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Biology版 - 问一下用FACS能否区分EGFP/RFP
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c*******7
发帖数: 28
1
在尝试用FACS区分表达EGFP/RFP的两种细胞,希望最后能统计出两者的ratio
但是奇怪的是,EGFP在FL1,FL2两个通道的分布几乎完全相同,不能区分
用的是pEGFP-C1载体,EGFP在N端,无插入序列,共聚焦显微镜下表达正常,用红色荧光通
道无法检测到
转293T cell,没有做任何固定,仅用PBS重悬
同时看了RFP或者mcherry,就可以用FL2通道检测,在FL1上信号很弱,可以区分出来
想问一下大家有没有遇到这样的情况?这是质粒本身的问题还是机器调试的问题?
c******r
发帖数: 3778
2
你有没有controls?就是说只有GFP和只有RFP的细胞?看起来什么样子?最好给个截图
看一眼。
m*********7
发帖数: 5207
3
查看一下你机器里FL2通道的设置,是不是波长在GFP和RFP之间?
c*******7
发帖数: 28
4
我说的就是单荧光的control,还没有把两种荧光混起来。
我把RFP和EGFP的结果上传了。EGFP那张图最后用FL1,FL2作为纵横坐标作图,结果就几
乎是一条直线。
机器是BD FACSCalibur Flow Cytometry System

【在 c******r 的大作中提到】
: 你有没有controls?就是说只有GFP和只有RFP的细胞?看起来什么样子?最好给个截图
: 看一眼。

c******r
发帖数: 3778
5
你有compensate?最后这个是compensate之前还是之后的?

【在 c*******7 的大作中提到】
: 我说的就是单荧光的control,还没有把两种荧光混起来。
: 我把RFP和EGFP的结果上传了。EGFP那张图最后用FL1,FL2作为纵横坐标作图,结果就几
: 乎是一条直线。
: 机器是BD FACSCalibur Flow Cytometry System

c*******7
发帖数: 28
6


【在 c******r 的大作中提到】
: 你有compensate?最后这个是compensate之前还是之后的?
c******r
发帖数: 3778
7
compensate应该有至少两套图吧?
一套是GFP的,四张图,只有FL1有positive staining
一套是RFP的,四张图,只有FL2有positive staining
你这两套图看着像GFP和negative control的,没有RFP的?

【在 c*******7 的大作中提到】

c*******7
发帖数: 28
8
RFP和GFP在4楼贴了
最后两张都是negative control,贴重复了

【在 c******r 的大作中提到】
: compensate应该有至少两套图吧?
: 一套是GFP的,四张图,只有FL1有positive staining
: 一套是RFP的,四张图,只有FL2有positive staining
: 你这两套图看着像GFP和negative control的,没有RFP的?

c******r
发帖数: 3778
9
哦,好像RFP问题不大?主要是GFP的fl1 leak到fl2了,你compensate了多少?
几种可能性:
1. 设置有问题。
2. 细胞本身有问题,比如会不会这个细胞已经有了RFP?
3. autofluorescent。那么这个细胞系也许不适合这个实验?

【在 c*******7 的大作中提到】
: RFP和GFP在4楼贴了
: 最后两张都是negative control,贴重复了

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