远低于其他地方 这在冠毒里也是常例 整个基因组里变异率如果
都恒定 才是奇怪的

【在 d********f 的大作中提到】
: 蝗虫兄弟你来评价下这片
t******g
发帖数: 10390
7
也可能是N端和穿山甲重组了?

【在 H********g 的大作中提到】
: S2的氨基酸保守性远高于S1 RBD(300-500左右)的突变率远高于其他地方 这
: 在冠毒里是常例 图三右边的情况是完全符合预期的 左边之所以看不出这个现象
: 可能是因为这俩病毒亲缘关系太近 变异数目不多 所以整个曲线的对比不强烈
: 后面 S基因保守性远低于其他地方 这在冠毒里也是常例 整个基因组里变异率如果
: 都恒定 才是奇怪的

t******g
发帖数: 10390
8
我读到一个rutgers的一个家伙twitter上提到的对实验室起源的质疑比较不容易解释,
他提出即使是人工的,痕迹早就在传代中给淹没了,但是无法排除病毒是在人工在实验室
动物内传代中变成了新冠的可能.

【在 H********g 的大作中提到】
: S2的氨基酸保守性远高于S1 RBD(300-500左右)的突变率远高于其他地方 这
: 在冠毒里是常例 图三右边的情况是完全符合预期的 左边之所以看不出这个现象
: 可能是因为这俩病毒亲缘关系太近 变异数目不多 所以整个曲线的对比不强烈
: 后面 S基因保守性远低于其他地方 这在冠毒里也是常例 整个基因组里变异率如果
: 都恒定 才是奇怪的

d********f
发帖数: 43471
9
民科是民科,我没有考证,但是逻辑上还是很有道理的。土鳖国这么崇拜文章的地方,
石正丽为什么要到病毒爆发以后发布一个自己2013年就发现了的病毒?这不合理

【在 T*U 的大作中提到】
: 很民科,直接pass
l**j
发帖数: 300
10
她一月份的时候说了什么?

【在 l*h 的大作中提到】
: 一月份我还是有些崇拜蝗虫妹的
相关主题
小平哥当年得迷倒多少少女啊 (转载)生物"性别"的出现居然是由于一次基因突变 (转载)
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生物"性别"的出现居然是由于一次基因突变 (转载)男孩天生长一副欧美脸 医生分析或因基因突变 (转载)
进入Joke版参与讨论
l**j
发帖数: 300
11
hc到底蓝的绿的?

【在 d********f 的大作中提到】
: 蝗虫兄弟你来评价下这片
l**j
发帖数: 300
12
yes, made in nature!
d********f
发帖数: 43471
13
我觉得再简单点,就算是纯天然,都不能排除五毒所拿来动物转移实验导致泄漏。武汉
这个爆发地实在是太可疑了。我在武汉呆过,武汉基本没什么食野味的习惯。

【在 t******g 的大作中提到】
: 我读到一个rutgers的一个家伙twitter上提到的对实验室起源的质疑比较不容易解释,
: 他提出即使是人工的,痕迹早就在传代中给淹没了,但是无法排除病毒是在人工在实验室
: 动物内传代中变成了新冠的可能.

H********g
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14
泄露是很难撇清的 好在病毒所说他们自己的人没有感染的
另外网上老是混淆病毒所和武汉疾控中心 病毒所在武昌 离爆发中心很远 离海鲜市
场近的是江汉区的疾控中心 这个地方基本不可能有处理高危动物的权限 武汉市的疾
控中心在离海鲜市场稍微远一点的市中心附近 但是它搞科研的实验室在哪里就不清楚了

【在 d********f 的大作中提到】
: 我觉得再简单点,就算是纯天然,都不能排除五毒所拿来动物转移实验导致泄漏。武汉
: 这个爆发地实在是太可疑了。我在武汉呆过,武汉基本没什么食野味的习惯。

a***s
发帖数: 1084
15
RaTG13要真是2013年就发现了,今年一月份才公布上传序列的话,石正丽可真要多解释
解释了。
记得之前法国媒体报道采访石,她说在武汉疫情爆发后失眠睡不着,深怕是实验室病毒
泄露,后来证明不是了才放下心来。意味深远。
a***s
发帖数: 1084
16
这个是一个美国的华人生物学教授写的,前几天上过两次路德的节目,肯定是反共的。
有人总结了,主要有几点。
1,RaTG13不存在,石正丽说没有毒株,只在2013年蝙蝠粪便里找到过。该序列在一月
份上传公布。不合情理。
2,RaTG13本身异体突变和同体突变平均值符合5:1,但是不同蛋白不是,而且差别很
大,不符合自然。
3,E蛋白在1月到2月间已经发生变异。但是爆发时病毒的E蛋白非常完美。如果病毒本
身就是自然变异来的,不应该这么完美。
4,病毒本身是All in one ,好像天然长了雕花的西瓜,太不可能了。几万亿年也很难
变异出来。
H********g
发帖数: 43926
17
1 没什么不合理,没发表的结果多了去了

【在 a***s 的大作中提到】
: 这个是一个美国的华人生物学教授写的,前几天上过两次路德的节目,肯定是反共的。
: 有人总结了,主要有几点。
: 1,RaTG13不存在,石正丽说没有毒株,只在2013年蝙蝠粪便里找到过。该序列在一月
: 份上传公布。不合情理。
: 2,RaTG13本身异体突变和同体突变平均值符合5:1,但是不同蛋白不是,而且差别很
: 大,不符合自然。
: 3,E蛋白在1月到2月间已经发生变异。但是爆发时病毒的E蛋白非常完美。如果病毒本
: 身就是自然变异来的,不应该这么完美。
: 4,病毒本身是All in one ,好像天然长了雕花的西瓜,太不可能了。几万亿年也很难
: 变异出来。

M********t
发帖数: 5032
18
新的大灌ready了,可以使用你的GitHub里的列表了。似乎列表2的名单比较多

的。
一月
别很
毒本
很难

【在 H********g 的大作中提到】
: 1 没什么不合理,没发表的结果多了去了
d********f
发帖数: 43471
19
美帝national lab有可能,国内不可能,我就没见过能发不发的文章。国内学生毕业都
要sci,再差的玩意你都得投出去,怎么又7年不发表的,我绝对不信

【在 H********g 的大作中提到】
: 1 没什么不合理,没发表的结果多了去了
b********6
发帖数: 35437
20
如果中国能制造和控制这么牛逼的病毒,美帝直接下跪磕头算了
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t******g
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21
现在新冠文章因为形势的关系经过peer review都鱼目混杂,至少还可靠一些.
这种不搞peer review的更难说了.
图三那个讲的是你第二点,蝗虫已经说了,你如果对sars1和sars2做同样的比较会得到类
似的图.【 在 alias (贾人贾义) 的大作中提到: 】
t******g
发帖数: 10390
22
那个rutgers的人的说法是未必是在故意搞这个病毒,只是在实验室动物的传代中不小心
创造出来的.【 在 beetle1986 (beetle) 的大作中提到: 】
t******g
发帖数: 10390
23
要是纯看地图的话,武汉铁路疾病控制中心更近.
另外,前两天方舟子那篇中药起源说的时候,我就觉得那个德国人引的第三军医大的文章
(zc45和zxc21那个)会被拿出来说事.【 在 Huangchong (净坛使者) 的大作中提到: 】
楚了
a***e
发帖数: 27968
24
武汉疾控的那个实验室也有个病毒大拿
号称目前病毒数据库里1/3他们发现,据说就是P2
这个家伙被蝙蝠尿过和抓伤过,据说离海鲜市场300米

楚了

【在 H********g 的大作中提到】
: 泄露是很难撇清的 好在病毒所说他们自己的人没有感染的
: 另外网上老是混淆病毒所和武汉疾控中心 病毒所在武昌 离爆发中心很远 离海鲜市
: 场近的是江汉区的疾控中心 这个地方基本不可能有处理高危动物的权限 武汉市的疾
: 控中心在离海鲜市场稍微远一点的市中心附近 但是它搞科研的实验室在哪里就不清楚了

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