d****o
发帖数: 32610 | 1 从五大学科竞赛来分，
码农应该是AI了
数学是不是还是代数几何？
生物是不是癌症？
物理没啥理论进展了吧？
化学家又在研究啥？ |
M*******n
发帖数: 10087 | |
x****6
发帖数: 4339 | 3 生物是癌症
物理是生物
化学是生物
今天的物理炸药奖就是物理在生物里的应用。 |
e******t
发帖数: 339 | |
e***d
发帖数: 8248 | 5 万一攻克癌症的 idea 被 EE PhD 想到了呢？
EE PhD 雇一帮 Bio PhD 跑胶？ |
p******g
发帖数: 8316 | |
d********m
发帖数: 3662 | 7 value-added model
【在 e******t 的大作中提到】
: 谁能用经济学解释外f?
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e******t
发帖数: 339 | 8 不完全契约理论。
【在 d********m 的大作中提到】
: value-added model
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d****o
发帖数: 32610 | 9 经济学这种不在五大竞赛之列的超纲了不讨论
【在 e******t 的大作中提到】
: 谁能用经济学解释外f?
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d********m
发帖数: 3662 | 10 生物下一个最大的革命，应该就在xiao86做的那块领域 |
|
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d****o
发帖数: 32610 | 11 哪块？
【在 d********m 的大作中提到】
: 生物下一个最大的革命，应该就在xiao86做的那块领域
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d********m
发帖数: 3662 | 12 synthetic biology
【在 d****o 的大作中提到】
: 哪块？
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d****o
发帖数: 32610 | 13 这是干啥的？
人造生命？
【在 d********m 的大作中提到】
: synthetic biology
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x****6
发帖数: 4339 | 14 戴摩不要捧杀我。
我不牛，但是我这个领域里的确很有多牛人和牛idea。
【在 d********m 的大作中提到】
: 生物下一个最大的革命，应该就在xiao86做的那块领域
|
d********m
发帖数: 3662 | 15 尼玛，我都说了是你这个领域了 :)
【在 x****6 的大作中提到】
: 戴摩不要捧杀我。
: 我不牛，但是我这个领域里的确很有多牛人和牛idea。
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d********m
发帖数: 3662 | 16 bottom-up design，正儿八经的有logic在里面了
【在 d****o 的大作中提到】
: 这是干啥的？
: 人造生命？
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x****6
发帖数: 4339 | 17 对生命进行精细复杂的改造/重新编程，来实现人设的功能，比如编码T细胞攻击癌症细
胞；在实验室里高效快速的进化有用大分子（药、工业酶，而不是等待大自然花成千上
万年）；用微生物生产大宗化学品
和高附加值药品等。
【在 d****o 的大作中提到】
: 这是干啥的？
: 人造生命？
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x********e
发帖数: 35261 | 18 生物需要攻克的还多呢。长远来看癌症免疫疗法不如溶瘤病毒。未来肯定是个性化治疗
的时代，测序和genome editing是基础手段
【在 d****o 的大作中提到】
: 从五大学科竞赛来分，
: 码农应该是AI了
: 数学是不是还是代数几何？
: 生物是不是癌症？
: 物理没啥理论进展了吧？
: 化学家又在研究啥？
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d****o
发帖数: 32610 | 19 拿一些标准基本元件搭出系统/产品？
听起来跟码农干的事情很像
【在 x****6 的大作中提到】
: 对生命进行精细复杂的改造/重新编程，来实现人设的功能，比如编码T细胞攻击癌症细
: 胞；在实验室里高效快速的进化有用大分子（药、工业酶，而不是等待大自然花成千上
: 万年）；用微生物生产大宗化学品
: 和高附加值药品等。
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d********m
发帖数: 3662 | 20 把“微生物生产大宗化学品和高附加值药品等”这个去掉
留下癌症那段，会不会更高大上点？
【在 x****6 的大作中提到】
: 对生命进行精细复杂的改造/重新编程，来实现人设的功能，比如编码T细胞攻击癌症细
: 胞；在实验室里高效快速的进化有用大分子（药、工业酶，而不是等待大自然花成千上
: 万年）；用微生物生产大宗化学品
: 和高附加值药品等。
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d********m
发帖数: 3662 | 21 说道个性化测序，四丹佛的michael snyder刚连续两期cell上发了文章，我还没打起精
神去读
【在 x********e 的大作中提到】
: 生物需要攻克的还多呢。长远来看癌症免疫疗法不如溶瘤病毒。未来肯定是个性化治疗
: 的时代，测序和genome editing是基础手段
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x****6
发帖数: 4339 | 22 虽然如此， 但目前合成生物学最成熟，并且已经实现明显社会价值的部分就是 微生物
的代谢工程。每年产值至少几百亿刀。
你认为高大上的，目前还没有什么产出。属于技术验证和打磨阶段。但是快了，十年内
会有起飞。
dimorphism (雷小阿伦) 的大作中提到: 】 |
x****6
发帖数: 4339 | 23 “癌症免疫疗法不如溶瘤病毒”
可否展开？谢谢
【在 x********e 的大作中提到】
: 生物需要攻克的还多呢。长远来看癌症免疫疗法不如溶瘤病毒。未来肯定是个性化治疗
: 的时代，测序和genome editing是基础手段
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d********m
发帖数: 3662 | 24 我对那些其实不太感兴趣
真正让我对synthetic biology感兴趣的还是那会看intrinsic/extrinsic noises文章
那会
我使用好的测量回答基本生物学问题的比较感兴趣
【在 x****6 的大作中提到】
: 虽然如此， 但目前合成生物学最成熟，并且已经实现明显社会价值的部分就是 微生物
: 的代谢工程。每年产值至少几百亿刀。
: 你认为高大上的，目前还没有什么产出。属于技术验证和打磨阶段。但是快了，十年内
: 会有起飞。
: dimorphism (雷小阿伦) 的大作中提到: 】
|
x****6
发帖数: 4339 | 25 握爪，leibler和elowitz的nature实在是太经典。
不过了解他们的出身，也就不奇怪了。统计物理科班训练出身的，看待生命系统跟生物
学家的纯描述性和唯象层面的眼光是截然不同的
我自己的工作就受到eibler的影响：工欲善其事，必先利其器。
就是找到/开发一个合适的工具对感兴趣的现象进行精确而系统的测量，然后才能获得
深刻的见解。工具和测量特别重要。
【在 d********m 的大作中提到】
: 我对那些其实不太感兴趣
: 真正让我对synthetic biology感兴趣的还是那会看intrinsic/extrinsic noises文章
: 那会
: 我使用好的测量回答基本生物学问题的比较感兴趣
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w********2
发帖数: 632 | 26 你不是进化吗，啥时候成了synthetic biology，这是biotech应用呀。
【在 x****6 的大作中提到】
: 戴摩不要捧杀我。
: 我不牛，但是我这个领域里的确很有多牛人和牛idea。
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x********e
发帖数: 35261 | 27 我觉得牛皮吹最大的是合成生物学
: synthetic biology
【在 d********m 的大作中提到】
: 我对那些其实不太感兴趣
: 真正让我对synthetic biology感兴趣的还是那会看intrinsic/extrinsic noises文章
: 那会
: 我使用好的测量回答基本生物学问题的比较感兴趣
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w********2
发帖数: 632 | 28 估计说的是东欧国家流行的噬菌体疗法。
【在 x****6 的大作中提到】
: “癌症免疫疗法不如溶瘤病毒”
: 可否展开？谢谢
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x********e
发帖数: 35261 | 29 然而你去掉的是实际在做的东西，留的是牛皮
: 把“微生物生产大宗化学品和高附加值药品等”这个去掉
: 留下癌症那段，会不会更高大上点？
【在 d********m 的大作中提到】
: 我对那些其实不太感兴趣
: 真正让我对synthetic biology感兴趣的还是那会看intrinsic/extrinsic noises文章
: 那会
: 我使用好的测量回答基本生物学问题的比较感兴趣
|
x********e
发帖数: 35261 | 30 engineer T cell那叫定向基因工程，跟合成生物学八杆子打不上，别往自己脸上贴金
了好吗
: 对生命进行精细复杂的改造/重新编程，来实现人设的功能，比如编码T细胞攻击
癌症细
: 胞；在实验室里高效快速的进化有用大分子（药、工业酶，而不是等待大自然花
成千上
: 万年）；用微生物生产大宗化学品
: 和高附加值药品等。
【在 x****6 的大作中提到】
: 握爪，leibler和elowitz的nature实在是太经典。
: 不过了解他们的出身，也就不奇怪了。统计物理科班训练出身的，看待生命系统跟生物
: 学家的纯描述性和唯象层面的眼光是截然不同的
: 我自己的工作就受到eibler的影响：工欲善其事，必先利其器。
: 就是找到/开发一个合适的工具对感兴趣的现象进行精确而系统的测量，然后才能获得
: 深刻的见解。工具和测量特别重要。
|
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d********m
发帖数: 3662 | 31 不大，必经之路，只不过现在能做测量的方法少了点，荧光蛋白这些用了十几年了，总
得缓一缓
【在 x********e 的大作中提到】
: 我觉得牛皮吹最大的是合成生物学
:
:
: synthetic biology
:
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w********2
发帖数: 632 | 32 这个应该早就有了，好像瑞典有家很有名的制酶公司，用的就是微生物合成。
用微生物生产大宗化学品
【在 x****6 的大作中提到】
: 握爪，leibler和elowitz的nature实在是太经典。
: 不过了解他们的出身，也就不奇怪了。统计物理科班训练出身的，看待生命系统跟生物
: 学家的纯描述性和唯象层面的眼光是截然不同的
: 我自己的工作就受到eibler的影响：工欲善其事，必先利其器。
: 就是找到/开发一个合适的工具对感兴趣的现象进行精确而系统的测量，然后才能获得
: 深刻的见解。工具和测量特别重要。
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x****6
发帖数: 4339 | 33 你没自己看上面我和戴莫的讨论，
synthetic biology有两个流派：
科学，就是用工程手段对细胞进行可控和系统的perturbation,以此来研究细胞行为的
机理。
工程，对细胞进行工程改造来实现社会产值。
小弟是进化博士训练，现在把进化论的思想运用到工程改造的细胞里，在实验室里实现
可控和加速的进化过程。目的是为了在实验室里进化出有用的大分子或者微生物机器人。
【在 w********2 的大作中提到】
: 你不是进化吗，啥时候成了synthetic biology，这是biotech应用呀。
|
d********m
发帖数: 3662 | 34 嗯，你的思想和一般生物千老不一样
你当年来哈佛千老多好，我们能每周喝酒打屁。
【在 x****6 的大作中提到】
: 握爪，leibler和elowitz的nature实在是太经典。
: 不过了解他们的出身，也就不奇怪了。统计物理科班训练出身的，看待生命系统跟生物
: 学家的纯描述性和唯象层面的眼光是截然不同的
: 我自己的工作就受到eibler的影响：工欲善其事，必先利其器。
: 就是找到/开发一个合适的工具对感兴趣的现象进行精确而系统的测量，然后才能获得
: 深刻的见解。工具和测量特别重要。
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d********m
发帖数: 3662 | 35 哦，原来你是进化博士
生物博士里的最底层，娃哈哈
人。
【在 x****6 的大作中提到】
: 你没自己看上面我和戴莫的讨论，
: synthetic biology有两个流派：
: 科学，就是用工程手段对细胞进行可控和系统的perturbation,以此来研究细胞行为的
: 机理。
: 工程，对细胞进行工程改造来实现社会产值。
: 小弟是进化博士训练，现在把进化论的思想运用到工程改造的细胞里，在实验室里实现
: 可控和加速的进化过程。目的是为了在实验室里进化出有用的大分子或者微生物机器人。
|
d****o
发帖数: 32610 | 36 俺研究了一下，
感觉就是在细菌里instantiate一些动力系统嘛
概念上好像不是很难
【在 x****6 的大作中提到】
: 握爪，leibler和elowitz的nature实在是太经典。
: 不过了解他们的出身，也就不奇怪了。统计物理科班训练出身的，看待生命系统跟生物
: 学家的纯描述性和唯象层面的眼光是截然不同的
: 我自己的工作就受到eibler的影响：工欲善其事，必先利其器。
: 就是找到/开发一个合适的工具对感兴趣的现象进行精确而系统的测量，然后才能获得
: 深刻的见解。工具和测量特别重要。
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x********e
发帖数: 35261 | 37 你了解一下pd-1的临床数据就知道其实效果并不好，CAR-T更是不靠谱。溶酶病毒的安
全性比前两者好多了，FDA已经披了一个T-vec，还有好几个都在三期临床阶段，非常有
前景，说明整个领域都靠谱，比免疫疗法靠谱。不是说免疫疗法不能用，而是很多人的
癌症不适合免疫疗法。
: “癌症免疫疗法不如溶瘤病毒”
: 可否展开？谢谢
【在 x****6 的大作中提到】
: 你没自己看上面我和戴莫的讨论，
: synthetic biology有两个流派：
: 科学，就是用工程手段对细胞进行可控和系统的perturbation,以此来研究细胞行为的
: 机理。
: 工程，对细胞进行工程改造来实现社会产值。
: 小弟是进化博士训练，现在把进化论的思想运用到工程改造的细胞里，在实验室里实现
: 可控和加速的进化过程。目的是为了在实验室里进化出有用的大分子或者微生物机器人。
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l*******4
发帖数: 1 | 38 这就叫互相吹捧吧
【在 d********m 的大作中提到】
: 嗯，你的思想和一般生物千老不一样
: 你当年来哈佛千老多好，我们能每周喝酒打屁。
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x****6
发帖数: 4339 | 39 合成生物学的确有很大的泡沫，可是现在哪个学术领域没有泡沫？
合成生物学根本就不用我来贴金。工业界和市场认可就行。
https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-programmers-are-the-next-
startup-millionaires/
【在 x********e 的大作中提到】
: engineer T cell那叫定向基因工程，跟合成生物学八杆子打不上，别往自己脸上贴金
: 了好吗
:
:
: 对生命进行精细复杂的改造/重新编程，来实现人设的功能，比如编码T细胞攻击
: 癌症细
:
: 胞；在实验室里高效快速的进化有用大分子（药、工业酶，而不是等待大自然花
: 成千上
:
: 万年）；用微生物生产大宗化学品
:
: 和高附加值药品等。
:
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w********2
发帖数: 632 | 40 感觉不对，synthetic chemistry就是合成化学，和进化化学没啥关系，如果一定要把
甲烷合成当作生命的开始，那也可以套上去，但总感觉是应用的术语。
人。
【在 x****6 的大作中提到】
: 你没自己看上面我和戴莫的讨论，
: synthetic biology有两个流派：
: 科学，就是用工程手段对细胞进行可控和系统的perturbation,以此来研究细胞行为的
: 机理。
: 工程，对细胞进行工程改造来实现社会产值。
: 小弟是进化博士训练，现在把进化论的思想运用到工程改造的细胞里，在实验室里实现
: 可控和加速的进化过程。目的是为了在实验室里进化出有用的大分子或者微生物机器人。
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x****6
发帖数: 4339 | 41 生物里 不难的概念 往往很难实现。因为细胞太复杂，你给他改一下，它还会有反应，
于是你的信号输出需要打一个折扣。
【在 d****o 的大作中提到】
: 俺研究了一下，
: 感觉就是在细菌里instantiate一些动力系统嘛
: 概念上好像不是很难
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l*******4
发帖数: 1 | 42 Xiao86在偷换概念
【在 w********2 的大作中提到】
: 感觉不对，synthetic chemistry就是合成化学，和进化化学没啥关系，如果一定要把
: 甲烷合成当作生命的开始，那也可以套上去，但总感觉是应用的术语。
:
: 人。
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w********2
发帖数: 632 | |
d********m
发帖数: 3662 | 44 这个，概念是不难
首先，在我这种纯生物出生的看起来，哇塞，生物还能这么做啊
其次，基因表达的heterogeneity，其实早就有人提出来了，但resolution不够，根本
测不到那个程度。他这个，估计还是自己搭的显微镜。所以工程上和科学上，都是满牛
逼的事情
【在 d****o 的大作中提到】
: 俺研究了一下，
: 感觉就是在细菌里instantiate一些动力系统嘛
: 概念上好像不是很难
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d****o
发帖数: 32610 | 45 不是bottom up吗
应该可以随便设计吧
【在 x****6 的大作中提到】
: 生物里 不难的概念 往往很难实现。因为细胞太复杂，你给他改一下，它还会有反应，
: 于是你的信号输出需要打一个折扣。
|
d********m
发帖数: 3662 | 46 上层搞科学的都这个鸟样。所以，这个习惯，我们要从千老开始培养
【在 l*******4 的大作中提到】
: 这就叫互相吹捧吧
|
x********e
发帖数: 35261 | 47 太基础了…虽然有些序列有意义，但很多时候就是噪音。还有grammar和syntax之类的
研究，是挺有意思。但换个model organism都不一定会得出一样的结论。
: 我对那些其实不太感兴趣
: 真正让我对synthetic biology感兴趣的还是那会看intrinsic/extrinsic
noises文章
: 那会
: 我使用好的测量回答基本生物学问题的比较感兴趣
【在 d********m 的大作中提到】
: 上层搞科学的都这个鸟样。所以，这个习惯，我们要从千老开始培养
|
l*******4
发帖数: 1 | 48 你听他给你扯犊子呢
【在 d****o 的大作中提到】
: 不是bottom up吗
: 应该可以随便设计吧
|
d********m
发帖数: 3662 | 49 细胞这东西，太TM敏感，估计比下将军还容易潮吹。perturbation很难控制输出的
【在 d****o 的大作中提到】
: 不是bottom up吗
: 应该可以随便设计吧
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w********2
发帖数: 632 | 50 主要是有代偿机制，很多pathway knock out之后都一样有活性。
【在 x****6 的大作中提到】
: 生物里 不难的概念 往往很难实现。因为细胞太复杂，你给他改一下，它还会有反应，
: 于是你的信号输出需要打一个折扣。
|
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d********m
发帖数: 3662 | 51 这个是universal的，我觉得可以称为是law of gene expression heterogeneity。以
前测，noise都被average out了。
【在 x********e 的大作中提到】
: 太基础了…虽然有些序列有意义，但很多时候就是噪音。还有grammar和syntax之类的
: 研究，是挺有意思。但换个model organism都不一定会得出一样的结论。
:
:
: 我对那些其实不太感兴趣
:
: 真正让我对synthetic biology感兴趣的还是那会看intrinsic/extrinsic
: noises文章
:
: 那会
:
: 我使用好的测量回答基本生物学问题的比较感兴趣
:
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x********e
发帖数: 35261 | 52 扫了一眼，吹吧吹的文章，脱离生物学搞大数据，毫无好感
: 说道个性化测序，四丹佛的michael snyder刚连续两期cell上发了文章，我还没
打起精
: 神去读
【在 d********m 的大作中提到】
: 这个是universal的，我觉得可以称为是law of gene expression heterogeneity。以
: 前测，noise都被average out了。
|
d********m
发帖数: 3662 | 53 那我相信你的品味，也懒得读了
【在 x********e 的大作中提到】
: 扫了一眼，吹吧吹的文章，脱离生物学搞大数据，毫无好感
:
:
: 说道个性化测序，四丹佛的michael snyder刚连续两期cell上发了文章，我还没
: 打起精
:
: 神去读
:
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x********e
发帖数: 35261 | 54 你贴金的是基因工程不是合成生物学ok？合成生物学是用原件按电路的思维搭建生物系
统完成需要的功能。基因工程是改造。
: 合成生物学的确有很大的泡沫，可是现在哪个学术领域没有泡沫？
: 合成生物学根本就不用我来贴金。工业界和市场认可就行。
: https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-programmers-are-the-
next-
: startup-millionaires/
【在 x****6 的大作中提到】
: 生物里 不难的概念 往往很难实现。因为细胞太复杂，你给他改一下，它还会有反应，
: 于是你的信号输出需要打一个折扣。
|
x****6
发帖数: 4339 | 55 这里就牵涉到两个概念了
生理适应：bottom up其实不准确，真正说起来，其实是repurpose，就是对已经存在的
复杂体系，进行修改。至于说bottom up是因为，修改的层次比较低(基因和细胞层次)
，对应于高层次的修改，比如把牛角切掉让它不伤人。
领会repurpose的本质之后，那么你修改一下，细胞就会回敬你一个它的response, 那
么就给你的输出信号打个折扣
遗传适应：但凡涉及到系统使用时间长，需要细胞繁殖。那么和 癌症一样的问题就
来了。突变会让系统逐渐失效。
【在 d****o 的大作中提到】
: 不是bottom up吗
: 应该可以随便设计吧
|
x********e
发帖数: 35261 | 56 合成生物学确实是bottom up随便设计。他是半路出家偷换概念，把生物工程说成是合
成生物学。
: 不是bottom up吗
: 应该可以随便设计吧
【在 d****o 的大作中提到】
: 不是bottom up吗
: 应该可以随便设计吧
|
x********e
发帖数: 35261 | 57 所以现在都单分子荧光监测转录啊
不过生物跨度那么大，单分子上的那点noise到底有多大的生物学意义呢？正常情况下
就应该是看均值。除非证明微观的扰动有很大的生物学意义。
: 这个是universal的，我觉得可以称为是law of gene expression
heterogeneity。以
: 前测，noise都被average out了。
【在 d********m 的大作中提到】
: 那我相信你的品味，也懒得读了
|
d********m
发帖数: 3662 | 58 有相当多实验证明，生物过程是fluctuation驱动的啊
【在 x********e 的大作中提到】
: 所以现在都单分子荧光监测转录啊
: 不过生物跨度那么大，单分子上的那点noise到底有多大的生物学意义呢？正常情况下
: 就应该是看均值。除非证明微观的扰动有很大的生物学意义。
:
:
: 这个是universal的，我觉得可以称为是law of gene expression
: heterogeneity。以
:
: 前测，noise都被average out了。
:
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x********e
发帖数: 35261 | 59 ……………太丢我们千老的脸了
: 这里就牵涉到两个概念了
: 生理适应：bottom up其实不准确，真正说起来，其实是repurpose，就是对已经
存在的
: 复杂体系，进行修改。至于说bottom up是因为，修改的层次比较低(基因和细胞
层次)
: ，对应于高层次的修改，比如把牛角切掉让它不伤人。
: 领会repurpose的本质之后，那么你修改一下，细胞就会回敬你一个它的
response, 那
: 么就给你的输出信号打个折扣
: 遗传适应：但是涉及到系统使用时间长，需要细胞，繁殖。那么和 癌症一样的
问题就
: 来了。突变会让系统逐渐失效。
【在 x****6 的大作中提到】
: 这里就牵涉到两个概念了
: 生理适应：bottom up其实不准确，真正说起来，其实是repurpose，就是对已经存在的
: 复杂体系，进行修改。至于说bottom up是因为，修改的层次比较低(基因和细胞层次)
: ，对应于高层次的修改，比如把牛角切掉让它不伤人。
: 领会repurpose的本质之后，那么你修改一下，细胞就会回敬你一个它的response, 那
: 么就给你的输出信号打个折扣
: 遗传适应：但凡涉及到系统使用时间长，需要细胞繁殖。那么和 癌症一样的问题就
: 来了。突变会让系统逐渐失效。
|
d********m
发帖数: 3662 | 60 其实就相当于，人类的文明进程，是由andrew wiles之类的人驱动一样
【在 d********m 的大作中提到】
: 有相当多实验证明，生物过程是fluctuation驱动的啊
|
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x****6
发帖数: 4339 | 61 "你贴金的是基因工程不是合成生物学ok？"
不要把你的话塞到别人嘴里。
我从来没有说过基因工程==合成生物学。
但合成生物学也在基因工程里有越来越多的应用，比如chrsitna smolke对酵母进行深
度改造（异源表达28个基因）来生产吗啡。这个用微生物生产高附加值化合物的套路是
基因工程的经典套路。可是这项工作被 科学杂志 称作是“合成生物学”的突破。就是
因为传统基因工程做不到的，使用合成生物学的技术就能变为现实。
the-
【在 x********e 的大作中提到】
: 你贴金的是基因工程不是合成生物学ok？合成生物学是用原件按电路的思维搭建生物系
: 统完成需要的功能。基因工程是改造。
:
:
: 合成生物学的确有很大的泡沫，可是现在哪个学术领域没有泡沫？
:
: 合成生物学根本就不用我来贴金。工业界和市场认可就行。
:
: https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-programmers-are-the-
: next-
:
: startup-millionaires/
:
|
x****6
发帖数: 4339 | 62 你自己看看上面的帖子，我在讲内容。
你除了会 唧唧歪歪 请你提供点干活。
【在 x********e 的大作中提到】
: ……………太丢我们千老的脸了
:
:
: 这里就牵涉到两个概念了
:
: 生理适应：bottom up其实不准确，真正说起来，其实是repurpose，就是对已经
: 存在的
:
: 复杂体系，进行修改。至于说bottom up是因为，修改的层次比较低(基因和细胞
: 层次)
:
: ，对应于高层次的修改，比如把牛角切掉让它不伤人。
:
: 领会repurpose的本质之后，那么你修改一下，细胞就会回敬你一个它的
: response, 那
|
d********m
发帖数: 3662 | 63 这里的关键是在哪里？我指的是”合成生物学的技术“
【在 x****6 的大作中提到】
: "你贴金的是基因工程不是合成生物学ok？"
: 不要把你的话塞到别人嘴里。
: 我从来没有说过基因工程==合成生物学。
: 但合成生物学也在基因工程里有越来越多的应用，比如chrsitna smolke对酵母进行深
: 度改造（异源表达28个基因）来生产吗啡。这个用微生物生产高附加值化合物的套路是
: 基因工程的经典套路。可是这项工作被 科学杂志 称作是“合成生物学”的突破。就是
: 因为传统基因工程做不到的，使用合成生物学的技术就能变为现实。
:
: the-
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d********m
发帖数: 3662 | 64 下将军比较擅长传统生物学的领域，比如病毒和免疫之类的
【在 x****6 的大作中提到】
: 你自己看看上面的帖子，我在讲内容。
: 你除了会 唧唧歪歪 请你提供点干活。
|
x********e
发帖数: 35261 | 65 brownian ratchet
不过就像所有物质都是由量子构成，你的世界仍然是连续的
: 有相当多实验证明，生物过程是fluctuation驱动的啊
【在 d********m 的大作中提到】
: 下将军比较擅长传统生物学的领域，比如病毒和免疫之类的
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l*******4
发帖数: 1 | |
d********m
发帖数: 3662 | 67 你这个太虚了
这行的基本理论基础是stochastic process。说难不难，说简单不简单
不过反正我是做不了
【在 x********e 的大作中提到】
: brownian ratchet
: 不过就像所有物质都是由量子构成，你的世界仍然是连续的
:
:
: 有相当多实验证明，生物过程是fluctuation驱动的啊
:
|
x********e
发帖数: 35261 | 68 你们讨论的癌症CART疗法是哪门子的合成生物学？
: "你贴金的是基因工程不是合成生物学ok？"
: 不要把你的话塞到别人嘴里。
: 我从来没有说过基因工程==合成生物学。
: 但合成生物学也在基因工程里有越来越多的应用，比如chrsitna smolke对酵母
进行深
: 度改造（异源表达28个基因）来生产吗啡。这个用微生物生产高附加值化合物的
套路是
: 基因工程的经典套路。可是这项工作被 科学杂志 称作是“合成生物学”的突破
。就是
: 因为传统基因工程做不到的，使用合成生物学的技术就能变为现实。
: the-
【在 x****6 的大作中提到】
: 你自己看看上面的帖子，我在讲内容。
: 你除了会 唧唧歪歪 请你提供点干活。
|
d****o
发帖数: 32610 | 69 其实俺是想了解一下各大学科前沿热点
结果全是生物学家
一个物理学家化学家都不来
唉
【在 d********m 的大作中提到】
: 下将军比较擅长传统生物学的领域，比如病毒和免疫之类的
|
x********e
发帖数: 35261 | 70 人非生物专业都知道合成生物学是用生物元件像电路一样实现任意功能。你怕是搞的平
行世界里的合成生物学吧？
: 你自己看看上面的帖子，我在讲内容。
: 你除了会 唧唧歪歪 请你提供点干活。
【在 x****6 的大作中提到】
: 你自己看看上面的帖子，我在讲内容。
: 你除了会 唧唧歪歪 请你提供点干活。
|
|
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d********m
发帖数: 3662 | 71 物理和化学，将来都要来捧生物大腿的
比如我说的测量的难题，就是物理的事情
【在 d****o 的大作中提到】
: 其实俺是想了解一下各大学科前沿热点
: 结果全是生物学家
: 一个物理学家化学家都不来
: 唉
|
d********m
发帖数: 3662 | 72 比如，今年物理的optical tweezer，马上就要变成生物领域内的常规perturbation手
段了
【在 d****o 的大作中提到】
: 其实俺是想了解一下各大学科前沿热点
: 结果全是生物学家
: 一个物理学家化学家都不来
: 唉
|
e***d
发帖数: 8248 | 73 所以偶在第一页就说了，你们千老的生物领域需要EE PhD来领军。
【在 d********m 的大作中提到】
: 你这个太虚了
: 这行的基本理论基础是stochastic process。说难不难，说简单不简单
: 不过反正我是做不了
|
x********e
发帖数: 35261 | 74 你先好好读两篇生物学里关于brownian ratchet的paper再来说玄与不玄
: 你这个太虚了
: 这行的基本理论基础是stochastic process。说难不难，说简单不简单
: 不过反正我是做不了
【在 d********m 的大作中提到】
: 比如，今年物理的optical tweezer，马上就要变成生物领域内的常规perturbation手
: 段了
|
x********e
发帖数: 35261 | 75 不是将来。你看现在的炸药奖哪个不抱生物大腿
: 物理和化学，将来都要来捧生物大腿的
: 比如我说的测量的难题，就是物理的事情
【在 d********m 的大作中提到】
: 比如，今年物理的optical tweezer，马上就要变成生物领域内的常规perturbation手
: 段了
|
d********m
发帖数: 3662 | 76 这个，是互相的
我们隔壁实验室有一个mit applied physics的博士，根本找不对生物的题目。已经千
老了3，4年了
【在 e***d 的大作中提到】
: 所以偶在第一页就说了，你们千老的生物领域需要EE PhD来领军。
|
x****6
发帖数: 4339 | 77 在我上面举的christina smolke的例子里，
“合成生物学”的技术关键是
1. 异源基因表达的精确调控（传统代谢工程对基因的表达比较粗放，就是有和没有，
顶多再细一点，就是多和少），而合成生物学通过对启动子库的筛选来实现某个基因的
定量表达，这样才能优化代谢通路的flux
2. 有些合成步骤，加入了反馈机制，比如产物抑制机制，来实现对代谢flux的动态、
自发控制，也是为了优化flux。 好比有毒中间产物积累过多，可能把细胞杀死，那么
产物抑制机制就能解决这个问题
3. 把28个异源基因放到基因组里，还要有想要的功能，这里也用到了合成生物学手段。
【在 d********m 的大作中提到】
: 这里的关键是在哪里？我指的是”合成生物学的技术“
|
d********m
发帖数: 3662 | 78 大姐，你数理统计这么差，就别来扯这些了。专注癌症和免疫好了，我基本可以确定你
是版上前五的好手
【在 x********e 的大作中提到】
: 你先好好读两篇生物学里关于brownian ratchet的paper再来说玄与不玄
:
:
: 你这个太虚了
:
: 这行的基本理论基础是stochastic process。说难不难，说简单不简单
:
: 不过反正我是做不了
:
|
d****o
发帖数: 32610 | 79 这不就是麦克斯韦妖的变种吗
也能发paper?
【在 x********e 的大作中提到】
: 你先好好读两篇生物学里关于brownian ratchet的paper再来说玄与不玄
:
:
: 你这个太虚了
:
: 这行的基本理论基础是stochastic process。说难不难，说简单不简单
:
: 不过反正我是做不了
:
|
b***a
发帖数: 377 | 80 物理： 二维材料
化学； 金属有机骨架，COF
【在 d****o 的大作中提到】
: 从五大学科竞赛来分，
: 码农应该是AI了
: 数学是不是还是代数几何？
: 生物是不是癌症？
: 物理没啥理论进展了吧？
: 化学家又在研究啥？
|
|
|
x********e
发帖数: 35261 | 81 确实。脑回路完全不同的人。能理解生物学意义的人太少了。不过只有有这么一个，都
是挺牛逼的人物。
: 这个，是互相的
: 我们隔壁实验室有一个mit applied physics的博士，根本找不对生物的题目。
已经千
: 老了3，4年了
【在 d********m 的大作中提到】
: 大姐，你数理统计这么差，就别来扯这些了。专注癌症和免疫好了，我基本可以确定你
: 是版上前五的好手
|
l*******4
发帖数: 1 | 82 你说的这个还是基因工程啊
段。
【在 x****6 的大作中提到】
: 在我上面举的christina smolke的例子里，
: “合成生物学”的技术关键是
: 1. 异源基因表达的精确调控（传统代谢工程对基因的表达比较粗放，就是有和没有，
: 顶多再细一点，就是多和少），而合成生物学通过对启动子库的筛选来实现某个基因的
: 定量表达，这样才能优化代谢通路的flux
: 2. 有些合成步骤，加入了反馈机制，比如产物抑制机制，来实现对代谢flux的动态、
: 自发控制，也是为了优化flux。 好比有毒中间产物积累过多，可能把细胞杀死，那么
: 产物抑制机制就能解决这个问题
: 3. 把28个异源基因放到基因组里，还要有想要的功能，这里也用到了合成生物学手段。
|
d********m
发帖数: 3662 | 83 所以传统生物学出生的，坚持到现在，看来也是一种优势
【在 x********e 的大作中提到】
: 确实。脑回路完全不同的人。能理解生物学意义的人太少了。不过只有有这么一个，都
: 是挺牛逼的人物。
:
:
: 这个，是互相的
:
: 我们隔壁实验室有一个mit applied physics的博士，根本找不对生物的题目。
: 已经千
:
: 老了3，4年了
:
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d****o
发帖数: 32610 | 84 二维材料就是石墨烯啥的？
俺始终觉得这个还是算化学合理
【在 b***a 的大作中提到】
: 物理： 二维材料
: 化学； 金属有机骨架，COF
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x****6
发帖数: 4339 | 85 1. 我上面已经给你贴了链接，可惜你不看，就来批判我。
2. 我再贴一次： https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-
programmers-are-the-next-startup-millionaires/
3. 我把页面拍下来，请注意紫色划线部分。这是MIT Tech Review 关于一个大制药公
司收购cart-T相关合成生物学技术的报道。
最后，请你以后不要把别人的善意当作软弱。
【在 x********e 的大作中提到】
: 人非生物专业都知道合成生物学是用生物元件像电路一样实现任意功能。你怕是搞的平
: 行世界里的合成生物学吧？
:
:
: 你自己看看上面的帖子，我在讲内容。
:
: 你除了会 唧唧歪歪 请你提供点干活。
:
|
d********m
发帖数: 3662 | 86 搞生物的都知道，quantify代谢一些中间产物，是很难得
早些年搞生化的，基本都是在体外测这些这些，出的书都是至少几百页。。。
段。
【在 x****6 的大作中提到】
: 在我上面举的christina smolke的例子里，
: “合成生物学”的技术关键是
: 1. 异源基因表达的精确调控（传统代谢工程对基因的表达比较粗放，就是有和没有，
: 顶多再细一点，就是多和少），而合成生物学通过对启动子库的筛选来实现某个基因的
: 定量表达，这样才能优化代谢通路的flux
: 2. 有些合成步骤，加入了反馈机制，比如产物抑制机制，来实现对代谢flux的动态、
: 自发控制，也是为了优化flux。 好比有毒中间产物积累过多，可能把细胞杀死，那么
: 产物抑制机制就能解决这个问题
: 3. 把28个异源基因放到基因组里，还要有想要的功能，这里也用到了合成生物学手段。
|
d****o
发帖数: 32610 | 87 其实这个也不排除是蹭buzz word的
跟pattern recognition/machine learning/AI概念无限扩展包罗万象类似
【在 x****6 的大作中提到】
: 1. 我上面已经给你贴了链接，可惜你不看，就来批判我。
: 2. 我再贴一次： https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-
: programmers-are-the-next-startup-millionaires/
: 3. 我把页面拍下来，请注意紫色划线部分。这是MIT Tech Review 关于一个大制药公
: 司收购cart-T相关合成生物学技术的报道。
: 最后，请你以后不要把别人的善意当作软弱。
|
x********e
发帖数: 35261 | 88 你和dimorphism与其自以为是不如老老实实去ncbi搜两篇文章看看。生物学本质是物理
里的热力学问题。利用分子热运动创造有序可不是臆想。
: 这不就是麦克斯韦妖的变种吗
: 也能发paper?
【在 d****o 的大作中提到】
: 其实这个也不排除是蹭buzz word的
: 跟pattern recognition/machine learning/AI概念无限扩展包罗万象类似
|
x****6
发帖数: 4339 | 89 这里是christina smolke的综述文章。
http://stm.sciencemag.org/content/3/106/106ps42
你信就看看，不信就当我是扯几把蛋就好。
【在 l*******4 的大作中提到】
: 你说的这个还是基因工程啊
:
: 段。
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d********m
发帖数: 3662 | 90 你这个属于步子迈的大过头，一脚跨到了民科的领域
【在 x********e 的大作中提到】
: 你和dimorphism与其自以为是不如老老实实去ncbi搜两篇文章看看。生物学本质是物理
: 里的热力学问题。利用分子热运动创造有序可不是臆想。
:
:
: 这不就是麦克斯韦妖的变种吗
:
: 也能发paper?
:
|
|
|
x********e
发帖数: 35261 | 91 那个人是合成生物学家。CART是gebetic reprogram，典型的基因工程。你这逻辑堪忧啊
: 1. 我上面已经给你贴了链接，可惜你不看，就来批判我。
: 2. 我再贴一次： https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-
: programmers-are-the-next-startup-millionaires/
: 3. 我把页面拍下来，请注意紫色划线部分。这是MIT Tech Review 关于一个大
制药公
: 司收购cart-T相关合成生物学技术的报道。
: 最后，请你以后不要把别人的善意当作软弱。
【在 x****6 的大作中提到】
: 这里是christina smolke的综述文章。
: http://stm.sciencemag.org/content/3/106/106ps42
: 你信就看看，不信就当我是扯几把蛋就好。
|
x****6
发帖数: 4339 | 92 我说的话，你们不信--》谁他么的相信菌斑里的言论？
我找来mit tech review的报道--》buzz word
我还有什么好说的呢？
洗洗睡吧，明天开化学奖。
【在 d****o 的大作中提到】
: 其实这个也不排除是蹭buzz word的
: 跟pattern recognition/machine learning/AI概念无限扩展包罗万象类似
|
e***d
发帖数: 8248 | 93 应用物理的，搞搞神经整整好。
【在 d********m 的大作中提到】
: 这个，是互相的
: 我们隔壁实验室有一个mit applied physics的博士，根本找不对生物的题目。已经千
: 老了3，4年了
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d********m
发帖数: 3662 | 94 听说过第一作者，天才少女级别的
【在 x****6 的大作中提到】
: 这里是christina smolke的综述文章。
: http://stm.sciencemag.org/content/3/106/106ps42
: 你信就看看，不信就当我是扯几把蛋就好。
|
d********m
发帖数: 3662 | 95 嗯，你是行家
神经领域里一堆埋没的物理人才
【在 e***d 的大作中提到】
: 应用物理的，搞搞神经整整好。
|
f******t
发帖数: 19544 | 96 都你妈死循环了。你引用我，我引用你。都在骗房顶。
【在 d****o 的大作中提到】
: 从五大学科竞赛来分，
: 码农应该是AI了
: 数学是不是还是代数几何？
: 生物是不是癌症？
: 物理没啥理论进展了吧？
: 化学家又在研究啥？
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d********m
发帖数: 3662 | 97 化学奖你猜哪个领域的？
【在 x****6 的大作中提到】
: 我说的话，你们不信--》谁他么的相信菌斑里的言论？
: 我找来mit tech review的报道--》buzz word
: 我还有什么好说的呢？
: 洗洗睡吧，明天开化学奖。
|
x****6
发帖数: 4339 | 98 这是UCSF的合成生物学大佬wendell lim的proposal abstract.
请你睁大你的狗眼认真看看，哪怕只是标题也好
http://grantome.com/grant/NIH/R01-CA196277-01
Redesigning the T cell: Using Synthetic Biology to Engineer Therapeutic
Cells
Lim, Wendell A.
University of California San Francisco, San Francisco, CA, United States
Engineered cells have the potential to serve as powerful """"""""smart""""""
"" therapeutic agents, but we lack a systematic framework for engineering
cells to optimize their efficacy and minimize their adverse effects. For
example, T cells expressing artificial tumor-directed receptors (Chimeric
Antigen Receptors - CARs) have achieved unexpected success in treating
certain leukemias. But the engineered cells lack the precision and control
of native T cells: off-target cell killing as well as hyperactivation of the
immune system lead to severe adverse effects in most patients. Achieving
control over these engineered T cells remains a major challenge to making
this a safe and reliable therapy that can be extended to a wider range of
diseases. We propose to apply the approaches of synthetic biology to
systematically engineer therapeutic immune cells with far more tailored and
precisely controlled behaviors. We will apply our knowledge of cell
signaling to engineer modular switches and circuits that can be used to
control these therapeutic cells. Our project will span two complementary
approaches, represented by the following aims:
Aim 1. Develop toolbox of circuit modules for precision control of CAR T
cells. We will construct modules that can be combined with CARs to increase
their specificity and safety, including: a. Remote control of T cells via
small molecules or light. Provide physicians with safety switches for
controlling activiy of transplanted therapeutic cells. b. Tunable feedback
circuits. Optimize CAR T cell responses by tuning dose-response thresholds,
kinetic proofreading, and the amplitude/duration of response. c. Multi-
antigen triggered activation. Increase discrimination of cancer cell
targeting. d. User-guided cell migration. Target T cells to specific sites
of action, increasing precision. e. Synthetic cell-cell communication.
Engineer autocrine and multi-cell decision-making circuits.
Aim 2. Refactoring T cells: identify submodules in the T cell response
network that can be used to construct custom response programs. Current CARs
replicate the native program of T cell activation, but in response to a
novel input. We postulate that there are many alternative ways to plug into
the T cell signaling network and to generate custom tailored responses. We
will scan combinatorial libraries of rewired T cell signaling proteins to
identify alternative control points that can be activated through induced
complex assembly (light or drugs). This network-rewiring library should
reveal modular subnetworks that can be used as building blocks to construct
custom response programs, including: a. Separate inducible control of: i) T
cell proliferation, ii) tumor cell killing, and iii) memory cell
establishment b. Induction of alternatie cytokine response programs ideal
for cancer treatment (e.g. induce Th1 program) c. Induction of custom """"""
""a la carte"""""""" hybrid cytokine response programs that are optimized
for cancer treatment.
忧啊
【在 x********e 的大作中提到】
: 那个人是合成生物学家。CART是gebetic reprogram，典型的基因工程。你这逻辑堪忧啊
:
:
: 1. 我上面已经给你贴了链接，可惜你不看，就来批判我。
:
: 2. 我再贴一次： https://www.technologyreview.com/s/609726/genetic-
:
: programmers-are-the-next-startup-millionaires/
:
: 3. 我把页面拍下来，请注意紫色划线部分。这是MIT Tech Review 关于一个大
: 制药公
:
: 司收购cart-T相关合成生物学技术的报道。
:
: 最后，请你以后不要把别人的善意当作软弱。
:
|
x********e
发帖数: 35261 | 99 你的问题是坐井观天。
: 你这个属于步子迈的大过头
【在 d********m 的大作中提到】
: 化学奖你猜哪个领域的？
|
d********m
发帖数: 3662 | 100 你咋这么不淡定？
""
【在 x****6 的大作中提到】
: 这是UCSF的合成生物学大佬wendell lim的proposal abstract.
: 请你睁大你的狗眼认真看看，哪怕只是标题也好
: http://grantome.com/grant/NIH/R01-CA196277-01
: Redesigning the T cell: Using Synthetic Biology to Engineer Therapeutic
: Cells
: Lim, Wendell A.
: University of California San Francisco, San Francisco, CA, United States
: Engineered cells have the potential to serve as powerful """"""""smart""""""
: "" therapeutic agents, but we lack a systematic framework for engineering
: cells to optimize their efficacy and minimize their adverse effects. For
|
|
|
x****6
发帖数: 4339 | 101 topoisomerase
【在 d********m 的大作中提到】
: 化学奖你猜哪个领域的？
|
d********m
发帖数: 3662 | 102 大姐，我每周参加至少2两个seminars。
【在 x********e 的大作中提到】
: 你的问题是坐井观天。
:
:
: 你这个属于步子迈的大过头
:
|
d****o
发帖数: 32610 | 103 搜了篇看了下
完全是在消耗能量的前提下选择性透过
很真正的brownian ratchet关系不大
完全是滥用概念
如果按这个思路
耗能的单向跨膜运输都算麦克斯韦妖了
【在 x********e 的大作中提到】
: 你和dimorphism与其自以为是不如老老实实去ncbi搜两篇文章看看。生物学本质是物理
: 里的热力学问题。利用分子热运动创造有序可不是臆想。
:
:
: 这不就是麦克斯韦妖的变种吗
:
: 也能发paper?
:
|
d********m
发帖数: 3662 | 104 我觉得要轮到ron vale了。我的偶像，哇咔咔
【在 x****6 的大作中提到】
: topoisomerase
|
d********m
发帖数: 3662 | 105 牛逼，还真去看了。我都没去看，因为肯定也是看不懂
【在 d****o 的大作中提到】
: 搜了篇看了下
: 完全是在消耗能量的前提下选择性透过
: 很真正的brownian ratchet关系不大
: 完全是滥用概念
: 如果按这个思路
: 耗能的单向跨膜运输都算麦克斯韦妖了
|
x****6
发帖数: 4339 | 106 细胞骨架的？
【在 d********m 的大作中提到】
: 我觉得要轮到ron vale了。我的偶像，哇咔咔
|
d****o
发帖数: 32610 | 107 这个概念明显是违反热二的
搞出来就是永动机
肯定是滥用了
【在 d********m 的大作中提到】
: 牛逼，还真去看了。我都没去看，因为肯定也是看不懂
|
d********m
发帖数: 3662 | 108 kinesin, dynein
【在 x****6 的大作中提到】
: 细胞骨架的？
|
x********e
发帖数: 35261 | 109 so what？CART本身就是生物工程。这不过是个proposal，忽悠投资者的报道，没做出
来你说个屁啊。所以我第一个帖就说了，合成生物学最不缺的就是吹牛皮
: 这是UCSF的合成生物学大佬wendell lim的proposal abstract.
: 请你睁大你的狗眼认真看看，哪怕是标题也好
: http://grantome.com/grant/NIH/R01-CA196277-01
: Redesigning the T cell: Using Synthetic Biology to Engineer
Therapeutic
: Cells
: Lim, Wendell A.
: University of California San Francisco, San Francisco, CA, United
States
: Engineered cells have the potential to serve as powerful """"""""smart
""""""
: "" therapeutic agents, but we lack a systematic framework for
engineering
: cells to optimize their efficacy and minimize their adverse effects.
For
【在 x****6 的大作中提到】
: 细胞骨架的？
|
x****6
发帖数: 4339 | 110 MIT 的 jeremy england是我知道的，从物理本质研究生命现象，比较前沿的一个人
他这篇文章就是从统计物理的角度看论证 自我复制 这一生命本质特征合理性
https://www.englandlab.com/uploads/7/8/0/3/7803054/2013jcpsrep.pdf
【在 d****o 的大作中提到】
: 搜了篇看了下
: 完全是在消耗能量的前提下选择性透过
: 很真正的brownian ratchet关系不大
: 完全是滥用概念
: 如果按这个思路
: 耗能的单向跨膜运输都算麦克斯韦妖了
|
|
|
x********e
发帖数: 35261 | 111 那也是坐井观天，自以为聪明，就不愿多看看文献
: 大姐，我每周参加至少2两个seminars。
【在 d********m 的大作中提到】
: kinesin, dynein
|
e***d
发帖数: 8248 | 112 所以，如果我是实验室主任，我会首选大蝌蚪做方向领头人，虾酱作为备选。
【在 d********m 的大作中提到】
: 牛逼，还真去看了。我都没去看，因为肯定也是看不懂
|
d****o
发帖数: 32610 | 113 应该这么说，
设计成circuit一次搞几个基因进去的角度算合成生物，
搞进去改变功能这个角度算基因工程
并不矛盾
现在学科之间都经常交叉，
你生物学内部反而搞门派对立，
就有点四种回字的感觉了
""
【在 x****6 的大作中提到】
: 这是UCSF的合成生物学大佬wendell lim的proposal abstract.
: 请你睁大你的狗眼认真看看，哪怕只是标题也好
: http://grantome.com/grant/NIH/R01-CA196277-01
: Redesigning the T cell: Using Synthetic Biology to Engineer Therapeutic
: Cells
: Lim, Wendell A.
: University of California San Francisco, San Francisco, CA, United States
: Engineered cells have the potential to serve as powerful """"""""smart""""""
: "" therapeutic agents, but we lack a systematic framework for engineering
: cells to optimize their efficacy and minimize their adverse effects. For
|
x****6
发帖数: 4339 | 114 你牛逼里踢，自己循环论证。
合成生物学是坨屎行了吧，你自己高兴就好。LOL
【在 x********e 的大作中提到】
: so what？CART本身就是生物工程。这不过是个proposal，忽悠投资者的报道，没做出
: 来你说个屁啊。所以我第一个帖就说了，合成生物学最不缺的就是吹牛皮
:
:
: 这是UCSF的合成生物学大佬wendell lim的proposal abstract.
:
: 请你睁大你的狗眼认真看看，哪怕是标题也好
:
: http://grantome.com/grant/NIH/R01-CA196277-01
:
: Redesigning the T cell: Using Synthetic Biology to Engineer
: Therapeutic
:
: Cells
:
: Lim, Wendell A.
|
d********m
发帖数: 3662 | 115 请给留个千老位置撒
【在 e***d 的大作中提到】
: 所以，如果我是实验室主任，我会首选大蝌蚪做方向领头人，虾酱作为备选。
|
d****o
发帖数: 32610 | 116 方向领头人是什么？
高级千老的别名吗？
【在 e***d 的大作中提到】
: 所以，如果我是实验室主任，我会首选大蝌蚪做方向领头人，虾酱作为备选。
|
x****6
发帖数: 4339 | 117 我61楼里就是这么说得，只是某个傻逼，硬要把它自己的偏见放到我的嘴里，
我的原文
“我从来没有说过基因工程==合成生物学。
但合成生物学也在基因工程里有越来越多的应用，比如chrsitna smolke对酵母进行深
度改造（异源表达28个基因）来生产吗啡。这个用微生物生产高附加值化合物的套路是
基因工程的经典套路。可是这项工作被 科学杂志 称作是“合成生物学”的突破。就是
因为传统基因工程做不到的，使用合成生物学的技术就能变为现实。”
【在 d****o 的大作中提到】
: 应该这么说，
: 设计成circuit一次搞几个基因进去的角度算合成生物，
: 搞进去改变功能这个角度算基因工程
: 并不矛盾
: 现在学科之间都经常交叉，
: 你生物学内部反而搞门派对立，
: 就有点四种回字的感觉了
:
: ""
|
d********m
发帖数: 3662 | 118 lab manager，听着像
【在 d****o 的大作中提到】
: 方向领头人是什么？
: 高级千老的别名吗？
|
x********e
发帖数: 35261 | 119 自己ncbi读paper去吧，各大journal挨个读读涨涨姿势
【在 d********m 的大作中提到】
: 你这个属于步子迈的大过头，一脚跨到了民科的领域
|
d********m
发帖数: 3662 | 120 physics review E? nature communication?
【在 x********e 的大作中提到】
: 自己ncbi读paper去吧，各大journal挨个读读涨涨姿势
|
|
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e***d
发帖数: 8248 | 121 有个驻校行吟诗人的位置目前空缺，愿低就否？^_^
【在 d********m 的大作中提到】
: 请给留个千老位置撒
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d********m
发帖数: 3662 | 122 这个。。。你去找leisure版的nola1998，肯定比我合适
【在 e***d 的大作中提到】
: 有个驻校行吟诗人的位置目前空缺，愿低就否？^_^
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d****o
发帖数: 32610 | 123 俺读了两篇，
确实是耗能过程，
不算brownian ratchet
【在 x********e 的大作中提到】
: 自己ncbi读paper去吧，各大journal挨个读读涨涨姿势
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d********m
发帖数: 3662 | 124 我觉得你要少读点杂志，静下心来思考重大的问题
【在 x********e 的大作中提到】
: 自己ncbi读paper去吧，各大journal挨个读读涨涨姿势
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x********e
发帖数: 35261 | 125 你喜欢ron vale居然不知道brownian ratchet model
: physics review E? nature communication?
【在 d********m 的大作中提到】
: 我觉得你要少读点杂志，静下心来思考重大的问题
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d********m
发帖数: 3662 | 126 如果我记得没错，ron vale文章里从来没有直接参与过运作这个model吧？
我喜欢他那些关于MT的工作，不代表我喜欢那些model
【在 x********e 的大作中提到】
: 你喜欢ron vale居然不知道brownian ratchet model
:
:
: physics review E? nature communication?
:
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x********e
发帖数: 35261 | 127 不不不，问题在于brownian ratchet在各大journal都发过文你居然以为是民科。
: 我觉得你要少读点杂志，静下心来思考重大的问题
【在 d********m 的大作中提到】
: 如果我记得没错，ron vale文章里从来没有直接参与过运作这个model吧？
: 我喜欢他那些关于MT的工作，不代表我喜欢那些model
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d********m
发帖数: 3662 | 128 我说你到了民科领域，主要是因为你提到啥量子连续之类的
【在 x********e 的大作中提到】
: 不不不，问题在于brownian ratchet在各大journal都发过文你居然以为是民科。
:
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: 我觉得你要少读点杂志，静下心来思考重大的问题
:
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x********e
发帖数: 35261 | 129 你只读一个人文章不关心领域？不知道molecular motor会drift和diffuse？
: 如果我记得没错，ron vale文章里从来没有直接参与过运作这个model吧？
: 我喜欢他那些关于MT的工作。
【在 d********m 的大作中提到】
: 我说你到了民科领域，主要是因为你提到啥量子连续之类的
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d********m
发帖数: 3662 | 130 随手搜了下，还真有不少这方面的，还是建立在ron vale工作上的
神奇的是，我读的MT paper应该不下一百篇了，的确对这个啥brownie hatch model没
有任何印象
【在 x********e 的大作中提到】
: 你喜欢ron vale居然不知道brownian ratchet model
:
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: physics review E? nature communication?
:
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x********e
发帖数: 35261 | 131 生物就是特殊的brownian ratchet，在微小扰动的基础上给很小的能量进行选择。回到
我提出这个term的原点，理解我的意思了吗
: 俺读了两篇，
: 确实是耗能过程，
: 不算brownian ratchet
【在 d****o 的大作中提到】
: 俺读了两篇，
: 确实是耗能过程，
: 不算brownian ratchet
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d********m
发帖数: 3662 | 132 概念上当然知道了
可是这些single molecule的东西，都是不在我的能力范围之内，关心了，根本就是浪
费时间不是
老老实实做生物的东西就可以了，MT领域内，值得关心的生物问题太多了
【在 x********e 的大作中提到】
: 你只读一个人文章不关心领域？不知道molecular motor会drift和diffuse？
:
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: 如果我记得没错，ron vale文章里从来没有直接参与过运作这个model吧？
:
: 我喜欢他那些关于MT的工作。
:
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x********e
发帖数: 35261 | 133 一百篇很少，而且你还没读其他细胞骨架和molecular motor的文章
: 随手搜了下，还真有不少这方面的，还是建立在ron vale工作上的
: 神奇的是，我读的MT paper应该不下一百篇了，的确对这个啥brownie hatch
model没
: 有任何印象
【在 d********m 的大作中提到】
: 概念上当然知道了
: 可是这些single molecule的东西，都是不在我的能力范围之内，关心了，根本就是浪
: 费时间不是
: 老老实实做生物的东西就可以了，MT领域内，值得关心的生物问题太多了
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d****o
发帖数: 32610 | 134 其实本质上就是你前面说的随机波动驱动的生物过程
但叫brownian ratchet显然是不合理的
因为是靠能量消耗在了固定棘爪的过程里才获得的负熵
严格来说应该叫伪布朗棘轮模型
【在 d********m 的大作中提到】
: 随手搜了下，还真有不少这方面的，还是建立在ron vale工作上的
: 神奇的是，我读的MT paper应该不下一百篇了，的确对这个啥brownie hatch model没
: 有任何印象
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d********m
发帖数: 3662 | 135 MT方面没必要读的
合作者里有个timothy mitchison，MT的关键问题问一下他就行了
这个层次，自己提出自己的model才是正解
【在 x********e 的大作中提到】
: 一百篇很少，而且你还没读其他细胞骨架和molecular motor的文章
:
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: 随手搜了下，还真有不少这方面的，还是建立在ron vale工作上的
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: 神奇的是，我读的MT paper应该不下一百篇了，的确对这个啥brownie hatch
: model没
:
: 有任何印象
:
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d********m
发帖数: 3662 | 136 我说的是brownie hatch model哦，哈哈
我得去睡了，很感谢你提出的这个主题。让我们千老实验之余也有地方畅谈一番。
【在 d****o 的大作中提到】
: 其实本质上就是你前面说的随机波动驱动的生物过程
: 但叫brownian ratchet显然是不合理的
: 因为是靠能量消耗在了固定棘爪的过程里才获得的负熵
: 严格来说应该叫伪布朗棘轮模型
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x********e
发帖数: 35261 | 137 你是因为tau对MT感兴趣？做细胞的觉得细胞骨架本身没啥可做的了。你不如去关注
phase transition的研究，跟你的方向更靠边
: 概念上当然知道了
: 可是这些single molecule的东西，都是不在我的能力范围之内，关心了，根本
就是浪
: 费时间不是
: 老老实实做生物的东西就可以了，MT领域内，值得关心的生物问题太多了
【在 d********m 的大作中提到】
: 我说的是brownie hatch model哦，哈哈
: 我得去睡了，很感谢你提出的这个主题。让我们千老实验之余也有地方畅谈一番。
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d****o
发帖数: 32610 | 138 brownian ratchet关键是不消耗额外能量
是一种第二类永动机
既然耗能了那就不能算了
取这个名字是蹭别人热度
【在 x********e 的大作中提到】
: 生物就是特殊的brownian ratchet，在微小扰动的基础上给很小的能量进行选择。回到
: 我提出这个term的原点，理解我的意思了吗
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: 俺读了两篇，
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: 确实是耗能过程，
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: 不算brownian ratchet
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d****o
发帖数: 32610 | 139 不等电话了？
【在 d********m 的大作中提到】
: 我说的是brownie hatch model哦，哈哈
: 我得去睡了，很感谢你提出的这个主题。让我们千老实验之余也有地方畅谈一番。
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d********m
发帖数: 3662 | 140 phase transition已经做烂的。在神经里，我们实验室最近两个月申稿了两篇cell的文
章，全是关于这个的。跟风没啥意思
当然phase transition还是很有意思的。
【在 x********e 的大作中提到】
: 你是因为tau对MT感兴趣？做细胞的觉得细胞骨架本身没啥可做的了。你不如去关注
: phase transition的研究，跟你的方向更靠边
:
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: 概念上当然知道了
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: 可是这些single molecule的东西，都是不在我的能力范围之内，关心了，根本
: 就是浪
:
: 费时间不是
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: 老老实实做生物的东西就可以了，MT领域内，值得关心的生物问题太多了
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x********e
发帖数: 35261 | 141 哈哈哈 你居然跟他合作
做MT就那么些人，都是老头子领域了
: MT方面没必要读的
: 合作者里有个timothy mitchison，MT的关键问题问一下他就行了
: 这个层次，自己提出自己的model才是正解
【在 d********m 的大作中提到】
: phase transition已经做烂的。在神经里，我们实验室最近两个月申稿了两篇cell的文
: 章，全是关于这个的。跟风没啥意思
: 当然phase transition还是很有意思的。
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d********m
发帖数: 3662 | 142 后天再说吧，等经济学的
【在 d****o 的大作中提到】
: 不等电话了？
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x********e
发帖数: 35261 | 143 不是跟风与否的问题。是MT本身没啥可研究的了，值得研究的也就这么一个现象。
: phase transition已经做烂的。在神经里，我们实验室最近两个月申稿了两篇
cell的文
: 章，全是关于这个的。跟风没啥意思
: 当然phase transition还是很有意思的。
【在 d********m 的大作中提到】
: 后天再说吧，等经济学的
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d********m
发帖数: 3662 | 144 嗯，年轻人的确没什么MT接班人了。关键是太难做了，基本上没有任何办法genetic
perturbation。
tau的发现者marc kirschner也在我们隔壁系。这里也算半个MT重镇了
【在 x********e 的大作中提到】
: 哈哈哈 你居然跟他合作
: 做MT就那么些人，都是老头子领域了
:
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: MT方面没必要读的
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: 合作者里有个timothy mitchison，MT的关键问题问一下他就行了
:
: 这个层次，自己提出自己的model才是正解
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d********m
发帖数: 3662 | 145 MT的问题是太重要，很多重要的理论比如调控 morphogenesis 80年代就已经提出了。
但就是因为太重要，所以根本没有遗传学的办法研究它的功能。tim以前有个搞物理的
弟子，相当牛，做的是MT的mechanical stress response。独立了以后，就根本发不出
任何东西了。
【在 x********e 的大作中提到】
: 不是跟风与否的问题。是MT本身没啥可研究的了，值得研究的也就这么一个现象。
:
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: phase transition已经做烂的。在神经里，我们实验室最近两个月申稿了两篇
: cell的文
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: 章，全是关于这个的。跟风没啥意思
:
: 当然phase transition还是很有意思的。
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e***d
发帖数: 8248 | 146 高级千老。
【在 d****o 的大作中提到】
: 方向领头人是什么？
: 高级千老的别名吗？
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x********e
发帖数: 35261 | 147 你想要的层面当然是很难的，目前还是只能去干扰合成和降解吧
: 嗯，年轻人的确没什么MT接班人了。关键是太难做了，基本上没有任何办法
genetic
: perturbation。
: tau的发现者marc kirschner也在我们隔壁系。这里也算半个MT重镇了
【在 d********m 的大作中提到】
: MT的问题是太重要，很多重要的理论比如调控 morphogenesis 80年代就已经提出了。
: 但就是因为太重要，所以根本没有遗传学的办法研究它的功能。tim以前有个搞物理的
: 弟子，相当牛，做的是MT的mechanical stress response。独立了以后，就根本发不出
: 任何东西了。
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d********m
发帖数: 3662 | 148 你娃咋样最近？
【在 x********e 的大作中提到】
: 你想要的层面当然是很难的，目前还是只能去干扰合成和降解吧
:
:
: 嗯，年轻人的确没什么MT接班人了。关键是太难做了，基本上没有任何办法
: genetic
:
: perturbation。
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: tau的发现者marc kirschner也在我们隔壁系。这里也算半个MT重镇了
:
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x********e
发帖数: 35261 | 149 我觉得是没有选好model system。做果蝇会好很多
: MT的问题是太重要，很多重要的理论比如调控 morphogenesis 80年代就已经提
出了。
: 但就是因为太重要，所以根本没有遗传学的办法研究它的功能。tim以前有个搞
物理的
: 弟子，相当牛，做的是MT的mechanical stress response。独立了以后，就根本
发不出
: 任何东西了。
【在 d********m 的大作中提到】
: 你娃咋样最近？
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x********e
发帖数: 35261 | 150 相当好，见风长，已经是个机灵鬼了
: 你娃咋样最近？
【在 d********m 的大作中提到】
: 你娃咋样最近？
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d********m
发帖数: 3662 | 151 哈哈，孩子这个阶段最可爱了
可惜我那会是错过我儿子这个阶段了。
睡了，晚安
【在 x********e 的大作中提到】
: 相当好，见风长，已经是个机灵鬼了
:
:
: 你娃咋样最近？
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d****o
发帖数: 32610 | 152 如果拿能老师的冷冻镜拍过
知道哪里结构对应什么功能，
应该可以搞几个突变，
改改相互作用的接触面来玩
【在 x********e 的大作中提到】
: 你想要的层面当然是很难的，目前还是只能去干扰合成和降解吧
:
:
: 嗯，年轻人的确没什么MT接班人了。关键是太难做了，基本上没有任何办法
: genetic
:
: perturbation。
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: tau的发现者marc kirschner也在我们隔壁系。这里也算半个MT重镇了
:
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x********e
发帖数: 35261 | 153 你说这话是因为你对MT毫无了解。这东西一突变细胞就活不了
: 如果拿能老师的冷冻镜拍过
: 知道哪里结构对应什么功能，
: 应该可以搞几个突变，
: 改改相互作用的接触面来玩
【在 d****o 的大作中提到】
: 如果拿能老师的冷冻镜拍过
: 知道哪里结构对应什么功能，
: 应该可以搞几个突变，
: 改改相互作用的接触面来玩
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x********e
发帖数: 35261 | 154 MT是最经典电镜研究的案例，不需要冷冻电镜，就普通电镜
: 如果拿能老师的冷冻镜拍过
: 知道哪里结构对应什么功能，
: 应该可以搞几个突变，
: 改改相互作用的接触面来玩
【在 d****o 的大作中提到】
: 如果拿能老师的冷冻镜拍过
: 知道哪里结构对应什么功能，
: 应该可以搞几个突变，
: 改改相互作用的接触面来玩
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d****o
发帖数: 32610 | 155 MT是啥？
能不能在保留正版的基础上
只生产一点点改造的，
观察影响？
【在 x********e 的大作中提到】
: 你说这话是因为你对MT毫无了解。这东西一突变细胞就活不了
:
:
: 如果拿能老师的冷冻镜拍过
:
: 知道哪里结构对应什么功能，
:
: 应该可以搞几个突变，
:
: 改改相互作用的接触面来玩
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d****o
发帖数: 32610 | 156 俺说的是具体结构
蛋白上哪一坨负责跟另外的蛋白接触，
就在那里改一两个氨基酸，
加个坑或者埋个包，
干扰一下功能
普通电镜能看这个？
【在 x********e 的大作中提到】
: MT是最经典电镜研究的案例，不需要冷冻电镜，就普通电镜
:
:
: 如果拿能老师的冷冻镜拍过
:
: 知道哪里结构对应什么功能，
:
: 应该可以搞几个突变，
:
: 改改相互作用的接触面来玩
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x********e
发帖数: 35261 | 157 微管不是蛋白，是微管蛋白构成的高级结构。功能是由这个结构完成，不能扰乱就只能
观测不能验证假设。
: 俺说的是具体结构
: 蛋白上哪一坨负责跟另外的蛋白接触，
: 就在那里改一两个氨基酸，
: 加个坑或者埋个包，
: 干扰一下功能
: 普通电镜能看这个？
【在 d****o 的大作中提到】
: 俺说的是具体结构
: 蛋白上哪一坨负责跟另外的蛋白接触，
: 就在那里改一两个氨基酸，
: 加个坑或者埋个包，
: 干扰一下功能
: 普通电镜能看这个？
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p******g
发帖数: 8316 | 158 microtubule (MT)
【在 d****o 的大作中提到】
: MT是啥？
: 能不能在保留正版的基础上
: 只生产一点点改造的，
: 观察影响？
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p******g
发帖数: 8316 | 159 中文就是微管
【在 d****o 的大作中提到】
: MT是啥？
: 能不能在保留正版的基础上
: 只生产一点点改造的，
: 观察影响？
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p***n
发帖数: 17190 | 160 唉
我也不想養細菌啊
【在 x****6 的大作中提到】
: 生物是癌症
: 物理是生物
: 化学是生物
: 今天的物理炸药奖就是物理在生物里的应用。
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