s********m
发帖数: 748 | 1 请问用Qtrap得到的data做Mascot search的时候parameter如何设置？ 我按照公司给的
参数好像结果不是很好。我之所以说不好是因为同一个样品我用LTQ做的时候多发现了
很多peptide，大概十几倍，感觉不太正常。我LTQ的peptide tol is 800ppm, MS/MS
is 0.6Da， instrument type is ESI-trap, 请问这三项Qtrap一般该如何设置？还有
其他需要特别注意的吗？
如果这些都不是主要问题的话，我不知道是不是实验本身的问题了，希望哪位熟悉此仪
器的高手给点建议， 谢谢 |
h*****t
发帖数: 1226 | 2 Similar to LTQ.
【在 s********m 的大作中提到】
: 请问用Qtrap得到的data做Mascot search的时候parameter如何设置？ 我按照公司给的
: 参数好像结果不是很好。我之所以说不好是因为同一个样品我用LTQ做的时候多发现了
: 很多peptide，大概十几倍，感觉不太正常。我LTQ的peptide tol is 800ppm, MS/MS
: is 0.6Da， instrument type is ESI-trap, 请问这三项Qtrap一般该如何设置？还有
: 其他需要特别注意的吗？
: 如果这些都不是主要问题的话，我不知道是不是实验本身的问题了，希望哪位熟悉此仪
: 器的高手给点建议， 谢谢
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s********m
发帖数: 748 | 3 really? That's so strange why the results get so different.
【在 h*****t 的大作中提到】
: Similar to LTQ.
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f********e
发帖数: 2194 | 4 LTQ is much better for qualitative peptide analysis than Qtrap.
【在 s********m 的大作中提到】
: 请问用Qtrap得到的data做Mascot search的时候parameter如何设置？ 我按照公司给的
: 参数好像结果不是很好。我之所以说不好是因为同一个样品我用LTQ做的时候多发现了
: 很多peptide，大概十几倍，感觉不太正常。我LTQ的peptide tol is 800ppm, MS/MS
: is 0.6Da， instrument type is ESI-trap, 请问这三项Qtrap一般该如何设置？还有
: 其他需要特别注意的吗？
: 如果这些都不是主要问题的话，我不知道是不是实验本身的问题了，希望哪位熟悉此仪
: 器的高手给点建议， 谢谢
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s********m
发帖数: 748 | 5 I know this, but I am using Qtrap to do MRM analysis, so I need the peptide
identification information from Qtrap first.
【在 f********e 的大作中提到】
: LTQ is much better for qualitative peptide analysis than Qtrap.
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