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Statistics版 - 求教:Cox PH 模型的cluster data处理
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1 (共1页)
u*****8
发帖数: 180
1
我要用cox proportional hazard模型分析鸦片类药物导致药物中毒的hazard risk。每
个病人的用药历史被分为多个episode9(比如说一个episode是08年1月到3月,另一个
是08年9月到09年5月).我把每个episode做成一个独立的time-to-event,假设每个人每
次episode的baseline risk 一样。
请问: 我是不是应该把属于同一个人的几个episode看作clustered data,因为存在
correlation。
多谢
A*******s
发帖数: 3942
2
recurrent event? 可以用frailty model。

【在 u*****8 的大作中提到】
: 我要用cox proportional hazard模型分析鸦片类药物导致药物中毒的hazard risk。每
: 个病人的用药历史被分为多个episode9(比如说一个episode是08年1月到3月,另一个
: 是08年9月到09年5月).我把每个episode做成一个独立的time-to-event,假设每个人每
: 次episode的baseline risk 一样。
: 请问: 我是不是应该把属于同一个人的几个episode看作clustered data,因为存在
: correlation。
: 多谢

u*****8
发帖数: 180
3
多谢解答。
这里不是recurrent event.。 我就测第一次中毒。求教这样的话怎么搞?
因为病人会有很常间隔不用鸦片药物,所以才分成数个episode。但是我只测量首次中
毒,假设中毒只和中毒发生时刻所在的那次episode的剂量相关。

【在 A*******s 的大作中提到】
: recurrent event? 可以用frailty model。
A*******s
发帖数: 3942
4
你的意思是每个病人最多只有一个event,其他episode/observation都是consored?
应该还是可以用frailty. 或者用三文治夹一夹也可以。

【在 u*****8 的大作中提到】
: 多谢解答。
: 这里不是recurrent event.。 我就测第一次中毒。求教这样的话怎么搞?
: 因为病人会有很常间隔不用鸦片药物,所以才分成数个episode。但是我只测量首次中
: 毒,假设中毒只和中毒发生时刻所在的那次episode的剂量相关。

u*****8
发帖数: 180
5
谢谢指点。
是这个意思,每个病人至多一个event,其他的censored. 一个event之后,病人中过毒
后面中毒的概率很不一样,所以只算第一次。
我尝试用你说的方法作一些。
谢。

【在 A*******s 的大作中提到】
: 你的意思是每个病人最多只有一个event,其他episode/observation都是consored?
: 应该还是可以用frailty. 或者用三文治夹一夹也可以。

k*******a
发帖数: 772
6
这个感觉是 time dependent hazard risk
A*******s
发帖数: 3942
7
嗯,听你这么一说有道理。按lz的描述,如果是model time to first 中毒 since
very beginning, 可以将历次服药的历史当成time dependent variables。难点在于估
计functional forms of time dependent internal variables.

【在 k*******a 的大作中提到】
: 这个感觉是 time dependent hazard risk
u*****8
发帖数: 180
8
两位高见。
实际上我尝试了把dose作为一个time dependent covariate. 难点也就是像你说的,怎
么设置这个参数。 我用90天的平均计量。
但是有个缺陷就是,用90天平均计量,会低估一些短episode (比如说一个人最近的
episode只用20天,高剂量,结果中毒了,但是90天的平均计量就变成一个低剂量),
这样不准确。
所以我既设置了个90天剂量做time dependent covariate做了个模型,又想用各自独立
的episode作为time-to-event measure来做一个我称作episode-based模型。
如果觉得我的做法不妥,请务必赐教。

【在 A*******s 的大作中提到】
: 嗯,听你这么一说有道理。按lz的描述,如果是model time to first 中毒 since
: very beginning, 可以将历次服药的历史当成time dependent variables。难点在于估
: 计functional forms of time dependent internal variables.

A*******s
发帖数: 3942
9
functional form只能靠domain knowledge来估计,数量上是没啥好方法的。除非你只
关心prediction不关心其他的inference,但是internal time dependent variable很
多情况都不能拿来做prediction。
你的情况可能exponential weighted moving average更合理一些。
还有,如果你仔细看看partial likelihood的形式,你的time dependent model和所谓
的episode-based model是可以等效的。(刚仔细想了一下,这段话说错了。请lz自行
忽略)

【在 u*****8 的大作中提到】
: 两位高见。
: 实际上我尝试了把dose作为一个time dependent covariate. 难点也就是像你说的,怎
: 么设置这个参数。 我用90天的平均计量。
: 但是有个缺陷就是,用90天平均计量,会低估一些短episode (比如说一个人最近的
: episode只用20天,高剂量,结果中毒了,但是90天的平均计量就变成一个低剂量),
: 这样不准确。
: 所以我既设置了个90天剂量做time dependent covariate做了个模型,又想用各自独立
: 的episode作为time-to-event measure来做一个我称作episode-based模型。
: 如果觉得我的做法不妥,请务必赐教。

y*****w
发帖数: 1350
10
A joint model of longitudinal and survival data? Google it.
1 (共1页)
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