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Biology版 - 完成的cancer genome sequencing 数据现在有吗?
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e*****t
发帖数: 642
1
只看到一些SNP,完整的DNA SEQ好像还没有呀,那位知道说说。
c*******d
发帖数: 192
2
how about this one? (lung cancer)
Nature. 2010 Aug 12;466(7308):869-73. Epub 2010 Jul 28
e*****t
发帖数: 642
3
我的意思是说DNA seq。他们这些数据都是加工过的啦。如果有原始的测序,像
1000genome,那样。我们也可以做一些bioinfo的分析。

【在 c*******d 的大作中提到】
: how about this one? (lung cancer)
: Nature. 2010 Aug 12;466(7308):869-73. Epub 2010 Jul 28

s*r
发帖数: 2757
4
你要那些没有变异的seq干什么
即使要的话,去ref seq下载就是啦

【在 e*****t 的大作中提到】
: 只看到一些SNP,完整的DNA SEQ好像还没有呀,那位知道说说。
e*****t
发帖数: 642
5
我要的是whole cancer genome seq. 现在可以看到的好像只是snp (我不确定,在网
站上找不到)
在哪可以下你说的 cancer genome seq。我找不到。

【在 s*r 的大作中提到】
: 你要那些没有变异的seq干什么
: 即使要的话,去ref seq下载就是啦

A*****n
发帖数: 243
6
这个dbGAP上有一些,不过都不是Pubic的,必须要签协议。

【在 e*****t 的大作中提到】
: 我要的是whole cancer genome seq. 现在可以看到的好像只是snp (我不确定,在网
: 站上找不到)
: 在哪可以下你说的 cancer genome seq。我找不到。

c*******d
发帖数: 192
7
Nature. 2010 May 27;465(7297):473-7.
Sequence data has been submitted to the NCBI Short Read Archive under
accession number SRA012097. Microarray data has been submitted to the NCBI
Gene Expression Omnibus under accession number GSE20585.
p******n
发帖数: 874
8
To access those data (clinical information and personal information), you
need to sign special forms.
e*****t
发帖数: 642
9
i just want to know if whole genome DNA seq is available. I would like
bother my boss to sign the form if yes. otherwise, i would not not bother.
anybody knows? I probably don't need clinical and personal info.

【在 p******n 的大作中提到】
: To access those data (clinical information and personal information), you
: need to sign special forms.

w******y
发帖数: 8040
10
search the ncbi short read archive and you will know it

【在 e*****t 的大作中提到】
: i just want to know if whole genome DNA seq is available. I would like
: bother my boss to sign the form if yes. otherwise, i would not not bother.
: anybody knows? I probably don't need clinical and personal info.

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