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Statistics版 - 请问诸位chi-square test
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1 (共1页)
y***i
发帖数: 11639
1
看文章
http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds=
figure 2C 用了chi-square test 不能理解
我的理解数据是这样的:
以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据
是monastrol significant,所以有个星号
control conditon有5%的cell 有deviation (supplimentary tableS2 红框内数据)
monastrol condition下, clone 10 有21.9%的cell 有deviation(supplimentary
tableS2 红框内数据),然后根据chi square test,这是significant.
我的理解是只有一个数据的话,没办法做统计。如果control和monastrol condition分
别有3个数据的话,勉勉强强可以用student t test。请问我的想法对不对。如果我的
想法是错的,这里的数据的确能做chi square test的话,请略解释一下,然后请教一
下两个比较,分别只有一个数据的话,怎么用这两个数据计算这个chi-square test。
多谢!
y***i
发帖数: 11639
2
想了一想,是不是用了类似fisher exact test, 用的不是%而是实际的数据计算出来
的?
比如 control cell 计数了200个,其中10个有变化 (5%)
monastrol condistion计数了 300个,66个有变化 (21.9%)
然后就可以计算chi square pValue了?

【在 y***i 的大作中提到】
: 看文章
: http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds=
: figure 2C 用了chi-square test 不能理解
: 我的理解数据是这样的:
: 以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据
: 是monastrol significant,所以有个星号
: control conditon有5%的cell 有deviation (supplimentary tableS2 红框内数据)
: monastrol condition下, clone 10 有21.9%的cell 有deviation(supplimentary
: tableS2 红框内数据),然后根据chi square test,这是significant.
: 我的理解是只有一个数据的话,没办法做统计。如果control和monastrol condition分

M*P
发帖数: 6456
3
用count data 作的。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器

【在 y***i 的大作中提到】
: 看文章
: http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds=
: figure 2C 用了chi-square test 不能理解
: 我的理解数据是这样的:
: 以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据
: 是monastrol significant,所以有个星号
: control conditon有5%的cell 有deviation (supplimentary tableS2 红框内数据)
: monastrol condition下, clone 10 有21.9%的cell 有deviation(supplimentary
: tableS2 红框内数据),然后根据chi square test,这是significant.
: 我的理解是只有一个数据的话,没办法做统计。如果control和monastrol condition分

y***i
发帖数: 11639
4
也就是说有点象fisher exact test? 用count的control/sample 变化/不变 的table
算出chi square count 然后查表算出来?
多谢!

【在 M*P 的大作中提到】
: 用count data 作的。
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器

s**f
发帖数: 365
5
This is proportion test, or z test ba.

【在 y***i 的大作中提到】
: 也就是说有点象fisher exact test? 用count的control/sample 变化/不变 的table
: 算出chi square count 然后查表算出来?
: 多谢!

l****u
发帖数: 529
6
这么大的sample size 没必要用Fisher

【在 y***i 的大作中提到】
: 也就是说有点象fisher exact test? 用count的control/sample 变化/不变 的table
: 算出chi square count 然后查表算出来?
: 多谢!

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