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O**W
发帖数: 58 | 2 自中国湖北省武汉市首次报道新型肺炎（COVID-19）以来，关于致病性病毒SARS-CoV-2
的起源一直存在大量讨论和不确定性。截至2020年2月14日，已确诊64473例，其中死亡
1,384例。该病毒显然能够在人与人之间有效的传播。由于目前尚无针对该疾病的疫苗
或特异性疗法，基于存在可能传播到医疗体系较弱的国家风险，WHO已宣布COVID-19疫
情为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）。
SARS-CoV-2是已知感染人类的冠状病毒科的第七名成员。 其中，三种病毒（SARS CoV-
1，MERS和SARS-CoV-2）可以引起严重的疾病。 四种病毒（HKU1，NL63，OC43和229E）
与轻度呼吸道症状有关。
该论文综述了从可用基因组序列数据的比较分析中可以推断出SARS-CoV-2的起源和早期
进化的方法。 值得注意的是，该论文提出了SARS-CoV-2基因组的显著特征，并讨论了
可能出现这些特征的场景。 重要的是，该分析为“SARS-CoV-2不是实验室产物也不是
有意操纵的病毒”这一论点提供了证据。
通过对α和β冠状病毒（冠状病毒科家族）的基因组比较确定了SARS-CoV-2基因组的两
个显着特征：
1）基于结构模型和早期生化实验，SARS-CoV-2似乎发生了进化，更易与人类的ACE2受
体相结合;
2）SARS-CoV-2在高度可变的刺突蛋白上出现一个酶切点，并在旁边发现了其他冠状病
毒中不存在的连续的十二个核苷酸的序列和3个O-连接聚糖。
特征1分析：
SARS-CoV-2的受体结合域的突变。SARS-CoV和SARS类冠状病毒的刺突蛋白中的受体结合
域（RBD）是病毒基因组中最易变化的部位。RBD中的六个氨基酸（残基）对于确定可能
的宿主范围至关重要。基于结构模型和早期生化实验，SARS-CoV-2似乎发生了进化，使
得更便于与人类的ACE2受体相结合。
如果使用SARS-CoV的基因组为参考，之前的实验证明 SARS-CoV-2中影响与人类ACE2受
体结合亲和力的6个相应氨基酸为L455，F486，Q493，S494，N501和Y505（注：F486代
表在第486位的氨基酸是苯丙氨酸）。这六个氨基酸中的五个在SARS-CoV-2中发生了突
变。
根据之前的研究，SARS-CoV-2似乎具有的一种受体结合域RBD，其可能与人、非人灵长
类、雪貂、猪和猫以及其他具有高受体同源系物种中的ACE2受体的亲和力很高。相比之
下，SARS-CoV-2与携带类SARS病毒相关的其他物种（包括啮齿动物和蜂巢）中的ACE2受
体的结合较为低效。
SARS-CoV-2 S蛋白中第486位残基的苯丙氨酸（F）对应于SARS-CoV Urbani菌株中的
L472。值得注意的是，在SARS-CoV细胞培养实验中，L472突变为了苯丙氨酸（L472F）
，虽然这种突变会显著提高病毒与人体受体结合的亲和力，然而该突变在自然宿主蝙蝠
和穿山甲的相关冠状病毒中都早已经存在了（蝙蝠的几个类SARS冠状病毒中也在对应位
置有苯丙氨酸），因此不能说这是刻意人为生成的突变。况且，之前的研究表明这种突
变并不是最强的突变方法。
另外5个氨基酸也都有可能导致亲和力的增强，如果真是某个分子生物学家的阴谋，那
他其实可以利用已有技术把其他5个氨基酸也都突变成更严重的组合。因此，SARS-CoV-
2的刺突似乎是在人或类人的ACE2受体上自然选择的结果，而不是基因工程的产物。
特征2分析：
酶切位点和O-连接聚糖。SARS-CoV-2在高度可变的刺突蛋白上出现一个酶切点，并在旁
边发现了其他冠状病毒中不存在的连续的十二个核苷酸的序列和3个O-连接聚糖（注：
酶切位点通常是人工基因重组技术留下的痕迹，这也是该病毒被怀疑是人为的原因）。
SARS-CoV-2的第二个显著特征是在两个亚基S1和S2的交界处的刺突蛋白中有一个多碱基
切割位点（RRAR）。
除了两个基本的精氨酸和一个在切割位点的丙氨酸外，还插入了一个脯氨酸。因此，完
全插入的序列是PRRA。重要的是，这个SARS-CoV-2病毒与任何已知的冠状病毒在核酸序
列组成上有不少细节上的变化，也说明了这个病毒并不是由一个已知的模板改造而生成
的病毒。
尽管尚不完全清楚，但这个可疑酶切位点和连续的十二个核苷酸的序列会使得SARS-CoV
-2在S蛋白上形成一个O-连接聚糖结构，之前研究也表明类似的结构可以导致禽流感病
毒和新城疫病毒提高致病性。如果这样的病毒模板真的存在，那么要想通过细胞培养或
动物传代产生SARS-CoV-2将需要事先分离具有非常高遗传相似性的祖病毒。
然后，要在细胞培养物中进行大量传代程序，并且产生这样的多碱基切割位点。从理论
上讲，SARS-CoV-2有可能在适应细胞培养传代过程中获得可观察到的RBD突变位点，正
如在SARS-CoV5和MERS-CoV31的研究中所观察到的那样。然而这个O-连接聚糖结构是不
可能通过体外细胞培养的方式得到，因为这种突变通常需要机体免疫系统的参与。
结论：
在全球COVID-19公共卫生紧急情况中，对动物病毒如何越过物种边界来如此有效地感染
人类的详细了解将有助于预防未来的人畜共患病事件。 本文描述的基因组特征可以部
分解释SARS-CoV-2在人类中的传染性和传播性。尽管基因组证据表明该病毒不可能是人
工产物，但目前尚无法完全证明或反证出真正的传播过程。当务之急是控制疫情，并持
续寻找更直接的中间宿主以防止再次暴发。 |
O**W
发帖数: 58 | 3 我借用一段话来说说这些着急出来洗地的
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如果一个骰子，掷了10次，全部都是6点，你要是去问一个数学家，他会告诉你，虽然
概率非常小，但这在概率上完全有可能的，他甚至可以用公式和计算来写满10页告诉你
为什么就是可能的，背后不存在什么阴谋。
但你要是去问开赌场的赌王何鸿燊，他肯定百分百告诉你，扔10次都是6点，那这枚骰
子肯定是给出老千的人做了手脚啦，死蠢。
这个世界发生的很多事情，背后都着各种各样的原因。有一些你能在公开的渠道得到确
认，但并不是所有事情的起因我们都能透过公开渠道得到答案的。
世界的运行本来就是一个黑盒。很多时候我们只能看到输出的结果，但最初的输入条件
和中间经过了盒子内部什么函数的运算，我们是看不清的。
在我看来，武断地把所有尚未得到考证的结论，一棍子全部都打死，归类为所谓的“阴
谋论”，恰恰是一个最大的阴谋，这个阴谋的目的就是服务于阴谋背后的既得利益者阻
碍更多的人去发掘世界的真相。 |
n******6
发帖数: 64 | 4 用"另外5个氨基酸也都有可能导致亲和力的增强，如果真是某个分子生物学家的阴谋，
那他其实可以利用已有技术把其他5个氨基酸也都突变成更严重的组合。"作为理由，来
推断 “因此，SARS-CoV-2的刺突似乎是在人或类人的ACE2受体上自然选择的结果，而
不是基因工程的产物”
这是什么逻辑思路？还不如“因为这4个氨基酸可能导致亲和力的增强，所以它是基因
工程的产物”来的合理一些。 |
S**********p
发帖数: 331 | 5 ”如果真是某个分子生物学家的阴谋，那他其实可以利用已有技术把其他5个氨基酸也
都突变成更严重的组合”
也可能这个分子千老用这种方式告诉大家，这次不过是warning shot，还没动真格的 |
O**W
发帖数: 58 | 6 翻译貌似不是完全一句一句对译
原文应该是这一段里面后半段
The phenylalanine (F) at residue 486 in the SARS-CoV-2 S protein corresponds
to L472 in the SARS-CoV Urbani strain. Notably, in SARS-CoV cell culture
experiments the L472 mutates to phenylalanine (L472F)5, which is predicted
to be optimal for binding of the SARS-CoV RBD to the human ACE2 receptor6.
However, a phenylalanine in this position is also present in several SARS-
like CoVs from bats (Figure 1a). While these analyses suggest that SARS-CoV-
2 may be capable of binding the human ACE2 receptor with high affinity, the
interaction is not predicted to be optimal1. Additionally, several of the
key residues in the RBD of SARS-CoV-2 are different to those previously
described as optimal for human ACE2 receptor binding6. In contrast to these
computational predictions, recent binding studies indicate that SARS-CoV-2
binds with high affinity to human ACE27. Thus the SARS-CoV-2 spike appears
to be the result of selection on human or human-like ACE2 permitting another
optimal binding solution to arise. This is strong evidence that SARS-CoV-2
is not the product of genetic engineering.
【在 n******6 的大作中提到】
: 用"另外5个氨基酸也都有可能导致亲和力的增强，如果真是某个分子生物学家的阴谋，
: 那他其实可以利用已有技术把其他5个氨基酸也都突变成更严重的组合。"作为理由，来
: 推断 “因此，SARS-CoV-2的刺突似乎是在人或类人的ACE2受体上自然选择的结果，而
: 不是基因工程的产物”
: 这是什么逻辑思路？还不如“因为这4个氨基酸可能导致亲和力的增强，所以它是基因
: 工程的产物”来的合理一些。
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发帖数: 1 | 7 和五毒所没有关系，剩下的交给国家吧,你不必说出来了 |
