由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: sted
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c********r
发帖数: 1125
1
跑胶间隙,神棍预测一把:
概率高的:
leptin (Friedman/colman)
nuclear receptor (jensen/chambon/evans)
这两组里面都有岁数很大的哥们了,再不给要死了就不好给了。
概率中等的:
chaperone
motor protein
miRNA(毕竟RNAi 刚给过)
神经领域(节律,触觉...),好多年没给了..
概率小的
longevity
SNAREs
autophagy
PALM/STORM/STED
l******u
发帖数: 936
2
PALM/STORM/STED should go physics?
l**********1
发帖数: 5204
3
来自主题: Biology版 - 绝对的大器晚成啊
You noted that is ordinary approach what published on @eLife 2013
and Cheng YF group borrowed that STED laser microscopy’s Philosophy as Cryo
-EM Methodology
pls check,
http://ipv6.weiming.info/zhuti/Biology/31646749/
285th floor
or
http://zeiss-campus.magnet.fsu.edu/tutorials/superresolution/st
l***y
发帖数: 1166
4
来自主题: Biology版 - 有没有什么仪器可以做的?
PALM , STORM, SIM, STED ==
b******k
发帖数: 2321
5
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
是有点怪 按说STED可以分1/2 然后PALM和STORM各分1/4
b******k
发帖数: 2321
6
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
没人说sted不行吧 说饿不都是palm不行么
s******y
发帖数: 28562
7
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
估计除了那个高敏感的相机以及处理软件之外还真没别的特别的了。
不过也正是因为如此所以这个技术能够很快普及起来。
而STED需要很特殊的硬件,据说还很难维护,所以我都没有怎么听说过有人用。
y***n
发帖数: 109
8
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
对做生物的来说,用STORM药比STED容易的多啦
p*l
发帖数: 1359
9
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
SIM 是所有样品都能两倍,就算是无荧光纯反光的样品也通吃。STED要特定的荧光
label,特复杂的仪器,调不好分辨率连SIM都不如。
g***s
发帖数: 733
10
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
要得到SIM的两倍也并不轻松,加光栅,还要相移,还要赚角度,折腾半天提高两倍,
性价比一般。STED确实复杂,但是提高分辨率一个量级,没法比呀。
p*l
发帖数: 1359
11
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
SIM还好了,只要是个光学实验室都能做出来,两倍分辨妥妥的。STED最坑人的地方是
,所有其他实验室,包括很多很有经验的光学组,做出来的分辨率都比Hell组里做的差。
g***s
发帖数: 733
12
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
STED确实是手艺活。STORM最elegant,商用前景最大。庄很可惜,但是她抄别人idea的
说法简直到处都是,颁奖委员会很难不考虑影响。

差。
J**a
发帖数: 215
13
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
xiaowei在super-resolution领域的贡献,相当于Feng Zhang在gene editing,和Karl
Deisseroth在optogenetics上的贡献。论领域最原始最原创的根基虽然不是他们开始
的,但是都在其领域在各自方法被广泛应用上做了最大推动的工作。
另外在super-resolution的应用推动这块,Hell和Betzig用STED,PALM至今没有导致什
么新生物结构的发现。而xiaowei已经用STORM有了若干个全新的structural findings。
s*****j
发帖数: 6435
14
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
06 年听 Gustafsson 报告. 结巴的太可怕. 一句话要一分钟才说完.
想来当时就有瘤子了.
SIM 是不是最有用不知道, 但一定是最难懂的. PALM/STROM/STED 还是可以对生物学
生, 没有物理背景的讲个半懂. SIM 是绝对没有可能.
s*****j
发帖数: 6435
15
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
in theory, there is no limit for SIM and PALM and STORM and STED
w**u
发帖数: 311
16
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
刚用了leica的新 STED. 非常好用,成象快.storm 成象有点慢.
p*l
发帖数: 1359
17
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
SIM确实是假象最少的。
suppresolution能分辨精细结构,但是很多时候,在某个分
辨率下本应该看起来连续的东西能被看成两半。
STED PALM STORM的文章,往往招牌图都秀比较稀疏的结构,
因为这样的结构出假象的几率少,而且出了假象也很容易判断。
唯独SIM,爱秀丛林一样密集的fiber,而且常规图和SIM图比
较,fiber根根都对得上,在分辨率以上的,绝对能分开,分辨
率以下的,绝对看着是连续的。
C*********h
发帖数: 83
18
【赛先生独家新闻】华人科学家有同等工作却未获今天诺贝尔化学奖
2014-10-08 按蓝字加我好友 赛先生
原文:
http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA3OTgzMzUzOA==&mid=200920471&
一小时前,瑞典皇家科学院宣布2014年诺贝尔化学奖授予三位在光学成像的科学家,美
国休斯医学研究所的Eric Betzig(贝慈葛)、德国马普生物物理化学研究所的Stefan
Hell(黑尔)、和美国斯坦福大学的William Moerner(莫尔纳),表彰他们在“发展超高
分辨荧光显微镜”上的贡献。
消息公布使很多人感到惊讶。其中,特别令人惋惜贝慈葛的工作不仅与华人教授庄小威
的工作在物理原理完全一样,而且他们研究论文发表的时间也一样,令人不解为何出现
厚此薄彼。
得奖的工作反映现代科学的交叉:实际上是物理学研究、目的是观察化学分子、用途是
生物医学研究,所以横跨物理、化学和生物。
得奖工作的核心概念和技术都是物理,颁发化学奖颇出人意料。
超高分辨荧光显微镜的发明突破了光学衍射极限(0.2微米),使科学家可以观察到更小
的结构,推动了人类从分子... 阅读全帖
s*****j
发帖数: 6435
19
来自主题: Biology版 - 诺贝尔奖得主在生物学家中
随便来说说今天得奖的两位.
Stefan Hell, 前些年参加一个成像的workshop, 有Stefan Hell 的 teleconference.
大光头一个, 和疯狂的石头里的徐峥很象. Hell 开始讲STED, 自己的思考历程, 这个
原理嘛, 是这样的… 讲到这, 他停下来了, 把大光头凑到摄像头前面, 光头反光的好
厉害. 认真看了一下会场这边的听众. 一摇头. 算了. 讲了你们也听不懂, 我就这样说
吧. NM, 太狂了! 我边上一个加拿大小姑娘差点拍案而起. 愤然道:“This guy has
an ego!”
Betzig. 06年的时候参加一个会. Betzig在台上讲PALM, 当时文章还没发. 我听着很
震惊. NM, 这也太牛了. Betzig也秀了他在客厅里搭的PALM, 我想任何一个听过他报告
的都见过. 晚上是龙虾buffet餐. 有幸和牛人一桌. Betzig当时刚拿到HHMI的职位. 边
吃边说, NM, 终于有工作了. NM, 以前社会对我真是不公. NM, 我今天要多吃几个龙
虾. 当时觉得这人挺平易近人的, 而且有性格.
前几个月... 阅读全帖
l********k
发帖数: 14844
20
来自主题: Biology版 - 诺贝尔奖得主在生物学家中
Hell是科研领域里的资本家,绝对的高富帅,高大上。尽管他的STED折腾了20多年还是
没人用lol
F*Q
发帖数: 3259
21
来自主题: Biology版 - 诺贝尔奖得主在生物学家中
在他爸那里做过小生意?原来他也拼过爹啊,呵呵
他说的“太多科研are just bullshit"说的太对了!那些捏造数据的造假、对别人idea
和结果的剽窃、各种潜规则、甚至所谓的“诚实的错误”都统统是bullshit!

随便来说说今天得奖的两位.
Stefan Hell, 前些年参加一个成像的workshop, 有Stefan Hell 的 teleconference.
大光头一个, 和疯狂的石头里的徐峥很象. Hell 开始讲STED, 自己的思考历程, 这个
原理嘛, 是这样的… 讲到这, 他停下来了, 把大光头凑到摄像头前面, 光头反光的好
厉害. 认真看了一下会场这边的听众. 一摇头. 算了. 讲了你们也听不懂, 我就这样说
吧. NM, 太狂了! 我边上一个加拿大小姑娘差点拍案而起. 愤然道:“This guy has
an ego!”
Betzig. 06年的时候参加一个会. Betzig在台上讲PALM, 当时文章还没发. 我听着很
震惊. NM, 这也太牛了. Betzig也秀了他在客厅里搭的PALM, 我想任何一个听过他报告
的都见过. 晚上是龙虾buff... 阅读全帖
V******t
发帖数: 444
22
来自主题: Biology版 - 弱问关于光学显微镜的问题
所以现在的sted也好 storm/palm也好 用的都是可见光区的激光咩?
u****d
发帖数: 1278
23
storm palm不就是单分子成像吗,sted虽然不是,但没有广泛应用,单分子技术影响远
比这两个细胞成像技术大,因为它不光是这两个技术基础,还影响了传统生化,更重要
的是它也是现代许多高通量测序技术基础
这就像当年发现内含子的不如发现自剪切内含子的先得,而发现mRNA的更靠后
l********k
发帖数: 14844
24
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: lunchbreak (考不上印度理工,才到麻省理工来), 信区: Military
标 题: 也谈偷idea:庄小威STORM之前,很多工作已经铺好路了
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 9 12:49:44 2014, 美东)
STORM的关键,除了这个荧光分子轮着闪、单个定位这个方法上的技巧之外,最最最关
键的是switchable dye. 只要掌握了这个东西,STORM也好,PALM也好,高中生、甚至
初中生都可以理解原理,甚至原创出来。庄小威是化学出身,之前研究的一个方向也正
是这个switchable dye, 比如她在2005年的这篇论文(STORM, PALM都是06年的工作):
Short-Range Spectroscopic Ruler Based on a Single-Molecule Optical Switch,
Phys. Rev. Lett. 94, 108101 – Published 15 March 2005
有了这个东西,基本上距离STORM只有一步之遥了。
但是很... 阅读全帖
s********x
发帖数: 472
25
搞super resolution的都知道,Betzig一直致力于beat optic resolution。
他开始搞近场显微镜是91年的事,但是近场的应用有限,他自己也觉得没意思。
后来他在94年95年的paper里面就已经propose利用PSF的精确性来突破光学成像
resoltuion的idea。但是当时主要困难在于没有合适的fluorophore来真正实现这个想
法。
直到后来他听说了NIH的Jennifer Lippincott-schwartz搞出了photoactivatable GFP
,终于意识到可以利用这个PA-GFP来实现自己在10年前就产生的设想。所以说到Storm/
Palm的思想源头,终归要导到Betzig头上。所以生么paper发表时间纯属细枝末节。
其实本来如果Nobel给 Storm/Palm的话,Betzig,Xaiowei,Jennifer倒是三个重要人
物。但是super resolution是个大领域,没有理由不给人家发明STED(比Storm/Palm还
早)等很多其他super resoltuion的大牛。
给Betzig作为Storm... 阅读全帖
n********k
发帖数: 2818
26
貌似有些道理哈:))不过我还是不能同意哈,stephan 根本不需要把sted做出来,而
且也不需要有推广,stephan94年(?)那篇PNAS还是physics Review的理念文章就决
定他应该获奖,后边有一系列的东西都是基于这个思路了,科学和理念意义太重大了..
.包括小薇同学最近15年的这个新技术也是同样的思路尽管是完全不同的技术和领域...
当然你可以说没有stephan最后也有人搞出这种理念,通过算法搞定physical搞不定的
东东,突破物理学原理的东东...但是你没法否认他是第一提出的...如果诺奖对于技术
应用的重视超出了原创的理念等,我想诺奖的影响力和价值会急剧下降...而反过来,
对于像基因编辑这种纯技术的东西,那么它的真正应用价值和普世性将会决定能否获奖
的最大因素了...所以,如果我来评,我会等待一些时间,让局面更加明朗化...但我同
意你提到的这几个都是要获奖的...另外,谈张峰获奖是有那么点可能,谈教堂获奖,
我没搞明白...连张峰都很有可能像siRNA的最关键贡献者tom shul一样遗恨,教堂哪有
什么机会?
m****a
发帖数: 270
27
来自主题: Biology版 - 火锅哥请注意了(转)
2015年医学奖
William C. Campbell & Satoshi ōmura 治疗蛔虫
Youyou Tu 青蒿素
2014年化学奖
Eric Betzig and William Moerner: PALM
Stefan Hell: STED
h*****i
发帖数: 9112
28
channel数已经没有差别了,尤其现在DNA paint普及以后
分辨率STORM占优,尤其是3D。既然是push limit,自然有很多研究会很在乎20 vs 40
nm的差别
其实这俩最主要的差别还是在数据采集和分析上。STED几乎完全基于硬件,直接输出图
像,类似一个超高分辨率的confocal,而STORM/PALM 输出点阵,后期分析要复杂一些
,很多实验室搞不定。
D*****I
发帖数: 987
29
来自主题: CivilEngineering版 - 请问岩土software/modeler大约能拿多少?
你是说用ENSOFT,STED,PCSTABL等软件包的吗?
J**a
发帖数: 215
30
Carlos和Steven Block发展了Optical tweezers,把精度提高到了1 base pair
resolution, 而Steve Chu发明了Optical tweezers. 另外Steve Chu第一次独创性的用
FRET来研究单分子。这2个成就让他开辟了一个崭新的领域:single molecule
biophysics. 用一个全新的视角来研究分子生物,这个领域现在慢慢开始blooming.
Berkeley的物理系,化学系今年招的几个tenure track. 比如Ahmet Yildiz,
stanford的化学系今年新招了Bianxiao Cui, Alex Dunn, ...等等,MIT物理系也在饥渴的
招人,全部都是这个领域的。Steve不仅仅发展和发明工具,而是打开了一个全新的交
叉学科的先驱。
去看看这期Nature Methods评出的Method of the year:基于signle molecule
measurement方法的super-resolution fluorescence microscopy. (STED/STOR
J**a
发帖数: 215
31
How about single molecule FRET? Steve Chu虽然不是发明FRET(Fluorescence
Resonance Energy Transfer)的人,但是第一个把它用于生物体系的单分子研究.你究竟看完了我的贴子么? 在FRET上,Steve刚好和optical tweezers的情形相反. 就我所知, FRET现在在
生物上的应用比optical tweezers还多,影响还大.包括现在基于single molecule
fluorescence技术上的super-resolution microscopy (STED, STORM, PALM).
s****t
发帖数: 1049
32
来自主题: Physics版 - 请教个阿秒激光的问题...
阿秒脉冲的频率在紫外,透射光学组件吸收很厉害,聚焦都是用镀金膜的凹面镜,不用
透射元件聚焦,光束损失很大。而且从产生机制上讲,通过hhg产生的阿秒脉冲强度非
常弱,测量一次就没了,没法用到后续加工。
另外飞秒因为飞秒作用时间段,热效应小,加工精度高,但如果作用时间太短,可能起
不到加工的作用,所以不是脉冲越短精度越高能无限的推理下去。
加工精度还跟光学分辨率有关,受到衍射极限的限制,一般都从光束设计入手解决更高
精度的加工问题,比如用双色激光,类似STED的方案做加工
s********t
发帖数: 247
33
来自主题: Statistics版 - 问个sequential test的问题
包子答谢
其实不是一个传统的sequential testing problem,因为sample size是不变的。
假设我有p个null hypotheses要test with same data set, 并且有一个很自然的顺序去
一个一个test。如果我在某一步fail to reject the null,就不用再做下去了。我觉的
这个问题也不同于multiple testing problem in which the null hypotheses are te
sted simultaneously。 请问大侠们有没有相关的书或者文章可以参考,多谢多谢
m****s
发帖数: 18160
34
来自主题: board版 - [合集] 申请历史版版主
☆─────────────────────────────────────☆
ridgway (ridgway) 于 (Thu Oct 28 09:26:07 2010, 美东) 提到:
是否已阅读:1)《站规》2)《版务操作简易手册》?:
已阅
[申请ID]:
ridgway
[申请版面]:
History
[申请职务]:
版主
[版务经验]:

[申请纲领]:
希望将history版建成一个真正讨论历史的言论自由百花齐放百家争鸣的版块。老将小
将中将毛轮邓轮共粉国粉一律欢迎,鼓励有见解有深度的原创和讨论。讨论话题基本不
设禁区,但对人身攻击言语粗俗等不文明现象将按版规给予处罚。不因版务个人立场偏
袒包庇任何人。 严格履行有法可依有法必依执法公正。
[版规草案]:
现版规本身并无不当之处,重点在于版务能否切实做到公正执法。在现有版规基础上将
作一些小的修改调整,如封人一律14天太过严厉,将视违规情节轻重给以适当处分。人
身攻击言语粗俗等帖子将立即删除,其他帖子原则上不予删除。若删除将备份以便作者
本人领回。
☆──────────────────────────────... 阅读全帖
k****o
发帖数: 408
35
来自主题: Complain版 - [投诉]Wisdom版副 DaWuDaWu滥用职权
原来这是扯谈阿?你早说么,害得我露了家派.
来,说说你是什么门吧.我们百花齐放.
发信人: qx02 (sted), 信区: Complain
标 题: Re: [投诉]Wisdom版副 DaWuDaWu滥用职权
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 28 11:28:44 2009, 美东)
能请问一下你是什么们吗?
Y**u
发帖数: 5466
36
给您看看几天前版上有人骂我的,跟这个比起来,他们这算什么PA呀,就是兄弟俩对呛
。。
就是下面者个,现在投诉俺的正义人士们不也都没吭一声不是。。
发信人: qx02 (sted), 信区: Wisdom
标 题: Re: 懂佛法的请进
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 30 01:02:46 2011, 美东)
i do
i do u
i do ur mother
and i do u and ur mother...
yisu 你根本是个浅薄的 狗屁不通的主儿。。。。

Y**u
发帖数: 5466
37
给您看看几天前版上有人骂我的,跟这个比起来,他们这算什么PA呀,就是兄弟俩对呛
。。
就是下面者个,现在投诉俺的正义人士们不也都没吭一声不是。。
发信人: qx02 (sted), 信区: Wisdom
标 题: Re: 懂佛法的请进
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 30 01:02:46 2011, 美东)
i do
i do u
i do ur mother
and i do u and ur mother...
yisu 你根本是个浅薄的 狗屁不通的主儿。。。。

m****s
发帖数: 18160
38
☆─────────────────────────────────────☆
yuuli (听,...听) 于 (Sat Jun 27 16:52:32 2009, 美东) 提到:
投诉人(ID):
yuuli
投诉对象及职务(限版主):
Wisdom版副 DaWu
投诉标题:
DaWu滥用职权
投诉目标(更改处理决定/更改板规/弹劾板主...):
解封yuuli, Waichi, dreamfly
DaWu道歉或者撤职
投诉理由及证据:
起因:DaWu封waichi 70天。
waichi回应一帖“我所说的是事实”,笔误为“我就是事实”,立刻删文重贴。
无论是这句话文法不通,道理不通,还是waichi立刻删文的事实,都说明waichi本意非此。但DaWu抓住这个笔误,再三攻击waichi.
-------
DaWu发贴“我就是真理”:既然某同修说“我就是事实”那版务当然可以说“我就是真理”了。我就是真理了,你就是无理了。
---------
而后又一而再再而三的发文声称waichi表达自己是事实:
---------
DaWu (yuanzhai), 信区: Wisdom... 阅读全帖
m****s
发帖数: 18160
39
☆─────────────────────────────────────☆
Reo ( 神 愛 世 人) 于 (Tue Nov 1 14:11:04 2011, 美东) 提到:
投诉人(ID):
Reo
投诉对象及职务(限版主):
Yisu
投诉标题:
投诉wisdom斑竹Yisu纵容waterer反复攻击网友
投诉目标
(删除无关话题/制止waterer对网友攻击)
投诉理由及证据:
1. Yisu公开说不保护wisdom一些艾迪
http://www.mitbbs.com/article/Wisdom/31535891_0.html
发信人: Yisu (大头教主), 信区: Wisdom
标 题: Re: 四叔说说你为啥来慧版的嘛
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 1 12:08:35 2011, 美东)
PA 当然不能自由, 我一开始好像说过。。我的版面上的PA有几类人不被保护, 版主,
号称大师, 阿罗汉,菩萨,佛, 真主,各种江湖侠士, 刀客等。。 俺只保护平民老
百姓, 真正追求或履行道化, 儒化, 佛化人生的人。。但是尽管上面... 阅读全帖
a*i
发帖数: 1652
40
http://findarticles.com/p/articles/mi_m0EIN/is_2007_Feb_9/ai_n1
ARLINGTON, Tenn. -- First graph, second sentence of release dated Feb. 8,
2007 should read: Thursday, February 15 (sted Thursday, February 14).
The corrected release reads:
TENNIS LEGEND JIMMY CONNORS JOINS WRIGHT MEDICAL TO SHARE HIS EXPERIENCES OF
TOTAL HIP REPLACEMENT DURING AMERICAN ACADEMY OF ORTHOPEDIC SURGEONS'
MEETING
Wright Medical Group, Inc. (NASDAQ: WMGI), a global orthopaedic medical
device company, announced today that... 阅读全帖
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