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攻坚结构生物学难题 清华学生在《自然》发表学术论文 (转载)[合集] 八卦以下, 颜宁和一宫 (转载)
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话题: 颜宁话题: 学生话题: 实验话题: 研究话题: 结构
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与颜宁初次见面,还是在2008年春。当我赶到医学院的时候,院办的老师说,颜宁老师
还在做实验,一会儿就过来。过了几分钟,那位老师指着走廊中过来的几位学生说:“
看,颜宁来了!”我左看右看找不到哪位是老师,最后走在一位高个子男生后面的“女
生”跟我打招呼:“你找我?”我顿时语塞——这是颜宁?这分明是一个清纯的“清华
女生”——这是颜宁留给我的最初印象。
后来接触得多了,才真正感觉到:年轻,正是颜宁的特质。如果说1977年出生的她
,有着“80后”的外表,那么她的内心更藏着一个“90后”的精灵。科学研究,在她那
里从来不是一个沉重的话题和事物,而是一种非常让人着迷的快乐。而生活中的她有着
活泼的性格和直爽的性子——和她谈话,不由自主地也变得天真起来。
“现在回头看,
回国是完全正确的选择”
对颜宁影响最大的母校有两个——清华大学和普林斯顿大学。在清华大学,颜宁走
入生物系进行了本科阶段的学习,清华严谨的学风和扎实的培养给了她做学问的基础;
在普林斯顿大学,颜宁师从施一公教授进行了博士和博士后阶段的研究,进而对微观世
界下的生命过程产生了极为浓厚的兴趣,而普林斯顿大学严格的科研训练也给了她在科
学领域飞翔的彩色翅膀。
2007年初,博士后课题告一段落,原本打算只是回国探亲的颜宁,意外地接到了清
华大学生物系原系主任、医学院常务副院长赵南明教授的邀请,请她回到母校,加盟医
学院。之后,颜宁通过了医学院教授会的面试,成为清华大学当时最年轻的教授和博士
生导师。
2010年,清华大学生命科学领域进行了综合国际评估,专家对颜宁的评价是:“未
来5年到10年,她将成为杰出青年女性科学家的榜样。”
如今已经回国5年,谈起当时自己的选择,颜宁毫不犹豫地说:“现在回头看,回
国是完全正确的选择。”
颜宁领导的实验室进行的是生物学领域最为前沿的科学研究,包括对于膜蛋白和植
物脱落酸受体的结构和生物学机理的研究。
颜宁回到清华的研究工作是从装修实验台、订购仪器试剂、手把手教学生做实验开
始的,可以说是“白手起家”。
一名年轻的老师带着几个学生,在一个没有任何积累的新的实验室敢于向结构生物
学最难的领域发起挑战,外人看来有点不可思议。
但就是在这种起点上,只用了5年的时间,她带领的研究团队或是独立完成或是与
别的团队合作解析了5个膜蛋白结构并分析了其功能机理,她以独立或共同通讯作者身
份发表或被接受了11篇研究论文,其中包括5篇CNS(即Cell,Nature,Science,国际
顶级学术期刊)论文。2009年,颜宁领导的关于脱落酸受体的结构与功能机理的研究,
与同年欧、美、日本的同类研究成果一起入选《科学》杂志评选的“2009年科学十大进
展”。
这种速度就连颜宁自己也十分惊讶:“以前想着我回来这几年能发表两三篇论文,
一项拿得出手的工作就够了,但是清华的学生太聪明太能干了,我完全没有预料到会有
这样的速度。如果我在国外以同样的起点同样的时间作研究,我想不会这么高产。”
为什么能够在这么短的时间内取得这么好的研究成果?颜宁总结出几个因素:
第一,因为清华的学生有着踏实的作风和优秀的素质,能够在很短的时间内使课题
实现质的“突破”;
第二,在实验室各项工作启动前期,学校和学院提供了充分的保障,使研究人员不
用为科研以外的问题分心,从而可以心无旁骛地做科研;
第三,师生间协作非常紧密,有问题随时解决,方向偏了随时纠正;
第四,结构生物学研究中心几个实验室的团队合作紧密,不同实验室资源共享,互
相取长,互相配合,互相借鉴,大大提高了实验的效率。
然而,如果不是我问起,她很少提到自己的工作状态:从上午11点开始,除去用餐
时间,她可以一直连续工作到凌晨2点。如果是在研究的攻坚阶段,甚至可以工作到凌
晨五六点,在办公室的沙发上眯一会儿再爬起来接着工作。这种高强度的研究工作,如
果不是乐在其中,常人很难做到。
颜宁说:“时间花在哪里是看得到的。就我自己而言,要想科研工作出成果,投入
很重要。回来之后,除去外出开会、春节和我休息之外,百分之八九十的时间都在实验
室或办公室,这种状态我非常享受。”
回顾这5年,她总结道:“我最满意的是把一个我开始认为非常有挑战性的领域做
到不再可怕。我的实验室积累了大量做膜蛋白的经验,培养了一批做膜蛋白结构生物学
的年轻人,我们现在信心满满地挑战更有生理意义的靶标。”
“学生超越我愈多我会愈加高兴”
眼前的颜宁,除了皮肤看上去稍稍有些干燥之外,岁月好像并没有在她的外表留下
太多痕迹。谈及此,她扮了个鬼脸说:“天天在实验室跟学生在一起,心态自然年轻啦
!”
虽然已经在清华做了5年的教授,但是颜宁至今一直保持的习惯是,每天都要在实
验室,即时跟随学生的研究进展,及时发现问题、解决问题。
只要不是在写论文,她会跟学生一起到实验室做实验,也会到结晶室跟学生一起长
蛋白质晶体。学生如果发现蛋白质纯化中或者蛋白质晶体生长中出现了什么新情况或问
题,随时都可以去喊她,她一定会去和学生一起研究蛋白质纯化结果,分析蛋白质晶体
的情况,看完之后跟同学们讨论下一步的实验该如何进行。
作为导师,她实验室的学生们在进行不同的课题,但是她对于每个课题的进展都非
常了解,每次跟同学们坐在一起讨论的时候,她经常说,上周你课题进行到哪里哪里了
,这几天有没有什么新的进展……这样亦步亦趋地紧紧跟随每个学生的研究步伐,可以
随时发现进程中的问题,进而改进实验。
在学生心目中,颜宁既是一位没有一点架子的“朋友型”导师,又是一位要求严格
会发脾气的“严师型”导师,她会在中午的时候在实验室吆喝“有没有人去吃饭”,或
是在某个晚上张罗一群人玩“三国杀”的游戏,也会在同学们犯错误的时候给予严厉的
批评。
李硕是清华大学医学院2007级博士研究生,他是颜宁的第一个博士生。2011年3月
20日,在颜宁的指导下,李硕和另外一位博士生作为共同第一作者在《自然》发表了题
为Structure and Mechanism of the Uracil Transporter UraA(《尿嘧啶转运蛋白
UraA的结构和机制》)的科研论文,在世界上首次解析了核苷碱基-维生素C转运(NAT
Nucleobase/Ascorbate Transporter)蛋白家族的代表性成员蛋白UraA的晶体结构,并
且发现了一种新颖的膜蛋白折叠类型。
谈起当年在颜宁老师指导下进行的研究,李硕感慨良多。
在课题的最后阶段,需要做生化实验分析蛋白结构的工作机理。从来没有做过类似
实验的他们一开始非常困惑,甚至有些畏惧的心理,但是颜宁鼓励他们大胆尝试,说,
最不好的情况就是做不出来结果,没什么可怕的。
然而最开始的几周,实验结果并不好。为了寻找问题所在,颜宁每天下午跟他们进
行讨论,晚上跟他们一起做几组实验,反复几次之后发现总有一个数据跟理想数值差距
很大,经过反复测算,颜宁最终发现是在做实验的时候,由于学生的疏忽把一个溶液的
浓度弄错了,进而导致整个实验出现了偏差。
当晚,颜宁跟他们谈了很久,告诉他们如果要做一个好的科学家,首先要严谨,要
重视细节,要对数据负责,否则很多重要的信息都会丢掉,实验的成功也无从谈起。
曾经在颜宁的指导下以第一作者在《自然》发表论文的博士研究生党尚宇说:“如
果你沮丧的话,颜老师会给你特别特别多的鼓励,她是一个很有活力的人,对科研很有
激情,这种激情会感染我们所有的人。”
党尚宇、孙林峰、黄永鉴3位清华学生为主力的课题组,用了1年半的时间,解析了
膜蛋白——大肠杆菌岩藻糖(L-fucose)转运蛋白(FucP)的结构,并结合生化手段初
步揭示了其工作机理。这项研究成果于2010年10月7日在《自然》发表。
在进行解析膜蛋白研究的时候,党尚宇和孙林峰遇到了前所未有的障碍:千辛万苦
得到的蛋白质晶体,即便是反复多次进行实验,得到的衍射数据还是不理想,大大低于
预期。在这种时候,两个年轻人想过放弃,也想过把整个实验设计推倒重来。
在这个关键时刻,颜宁鼓励他们说:“膜蛋白的研究,某种程度上就是要看谁先放
弃!谁先放弃谁就输了,坚持到最后的就赢了。再难的,以前人们认为不可能的事情,
科学家们都研究出来了,还有什么做不出来的呢?”
颜宁鼓励两个年轻人坚持下去,并且一直和他们一起讨论实验结果和下一步的实验
方案,最终在经过坎坷之后取得了满意的研究结果。
不仅是在科研中,在生活上和个人职业规划上,颜宁也扮演着“导师”的角色:
一位非常优秀的女生失恋之后一蹶不振,颜宁就特别留意这位女生的状态,拉她吃
饭跟她谈心,帮助她尽快走出阴影;
一位博士二年级的女生在男友出国之后几乎要放弃学业,颜宁鼓励她联系到了出国
合作项目,使得她事业生活两不误;
有的学生在经过一段时间的研究后对于选题有了自己的想法,希望做一个自己非常
感兴趣但是并不是实验室主攻方向的课题,颜宁也给予了全力的支持;
有位学生经过慎重考虑之后准备放弃科研工作转而投身管理工作,颜宁在经过与这
位学生的多次沟通后,确认这位学生在管理工作方面有着出色的潜质后非常支持学生本
人的选择,并积极提供给学生锻炼的机会......
颜宁还会尽力在经费允许的最大限额下给学生们提高生活补贴,发表论文得到的学
院或学校的奖励全部发给学生。她希望她的学生们都可以尽量在没有生活压力的情况下
尽情享受科研。
谈起对于学生本人的尊重,她说:“我会用行动让学生们意识到,学生不是所谓‘
老板’的劳力,从学生进实验室的那一刻开始,就已经是青年科学家了。导师的存在是
为了在大家的科研之路上辅导大家,是为了让大家得到更好的科研训练之后获得更多个
人更好发展的机会,我们是在成就彼此。他们将来越有出息,超越我愈多,我会愈加高
兴。”
虽然对学生们的评价很高,但是颜宁还是觉得,学生们太“乖”了,自己有责任有
义务让他们更加活跃起来。她鼓励学生跟自己“唱反调”,如果学生在课题组的研讨会
上跟她就学术问题争论起来,她会在争论之后马上肯定这个学生积极思辨的态度。
不仅是跟自己争论学术问题,颜宁还鼓励学生在国际会议上跟“大牛”们提问讨论
:“之所以这么逼着学生在国际会议上去问问题,不是为了面子,而是有感于我们的学
生会做的多,说的少。‘行胜于言’不代表不会言,所以要抓住各种机会训练自己的表
达和交流能力,慢慢这其中的益处就显现出来了。”
2011年4月和5月,在清华大学和苏州分别有两个高级别的国际会议,颜宁的学生们
悉数参加。
早在会议召开之前,颜宁就“恶狠狠”地警告学生,会认真记录谁在会上提问了,
谁在休息时间和作演讲的科学家们交流了。表现好的有奖,自己“扎堆”聊天的回来等
着挨批评。
在颜宁的的激励下,学生们表现不俗。4月在清华的会议上,也许是因为在自己的
“地盘”有心理优势吧,几乎每个学生都问了至少一个问题,其中不乏精彩者。
颜宁在美国的同事对她说:“我以为中国的学生很内向,可他们好像比美国学生还
敢提问。”
而5月份在苏州召开的会议上,学生们不仅提问踊跃,而且在休息和吃饭时间,已
经和作演讲的科学家们三三两两地在一起谈笑风生,讨论感兴趣的话题。
“就是要做出玩科学的感觉”
在结构生物学研究中心走廊的墙壁上,挂着颜宁和学生们几幅充溢着想象力的“画
作”:
在八聚体的蛋白质结构上,她描上了中国的太极八卦图,两幅图在分布和线条上“
不谋而合”,使研究内容“细胞凋亡体”与古老的哲学命题浑然一体,不得不让人惊叹
大自然的神奇;
翻飞的蝴蝶做背景,与蛋白质分子的α螺旋结构交相辉映,旁边配上沾着露珠的小
草,让人无限遐想……
而在给NAT蛋白家族代表UraA绘制其转运机制示意图的时候,她给学生隆重地推出
了“板砖闷棍”模型——核心结构域就是“板砖”,门控结构域就是“闷棍”,听来十
分诙谐,但是仔细想想也不无道理,十分形象。聊起此图来,颜宁也是“忍俊不禁”。
那些别人觉得枯燥无趣的蛋白质结构,在颜宁的眼中,仿佛都有着神奇的生命力:
“当你把细胞里那些只有几到几十纳米大小的蛋白质分子通过X射线衍射的方法解析出
原子分辨率的结构,在电脑上放大几亿倍之后,清清楚楚地看到这些美丽的构造如何行
使复杂的功能时,你总忍不住要感叹大自然的聪明——她的精妙设计很多时候远远超出
了我们的想象!而你是世界上第一个揭示出这些大自然奥秘的人,那种成就感和满足感
是难以言喻的。”
而爱上了这个神秘而美丽的世界,或许就是颜宁乐此不疲地工作着的重要原因吧!
她说:“在做科研的时候有三个时刻最畅快,一是解决了实验中困扰已久的难题,
也许就像武侠小说中打通任督二脉那一刻的感觉;二是实验出结果的时候,那时你会为
崭新的发现而狂喜不已;最后一个就是论文发表的时候,这主要在一定程度上满足了我
从小的‘作家梦’,尽管文笔有点对不起大家。科研做到一定程度,就没有工作的压力
了,到最后是玩科学的感觉,这种感觉非常棒!”
喜欢穿休闲的衣服,喜欢用小小的恶作剧捉弄身边的人,喜欢在时间不太紧张的时
候每天睡到自然醒,喜欢在思考或写作卡壳的时候到网上转转或是看看电影和小说,这
,是喜欢无拘无束的颜宁。
同样是这位女子,喜欢和学生在科研问题上争论得面红耳赤,可以连续工作48个小
时丝毫不觉得疲惫——这也是颜宁,她忠实于自己的内心,做自己喜欢做的事情。
颜宁说:“做科研要做得狠,玩也要玩得狠,这是性格原因吧。还好,我调剂得还
挺好的,都是乐在其中。”
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施一公博文:在普林斯顿大学做助理教授的日子(zz科学网)美国《商业周刊》:半数华人学者愿回国 (转载)
懂行的说说这两个教育部新世纪优秀人才什么水平?ZT:中组部千人计划海归典型人物
清华颜宁拿到杰青了八卦以下, 颜宁和一宫 (转载)
原标题:颜宁为何从清华跳槽去美国普林斯顿大学,她终于说出原Re: Re: 八卦以下, 颜宁和一宫 (转载)
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