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Biology版 - RNA 升高10倍,蛋白却下降80%,有何解释?
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话题: 蛋白话题: rna话题: mrna话题: 升高话题: 下降
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t******y
发帖数: 716
1
最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问
题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况?
1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。
2)蛋白降解抑制。
为什么细胞需要做这样的调整?
用的细胞是上皮细胞。
s******s
发帖数: 13035
2
首先你要确定确实原来的mRNA升高了10倍,而不是alternative splicing一类的

【在 t******y 的大作中提到】
: 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问
: 题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况?
: 1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。
: 2)蛋白降解抑制。
: 为什么细胞需要做这样的调整?
: 用的细胞是上皮细胞。

a*******g
发帖数: 33
3
会不会是体内的siRNA导致的转录后抑制?有做siRNA的可以出来讲讲
p****p
发帖数: 3360
4
1. 前面有一个人说得好,要仔细查看是否有alternative splicing导致其他isoform
增多,而你检查的isoform随之下降了。也就是说,看看你检查的mRNA和protein是否来
自同一个isoform。
2. 另外看看你的蛋白是否有转录后调控的功能。看看它是否能反馈调节自己。
3. 你的蛋白是生物钟调控的。你的mRNA,蛋白取样的时间不一样,所以丰度高低也就
不同了。

【在 t******y 的大作中提到】
: 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问
: 题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况?
: 1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。
: 2)蛋白降解抑制。
: 为什么细胞需要做这样的调整?
: 用的细胞是上皮细胞。

t******y
发帖数: 716
5
1. 目前看到的2个isoforom的蛋白量都下降。
2. 你是指转录后反向抑制蛋白合成?
3. 应该和生物钟没有关系。

【在 p****p 的大作中提到】
: 1. 前面有一个人说得好,要仔细查看是否有alternative splicing导致其他isoform
: 增多,而你检查的isoform随之下降了。也就是说,看看你检查的mRNA和protein是否来
: 自同一个isoform。
: 2. 另外看看你的蛋白是否有转录后调控的功能。看看它是否能反馈调节自己。
: 3. 你的蛋白是生物钟调控的。你的mRNA,蛋白取样的时间不一样,所以丰度高低也就
: 不同了。

f******o
发帖数: 427
6
蛋白降解加快,而RNA代偿性升高,可以比较一下处理前后蛋白ubiquitin化的水平。

【在 t******y 的大作中提到】
: 最近做一个蛋白,处理后mRNA 升高了10倍,蛋白量却下降了有将近80%。你们会认为问
: 题出在哪里?有没有谁碰到类似的情况?
: 1)蛋白翻译受到抑制,蛋白降解提高。
: 2)蛋白降解抑制。
: 为什么细胞需要做这样的调整?
: 用的细胞是上皮细胞。

n**8
发帖数: 221
7
你用什么方法检测mRNA水平的? qRT-PCR 还是northern。
如果是我,我会去检测是否存在anti-sense RNA(noncoding RNA)。
会不会只是anti-sense RNA水平上升?
t******y
发帖数: 716
8
用qPCR 检测RNA。
i*****g
发帖数: 11893
9
你的RNA extract里面DNA去干净没有?
另外,RNA的事情和蛋白可以差很远
n**8
发帖数: 221
10
qRT-PCR引物一般跨intron吧...

【在 i*****g 的大作中提到】
: 你的RNA extract里面DNA去干净没有?
: 另外,RNA的事情和蛋白可以差很远

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