d***y
发帖数: 8107 | 1 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
Brain Research)
林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
中熟睡的爱女。
物理学出道
林映晞吿诉记者，她出生在广西大学一个知识分子家庭。也许是教数学的母亲的遗传，
林映晞从小就显示出数学上的天分。1986年从南宁三中毕业后，考取清华大 学，从此
就一直在世界顶尖大学里学习和从事科硏工作。林映晞先后于1991年和1994年获得清华
大学工程物理专业学士和硕士学位。在攻读硕士学位期间， 林映晞参与过信号采集探
测等生物仪器的研制。
1994年，林映晞获得全额奖学金到哈佛大学攻读物理学博士。“来哈佛时想学医学成像
。 1995年，我到MIT选修了一门磁共振成像(MRI)的课，从中学到用核磁共振谱仪看分
子结构，开始接触生物蛋白，从而对生物学产生了兴趣。因 此，1999年底博士毕业之
后，我决定申请做神经生物学博士后，”林映晞吿诉记者。
转换生物学跑道
2001年，在等待了一年的空位(bench)之后，林映晞如愿以偿进入非常热门的哈佛大学
附属波士顿儿童医院的格林伯格教授(Mike Greenberg)实验室。作为哈佛大学医学院神
经生物系主任，格林伯格挑选博士后的标准非常高。林映晞回忆说：“我很奇怪格林伯
格教授会收我到他的实 验室。他后来吿诉我，他看重我的物理专业背景，做事会比较
严谨。的确，同格林伯格教授一样，我是个非常注重细节的人。”
林映晞的出色表现再次证明格林伯格教授的直觉是正确的。在波士顿儿童医院做博士后
硏究期间，林映晞发现了哺乳动物中普遍存在的Npas4基因，并通过硏究发现这个基因
在大脑的海马区特别活跃。
自立门户
2009 年1月，林映晞应聘到MIT麦戈文脑科学硏究所建立自己的实验室，并获得MIT提供
的启动资金，后又申请到美国国家卫生署(NIH)的硏究经费。这篇论文的基础就是她带
领5名硏究生、博士后和技术员，在过去两年多来每周工作7天、每天10小时以上所取得
的实验成果。(李强)
林映晞吿诉记者，这项 实验的名称是“环境恐惧识别”(contextual fear
conditioning)。把一个小老鼠放到一个新笼子里，仅用3～4分钟，它会很快记住这个
笼子。如果同时通过笼子对小老鼠电击3-4次，每次2秒锺 的话，小老鼠就会记住这个
笼子是危险的。下次再把它放进这个笼子时，它会害怕地缩到笼子一角。正常情况下，
对这个可怕的笼子记忆会保持几个月，甚至是小老 鼠的一生。用一只Npas4基因被拿掉
的小老鼠做同样的实验，发现小老鼠对可怕笼子的记忆只能持续5分钟。把Npas4基因再
植入小老鼠大脑后，小老鼠又 能正常的长期记住这个可怕的笼子了。
在描述了上述实验现象之后，林映晞的论文进一步分析了其背后的生物神经理论，并探
讨了Npas4基因对于短期记忆在大脑中转化为长期记忆的控制作用。 |
d***y
发帖数: 8107 | 2 1周7天，每天10小时工作，能发篇science是不是也值了？呵呵…… |
n********k
发帖数: 2818 | 3 What a news! I don't remember I have read such a paper though:)))...
【在 d***y 的大作中提到】
: 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
: 月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
: 作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
: 献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
: 1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
: Brain Research)
: 林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
: 假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
: 以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
: 中熟睡的爱女。
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k****o
发帖数: 589 | |
h*****o
发帖数: 342 | 5 这位姐姐做了八年的博后，真了不起
【在 d***y 的大作中提到】
: 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
: 月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
: 作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
: 献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
: 1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
: Brain Research)
: 林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
: 假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
: 以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
: 中熟睡的爱女。
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i****g
发帖数: 426 | 6 8年博后换来mit教职，很多人都愿意干的
【在 h*****o 的大作中提到】
: 这位姐姐做了八年的博后，真了不起
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L*******e
发帖数: 2153 | 7 我现在觉得我读中文不成了。
看学术的还是看英文看的比较爽。
汗～～～～～
【在 d***y 的大作中提到】
: 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
: 月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
: 作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
: 献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
: 1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
: Brain Research)
: 林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
: 假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
: 以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
: 中熟睡的爱女。
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M****7
发帖数: 214 | |
p*****m
发帖数: 7030 | 9 话说如果开始做postdoc的时候告诉你 干8年，保证你有个top10学校的AP offer,多少
人会跳？我是不跳的。。这个问题其实蛮现实的，还是颇有一些lab能保证这个产出的
（比如文中提到的michael greenberg lab)
【在 i****g 的大作中提到】
: 8年博后换来mit教职，很多人都愿意干的
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w********h
发帖数: 12367 | 10 12年前看到这种报道，我会很敬佩。。。
现在看到这种报道，我只会感觉很心酸。。。
【在 d***y 的大作中提到】
: 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
: 月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
: 作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
: 献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
: 1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
: Brain Research)
: 林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
: 假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
: 以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
: 中熟睡的爱女。
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d*****r
发帖数: 2583 | 11 你第几年开始变的
【在 w********h 的大作中提到】
: 12年前看到这种报道，我会很敬佩。。。
: 现在看到这种报道，我只会感觉很心酸。。。
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S**********l
发帖数: 3835 | 12 8周大带到办公室，为啥不请个保姆呢？
【在 d***y 的大作中提到】
: 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
: 月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
: 作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
: 献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
: 1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
: Brain Research)
: 林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
: 假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
: 以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
: 中熟睡的爱女。
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S**********l
发帖数: 3835 | 13 top 10引力不够。top 1的话俺有可能跳。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 话说如果开始做postdoc的时候告诉你 干8年，保证你有个top10学校的AP offer,多少
: 人会跳？我是不跳的。。这个问题其实蛮现实的，还是颇有一些lab能保证这个产出的
: （比如文中提到的michael greenberg lab)
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n********k
发帖数: 2818 | 14 Breaking news:
notorious MITBBS biology QIANNIAN ID Neverthink just committed suicide with
the help of some old friends including Wonderlich and P...
【在 w********h 的大作中提到】
: 12年前看到这种报道，我会很敬佩。。。
: 现在看到这种报道，我只会感觉很心酸。。。
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n********k
发帖数: 2818 | 15 not when you are in your 4 or 5th ys and got stuck...Well, u are a BT anyway
:)))...we are the norm...well, it seems it is not uncommon in his lab...
【在 p*****m 的大作中提到】
: 话说如果开始做postdoc的时候告诉你 干8年，保证你有个top10学校的AP offer,多少
: 人会跳？我是不跳的。。这个问题其实蛮现实的，还是颇有一些lab能保证这个产出的
: （比如文中提到的michael greenberg lab)
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p*****m
发帖数: 7030 | 16 top1压根就没法定义 top10相对要容易一些
【在 S**********l 的大作中提到】
: top 10引力不够。top 1的话俺有可能跳。
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c**b
发帖数: 474 | |
p*****m
发帖数: 7030 | 18 我也觉得这个挺奇怪的 难道是准备随时胸喂？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 8周大带到办公室，为啥不请个保姆呢？
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p*****m
发帖数: 7030 | 19 我知道 谁一开始也不会想我要干到7 8年再走 都是一步一步过来的。所以这个问题才
有意义。。
anyway
【在 n********k 的大作中提到】
: not when you are in your 4 or 5th ys and got stuck...Well, u are a BT anyway
: :)))...we are the norm...well, it seems it is not uncommon in his lab...
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S**********l
发帖数: 3835 | 20 世界上有一所人所共知回国极易忽悠的top 1。什么XX女孩，XX男孩，XX博士，XXAP之
类。俺说的就是那所。
【在 p*****m 的大作中提到】
: top1压根就没法定义 top10相对要容易一些
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S**********l
发帖数: 3835 | 21 或许是的。有研究表明直接胸喂的小孩比较聪明。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 我也觉得这个挺奇怪的 难道是准备随时胸喂？
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p*****m
发帖数: 7030 | 22 H有啥好的 压力大 tenure clock长，拿tenure困难。。还值得你用8年去换啊
【在 S**********l 的大作中提到】
: 世界上有一所人所共知回国极易忽悠的top 1。什么XX女孩，XX男孩，XX博士，XXAP之
: 类。俺说的就是那所。
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p*****m
发帖数: 7030 | 23 发个link看看？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 或许是的。有研究表明直接胸喂的小孩比较聪明。
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S**********l
发帖数: 3835 | 24 为啥每次这种标题，俺都会看成美女科学家
【在 d***y 的大作中提到】
: 中新网1月17日电据美国《侨报周末》报道，具有国际影响力的学术期刋《科学》上个
: 月发表了一篇长篇学术论文，揭示Npas4基因对于大脑短期记忆转化为长期记忆的关键
: 作用。这篇论文对人类进一步理解短期记忆在大脑中转化为长期记忆的机制作出重要贡
: 献，将对老年痴呆症、健忘症等大脑神经疾病的硏究和治疗产生深远影响。
: 1月5日，记者在麻省理工学院(MIT)麦戈文脑科学硏究所(McGovern Institute for
: Brain Research)
: 林氏实验室采访了论文作者、Npas4基因发现者林映晞(Yingxi Lin)博士。刚刚休完产
: 假的林映晞把才8周大的女儿也带到办公室。她一边向记者深入浅出地介绍硏究成果，
: 以及从清华大学工程物理本科毕业到成为一位生物学家的经历；一边时不时照看下摇篮
: 中熟睡的爱女。
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y********e
发帖数: 8315 | 25 我也看成了美女科学家。。。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 为啥每次这种标题，俺都会看成美女科学家
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g********0
发帖数: 6201 | 26 明显比2009年的时候苍老不少了。天啊，想一想都会让人发疯的生活。 |
g********0
发帖数: 6201 | |
p*****m
发帖数: 7030 | 28 me 3
【在 y********e 的大作中提到】
: 我也看成了美女科学家。。。
|
n********k
发帖数: 2818 | 29 The next one is gonna be NPAS4 regulates sexuality and arousing behavior...
【在 p*****m 的大作中提到】
: me 3
|
S**********l
发帖数: 3835 | 30 不是的。是abnormal circulating lipid level， seizures，
abnormal ear physiology。俺刚查了俺的prediction，第一个是abnormal learning/
memory/conditioning
【在 n********k 的大作中提到】
: The next one is gonna be NPAS4 regulates sexuality and arousing behavior...
|
|
|
n********k
发帖数: 2818 | 31 and the third follow up is
NPAS4 dependent activity-regulated gene expression is involved in LES
behaviors
【在 n********k 的大作中提到】
: The next one is gonna be NPAS4 regulates sexuality and arousing behavior...
|
n********k
发帖数: 2818 | 32 Pls refer to my other post:)))while I am dying
【在 S**********l 的大作中提到】
: 不是的。是abnormal circulating lipid level， seizures，
: abnormal ear physiology。俺刚查了俺的prediction，第一个是abnormal learning/
: memory/conditioning
|
a****k
发帖数: 1130 | 33 跟了几个回帖，发现这有孩子的讨论的话题就是不一样。。。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 发个link看看？
|
p****y
发帖数: 23737 | 34 人生大半时间都跟小老鼠共度，想想都觉得恐怖。
【在 w********h 的大作中提到】
: 12年前看到这种报道，我会很敬佩。。。
: 现在看到这种报道，我只会感觉很心酸。。。
|
p****y
发帖数: 23737 | 35 me too
【在 y********e 的大作中提到】
: 我也看成了美女科学家。。。
|
i*****g
发帖数: 11893 | 36 我也看成了美女科学家。。。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 为啥每次这种标题，俺都会看成美女科学家
|
m*p
发帖数: 1331 | 37 wsnv还带小孩去lab？ 就算人家不complain，这种环境对baby也不好吧？万一泄露了什
么有毒气体小baby咋办？是不是该告她abuse？ |
y******8
发帖数: 1764 | 38 For babies, no one is better than mom.
【在 m*p 的大作中提到】
: wsnv还带小孩去lab？ 就算人家不complain，这种环境对baby也不好吧？万一泄露了什
: 么有毒气体小baby咋办？是不是该告她abuse？
|
b****r
发帖数: 17995 | 39 anyway，她的这个发现如果能被重复出来，绝对是个里程碑式的发现。
既然我们大家都是以科学家为职业，人家有了这么有意思的发现，我们应该更多地是为
她庆贺吧 |
j*****d
发帖数: 787 | 40 tonegawa作了不少类似的工作，她应该是被这个老头看中了，08年拿到的offer
08年的nature 出来之后，只有三片文章follow-up，包括这个science
她下面应该是做Optogenetics 了
【在 b****r 的大作中提到】
: anyway，她的这个发现如果能被重复出来，绝对是个里程碑式的发现。
: 既然我们大家都是以科学家为职业，人家有了这么有意思的发现，我们应该更多地是为
: 她庆贺吧
|
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j*****d
发帖数: 787 | 41 good idea! lol
I bet it is optogenetics.
【在 n********k 的大作中提到】
: The next one is gonna be NPAS4 regulates sexuality and arousing behavior...
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l******n
发帖数: 492 | 42 基因影响老年痴呆？
【在 b****r 的大作中提到】
: anyway，她的这个发现如果能被重复出来，绝对是个里程碑式的发现。
: 既然我们大家都是以科学家为职业，人家有了这么有意思的发现，我们应该更多地是为
: 她庆贺吧
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c*********7
发帖数: 148 | 43 老鼠放到其他笼子里面也会卷缩成一团吗？
求个原文链接。。。。 |
m******g
发帖数: 3924 | |
p*****m
发帖数: 7030 | 45 为啥说里程碑？求科普
【在 b****r 的大作中提到】
: anyway，她的这个发现如果能被重复出来，绝对是个里程碑式的发现。
: 既然我们大家都是以科学家为职业，人家有了这么有意思的发现，我们应该更多地是为
: 她庆贺吧
|
G***G
发帖数: 16778 | 46 two conditions are compared: knocking out gene NPAS4 and un-knocking out.
how to remove the bias due to the operation's harm to the mouse brain when
knocking out some genes?
is it possible that knocking out genes has an effect on mouse's memory,
no matter the gene is NPAS4 or not?
If a doctor inject something into my brain, I believe it won't work normally.
【在 b****r 的大作中提到】
: anyway，她的这个发现如果能被重复出来，绝对是个里程碑式的发现。
: 既然我们大家都是以科学家为职业，人家有了这么有意思的发现，我们应该更多地是为
: 她庆贺吧
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n********k
发帖数: 2818 | 47 Co求科普...It is not a bad piece though...
BTW, P, you know NPAS4 is a strongest target...I have been thinking about it
for quite some time and will probably still do something with it along the
similar line in one of my future directions...
Also, look at this one, the author must feel somewhat bad...
The neuronal PAS domain protein 4 (Npas4) is required for new and reactivated fear memories.
Ploski JE, Monsey MS, Nguyen T, DiLeone RJ, Schafe GE.
PLoS One. 2011;6(8):e23760. Epub 2011 Aug 22.
【在 p*****m 的大作中提到】
: 为啥说里程碑？求科普
|
n********k
发帖数: 2818 | 48 what's your question again? Could you pls rephrase it? I am slow and didn't
quite get it...
normally.
【在 G***G 的大作中提到】
: two conditions are compared: knocking out gene NPAS4 and un-knocking out.
: how to remove the bias due to the operation's harm to the mouse brain when
: knocking out some genes?
: is it possible that knocking out genes has an effect on mouse's memory,
: no matter the gene is NPAS4 or not?
: If a doctor inject something into my brain, I believe it won't work normally.
|
G***G
发帖数: 16778 | 49 does the operation of Knocking itself hurt the mouse's brain?
I bet knocking any genes out would decrease the mouse's memory.
t
【在 n********k 的大作中提到】
: what's your question again? Could you pls rephrase it? I am slow and didn't
: quite get it...
:
: normally.
|
S**********l
发帖数: 3835 | 50 他的问题是典型的CS的人的问题。俺LD过一段时间就要问我这个问题。意思就是那个
phenotype根本不是gene引起的，是knockout这个或其他人为procedure引起的。比如你
啥都不knockout,只要把老鼠打一顿，肯定对大脑也有损害的。或者，你knock out any thing,或者只是做knockout这个动作，老鼠也会变傻。
t
【在 n********k 的大作中提到】
: what's your question again? Could you pls rephrase it? I am slow and didn't
: quite get it...
:
: normally.
|
|
|
G***G
发帖数: 16778 | 51 yes, you are right.
knocking out any gene may produce the same result.
do you think so?
【在 S**********l 的大作中提到】
: 他的问题是典型的CS的人的问题。俺LD过一段时间就要问我这个问题。意思就是那个
: phenotype根本不是gene引起的，是knockout这个或其他人为procedure引起的。比如你
: 啥都不knockout,只要把老鼠打一顿，肯定对大脑也有损害的。或者，你knock out any thing,或者只是做knockout这个动作，老鼠也会变傻。
:
: t
|
n********k
发帖数: 2818 | 52 well, I expect those are the obvious caveats which are easily controlled as
long as the experiments are done in a blinded fashion...
【在 G***G 的大作中提到】
: does the operation of Knocking itself hurt the mouse's brain?
: I bet knocking any genes out would decrease the mouse's memory.
:
: t
|
S**********l
发帖数: 3835 | 53 那显然不是的。大部分gene都没有这个phenotype。
但是所有的实验都有这个漏洞，你没法证明只有knockout+此gene才会产生phenotype，
及双重干预。这个没办法的。这就是所谓的观察者必然对被观察者产生的影响（物理，
玄学都是搞这个的）。刘慈欣写的球状闪电讲的就是这个意思。不过你跟学生物的人讲
这个好比鸡同鸭讲。
【在 G***G 的大作中提到】
: yes, you are right.
: knocking out any gene may produce the same result.
: do you think so?
|
G***G
发帖数: 16778 | 54 please tell us how you knock out a gene in the brain tissue?
do you knock out the gene in every brain cell?
any thing,或者只是做knockout这个动作，老鼠也会变傻。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 他的问题是典型的CS的人的问题。俺LD过一段时间就要问我这个问题。意思就是那个
: phenotype根本不是gene引起的，是knockout这个或其他人为procedure引起的。比如你
: 啥都不knockout,只要把老鼠打一顿，肯定对大脑也有损害的。或者，你knock out any thing,或者只是做knockout这个动作，老鼠也会变傻。
:
: t
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S**********l
发帖数: 3835 | 55 反之，跟CS的人讲生物也是鸡同鸭讲。。。
【在 G***G 的大作中提到】
: please tell us how you knock out a gene in the brain tissue?
: do you knock out the gene in every brain cell?
:
: any thing,或者只是做knockout这个动作，老鼠也会变傻。
|
G***G
发帖数: 16778 | 56 how can you prove knocking out a gene won't hurt its body or brain?
why not knocking out a gene from a patient?
【在 S**********l 的大作中提到】
: 那显然不是的。大部分gene都没有这个phenotype。
: 但是所有的实验都有这个漏洞，你没法证明只有knockout+此gene才会产生phenotype，
: 及双重干预。这个没办法的。这就是所谓的观察者必然对被观察者产生的影响（物理，
: 玄学都是搞这个的）。刘慈欣写的球状闪电讲的就是这个意思。不过你跟学生物的人讲
: 这个好比鸡同鸭讲。
|
S**********l
发帖数: 3835 | 57 大家理解俺每天给学CS的人讲生物，给学生物的人讲CS的痛苦了吧...同情俺吧。。。
【在 G***G 的大作中提到】
: how can you prove knocking out a gene won't hurt its body or brain?
: why not knocking out a gene from a patient?
|
p*****m
发帖数: 7030 | 58 这个没有回答他的问题(他们也不是注射蛋白 viral infection)。能rescue只说明本来
的phenotype确实是这个蛋白引起的（其实严格来说这个也没有说明），不说明随便弄
掉啥蛋白都有可能影响memory这句话是不正确的 |
G***G
发帖数: 16778 | 59 how good does the knocking out work?
for example, for a tissue, after the knocking out gene A,
all geneA disappear in the tissue
all other genes remaine.
could we use Next Generation Sequencing prove this? |
p*****m
发帖数: 7030 | 60 这个本来就是用genetics做behavior/neurophysiology的大问题之一么。无解的。
你看你要是KO一个gene发现细胞里面某细胞器大小变了 解释起来就不会有这些麻烦
【在 G***G 的大作中提到】
: how can you prove knocking out a gene won't hurt its body or brain?
: why not knocking out a gene from a patient?
|
|
|
p*****m
发帖数: 7030 | 61 你这个理论上倒是问题不大 KO过程中会有不可预测的基因组修饰事件产生 但是既然重
新在KO老鼠里表达npas4能rescue phenotype，那至少说明这些不可预测的修饰不太重要
【在 G***G 的大作中提到】
: how good does the knocking out work?
: for example, for a tissue, after the knocking out gene A,
: all geneA disappear in the tissue
: all other genes remaine.
: could we use Next Generation Sequencing prove this?
|
S**********l
发帖数: 3835 | 62 只要加以实验，甚至只是肉眼看，就不能保证观察者对被观察者没有产生预期实验以外
的影响。所以某种程度上所有的实验都是假的。只有变成一个弱观察者的时候，比如快
完蛋的时候，才能接近事实的真相。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 这个没有回答他的问题(他们也不是注射蛋白 viral infection)。能rescue只说明本来
: 的phenotype确实是这个蛋白引起的（其实严格来说这个也没有说明），不说明随便弄
: 掉啥蛋白都有可能影响memory这句话是不正确的
|
p*****m
发帖数: 7030 | 63 你这个就扯淡了 宏观物体的量子效应有那么大么br />
再说了 人快死了就变成弱观察者 这句话除了刘慈欣别的物理学家信不？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 只要加以实验，甚至只是肉眼看，就不能保证观察者对被观察者没有产生预期实验以外
: 的影响。所以某种程度上所有的实验都是假的。只有变成一个弱观察者的时候，比如快
: 完蛋的时候，才能接近事实的真相。
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n********k
发帖数: 2818 | 64 you have the potential to make every question shining:)))...but do you think
a CS would follow your logy...
【在 p*****m 的大作中提到】
: 这个本来就是用genetics做behavior/neurophysiology的大问题之一么。无解的。
: 你看你要是KO一个gene发现细胞里面某细胞器大小变了 解释起来就不会有这些麻烦
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S**********l
发帖数: 3835 | 65 俺是从本质上解释gooog的问题。就是你只要参与实验，就不可能排除副作用。。。
说不定你盯着人家knockout mouse看的时候导致人家精神紧张所以考试没通过呢。
我的意思是他的问题是没法解决的，在所有的实验科学中。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 你这个就扯淡了 宏观物体的量子效应有那么大么br />
: 再说了 人快死了就变成弱观察者 这句话除了刘慈欣别的物理学家信不？
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n********k
发帖数: 2818 | 66 那至少说明这些不可预测的修饰不太重要
Wrong! you need to make up some genetics/or epigenetics...just for the seek
of arguing though...:))) BTW, you think way beyond than the questions
literally have asked for...
重要
【在 p*****m 的大作中提到】
: 你这个理论上倒是问题不大 KO过程中会有不可预测的基因组修饰事件产生 但是既然重
: 新在KO老鼠里表达npas4能rescue phenotype，那至少说明这些不可预测的修饰不太重要
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n********k
发帖数: 2818 | 67 I am with you... I was going to say you were just following his logy...
【在 S**********l 的大作中提到】
: 俺是从本质上解释gooog的问题。就是你只要参与实验，就不可能排除副作用。。。
: 说不定你盯着人家knockout mouse看的时候导致人家精神紧张所以考试没通过呢。
: 我的意思是他的问题是没法解决的，在所有的实验科学中。
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S**********l
发帖数: 3835 | 68 这行一般没有logy，这行应该叫binology。
【在 n********k 的大作中提到】
: I am with you... I was going to say you were just following his logy...
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p*****m
发帖数: 7030 | 69 你这第一句话等于没说，所有试验现象，在有合适control的条件下，都可以解释称观
察和实验操作共同作用的结果。但是如果前者的贡献<0.00000000000000000001%，那把
结论简化成主要是后者的贡献好像没有不妥吧。。
第二句话，这里就是control的作用啊。你把实验做成双盲的不就行了，这样自动回到
上一段。
而且gooog的问题不是这个吧 他是在问KO gene 影响行为会不会是non-specific的，比
如KO本身导致老鼠不那么爽不那么健康 这个本身确实是个问题
【在 S**********l 的大作中提到】
: 俺是从本质上解释gooog的问题。就是你只要参与实验，就不可能排除副作用。。。
: 说不定你盯着人家knockout mouse看的时候导致人家精神紧张所以考试没通过呢。
: 我的意思是他的问题是没法解决的，在所有的实验科学中。
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p*****m
发帖数: 7030 | 70 不太明白你的意思 有rescue难道不说明KO phenotype基本上应该就是KO某gene导致的？
seek
【在 n********k 的大作中提到】
: 那至少说明这些不可预测的修饰不太重要
: Wrong! you need to make up some genetics/or epigenetics...just for the seek
: of arguing though...:))) BTW, you think way beyond than the questions
: literally have asked for...
:
: 重要
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n********k
发帖数: 2818 | 71 you always can read the meaning between the lines which I am incapable to do
sometimes, which is what make you a great one:)))...Anyway, I am gonna stop
watering on this particular point...
so what's your take on the article--why it is a science? NPAS4 function is
CA3/activity specific...without a behavior/circuitry background, I am still
wondering what made it to science...the molecular mechanism part to me is
neither novel nor impressive...but I'll read the details later...
【在 p*****m 的大作中提到】
: 你这第一句话等于没说，所有试验现象，在有合适control的条件下，都可以解释称观
: 察和实验操作共同作用的结果。但是如果前者的贡献<0.00000000000000000001%，那把
: 结论简化成主要是后者的贡献好像没有不妥吧。。
: 第二句话，这里就是control的作用啊。你把实验做成双盲的不就行了，这样自动回到
: 上一段。
: 而且gooog的问题不是这个吧 他是在问KO gene 影响行为会不会是non-specific的，比
: 如KO本身导致老鼠不那么爽不那么健康 这个本身确实是个问题
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n********k
发帖数: 2818 | 72 Sure, KO is important but the KO-caused downstream reversible modifications
could also be important...so your second part doesn't have to be true in all
scenarios, agree?
的？
【在 p*****m 的大作中提到】
: 不太明白你的意思 有rescue难道不说明KO phenotype基本上应该就是KO某gene导致的？
:
: seek
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S**********l
发帖数: 3835 | 73 你需要re-define 'great one'。牛顿，爱因斯坦是great。搞生物的孟德尔达尔文是
great。
断章取义不可以算great。
do
stop
still
【在 n********k 的大作中提到】
: you always can read the meaning between the lines which I am incapable to do
: sometimes, which is what make you a great one:)))...Anyway, I am gonna stop
: watering on this particular point...
: so what's your take on the article--why it is a science? NPAS4 function is
: CA3/activity specific...without a behavior/circuitry background, I am still
: wondering what made it to science...the molecular mechanism part to me is
: neither novel nor impressive...but I'll read the details later...
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p*****m
发帖数: 7030 | 74 哦哦 这个当然啦 我是说Ko过程中（比如说，DNA断链以后产生的free end对genome其
他区域的潜在影响）的随机事件可以被rescue排除。rescue当然排除不了KO这个gene产
生的任何影响了
modifications
all
【在 n********k 的大作中提到】
: Sure, KO is important but the KO-caused downstream reversible modifications
: could also be important...so your second part doesn't have to be true in all
: scenarios, agree?
:
: 的？
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p*****m
发帖数: 7030 | 75 这样吧 让gooog自己说说 他质疑的是KO gene产生phenotype是不是因为有non-
specific的影响（比如不健康，不高兴），还是质疑实验本身（包括观察）对结果的影响
【在 S**********l 的大作中提到】
: 你需要re-define 'great one'。牛顿，爱因斯坦是great。搞生物的孟德尔达尔文是
: great。
: 断章取义不可以算great。
:
: do
: stop
: still
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n********k
发帖数: 2818 | 76 YOU! STOP it! If I say it is great, it is great! got it...
BTW, you are a great one too...Also, I recommend you and P have a duel or
dual:))....
【在 S**********l 的大作中提到】
: 你需要re-define 'great one'。牛顿，爱因斯坦是great。搞生物的孟德尔达尔文是
: great。
: 断章取义不可以算great。
:
: do
: stop
: still
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S**********l
发帖数: 3835 | 77 这不是一回事么。我只是high level summarize了一下。GOOOG的问题在别的实验手段
难道就不是问题了。比如你把蛋白结晶了，照X光，怎么保证跟在cell里面一样?
影响
【在 p*****m 的大作中提到】
: 这样吧 让gooog自己说说 他质疑的是KO gene产生phenotype是不是因为有non-
: specific的影响（比如不健康，不高兴），还是质疑实验本身（包括观察）对结果的影响
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n********k
发帖数: 2818 | 78 you are very CS now:)))
【在 S**********l 的大作中提到】
: 这不是一回事么。我只是high level summarize了一下。GOOOG的问题在别的实验手段
: 难道就不是问题了。比如你把蛋白结晶了，照X光，怎么保证跟在cell里面一样?
:
: 影响
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p*****m
发帖数: 7030 | 79 两回事啊这是 就拿你的例子来说，把蛋白结晶出来侧结构能不能代表体内水合状态的
结构，和X光照结构本身会不会影响结构，难道问的是一个问题？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 这不是一回事么。我只是high level summarize了一下。GOOOG的问题在别的实验手段
: 难道就不是问题了。比如你把蛋白结晶了，照X光，怎么保证跟在cell里面一样?
:
: 影响
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m******5
发帖数: 1383 | 80 不用ngs啊，一个regular rt pcr就可以了
【在 G***G 的大作中提到】
: how good does the knocking out work?
: for example, for a tissue, after the knocking out gene A,
: all geneA disappear in the tissue
: all other genes remaine.
: could we use Next Generation Sequencing prove this?
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S**********l
发帖数: 3835 | 81 I think it's the same question。当然，你肯定会分成两篇paper写的。
【在 p*****m 的大作中提到】
: 两回事啊这是 就拿你的例子来说，把蛋白结晶出来侧结构能不能代表体内水合状态的
: 结构，和X光照结构本身会不会影响结构，难道问的是一个问题？
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g*********5
发帖数: 2533 | 82 Where are you from? CS?
【在 G***G 的大作中提到】
: how good does the knocking out work?
: for example, for a tissue, after the knocking out gene A,
: all geneA disappear in the tissue
: all other genes remaine.
: could we use Next Generation Sequencing prove this?
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p*****m
发帖数: 7030 | 83 当然了，从神的角度啥东西都是一样的。。都是虫子游戏么
我说这两件事的区别你不会看不出来吧 前者理论上是可以避免/改进/优化的(比如说，
用NMR做结构，X ray结构设计突变在体内验证，等等);后者理论上是无法避免的，除非
改写量子力学。
【在 S**********l 的大作中提到】
: I think it's the same question。当然，你肯定会分成两篇paper写的。
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y********a
发帖数: 138 | 84 wanted to ask the same question since GoooG's first post
He/she seems 1) doesn't understand what KO is and 2) doesn't understand
what the "controls" are for. That NGS question/proposal makes me LOL (no
offense, just felt cute) and reminds my old time being a naive physics
student.
【在 g*********5 的大作中提到】
: Where are you from? CS?
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p*****m
发帖数: 7030 | 85 不觉得他这个NGS的主意有什么太不对的 没有人能保证KO mice就真的只有一个gene
locus被改变了，free end DNA在细胞里什么事都能干。。rescue可以部分的说明
phenotype来自KO本身，但是不能完全说明，尤其当这个rescue其实本质上是over-
expression的时候
当然现实中基本上没有谁会去做个sequencing来说明自己的KO mice真的只有一个gene
被影响了 但是大家有意识不去做这个是一回事，这个验证本身有没有道理是另外一回事
【在 y********a 的大作中提到】
: wanted to ask the same question since GoooG's first post
: He/she seems 1) doesn't understand what KO is and 2) doesn't understand
: what the "controls" are for. That NGS question/proposal makes me LOL (no
: offense, just felt cute) and reminds my old time being a naive physics
: student.
:
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y********a
发帖数: 138 | 86 you are way too literate about my statement.
I agree with you it is not WRONG to check target locus & neighbors and
even doing whole genome profiling to ensure no mis-interpretation of the
results.
I was laughing at the idea of thinking NGS is to the rescue of all biology
problems (although myself is intensively engaged in this area).
gene
回事
【在 p*****m 的大作中提到】
: 不觉得他这个NGS的主意有什么太不对的 没有人能保证KO mice就真的只有一个gene
: locus被改变了，free end DNA在细胞里什么事都能干。。rescue可以部分的说明
: phenotype来自KO本身，但是不能完全说明，尤其当这个rescue其实本质上是over-
: expression的时候
: 当然现实中基本上没有谁会去做个sequencing来说明自己的KO mice真的只有一个gene
: 被影响了 但是大家有意识不去做这个是一回事，这个验证本身有没有道理是另外一回事
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p*****m
发帖数: 7030 | 87 我不觉得gooog有这个幼稚想法啊 他明白说了是想用ngs确认是不是别的基因都没有被
影响到
biology
【在 y********a 的大作中提到】
: you are way too literate about my statement.
: I agree with you it is not WRONG to check target locus & neighbors and
: even doing whole genome profiling to ensure no mis-interpretation of the
: results.
: I was laughing at the idea of thinking NGS is to the rescue of all biology
: problems (although myself is intensively engaged in this area).
:
: gene
: 回事
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y********a
发帖数: 138 | 88 Fine, I already said I agree with that.
"I agree with you it is NOT WRONG to check target locus & neighbors and
I simply say it is funny to always think NGS first to solve a bio problem. |
p*****m
发帖数: 7030 | 89 这个我当然同意呀
【在 y********a 的大作中提到】
: Fine, I already said I agree with that.
: "I agree with you it is NOT WRONG to check target locus & neighbors and
: I simply say it is funny to always think NGS first to solve a bio problem.
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s*******0
发帖数: 3461 | 90 我擦啊 敬你提醒 才看出来不是的 呵呵
其实这么理解也可以啦 美丽的 华人女科学家 呵呵 简称 美华人女科学家
【在 y********e 的大作中提到】
: 我也看成了美女科学家。。。
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T******y
发帖数: 14506 | 91 这个只能说reviewer网开一面。怎么说敲除Npas4基因，除记忆外，其他神经系统正常
？也可能是运动神经萎缩？还有很多别的假设。怎么这么肯定是记忆出问题？ |
s******8
发帖数: 2131 | 92 outsider question: does human have npas4 (seems yes), does it play the same
role in humans?
【在 T******y 的大作中提到】
: 这个只能说reviewer网开一面。怎么说敲除Npas4基因，除记忆外，其他神经系统正常
: ？也可能是运动神经萎缩？还有很多别的假设。怎么这么肯定是记忆出问题？
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l**********1
发帖数: 5204 | 93 If human had and this kind of projects are used by terrorist or devil
country to white house No. 1 or No. 2 VIP
what happened next?
NSABB might ban this kind of projects full open published in the future for securities reason
likes below article:
htp://news.sciencenet.cn/htmlnews/2011/11/256091.shtm
LX L may should have to change her career main target if she still in US.
same
【在 s******8 的大作中提到】
: outsider question: does human have npas4 (seems yes), does it play the same
: role in humans?
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j*****d
发帖数: 787 | 94 你这算是玩计算机玩出玄学了。
有点丢份阿
【在 S**********l 的大作中提到】
: 只要加以实验，甚至只是肉眼看，就不能保证观察者对被观察者没有产生预期实验以外
: 的影响。所以某种程度上所有的实验都是假的。只有变成一个弱观察者的时候，比如快
: 完蛋的时候，才能接近事实的真相。
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j*****d
发帖数: 787 | 95
it
the
reactivated fear memories.
good pick. but the one in PLoS submitted in July 20 and accepted July 24.
Lin's paper submitted in May, accepted in October.
【在 n********k 的大作中提到】
: Co求科普...It is not a bad piece though...
: BTW, P, you know NPAS4 is a strongest target...I have been thinking about it
: for quite some time and will probably still do something with it along the
: similar line in one of my future directions...
: Also, look at this one, the author must feel somewhat bad...
: The neuronal PAS domain protein 4 (Npas4) is required for new and reactivated fear memories.
: Ploski JE, Monsey MS, Nguyen T, DiLeone RJ, Schafe GE.
: PLoS One. 2011;6(8):e23760. Epub 2011 Aug 22.
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j*****d
发帖数: 787 | 96 还有，science的重点有两个，in vivo memory function以及transcriptional
control，特别是NPAS4 对 c-fos的调控，很强大的
【在 j*****d 的大作中提到】
:
: it
: the
: reactivated fear memories.
: good pick. but the one in PLoS submitted in July 20 and accepted July 24.
: Lin's paper submitted in May, accepted in October.
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n********k
发帖数: 2818 | 97 you think Plos one is their first trial? Think it again! I think they must
have gone through a number of other journals...I was in this guy's talk a
while back...he has been working on NPAS4 back when he was in a postdoc in
Yale as well...
【在 j*****d 的大作中提到】
: 还有，science的重点有两个，in vivo memory function以及transcriptional
: control，特别是NPAS4 对 c-fos的调控，很强大的
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j*****d
发帖数: 787 | 98 我的意思是林的文章无视那篇plos one是正常的
plos one 只有一个主要论点，science有至少两个，都很系统
原来之前你关于npas4的臆想是有备而来啊
must
【在 n********k 的大作中提到】
: you think Plos one is their first trial? Think it again! I think they must
: have gone through a number of other journals...I was in this guy's talk a
: while back...he has been working on NPAS4 back when he was in a postdoc in
: Yale as well...
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n********k
发帖数: 2818 | 99 well part of my interest is along the same line, I became interested in
NPAS4 long before I was in that talk but I just never had the time/freedom
earlier to do any...now I have been entertaining one line of research pretty
much similar to Lin's work on NPAS4... apparently NPAS4 is not my gene but
it is a very much relevant one...
【在 j*****d 的大作中提到】
: 我的意思是林的文章无视那篇plos one是正常的
: plos one 只有一个主要论点，science有至少两个，都很系统
: 原来之前你关于npas4的臆想是有备而来啊
:
: must
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l**********1
发帖数: 5204 | 100 RE DJ/XM
没听说过藤校的PhD awarded never could become the same 藤校的PI/AP later full
professorship 这一暗规则吗
为了防止Faculty选拔的 不平等及相关利益的冲突
更别说藤校头牌的harvard了
从MIT 的以下关于林的H 物理学博士学位的资料 她不可能当H的PI/AP
htp://syntheticneurobiology.org/PDFs/news.081201.mcgovernbrainscan.pdf
还有PoLS One (2011) paper?
was after
Lin Y, Bloodgood BL, Hauser JL, Lapan AD, Koon AC, Kim TK, Hu LS, Malik AN,
Greenberg ME. Activity-dependent regulation of inhibitory synapse
development by Npas4. Nature. 2008 Oct 30;455(7217):1198-204.
htp://www.hms.harvard.edu/dms/BBS/fac/greenberg.php
Re: 发信人: neverthink (nevernetbug)
====
------
[回复]
发信人: neverthink (nevernetbug), 信区: Biology
标 题: Re: 美华人女科学家重大研究突破:基因影响大脑记忆
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jan 19 12:38:00 2012, 美东)
well part of my interest is along the same line, I became interested in
NPAS4 long before I was in that talk but I just never had the time/freedom
earlier to do any...now I have been entertaining one line of research pretty
much similar to Lin's work on NPAS4... apparently NPAS4 is not my gene but
it is a very much relevant one...
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【在 S**********l 的大作中提到】
: 世界上有一所人所共知回国极易忽悠的top 1。什么XX女孩，XX男孩，XX博士，XXAP之
: 类。俺说的就是那所。
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s********s
发帖数: 67 | 101 HSV1 病毒in vivo overexpression后 能回复这个挺牛的。
【在 b****r 的大作中提到】
: anyway，她的这个发现如果能被重复出来，绝对是个里程碑式的发现。
: 既然我们大家都是以科学家为职业，人家有了这么有意思的发现，我们应该更多地是为
: 她庆贺吧
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