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_Molecular_Simulation版 - DL-POLY4.01 CUDA并行安装经验
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q********g
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Core-Shell模型使用dl-poly是最方便了。因此只好用了。
1.确定你的机器安装mpich2,我装的版本是1.2.1p1。compile的时候确定使用--enable
-f90 --enable-cxx FC=(你的fortran编译器)
2.安装fftw,我使用的2.1.5,不确定fftw3是否支持。编译时保证有--enable-mpi --
enable-fortran --enable-threads F77=(你的fortran编译器)。默认安装了双精度之
后。再安装单精度--enable-float --enable-type-prefix。
3. 安装:显卡驱动程序,cudatoolkit与SDK。我使用版本是3.1。root权限下sh ./
cudatoolkit.***.run安装即可。
把以上bin与lib或lib64设置PATH与LD_LIBRARY_PATH环境变量。(版本不一定是越新越
好,主要是看你用的软件写的时候用了什么版本。这里用了老版本主要是和我正在使用
的LAMMPS保持一致。)
把source/CUDA目录下的Makefile_CUDA复制并改名Makefile到/source目录下。
在开头增加几个本地路径:
export CUDA_HOME=/usr/local/cuda
CUDA_SDK=/usr/local/cuda_skd/C
MPI_HOME=/usr/local/mpich2/1.2.1p1
请修改红色的路径。
在/source路径下,老一代卡用make tesla,新一代fermi用make fermi。具体修改
Makefile。
应该没什么问题了。另外我使用intel的icc, icpc, ifor做编译器,如果用intel的安
装顺序应该是先intel,mpich2,fftw。cudatoolkit不再顺序中,任意安装。如果用g+
+和gfortran也应该没问题。
如果想用Java GUI,可以把2.20版本目录下的/java目录复制到4.01同等目录下,按照2
.20版本编译GUI就可以了。
安装成功了,只是个开始。
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