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Biology版 - 关于AF488标记的antagonist在flow cytometry上面的问题,谢谢!
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话题: antagonist话题: af488话题: 标记话题: cytometry话题: flow
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t******n
发帖数: 33
1
一个荧光(Alexa Fluor 488)标记的antagonist可以抑制细胞表面的分子信号通路,
IC50在100~200nM。但是用这个AF488标记的antagonist染色target高表达的细胞系,
在flow cytometry上面看不见那个波峰向右边移动,请问大侠可能的原因是什么?谢谢
c******8
发帖数: 36
2
你的抗体不work 吧!
s******c
发帖数: 331
3
如果你确定你的小分子结合你想看的target,那么最大的可能是dissociation太快。小
分子和抗体的结合动力学有时候会差很多,描述小分子作用方式的不能仅仅用affinity
或IC50,小分子哪怕affinity在single digit nM range,可能dissociation都是秒级
的,这样在FACS里当然看不到。
t******n
发帖数: 33
4
谢谢回复!AF488标记应该work,高浓度的时候能看见非特异的结合。
请问seraphzc,有什么办法可以解决这个off rate太快的问题?我试了Formaldehyde
fix,对小分子好像不起作用,还有啥其他得可能方法吗?
非常感谢!

affinity

【在 s******c 的大作中提到】
: 如果你确定你的小分子结合你想看的target,那么最大的可能是dissociation太快。小
: 分子和抗体的结合动力学有时候会差很多,描述小分子作用方式的不能仅仅用affinity
: 或IC50,小分子哪怕affinity在single digit nM range,可能dissociation都是秒级
: 的,这样在FACS里当然看不到。

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