T*********y
发帖数: 643 | 1 我研究的基因有两个cDNA克隆，当我把它们和已知的来自于基因组的CDs比对时，发现
这两个cDNA克隆各有一个核苷酸的缺失，处于不同位置。我原来推测可能是cDNA克隆序
列不对，但后来测序其中一个cDNA克隆，证实确有一个氨基酸的缺失；当然也有其他的
突变，我推测是SNP。请问造成这种核苷酸缺失的原因是什么？ |
b****r
发帖数: 17995 | 2 这个不叫SNP，这个是deletion
买来的克隆有突变一点也不奇怪，所以买来第一件事应该就是全程测序 |
s******s
发帖数: 13035 | 3 看不懂。你开头没测序怎么“发现”的？你的cDNA哪里来的？
【在 T*********y 的大作中提到】
: 我研究的基因有两个cDNA克隆，当我把它们和已知的来自于基因组的CDs比对时，发现
: 这两个cDNA克隆各有一个核苷酸的缺失，处于不同位置。我原来推测可能是cDNA克隆序
: 列不对，但后来测序其中一个cDNA克隆，证实确有一个氨基酸的缺失；当然也有其他的
: 突变，我推测是SNP。请问造成这种核苷酸缺失的原因是什么？
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s****t
发帖数: 461 | 4 到底是nucleotide deletion or amino acid deletion? |
T*********y
发帖数: 643 | 5 是的，买来的克隆有突变一点不奇怪。
很奇怪的是有nucleotide deletion. |
T*********y
发帖数: 643 | 6 网上有提供的cDNA序列，从专门的resource center 买来的。和公布的genomic region
的序列比对，发现有one nucleotide deletion, 我买来后测序也确证有。
【在 s******s 的大作中提到】
: 看不懂。你开头没测序怎么“发现”的？你的cDNA哪里来的？
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T*********y
发帖数: 643 | 7 one nucleotide deletion.
【在 s****t 的大作中提到】
: 到底是nucleotide deletion or amino acid deletion?
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o********r
发帖数: 775 | 8 fs还能表达？
【在 T*********y 的大作中提到】
: one nucleotide deletion.
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m*p
发帖数: 226 | 9 Nobody can be sure their cDNAs are 100% right, even published in the NCBI.
You are just not lucky. Put that one in, if you think it is a real deletion. |
