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Statistics版 - [合集] 请科普一下biostatistics and bioinformatics
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[合集] 帮忙选校: bioinformatics vs. biostatistics请科普一下biostatistics and bioinformatics
欢迎申请BIOSTATISTICS@ULbioinformatics和biostatistics是差不多的吗
difference between biostatistics and bioinformatics?请教offer 选择: biostatistics 还是bioinformatics
都tmd生物搞的。。。请问大家都是怎么找到summer intern的呢?
statistical genetics这个方向和生统有何差别?phd 选校求指导,谢谢!
哪个更好一点呢?生物统计 fresh MS graduate 找工作好难啊
请帮忙分析一下统计专业方向的特点Position: Research Scientist in Biostatistics/Bioinformatics
大家来说说对biostatistics领域界定的理解[合集] 有关PITTSBURGH的Biostatistics PhD 申请
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p********a
发帖数: 5352
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Dreamer1122 (MX) 于 (Sat Aug 13 18:04:55 2011, 美东) 提到:
Biostatistics is the analysis of biological data using statistical
mathematics.
Bioinformatics is the analysis and processing of biological data sets,
particularly very large ones like the type generated by the human genome
project or gene chips. The volume of information from these modern
techniques is absolutely massive and so searching that information for data
that is relevant to your particular study is a field of knowledge in itself.
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sat Aug 13 22:50:49 2011, 美东) 提到:
两者间的关系是全集与子集的关系。所以,bioinfomatics这个术语是一帮不懂生物统计的人搞出的新名词,只在较狭隘的范畴里有意义。基本上,用来解决基因数据分析(这是bioinformatics这门学科得以产生的生物学背景和基础)的方法都只能在基本统计思维下被提出来。

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drburnie (专门爆料) 于 (Sat Aug 13 23:27:43 2011, 美东) 提到:
陈大师啊,microarray都要被淘汰了,你才开始接触,就你这点经验,咋总敢这么不要
脸的去评论一个领域呢?你是脸太多不怕丢还是没有脸呢?
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sat Aug 13 23:35:04 2011, 美东) 提到:
我看,如果真有不要脸的,非你莫属。难道你能说“bioinformatics”所要处理的对象
、试图得到的结论可以与“随机性和变异性”无关?如果有关,那么在方法论上与基本
统计思维有何区别?答案是没有区别,因为它所涉及的一切问题都是随机的且存在变异。
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drburnie (专门爆料) 于 (Sat Aug 13 23:45:22 2011, 美东) 提到:
大师啊,你以为这世间上除了随机模型之外,没有别的模型了?
蛋白质空间结构,是典型的拓扑问题,经常用图论和几何来分析。
系统生物学,很多都涉及到力学模型,用偏微分方程来描述,甚至涉及到大量的有限元
计算

序列的frequency pattern查找,大量的算法问题。
还有很多问题只是用了最简单的统计工具来做预处理,核心问题都不使用统计模型来解
决。
比如Gene network,网络构建可能依靠一些简单的统计工具,比如Coexpression
Network,
但是核心分析工具涉及大量的网络拓扑。
大师啊,你真是无知者无谓的典型代表啊。
异。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sat Aug 13 23:51:16 2011, 美东) 提到:
少在这里堆砌数学名词。你以为你知道几个数学术语就可以上天?你用拓扑、图论、几何、有限元、偏微分方程、生物动力学技术等等来解决你的所谓的生物学问题,你以为你用这些数学方法来处理的对象没有随机性和变异性了?你的数学假设就能带给我们真实的世界? 笑话。
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Actuaries (striving) 于 (Sun Aug 14 00:01:20 2011, 美东) 提到:
我来模仿一下:
哲学与其他任何学科都是全集和子集的关系。所以,数学,物理,化学...都是一帮不
懂哲学的人搞出来的新名词,只在较狭隘的范畴里有意义。基本上,用来解决客观问题
的方法都只能在基本哲学思维下被提出来。
统计的人搞出的新名词,只在较狭隘的范畴里有意义。基本上,用来解决基因数据分析
(这是bioinformatics这门学科得以产生的生物学背景和基础)的方法都只能在基本统
计思维下被提出来。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 00:04:57 2011, 美东) 提到:
统计学不同于数学、物理、化学等,它是一门通用科学方法论,其根扎在哲学的认识论中,数学不过是提供一个算法支持的技术手段而已。
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drburnie (专门爆料) 于 (Sun Aug 14 00:12:59 2011, 美东) 提到:
大师作为数学盲,从来没有考虑学一点数学,相反,天天在这里鄙视数学,大师这是何
苦在这里作践自己的名声呢?当然大师也没什么名声可言,至少没啥好的名声。
几何、有限元、偏微分方程、生物动力学技术等等来解决你的所谓的生物学问题,你以
为你用这些数学方法来处理的对象没有随机性和变异性了?你的数学假设就能带给我们
真实的世界? 笑话。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 00:15:24 2011, 美东) 提到:
我从来不鄙视数学,我鄙视的是那些鄙视哲学的数学头脑们。
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drburnie (专门爆料) 于 (Sun Aug 14 00:31:03 2011, 美东) 提到:
大师啊,你整天在这里打着哲学和上帝的旗号在胡说八道,还号称自己懂哲学有信仰,
上帝都会为你感到羞耻的。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 00:32:36 2011, 美东) 提到:
你就回家自慰去吧。恕不奉陪。
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drburnie (专门爆料) 于 (Sun Aug 14 00:34:32 2011, 美东) 提到:
大师抓狂了?大师一如既往的不要脸的淡定哪里去了?
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sss1609070 (sss1609070) 于 (Sun Aug 14 00:39:31 2011, 美东) 提到:
咳咳,纯属打酱油路过,但是“无知者无畏”是类似“初生牛犊不怕虎”的意思。
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chaneason (K歌之王) 于 (Sun Aug 14 09:29:20 2011, 美东) 提到:
胡扯
统计的人搞出的新名词,只在较狭隘的范畴里有意义。基本上,用来解决基因数据分析
(这是bioinformatics这门学科得以产生的生物学背景和基础)的方法都只能在基本统
计思维下被提出来。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 14:54:13 2011, 美东) 提到:
所谓的bioinformatics是biology + informatics,即一门关于生物学信息的抽象概括
的学问。由于生物学观察数据的大量性、随机性、变异性和复杂性,有关生物信息的抽
象概括的方法学是且只能是统计学的方法,所以,我的观点是两者间的关系(在方法论
上)是全集和子集的关系。如果你认为我在胡扯,就要为此给出你的论证,至少要举出
bioinformatics中的一个要素不属于生物统计(=生物学+统计学)的范畴以支持你的观
点。
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drburnie (专门爆料) 于 (Sun Aug 14 16:11:52 2011, 美东) 提到:
呵呵,又是这种不要脸的强词夺理。
前面明明给你举了例子,你自己视而不见。
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andone (andone) 于 (Sun Aug 14 16:14:48 2011, 美东) 提到:
陈大师经常步子迈太大,你又不是不知道
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chaneason (K歌之王) 于 (Sun Aug 14 16:21:30 2011, 美东) 提到:
谁说生物统计=生物学+统计学谁就是在胡扯啊
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andone (andone) 于 (Sun Aug 14 16:23:40 2011, 美东) 提到:
statistical genetics作为生统的一个分支和bioinformatics联系非常大. 基本上
statistical genetics 偏重统计方法比如怎么做association analysis, 有
association 怎么做inference,怎么control FWER,FDR. Bioinformatics/
Computational Biology还是注重软件和算法实现.生统还做survival analysis,
clinical trial这些都是bioinformatics不做的.然后protein structural prediction
, sequence alignment生统也不太会涉及. 怎么说呢要做好生统统计知识要学好, 生物
信息计算机要学好.生物知识做辅助.
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goldmember (蔬菜<<<菜鸟) 于 (Sun Aug 14 16:40:16 2011, 美东) 提到:
高维数据也是个交集。很多统计大牛,比如bickle,speed都做。
要是把multiple testing也算进去,那就更多了,什么efron,tibshirani和前几天提
过的storey都做。
超高维数据里面的variable selection,也算bioinfo提出的问题。人就更多了。
很多bayesian都在bioinfo里发现非常好的应用,比如刘军。
prediction
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 18:13:09 2011, 美东) 提到:
本质上,bioinformatics是试图为基因数据分析提供一套方法论。这就是为什么我说bioinformaitcs与biostatistics是子集与全集的关系的原因。都是从生物学观察与实验(生物学实验从广义上说也是一种观察)的数据中抽象或归纳出普遍结论的方法学。由于观察的随机性和变异性br />
nformatics本质上就是biostatistics。既然biostatistics早已存在于学术界,那么搞出一个新名词bioinformatics就是那些无视或不懂biostatistics人的创造。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 18:15:11 2011, 美东) 提到:
请拿出证据,给出论证。如果你连这个都不能理解,我很怀疑你能否在生物学领域做好
统计工作。
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ningyan (ningyan) 于 (Sun Aug 14 21:08:02 2011, 美东) 提到:
bioinfo 范围很广,凡是用数学,统计,IT的方法来分析生物的数据都可以归为
bioinfo. 传统biostat就比较窄了。不过现在很多生统的人也在做bioinfo 。你可以看
下bioinformatics和biostatistics这两个journal都有什么文章就心里有数了。
bioinfo里有各种背景的人,统计, CS, 生物,数学,engineering。 我比较看好的是
生物+统计背景的,尤其一个lab有干有湿的这样最NB了。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Sun Aug 14 21:25:51 2011, 美东) 提到:
归根到底是统计的基本思维和原则。无论从哪个领域做bioinformatics,都必须遵循统
计的基本原则和方法论。所以,那些不懂统计的以数学、CS、生物、engineering等为
背景的人是不可能提出合理和正确的方法论或解决方案的。
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ningyan (ningyan) 于 (Sun Aug 14 22:55:49 2011, 美东) 提到:
bioinfo的讨论去生物版看看更实际。
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andone (andone) 于 (Mon Aug 15 11:18:09 2011, 美东) 提到:
能精通一门就不错了,真正生物强,统计也强的人基本没有,太不现实了。biostat还
是两方面的人合作的多,人的精力和时间有限。
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ningyan (ningyan) 于 (Mon Aug 15 12:06:34 2011, 美东) 提到:
其实我们是一个意思。呵呵。关键在于要解决生物方面的问题,这是统计和生统的弱点
,要有生物方面的人来提出问题。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Mon Aug 15 12:10:56 2011, 美东) 提到:
所以,数学背景搞生物统计的,总是等待着前沿提出的问题。如果一个位于前沿的生物
学家懂得如何构造新的统计方法来解决他的问题,他就是一个伟大的生物和统计学家了。
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ningyan (ningyan) 于 (Mon Aug 15 12:15:26 2011, 美东) 提到:
你不要总附和我,行不行? 整的我跟你一伙似的
了。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Mon Aug 15 13:24:28 2011, 美东) 提到:
Sorry, 我对“事”不对人。
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PharmD (夜里发呆) 于 (Tue Aug 16 12:19:32 2011, 美东) 提到:
在鄙校,高维数据就是bioinfo的活儿,剩下的就是俺们biostat的。
另:精算,你娃越长越帅了。
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drburnie (专门爆料) 于 (Tue Aug 16 13:10:40 2011, 美东) 提到:
现在Biostat里很多都在搞high throughphut data。Dimension动不动就几十万几百万
以上
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eternity (Stranger in a Strange land) 于 (Tue Aug 16 17:16:50 2011, 美东) 提到:
生物统计本来就和生物没什么关系
对生物避之惟恐不急,还要在生物领域做好统计工作?
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Tue Aug 16 17:56:56 2011, 美东) 提到:
可笑之极。
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Tue Aug 16 18:16:42 2011, 美东) 提到:
我也认为PharmD所在学校的那种学科划分没有道理。对高维空间的认识方法问题也只能
在统计的基本思维和逻辑下得到解决。
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drburnie (专门爆料) 于 (Tue Aug 16 18:37:57 2011, 美东) 提到:
我靠,我不得不赞一下ningyan了。
陈大师你个不要脸的,能不能不要附和我的帖子!!!
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TNEGIETNI (lovewisdom) 于 (Tue Aug 16 18:46:19 2011, 美东) 提到:
我也不得不重复一下对ningyan的回答:Sorry, 我对“事”不对人。这里是自由论坛,
是交流思想的地方。不是骂人的地方。
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ningyan (ningyan) 于 (Tue Aug 16 19:04:19 2011, 美东) 提到:
别介,别赞我。你赞我,我情愿跟大师一伙。起码大师还看得起统计硕士
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Bremen (獨孤不再) 于 (Tue Aug 16 19:08:22 2011, 美东) 提到:
誇張一點的說 對不少作生物統計的人來說 統計和生物的比率是99:1
作生物信息的不懂生物通常就沒法做出好的結果
prediction
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drburnie (专门爆料) 于 (Tue Aug 16 19:13:10 2011, 美东) 提到:
现在发现,你跟大师还真的是一丘之貉哦。
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ningyan (ningyan) 于 (Tue Aug 16 19:14:57 2011, 美东) 提到:
嗯,别跟你一类就行。看不起统计的,还在统计版混。
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ningyan (ningyan) 于 (Tue Aug 16 19:15:58 2011, 美东) 提到:
现在生统懂生物也越来越多了
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drburnie (专门爆料) 于 (Tue Aug 16 19:22:45 2011, 美东) 提到:
你很擅长大师乱扣帽子的绝招啊。
我只是认为统计硕士没什么含金量,没看不起统计。
倒是你把整个CS的Level都降到高中水平。
统计的research还是很有技术含量的,至少比你认为了不得的那几门课有技术含量多了。
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ningyan (ningyan) 于 (Tue Aug 16 19:27:07 2011, 美东) 提到:
什么叫乱扣帽子。你发的贴拿统计硕士跟CS本科比,远远比不上,什么99%, 30%,这个
谁说的。到此为止了,也不想跟你说什么了。
了。
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drburnie (专门爆料) 于 (Tue Aug 16 19:43:07 2011, 美东) 提到:
你又开始偷换概念了,呵呵。
估计你也没啥可说的了,从这帖子就看出来你已经理屈词穷了。
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ningyan (ningyan) 于 (Tue Aug 16 20:17:09 2011, 美东) 提到:
你的原话:
你把CS的本科生找来读统计硕士那点课程,99%都能轻松搞定。你把统计的硕士拿来,
让他们从头学编程,最多也就30%能坚持下来。
这个你自己信吗?还有你那个CS的master都得到了很好的training. 这个你自己信吗?
我理屈词穷了,以后不在回你的贴了。
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drburnie (专门爆料) 于 (Tue Aug 16 20:45:40 2011, 美东) 提到:
你还好意思质疑?
你前面把你同学“混出来了”归功于他们没有转行;把你自己“没混出来”归咎于你转
CS了。你自己信不信,我不知道,反正大家是不信,呵呵。
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PharmD (夜里发呆) 于 (Tue Aug 16 22:48:21 2011, 美东) 提到:
这不是学科上研究方向的划分,这是工作职能的划分。
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