由买买提看人间百态

topics

全部话题 - 话题: bioinform
1 (共1页)
F********E
发帖数: 1025
1
有没有关于computational chem/bioinform的meeting?或者能否烦劳提供一下专门
search meeting的网站?谢谢了。
y*****s
发帖数: 2028
2
来自主题: Military版 - 现在我准备去IT公司了
我是做计算的,但是不是bioinform。
m****e
发帖数: 139
3
来自主题: JobHunting版 - 攒人品:一些找工作的经验
"qualification" (没有s)和"* data analysis"之间有没有一段话?三句或四句。类似于
Intelligent and diligent statistisian with excellent technical
competency in bioinformation/financial/insurance(选一个,或者填一个类似的定位
词)applications. All-around statistical knowledge backed by outstanding
academic performances (straight-A in highly-ranked/top-ranked/well-
regarded graduate program). Demonstrated ability to translate solid
academic training into practical applications.
建议不要照抄。这玩意写多了,张嘴就来,全是套话。基本上是:第一句,给自己定位
。后面的,夸
自己的闪光点。以事实为基础(学
m*****a
发帖数: 13
4
来自主题: JobMarket版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math (stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
B*********r
发帖数: 19
5
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: BioInformer (Next Generation), 信区: Biology
标 题: 求建议:Fresh PhD海归药企的利弊?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 15 10:06:33 2013, 美东)
3个月前交了论文开始找工作,联系了两家药企国内的R&D职位,眼下似乎都有offer意
向。Entry level,还不知道具体的package,但就眼下这形势,也就温饱吧。
同时也在联系这边的公司,目前形势还不明朗,但好在老板很支持,反正博后的合同可
以给到什么时候找到工作为止。眼下已经是拖家带口,而且刚拿到了绿卡,所以回国的
决心还真不好下,但考虑到父母年纪也大了,双方又都是独生子女,迟早得归,那么晚
归还不如早归...
身边海归的都是走PI的路,去公司的很少,很难全面权衡,版上有没有前辈过来人肯指
点一下?多谢!
m*****a
发帖数: 13
6
来自主题: Working版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math (stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
p******3
发帖数: 25
7
来自主题: I485版 - 新人问G325表格问题
作contractor的经历应该如何写呢?我是给同一个雇主做,签的是一个合同。中间断断
续续作了5个projects.时间是1-4月,6-7月。应该怎么写呢?
那个bioinformation表格上父母residence是写居住地址,还是户口地址呢?
记得有个地方还要写父母是从什么时候开始在此居住,有这个要求吗?好像以前看到,
这次怎么也找不到了。
谢谢!
A*F
发帖数: 2272
8
好几篇manuscript需要reviewer
杂志IF 2.5左右
请把简历发到[email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=document.createTextNode(s);l.parentNode.replaceChild(s,l);}}catch(e){}})();
/* ]]> */
背景需要是population genetics, polymorphism, association studies一类的
如果你只做wet lab,没有上述分析经验的可能没有... 阅读全帖
d***e
发帖数: 243
9
来自主题: BMU版 - 打个招呼
麦壳就是喜欢跟MM聊天。 什么冰美人,胡扯!
今天庆祝自己又拿了个B,结束本学期课程。
明年夏天转田那西学bioinformation,顺路去敲麦壳的脑壳。
d***e
发帖数: 243
10
来自主题: BMU版 - 去年的现在
老陪呀,想什么呢。是不是想妹妹了,肉茸茸MM快来劝劝。
其实在这里过一个战斗的圣诞有何不妙的,想去年的现在
我才从ebay上买了一个信销的梅兰芳小型张,今年反过来
在ebay上倒卖GPS,PALM,blah,blah....
BTW,上午从walmart.com买了个芭比娃的小屋子,在ebay上是
100%的利润呀,闲着也是闲着,等明年转道bioinformation去
就忙死了:-((
s*****d
发帖数: 160
11
来自主题: BUPT版 - hello again
真不好意思,说了一声hello就忘记了再说说自己
还有一个不好意思,我还没到白区呢,正在等待状态
最后一个不好意思,组织上的指示太多了,我都没记住。
先介绍一点点,慢慢再多介绍一点别的。我是
8系的,这儿有人是8系的吗?有谁知道我们
这个小系吗?
本人有志于研究 computational biology
或者做一个 bioinformation
有志同道合者请举手.
m*******h
发帖数: 896
12
来自主题: XMU版 - [转载] Help needed on paper
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
【 原文由 macintosh 所发表 】
I need help to get the PDF of the papers listed below, please send them to
i*********[email protected]
Thanks a lot! 多谢, 多谢.
1) Curr Pharm Biotechnol. 2004 Feb;5(1):79-88.
Bioinformatics in proteomics.
Blueggel M, Chamrad D, Meyer HE.
2) J Bioinform Comput Biol. 2003 Apr;1(1):183-200.
Bioinformatics meets proteomics--bridging the gap between mass spectrometry
data analysis and cell biology.
Kearney P, Thibault P.
3) Contrib Nephrol. 2004
Z*I
发帖数: 397
13
来自主题: CS版 - CVPR太太太太太牛了
以Computer Vision and Pattern Recognition为Publication Title的关键字,以
Minnesota为Author Affiliation的关键字发现umn发的一共20篇CVPR的paper里中国学
生为第一作者的(不算2010年的一篇,因为那个帖子是2009年发的)只有2006年Tao
Xiong的一篇
http://ieeexplore.ieee.org/search/searchresult.jsp?action=searc
此人还有NIPS 2004第一作者的paper
http://www.informatik.uni-trier.de/~ley/db/indices/a-tree/x/Xio
但根据IEEE/ACM Trans. Comput. Biology Bioinform.里的作者介绍Tao Xiong毕业于
北京交大...
这个毕业于电子科大,当年参加过数学冬令营的还是一个谜一样的人物。。。
难道他的3篇CVPR都是在电子科大读本科的时候发的?
l********0
发帖数: 283
14
来自主题: Java版 - 请教document

~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~bioinformation?
每次刷新界面,这个for都要运行一遍吗?
m*****a
发帖数: 13
15
来自主题: Actuary版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math (stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
J********n
发帖数: 534
16
Bioinformation?
r*****y
发帖数: 3406
17
来自主题: Biology版 - 求教: 细菌genome分析
哪位做过的大侠给讲讲基本步骤啊
俺现在是有了genome的DNA序列,第一步是蛋白预测
看文献是用critica,generation, glimmer预测,在有手工fix
这些分析都是在哪做的?就在NCBI上找到了Glimmer
另外两个谁用过?是免费的软件么?
还有就是有些文献上讲IMG这个组织给手工curation
谁知道这个组织是咋回事?是免费的还是要给钱?
从来没接触过bioinformation的人在做基因组分析
内牛满面啊
c****y
发帖数: 2544
18
来自主题: Biology版 - 求一篇 paper
Letter to the Editor: Stability of Random Forest importance measures
Brief Bioinform (2010)
doi: 10.1093/bib/bbq011
First published online: March 31, 2010
http://bib.oxfordjournals.org/content/early/2010/03/31/bib.bbq0
email: c*******[email protected]
非常感谢
a********e
发帖数: 1181
19
来自主题: Biology版 - JCR 来了 NATURE 36, SCIENCE 31
Mark Rank Abbreviated Journal Title
(linked to journal information) ISSN JCR Data More Information
EigenfactorTM MetricsMore Information
Total Cites Impact
Factor 5-Year
Impact
Factor Immediacy
Index Articles Cited
Half-life EigenfactorTM
Score Article InfluenceTM
Score
1 NAT BIOTECHNOL 1087-0156 34520 31.085 29.061 5
.342 117 6.2 0.13226 12.257
2 NAT REV DRUG DISCOV 1474-1776 14742 28... 阅读全帖
a********k
发帖数: 2273
20
来自主题: Biology版 - Impact factor 2010
JCR Year and Edition: 2010 Science

Abbreviated Journal Title ISSN {2010} Total Cites Impact Factor
5-Year Impact Factor Immediacy Index {2010} Articles Cited Half-
Life Eigenfactor Score Article Influence Score
CA-CANCER J CLIN 0007-9235 9801 94.262 70.216 8.667 18
3.8 0.04923 24.782
ACTA CRYSTALLOGR A 0108-7673 13944 54.333 24.717 0.629 70
6.2 0.04... 阅读全帖
t*d
发帖数: 1290
21
来自主题: Biology版 - the Real Cost of Sequencing
http://www.genomeweb.com//node/980559?hq_e=el&hq_m=1103092&hq_l
----------------------------------------
A recent study by scientists at Yale University suggests that the actual
cost of sequencing may be much higher than some current estimates indicate
since those figures may not factor in the analysis costs that are necessary
for a successful sequencing project.
In the paper, published in Genome Biology last month, Yale's Mark Gerstein
and colleagues consider costs that weren’t taken into accou... 阅读全帖
o**d
发帖数: 3080
22
pubmed: Gong Zhang, Zoya Ignatova
1.Polyglutamine expansion alters the dynamics and molecular architecture of
aggregates in dentatorubropallidoluysian atrophy.
Hinz J, Lehnhardt L, Zakrzewski S, Zhang G, Ignatova Z.
J Biol Chem. 2012 Jan 13;287(3):2068-78. Epub 2011 Dec 1.
PMID:
22134925
[PubMed - in process]
2.Length-dependent translation of messenger RNA by ribosomes.
Valleriani A, Zhang G, Nagar A, Ignatova Z, Lipowsky R.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2011 Apr;83(4 Pt 1):04... 阅读全帖
b*******m
发帖数: 3
23
【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: bioinform (ngs), 信区: Postdoc
标 题: postdoc position available in bioinformatics
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 20 00:44:34 2012, 美东)
Hiring unit:
Garmire Group (PI starting 09/01/2012, the postdoc position available 09/01
or later)
University of Hawaii Cancer Research Center
Job description:
Located on the beautiful sea shore of Honolulu, Hawaii, overlooking the
Pacific Ocean, the University of Hawaii Cancer Center (UHCC) is one of only
66 research organizations in the coun... 阅读全帖
K****n
发帖数: 5970
24
来自主题: Biology版 - Bioinformatics job at Stanford
大家为啥对这个广告贴这么有意见
小弟其实有一条妙计:去硅谷做码农,去goog去fb,entry level也就是一年十八万,
这还是把七七八八加起来咬着牙说的。依我看还不如先潜入史丹佛。史丹佛是一所人民
群众喜闻乐见,有着悠久历史,深厚的文化底蕴汗优良传统的百年古校。如果成为了史
丹佛的faculty,比如lab technician,就可以开始*免*费*曾*课*啦*!试问,有多少硅
谷码农业余时间搞到了史丹佛的management master? 如果bioinform什么什么曾一个史
丹佛的什么finance, stats, cs, etc. etc.,那就成了流氓会武术。牛了逼了
谢谢大家
u*********1
发帖数: 2518
25
来自主题: Biology版 - 请教neurogenomics职业规划
为啥中国人没优势?
中国人的数学好,我看bioinformatis一堆堆的中国人。。。
另外关于算法和分析,我觉得这个竞争才超激烈;比如structural variants,本身受
到100bp short reads的限制,所以你再怎么改进算法还是没用。所以那些真正聪明的
搞methodology的比如heng li这样的肯定早就设计比如pacbio这种5kb,10kb的reads的
algorithm了。
不过很同意的是,大部分我们这种半路出家的数学计算机都是半吊子,做不过人家专门
的搞algorithm的
所以我是感觉搞bioinform的一定要对sequencing技术本身超级关注。
其实都是技术技术技术技术技术技术技术技术。。。。。
有了独门技术,才能走遍天下,称霸武林。。。。
s*****g
发帖数: 7857
26
来自主题: Biology版 - 过年了,我释放点正能量吧
MGD地!
debug对计算机专业的人也不好受啊!只是你原先的TRAINING是生物,就人为生物好了.
逻辑思维不强思维习惯有漏洞的人在设计生物实验时也有漏洞啊!
COMPUTER或统计的人"时间比较flexible",人家可以WORK FROM HOME,你能吗?
不过本人还是灰长灰长喜欢做生物地!至少BIOINFORMATION是为我生物服务地!至少生物
可以挑战未知,而COMPUTER就是工具和为生物人服务地!他们多数人永远没有/或很少有
可能能有申请专利的机会....
n*******s
发帖数: 22
27
来自主题: Biology版 - 我应不应该同意equal contribution?
我是一个新实验室的第一个薄厚,负责优化和建立一个实验平台。我用了两年时间优化
了这个实验平台,一年的时间用这个实验平台去处理实验样品,产生生物数据, 然后
由实验室的bioinformatician进行数据分析, 经历三年的工作,等我把所有的实验都
做完了,图弄好了,manuscript 写好了,老板对我说我和bioinformatician应该co-
first-author, equal contribution....
我心里觉得很不愿意,觉得自己3年的bench work跟几个月的数据分析处于同一地位,
我觉得很不公平。我建立的实验平台是整个文章的foundation. 而且我们写的是生物的
文章,又不是bioinform. 我跟bioinformatician聊了一下, 人家说第二也可以,不知
道老板为什么坚持co-first-author。
我是应该争呢还是从呢?
P*****D
发帖数: 141
28
真的吗?我们学校的biostat 的学生以前很好找工作,最近据说也不是那么好。 今年
学校会新建立bioinformatics department,一直以为bioinform 比较好些。
y******8
发帖数: 1764
29
来自主题: Biology版 - IF top 500 - 2012
Abbreviated Journal Title ISSN {2012} Total Cites Impact Factor
5-Year Impact Factor Immediacy Index {2012} Articles Cited Half-
Life Eigenfactor Score Article Influence Score
CA-CANCER J CLIN 0007-9235 13722 153.459 88.55 27.04 25
3.3 0.0517 29.478
NEW ENGL J MED 0028-4793 245605 51.658 50.807 12.667 360
8 0.65776 21.494
REV MOD PHYS 0034-6861 35720 44.982 51.882 6.478 46 10
0.13048 32.634... 阅读全帖
u*********1
发帖数: 2518
30
来自主题: Biology版 - 该转到computational bio领域吗
爱一个人没有理由,不爱一个人可以找出一千条理由。
人家老师不要你或许有很多很多原因,他只是找个借口搪塞下罢了。
可以感觉你的这个老师应该是专门的pure dry lab吧。那么他自然有他自己的
preference
在我看来,很多人把bioinformatics和benchwork彻底划分开,是非常愚蠢的。或许90
年代刚兴起的时候,那时候运算能力低,各种算法软件都没有,而且能做bioinfor的单
位也很少(比如human genome project),所以需要非常专业的计算机人才来做。但现
在完全不同,各种program平台都有了,每个独立的小实验室都有sequencing数据,都
需要相关人才。
bioinform作为新兴的科学,那你可以质问你的老师:你一开始就是做这行的吗? 明显
他也不是。他也是从其他的学科转到bioinfor的,对不对?既然你能做成功,我为什么
不能做成功?我比你年轻,平台更好。所以我最不爽那些倚老卖老或者仗着自己是数理
出身觉得自己很了不起的所谓的bioinformatician
可以预料到未来,我们有很便捷快速的sequencer产生无数的data,非... 阅读全帖
m****e
发帖数: 489
31
来自主题: Biology版 - paper help please!!
Application of next generation sequencing to human gene fusion detection:
computational tools, features and perspectives
Brief Bioinform (2013) 14 (4): 506-519 first published online August 9, 2012
pls send to [email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=docume... 阅读全帖
c********e
发帖数: 598
32
计算机要刷题,和刷试管不是一个级别的。能有刷题的智商,offer很容易的,但很可能
成为终生吗工了。
如果你不行, 可以试试abmg。
abmg以后要发文章的,尤其医学院,但不用写grant. 小医院如果不挣啥钱,是个鸡肋
。 有molecular 很难进的,很多千老来竞争的。有十年遗传工作经验的人要来竞争,
你就不会被
选上。最好选家标本量大的医院,全国就几家。
bioinform 现在会用软件的也太多了。这领域需要的是创新性人才推动行业的发展。你
如果觉得你能找到个niche, 可以玩一下。
c********e
发帖数: 598
33
计算机要刷题,和刷试管不是一个级别的。能有刷题的智商,offer很容易的,但很可能
成为终生吗工了。
如果你不行, 可以试试abmg。
abmg以后要发文章的,尤其医学院,但不用写grant. 小医院如果不挣啥钱,是个鸡肋
。 有molecular 很难进的,很多千老来竞争的。有十年遗传工作经验的人要来竞争,
你就不会被
选上。最好选家标本量大的医院,全国就几家。
bioinform 现在会用软件的也太多了。这领域需要的是创新性人才推动行业的发展。你
如果觉得你能找到个niche, 可以玩一下。
l*******r
发帖数: 39
34
ccl.net
m*****a
发帖数: 13
35
来自主题: Computation版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math (stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
m*****a
发帖数: 13
36
来自主题: Computation版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math (stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
R****d
发帖数: 309
37
我知道读IP的没有一个是CS,到底IT的整体不好,律师行业一定受到影响。如果你只是ma
ster,还是先找工作,好过一下子跳进去花个12万刀,你自己投资也不会冒那么大风险对
吗?我认识的中国人IP律师就两个,所以sample size太小,不能作准。
我觉得这个有点跟进IB一样。你要真有决心,先找个paralegal,patent agent工作尝试
。IB的analyst职位比associate难,但是你只要做了analyst,读完MBA即使经济很差少有
回不去的。在律师行方面也有同样情形,一个已经做过的,跟一个只有文凭的,你选谁呢


10读书的中国大陆学生(指


就我看来的消息,好像现在这方面的master+工作经验还好。还有,有人跟我说bioinform









R****d
发帖数: 309
38
你去申请过这样的工作没有呢?他们最看重的还是对口的专业,这要取决于不同律师行的
客路,客人的需求。我觉得不容易,但是没有那么多人想象的难。
语言能力一定要想法提高。要有决心在美国扎根无论做哪行英语表达能力是头等大事。Pa
tent活,以我接触的经验来说,是概括能力,组织能力与程序的活,大部分人具有专业知
识的人都能干。你要有兴趣,最好先拿几个样品来看看,看人家是如何组织的。或者争取
在现有的公司参与。
有志者事竟成。












就我看来的消息,好像现在这方面的master+工作经验还好。还有,有人跟我说bioinform
m*****a
发帖数: 13
39
来自主题: Quant版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math (stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
k******7
发帖数: 201
40
来自主题: Statistics版 - 做biostat/clinical trial的前景
本人phd第一年,进的是bioinform graduate program,感觉对genomic等等不是很感兴
趣。这学期做了个clinical trial的rotation,觉得还行。不知道在这行混前景如何,
这个行业有没有意思?
duke没有具体的biostat degree,搞这个方向的人都分散在学校各个institute里。
rotation的advisor建议我去unc或者ncsu选修些这方面的课(triangle的这三所学校还
挺方便,可以互相随便选课),感觉这两所靠industry近点,到时候或许可以和这方面
的人多network一下
k******7
发帖数: 201
41
来自主题: Statistics版 - 做biostat/clinical trial的前景
感觉bioinform的opening大部分在institute里,最近看了一些job post,貌似及时在
公司里做的也是差不多的事。
不知道huxxx有没有这方面经验,或者就是这个(biostat)领域里面的行内人。我总觉
得进药厂做clinical trial方向也没多少可以选的?
a***g
发帖数: 2761
42
来自主题: Statistics版 - qingjiao
As I know some groups on stat want postdocs having training of computational
biology or bioinformation. if you can accept a postdoc which will take one
or two years, you can have a chance to access the areas.
e****t
发帖数: 766
43
i know a friend with computational chemistray PhD and now working as
bioinformation. maybe it is option.
m*****a
发帖数: 13
44
来自主题: Statistics版 - 专业方向 -- 求助各位前辈
本人有数学建模背景,想尝试 finance quant / cs(data mining)/ math(stats)/
bioinform 四个master program之中的一个。 不知道那个就业前景最好,未来比较明
朗。 求懂行的有经验的前辈给指点一下,谢谢啦!
a****r
发帖数: 62
45
是不是相当于函授之类的
1 (共1页)