Z******5
发帖数: 435 | 1 刚查EZH2抗体，Abcam ab3748
这是产品说明书
http://www.abcam.com/KMT6-EZH2-antibody-ab3748.html
上面说 ab3748 antibody recognises EZH2 in cells transfected with HA-EZH2 in
IP and WB however we have not found a signal on endogenous EZH2 in any of
our batches tested.
但是看这篇文章，用这个抗体做ChIP（FigureS8），竟然能把结果做的这么漂亮。
Aging cell影响因子7左右。
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1474-9726.2010.005
http://onlinelibrary.wiley.com/store/10.1111/j.1474-9726.2010.0
用过这个抗体的人讲讲 |
W****C
发帖数: 1937 | 2 我觉得这个结果也可疑。。。厂家都说不行的抗体他们居然做出来。。。 |
d****7
发帖数: 109 | 3 这个很难说,他们的结果normalization的单位是AU,而不是%Input,如果是%Input,对于
转录因子来说只要能pull down 0.01%-0.2%就不错了 |
s******s
发帖数: 13035 | 4 杂志比较烂吧。一般有ChIP都会要求一张genomebrowser上面的图，
叫啥wiggle track一类的，表明ChIP质量没问题。这篇啥也没有也
能收，显然那张图不能见人
in
【在 Z******5 的大作中提到】
: 刚查EZH2抗体，Abcam ab3748
: 这是产品说明书
: http://www.abcam.com/KMT6-EZH2-antibody-ab3748.html
: 上面说 ab3748 antibody recognises EZH2 in cells transfected with HA-EZH2 in
: IP and WB however we have not found a signal on endogenous EZH2 in any of
: our batches tested.
: 但是看这篇文章，用这个抗体做ChIP（FigureS8），竟然能把结果做的这么漂亮。
: Aging cell影响因子7左右。
: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1474-9726.2010.005
: http://onlinelibrary.wiley.com/store/10.1111/j.1474-9726.2010.0
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Z******5
发帖数: 435 | 5 你说的那个是ChIP-seq结果吧？
我们普通的话就是按照文章上这样做啦。 不过他用的这个纵轴的单位我不太懂。
还有这个杂志至少从影响因子来说不算低啊，而且还有上升的趋势。
【在 s******s 的大作中提到】
: 杂志比较烂吧。一般有ChIP都会要求一张genomebrowser上面的图，
: 叫啥wiggle track一类的，表明ChIP质量没问题。这篇啥也没有也
: 能收，显然那张图不能见人
:
: in
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Z******5
发帖数: 435 | 6 其实我虽然做过，但还真不太懂这个单位，我就是按照upstate说明说做的，计算的结
果。
你能不能把这个AU, %input都展开讲讲？
【在 d****7 的大作中提到】
: 这个很难说,他们的结果normalization的单位是AU,而不是%Input,如果是%Input,对于
: 转录因子来说只要能pull down 0.01%-0.2%就不错了
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d****7
发帖数: 109 | 7 I'm not sure how they define AU. I think maybe they just treat their
control (IgG or vector control) as 1, then their calculate their TF
binding. About %Input, you can check this document:
http://expression.genomecenter.ucdavis.edu/documents/chIP_effic
More information about basic ChIP can be found here:
http://expression.genomecenter.ucdavis.edu/workshop.html
Sorry, I cannot type Chinese at the moment.
【在 Z******5 的大作中提到】
: 其实我虽然做过，但还真不太懂这个单位，我就是按照upstate说明说做的，计算的结
: 果。
: 你能不能把这个AU, %input都展开讲讲？
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