由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 请做cell migration的牛人帮帮偶阿
相关主题
请教Boyden chamber做migration assay的问题Position Available: Associate Scientist, High Throughput Screening/Assay Development
问一下boyden chamber invasion assay问个neuron migration基本问题
求教Boyden chamber matrigel invasion assay招了码工了
how to normalize ELISA signal??feng zhang又一篇cell.
紧急求助:做HE染色时伊红染料崩到身上怎么办?听来的
NGS/Array Job opportunity -Illuminafeng zhang joins MIT faculty
Temp position:RA in Genentech (转载)Boyden 在他新近的回忆文章里报告了几个八卦
求推荐:96 well plate 哪家公司的比较好?boyden今天过来给talk,牛人帮我想想有什么问题可以问?
相关话题的讨论汇总
话题: migration话题: 细胞话题: assay话题: 迁移话题: cell
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
n*m
发帖数: 27
1
做了好久的cell migration,就是用那个boyden chamber做的,买的insert下面是有孔
的膜,放在24well plate中,膜将上下两个well隔开。8um的孔径。偶都做了快半
年了,结果总是变化无常,好无助阿,大牛快出现帮帮忙吧,讲讲你们都是怎么做,怎
么quantification的阿
拜谢了!!!
t****p
发帖数: 1504
2
如果你的细胞需要trypsinize,我觉得结果肯定变化无常。

【在 n*m 的大作中提到】
: 做了好久的cell migration,就是用那个boyden chamber做的,买的insert下面是有孔
: 的膜,放在24well plate中,膜将上下两个well隔开。8um的孔径。偶都做了快半
: 年了,结果总是变化无常,好无助阿,大牛快出现帮帮忙吧,讲讲你们都是怎么做,怎
: 么quantification的阿
: 拜谢了!!!

s**********e
发帖数: 2888
3
我现在已经不做这个assay了,结果变化太大
d********m
发帖数: 3662
4
我做了一个月,觉得基本无解,就放弃了。当时还觉得放弃的太快了
t****p
发帖数: 1504
5
生物学中让人头痛的地方就是这种情况,想做定量,但是varyation太大,不知道是否
该相信。
做过一些迁移的实验,多说两句。
1 transwell assay: 细胞状态很重要。你如果是贴壁细胞,trypsinization时间的些
微差别,离心重悬吊强度就有影响。另外我非常怀疑公司的产品是否能够做到不同孔的
膜都做得一样。
2 in vitro wounding assay:就是贴壁细胞划线,然后在特定时间看迁移到细胞所覆
盖的面积。此assay对medium的成分非常灵敏,要严格按照别人的protocol来做。换个
medium结果竟然会相反!你说该信哪个?此assay的定量分析非常耗时。
3 needle assay:就是一个小needle尖头释放chemoattractant,然后用软件实时记录
每个细胞的迁移,运算得到迁移速度和角度。模式生物Dictyostelium做这个assay的时
候需要先polarize才能迁移。很多文章说某个突变体影响力迁移速度。问题是很多突变
体本身它没法被polarized。你说究竟是它的极化能力受到影响还是本身的迁移受到影
响呢?曾经给community群发邮件询问这个问题的答案,竟然没有一个人能回答我的问
题。另外,此assay对细胞状态,温度等也非常敏感,所谓的定量其实只是定性。
4 EZ-TAXIScan chemotaxis assay:据说是日本一公司推出的仪器,巨贵。就是一头加
细胞,另一头加chemoattractant,细胞迁移的时候实时照相,追踪路径并计算速度和
角度。这是我迄今为止看到定量最让我信服的assay。此仪器软件有待改进,就是细胞
不迁移的话不追踪,只计算那些迁移明显的细胞。

【在 n*m 的大作中提到】
: 做了好久的cell migration,就是用那个boyden chamber做的,买的insert下面是有孔
: 的膜,放在24well plate中,膜将上下两个well隔开。8um的孔径。偶都做了快半
: 年了,结果总是变化无常,好无助阿,大牛快出现帮帮忙吧,讲讲你们都是怎么做,怎
: 么quantification的阿
: 拜谢了!!!

y***k
发帖数: 60
6
楼主做实验的时候,各个well里面是同种细胞么?migration变化比例多大?肉眼能看
出比较明显的差异么?
我不知道“结果总是变化无常”是什么意思,是说migration有时升高有时降低么?如
果是这种情况,只有两种可能,一是楼主的实验技术有问题,二是细胞的migration基
本没有差别
boyden chamber是比较tricky的实验,影响因素很多,主要体现在对细胞状态,细胞数
量和migration时间的把握上,建议楼主用多种排列组合试几次
我也做boyden chamber,感觉对于真正细胞迁移能力有差异的情况,虽然每次chamber
的结果会有些起伏,但是总体趋势肯定是不变的,具体实验里种种tricky的手段只是为
了把表型做的更加明显一点而已
n*m
发帖数: 27
7
多谢你们的解析,其实我也不知道那个做migration的是transwell还是boyden
chamber,反正就是那种买的insert独立包装的,把它放在24well plate中。
control就是无serum的培养液,实验组就是正常10%serum的培养液。结果就是有时候
control里migration的细胞很少(相对10%的培养液的实验组),有时候很高,与实
验组没区别。migration的时间是4小时。
感觉每次细胞状态变化很大,除去没migration的细胞这个操作变化也很大,不知道大
家都是怎么做的,protocol都是说用cotton swab,感觉这个操作起来变化太大了
大家是怎么操作,怎么染色,定量的?
谢谢!!!

chamber

【在 y***k 的大作中提到】
: 楼主做实验的时候,各个well里面是同种细胞么?migration变化比例多大?肉眼能看
: 出比较明显的差异么?
: 我不知道“结果总是变化无常”是什么意思,是说migration有时升高有时降低么?如
: 果是这种情况,只有两种可能,一是楼主的实验技术有问题,二是细胞的migration基
: 本没有差别
: boyden chamber是比较tricky的实验,影响因素很多,主要体现在对细胞状态,细胞数
: 量和migration时间的把握上,建议楼主用多种排列组合试几次
: 我也做boyden chamber,感觉对于真正细胞迁移能力有差异的情况,虽然每次chamber
: 的结果会有些起伏,但是总体趋势肯定是不变的,具体实验里种种tricky的手段只是为
: 了把表型做的更加明显一点而已

y****6
发帖数: 196
8
Want to try this?
Oris™ Cell Migration Assay
n*m
发帖数: 27
9
Do you have experience with this product? How do you apply chemoattractants
in the system?
Thank you for your information

【在 y****6 的大作中提到】
: Want to try this?
: Oris™ Cell Migration Assay

s**********e
发帖数: 2888
10
这个我用过,效果也一般

【在 y****6 的大作中提到】
: Want to try this?
: Oris™ Cell Migration Assay

y***k
发帖数: 60
11
“control就是无serum的培养液,实验组就是正常10%serum的培养液”
我没看明白啊,对照组和实验组不应该是细胞么?
我做chamber的时候,细胞重悬在0%或者1%serum的培养液中,铺在upper plate里,
bottom well里面加10%serum培养液,细胞在serum浓度差的影响下会自发从上往下爬,
不知你的实验是如何设计的啊?
btw,我是用伊红染细胞的,拍照计数定量

【在 n*m 的大作中提到】
: 多谢你们的解析,其实我也不知道那个做migration的是transwell还是boyden
: chamber,反正就是那种买的insert独立包装的,把它放在24well plate中。
: control就是无serum的培养液,实验组就是正常10%serum的培养液。结果就是有时候
: control里migration的细胞很少(相对10%的培养液的实验组),有时候很高,与实
: 验组没区别。migration的时间是4小时。
: 感觉每次细胞状态变化很大,除去没migration的细胞这个操作变化也很大,不知道大
: 家都是怎么做的,protocol都是说用cotton swab,感觉这个操作起来变化太大了
: 大家是怎么操作,怎么染色,定量的?
: 谢谢!!!
:

y****6
发帖数: 196
12
I know someone who used. But I have not tried.

chemoattractants

【在 n*m 的大作中提到】
: Do you have experience with this product? How do you apply chemoattractants
: in the system?
: Thank you for your information

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
boyden今天过来给talk,牛人帮我想想有什么问题可以问?紧急求助:做HE染色时伊红染料崩到身上怎么办?
Gene Expression by Remote ControlNGS/Array Job opportunity -Illumina
bbc horizon讲合成生物学的一期Temp position:RA in Genentech (转载)
那个Deisseroth比徒弟Boyden猛多了阿求推荐:96 well plate 哪家公司的比较好?
请教Boyden chamber做migration assay的问题Position Available: Associate Scientist, High Throughput Screening/Assay Development
问一下boyden chamber invasion assay问个neuron migration基本问题
求教Boyden chamber matrigel invasion assay招了码工了
how to normalize ELISA signal??feng zhang又一篇cell.
相关话题的讨论汇总
话题: migration话题: 细胞话题: assay话题: 迁移话题: cell