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Biology版 - 请指教Conditional KO的对照?
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w***j
发帖数: 88
1
前辈们指教一下:
我有一个A flox/flox 的mice,需要和Tek-Cre杂交,得到血液系统敲除的A -/- mice。
Breeding程序如下:
1. A flox/flox mating with Tek+ 得到 "A wt/lox Tek+" and "A wt/lox Tek-"
2. "A flox/flox" mating with "A wt/flox Tek+" 得到以下四种:
"Rictor wt/flox Tek+"
"Rictor flox/flox Tek+"
"Rictor flox/flox Tek-"
"Rictor flox/wt Tek-"
"Rictor flox/flox Tek+"是我要的KO, 称为Hem_A -/-, 那么"Rictor flox/flox Tek-
"是我的对照,称为Hem_A +/+,是不是这样?
做实验是不是最好还要wild-type? 那么wild-type是哪个?
叩谢!
i*********0
发帖数: 915
2
理论上其他的都可以当作control。只要你的gene不是haploinsufficiency.
D*a
发帖数: 6830
3
我们只用A flox/flox ; Cre 和 A flox flox交配,一半cre+,另一半对照
i*********0
发帖数: 915
4
if you Af/f cre+ is not lethal, it is better to do as Dua said. but bear in
mind that some cre line already has effect in the tissues or cells they
express.
n****n
发帖数: 165
5
Usually mate wt/lox cre+ each other and then use wt/wt cre+ as control to
compare lox/lox cre+ one. One question: how can you get wt/lox Tek- mice if
you just mate lox/lox with Tek one?

mice。
Tek-

【在 w***j 的大作中提到】
: 前辈们指教一下:
: 我有一个A flox/flox 的mice,需要和Tek-Cre杂交,得到血液系统敲除的A -/- mice。
: Breeding程序如下:
: 1. A flox/flox mating with Tek+ 得到 "A wt/lox Tek+" and "A wt/lox Tek-"
: 2. "A flox/flox" mating with "A wt/flox Tek+" 得到以下四种:
: "Rictor wt/flox Tek+"
: "Rictor flox/flox Tek+"
: "Rictor flox/flox Tek-"
: "Rictor flox/wt Tek-"
: "Rictor flox/flox Tek+"是我要的KO, 称为Hem_A -/-, 那么"Rictor flox/flox Tek-

h********n
发帖数: 4079
6
我觉得最终的比较组:
Rictor wt/flox Tek+
Rictor flox/flox Tek+
Rictor wt/wt Tek+
i*********0
发帖数: 915
7
亲代tek-cre 又不一定是homozygote,子代可以是+也可以是-。
D*a
发帖数: 6830
8
control说起来可以到四五个组,不过你光control就别想做实验了
我建议你看看你的cre都有谁用,有没有副作用,没有就算了,人家能发一个对照的,
你也能发。另外自己稍微留心下你主要的phenotype是不是cre的作用,留点data, 你
到时候引一下别人的,再data not shown一下就行了。
就算你最后要发cns,也别还没思路的时候第一个实验就上一堆对照,你先有点思路了
,再想想怎么加对照也不迟。
n****n
发帖数: 165
9
That's right if like this.

【在 i*********0 的大作中提到】
: 亲代tek-cre 又不一定是homozygote,子代可以是+也可以是-。
w***j
发帖数: 88
10
说句实话 我有点晕
这个Cre的事情确实太复杂 Control的用法几乎每篇文章都不一样
我就想 到时候Reviewer想毙掉这篇文章,随便找个control不够的理由不就拒掉了吗
嗨!
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w***j
发帖数: 88
11
Dua说的是最简洁的一种,最后的就是A flox/flox;Cre和A flox/flox,后者是对照组
,但这种做法完全不考虑Cre的影响。
htscorpion的方法比较复杂,还要同A wt/wt;Cre作对照,可能更为严格一些,但也更
为复杂。
w***j
发帖数: 88
12
无论怎样 都要谢谢大家!
n****n
发帖数: 165
13
The most critial requirement is good for your study,though sometimes this will take your time and be not easy to do.



【在 w***j 的大作中提到】
: 说句实话 我有点晕
: 这个Cre的事情确实太复杂 Control的用法几乎每篇文章都不一样
: 我就想 到时候Reviewer想毙掉这篇文章,随便找个control不够的理由不就拒掉了吗
: 嗨!

D*a
发帖数: 6830
14
Reviewer总有理由的,关键是你得先把文章拿出来,才有可能被Reviewer毙掉啊 :-)



【在 w***j 的大作中提到】
: 说句实话 我有点晕
: 这个Cre的事情确实太复杂 Control的用法几乎每篇文章都不一样
: 我就想 到时候Reviewer想毙掉这篇文章,随便找个control不够的理由不就拒掉了吗
: 嗨!

h********n
发帖数: 4079
15
A-flox/wt X A-flox/wt Cre/Cre 就可以得到三种.
我觉得, 选什么样的对照, 要看你的目的是什么.

【在 w***j 的大作中提到】
: Dua说的是最简洁的一种,最后的就是A flox/flox;Cre和A flox/flox,后者是对照组
: ,但这种做法完全不考虑Cre的影响。
: htscorpion的方法比较复杂,还要同A wt/wt;Cre作对照,可能更为严格一些,但也更
: 为复杂。

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