如何dig out一个蛋白的潜在isoform - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 如何dig out一个蛋白的潜在isoform

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相关话题的讨论汇总
话题: isoform话题: event话题: dig话题: 两个话题: spicing

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y*********u 发帖数: 183	1 在研究一个蛋白文献报道有两个isoform ，A和B isoform A所有exon都表达 isoform B发生了两个splicing event 我现在疑问的地方就是觉得可能存在另外两个isoform ：因为从序列特性上来说，两个 spicing event都可以独立发生在这种情况下，要去哪些数据库中dig out可能的spicing event 呢？
b****r 发帖数: 17995	2 如果片段不是太大，设计引物巧妙一点，几对引物就能试出来是不是有某种isoform 不过这种课题是不是意义不够重大，除非你前期已经有很多工作，有证据表明如果有这种新isoform存在会很有意思
m******5 发帖数: 1383	3 我现在也在这么设计　，　不过我们实验室之前已经有很多默认两个splicing event同时发生情况下设计的工作了……现在特别害怕其实这两个event是独立的，有一种start over的感觉……很不爽【在 b****r 的大作中提到】 : 如果片段不是太大，设计引物巧妙一点，几对引物就能试出来是不是有某种isoform : 不过这种课题是不是意义不够重大，除非你前期已经有很多工作，有证据表明如果有这 : 种新isoform存在会很有意思
n******7 发帖数: 12463	4 clone了拿去测序不就好了测个10个clone，如果总是两个events一起出现，也基本上可以肯定了

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● alternative splicing对protein structure的影响有什么review推荐吗？	● ES cell的transcriptome
● 汗了个去，我的引物出啥问题了	● 请教个学术问题。
● knock out的问题	● 克隆splicing isoform的套路
● 2bp的deletion仍然有蛋白表达	● 求教：怎么定义splicing site mutation
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