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Biology版 - 如何去除plasmid prep里的gDNA
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f*****r
发帖数: 84
1
要做一个screen 然后sequence plasmid library. 所以小含量的gDNA 会比较影响结果
。 大家有什么比较好的方法除去gDNA 么。 是不是大片段dna 在cartridge 上elute
就不容易, 这样我再做一个pcr clean up 是不是gDNA 会去掉很多。
thanks!
j****n
发帖数: 3370
2
用exonuclease切一切会不会有效果?

elute

【在 f*****r 的大作中提到】
: 要做一个screen 然后sequence plasmid library. 所以小含量的gDNA 会比较影响结果
: 。 大家有什么比较好的方法除去gDNA 么。 是不是大片段dna 在cartridge 上elute
: 就不容易, 这样我再做一个pcr clean up 是不是gDNA 会去掉很多。
: thanks!

M******g
发帖数: 152
3
gel purification.
f*****r
发帖数: 84
4
是一个library 的PLASMIDS, 所以跑胶会像smear,切一大块胶不知道产率会不会很低
呢。
exonuclease对plasmid 没影响么?
thanks!
f*****r
发帖数: 84
5
似乎有plasmid safe exonuclease 看来可以试一下。 Thanks!
f*****r
发帖数: 84
6
似乎有plasmid safe exonuclease 看来可以试一下。 Thanks!
f*****r
发帖数: 84
7
似乎有plasmid safe exonuclease 看来可以试一下。 Thanks!
f*******e
发帖数: 628
8
很多 plasmid extraction kit 里面在初期提纯的步骤都会用 exonuclease 来去除
gDNA。
因为 plasmid 是 circular 的,不会被影响。之后的进一步提纯步骤会同时去除掉
exonuclease.
t******5
发帖数: 67
9
gDNA 分子量非常大,如果抽提过程中动作轻柔的话gDNA不会裂成小片段,再跑胶回收
就能去除gDNA

elute

【在 f*****r 的大作中提到】
: 要做一个screen 然后sequence plasmid library. 所以小含量的gDNA 会比较影响结果
: 。 大家有什么比较好的方法除去gDNA 么。 是不是大片段dna 在cartridge 上elute
: 就不容易, 这样我再做一个pcr clean up 是不是gDNA 会去掉很多。
: thanks!

m*********D
发帖数: 1727
10
考虑一下比较老的方法:Traditional Methods for CsCl Isolation
of Plasmid DNA by Ultracentrifugation
1 (共1页)
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