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Statistics版 - 请大家说说用C/C++做统计模拟吧!
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请问C#/C++有什么好的statistic library?生物PHD在读第一年,想转统计~请大家指点下吧
Any one who have called C++ function in R and the C++ used gsl library ? 准统计新成员弱弱地问: 大家常用的软件是什么? SAS, Matlab? 还有其他地吗?
这儿有人用c++么。转学应用统计咨询
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相关话题的讨论汇总
话题: imsl话题: c++话题: fortran话题: 统计话题: library
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1 (共1页)
s******e
发帖数: 20
1
最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
多点循环或者大点矩阵就out of memory了。
下面具体说下我的疑惑吧。
我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来也是快白搭。
所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
用C做统计计算,要注意些什么。
如能推荐相关资料那是再好不过的了。
B******5
发帖数: 4676
2
很多人用C做统计计算的,你看看R里面很多package的核心都用C写的,R有个不错的
interface给C和fotran的

【在 s******e 的大作中提到】
: 最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
: 多点循环或者大点矩阵就out of memory了。
: 下面具体说下我的疑惑吧。
: 我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
: 我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
: 如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
: 如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
: 用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来也是快白搭。
: 所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
: 用C做统计计算,要注意些什么。

t********e
发帖数: 7
3
谭浩强里面太细节的没啥用
会写loop, function, class, 和基本传指针参数啥的我觉得差不多就够了
反正只是做computation, 我是不能保证我程序最优化的:) 不过还是比R
快多了
还有好多现有的package可以去下载了直接用,比如lapack

【在 s******e 的大作中提到】
: 最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
: 多点循环或者大点矩阵就out of memory了。
: 下面具体说下我的疑惑吧。
: 我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
: 我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
: 如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
: 如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
: 用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来也是快白搭。
: 所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
: 用C做统计计算,要注意些什么。

D******n
发帖数: 2836
4
I used GSL

【在 t********e 的大作中提到】
: 谭浩强里面太细节的没啥用
: 会写loop, function, class, 和基本传指针参数啥的我觉得差不多就够了
: 反正只是做computation, 我是不能保证我程序最优化的:) 不过还是比R
: 快多了
: 还有好多现有的package可以去下载了直接用,比如lapack

d******e
发帖数: 7844
5
学fortran吧。

【在 s******e 的大作中提到】
: 最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
: 多点循环或者大点矩阵就out of memory了。
: 下面具体说下我的疑惑吧。
: 我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
: 我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
: 如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
: 如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
: 用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来也是快白搭。
: 所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
: 用C做统计计算,要注意些什么。

A*****n
发帖数: 243
6
也可以直接修改R的一些函数的C代码,我以前就直接用ks.test的C代码修改之后编译,
中间可能用到GSL实现一些排序或者矩阵的运算。
没具体作过测试,但是想过去内存占用可能会少,不过运算速度可能不会提高很多,毕
竟R很多时候也是调用一些so文件。

【在 B******5 的大作中提到】
: 很多人用C做统计计算的,你看看R里面很多package的核心都用C写的,R有个不错的
: interface给C和fotran的

b****z
发帖数: 337
7
你需要个数学统计库函数, 如IMSL或者 numerical recipes
you do not want to write everything by yourself.
It is painful at first with debugging, but after that it should be fine.
I use Fortran (Compaq Visual Fortran, Intel Visual Fortran with IMSL),
not C/C++, but I think their computational power should be similar.
I once compared R and Fortran for one project
R: several hours (> 2.5)
Fortran: 1 min
Of course, I never care about optimization, as long as it works.
你说的这些函数,可以很方便地在LIBRARY中找到,如IMSL
call rnnoa/rnnof/

【在 s******e 的大作中提到】
: 最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
: 多点循环或者大点矩阵就out of memory了。
: 下面具体说下我的疑惑吧。
: 我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
: 我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
: 如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
: 如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
: 用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来也是快白搭。
: 所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
: 用C做统计计算,要注意些什么。

v****s
发帖数: 1112
8
true, u just need a library.

【在 b****z 的大作中提到】
: 你需要个数学统计库函数, 如IMSL或者 numerical recipes
: you do not want to write everything by yourself.
: It is painful at first with debugging, but after that it should be fine.
: I use Fortran (Compaq Visual Fortran, Intel Visual Fortran with IMSL),
: not C/C++, but I think their computational power should be similar.
: I once compared R and Fortran for one project
: R: several hours (> 2.5)
: Fortran: 1 min
: Of course, I never care about optimization, as long as it works.
: 你说的这些函数,可以很方便地在LIBRARY中找到,如IMSL

s******e
发帖数: 20
9
但是需要什么样的library呢?
去哪里装?
要是能有这方面的入门书或者别人写好的
C code来做simulation先学学就好了。

【在 v****s 的大作中提到】
: true, u just need a library.
B****n
发帖数: 11290
10
If you only need to use C to do one thing, you can consider writing a C
subroutine only for that purpose, and write other parts in R and call the C
subroutine.

【在 s******e 的大作中提到】
: 最近有个想法,就是想用C/C++做统计计算,因为用R,matlab都很慢,效率不高。
: 多点循环或者大点矩阵就out of memory了。
: 下面具体说下我的疑惑吧。
: 我的C的就是学过谭浩强那本C语言,然后就在没有接触其他的了。
: 我总是想有些在R里面很容易实现的东西在C里面好像很困难。
: 如 生存伪正态随机数,在R里就 rnorm 可以实现,
: 如 矩阵求逆,R 用 solve 即可,还有很多例子。而这些要
: 用C写的话,就很慢,出错的可能也增多,即使运行起来也是快白搭。
: 所以请板上用C/C++做统计计算的人,指点一下,应该怎么入门
: 用C做统计计算,要注意些什么。

相关主题
C programming in statistics[合集] 帮我姐姐问,她要申请哈佛的统计,不知道可否?请帮参考.
看来公司是想把我们全开掉了生物PHD在读第一年,想转统计~请大家指点下吧
关于R的优劣,与其他软件的比较准统计新成员弱弱地问: 大家常用的软件是什么? SAS, Matlab? 还有其他地吗?
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o****o
发帖数: 8077
11
可以到veryCDs上下IMSL的C函数库
http://www.verycd.com/topics/125157/

【在 s******e 的大作中提到】
: 但是需要什么样的library呢?
: 去哪里装?
: 要是能有这方面的入门书或者别人写好的
: C code来做simulation先学学就好了。

f*******e
发帖数: 9
12
我从来都很懒得去写c
而是写成可以高度并行化的东西放到cluster上去跑
毕竟R的用在开发上时间要比C短的多
可以节约更多的时间去作其他事情
钱吗。。。 我是80后。。。
f*******e
发帖数: 9
13
我一直在想如果用imsl作出来的东西是不是就不能写成R package拿来每个人都用了呢?

【在 o****o 的大作中提到】
: 可以到veryCDs上下IMSL的C函数库
: http://www.verycd.com/topics/125157/

o****o
发帖数: 8077
14
你买正版的IMSL,写个免费的R package应该还是可以的吧

呢?

【在 f*******e 的大作中提到】
: 我一直在想如果用imsl作出来的东西是不是就不能写成R package拿来每个人都用了呢?
n*****3
发帖数: 1584
15
so u get some 正版的IMSL, everybody else could use part of it?
I do not think so.
BTW it is very hard to use IMSL to write a R package,
u could not see the source code, which makes it very hard to debug/test.
Not the mention write open source software with some close source library.
better use GSL , lapack .....
just my 2 cents.

【在 o****o 的大作中提到】
: 你买正版的IMSL,写个免费的R package应该还是可以的吧
:
: 呢?

d***g
发帖数: 15
16
我也懒得学C
对并行运算不了解,能不能展开讲讲,或给个链接。很想学学这方面的东西。

【在 f*******e 的大作中提到】
: 我从来都很懒得去写c
: 而是写成可以高度并行化的东西放到cluster上去跑
: 毕竟R的用在开发上时间要比C短的多
: 可以节约更多的时间去作其他事情
: 钱吗。。。 我是80后。。。

1 (共1页)
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关于转行统计的前景看来公司是想把我们全开掉了
化学博士找生统博后有戏吗?关于R的优劣,与其他软件的比较
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请问C#/C++有什么好的statistic library?生物PHD在读第一年,想转统计~请大家指点下吧
Any one who have called C++ function in R and the C++ used gsl library ? 准统计新成员弱弱地问: 大家常用的软件是什么? SAS, Matlab? 还有其他地吗?
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