x****6
发帖数: 4339 | 1 从编辑对DNA的效果来看，可以分为 敲除（knock-out）和 敲入（knock-in）。
敲除，故名思意就是让目标基因失去功能。这个相对容易实现。因为基因经过长期的进
化出来的精细结构，随机的删除或者添加几个碱基对(生物里的0 1）就能让目标基因
失效。
如何实现？CAS9或者其他的核酸酶，在破坏DNA双链以后，细胞会自动修复损伤。这个
修复的机制叫做非同源性末端连接（Non-homology end joining,NHEJ）。就是直接把
绳子断开的两端直接连接回去。但是这个过程不精确，大概率的会随机造成几个碱基对
的删除或者添加。那么正好就可以让基因失效。
这就是贺所采取的手段：基因敲除。
-------------------------------
第二种，敲入。和敲除相反，把一段给定的DNA序列精确的整合进入目标基因组位点。
精确是这里的关键词。敲入的结果就是编辑以后的目标基因的新序列和预先设计的要一
模一样，这就和 随机 的“敲除”形成鲜明对比。显然，敲入 要比敲除 更牛逼：你想
要什么就有什么，而不是靠运气。
如何实现？同样的，用CAS9或者其他的核酸酶切断DNA双链以后，如果同时，细胞里还
有一段人工转入的特殊DNA片段。它携带精确的新序列，并且头尾都和基因组目标位点
的序列重合。这个时候，细胞会通过一种叫做双链破损修复（double strand break
repair,DSBR）的机制来回复DNA的完整性。这个机制会把那段特殊DNA当作补丁打到断
裂的基因组DNA上，从而把断口连接起来。结果就是 人工设计的序列被精确的“写入”
了目标基因组位点。
当然，这个牛逼的方法的效率跟前面一个比起来，低很多（~100倍？）。
--------------------------------
回到He的工作，
他用 基因敲除 把CCR5的原始功能去除了，和文献报道的CCR5_delta32的突变属于同以
类型的突变。而现在剩下来的问题的是：
CCR5_delta32和 LULU, NANA所携带的CCR5突变 虽然都因为不能表达出CCR5原始蛋白而
对HIV(的
一种亚型)形成免疫；但是它们都还是会表达蛋白质产物。CCR5_delta32的产物似乎对
欧洲人没有什么影响。而LULU,NANA突变的CCR5会表达不同产物，这些“新”产物对人
体的影响是什么？ 我们只能等LULU NANA来告诉我们。
---------------------------------
我个人的猜测是，她们的这些“新产物”应该和CCR5_delta32的产物一样，不会对人体
有太大影响。
我觉得真正的问题在于，那些脱靶的、还未知的突变将会造成什么影响。 |
m*******k
发帖数: 839 | 2 CCR5原始蛋白除了跟HIV结合外还有没有什么已知的功能？
【在 x****6 的大作中提到】
: 从编辑对DNA的效果来看，可以分为 敲除（knock-out）和 敲入（knock-in）。
: 敲除，故名思意就是让目标基因失去功能。这个相对容易实现。因为基因经过长期的进
: 化出来的精细结构，随机的删除或者添加几个碱基对(生物里的0 1）就能让目标基因
: 失效。
: 如何实现？CAS9或者其他的核酸酶，在破坏DNA双链以后，细胞会自动修复损伤。这个
: 修复的机制叫做非同源性末端连接（Non-homology end joining,NHEJ）。就是直接把
: 绳子断开的两端直接连接回去。但是这个过程不精确，大概率的会随机造成几个碱基对
: 的删除或者添加。那么正好就可以让基因失效。
: 这就是贺所采取的手段：基因敲除。
: -------------------------------
|
x****6
发帖数: 4339 | 3 失效以后，让人更容易感染流感/
【在 m*******k 的大作中提到】
: CCR5原始蛋白除了跟HIV结合外还有没有什么已知的功能？
|
T*******x
发帖数: 8565 | 4 不错。
【在 x****6 的大作中提到】
: 从编辑对DNA的效果来看，可以分为 敲除（knock-out）和 敲入（knock-in）。
: 敲除，故名思意就是让目标基因失去功能。这个相对容易实现。因为基因经过长期的进
: 化出来的精细结构，随机的删除或者添加几个碱基对(生物里的0 1）就能让目标基因
: 失效。
: 如何实现？CAS9或者其他的核酸酶，在破坏DNA双链以后，细胞会自动修复损伤。这个
: 修复的机制叫做非同源性末端连接（Non-homology end joining,NHEJ）。就是直接把
: 绳子断开的两端直接连接回去。但是这个过程不精确，大概率的会随机造成几个碱基对
: 的删除或者添加。那么正好就可以让基因失效。
: 这就是贺所采取的手段：基因敲除。
: -------------------------------
|
g******y
发帖数: 1 | 5 这段基因从胚胎发育到成人各个阶段的功能都了解清楚了吗？
最怕一知半解的想当然，造成不可挽回的后果 |
x****6
发帖数: 4339 | 6 完全不清楚，至少目前来看，至少不影响小孩出生。
【在 g******y 的大作中提到】
: 这段基因从胚胎发育到成人各个阶段的功能都了解清楚了吗？
: 最怕一知半解的想当然，造成不可挽回的后果
|
x********e
发帖数: 35261 | 7 第一句话就错了
【在 x****6 的大作中提到】
: 从编辑对DNA的效果来看，可以分为 敲除（knock-out）和 敲入（knock-in）。
: 敲除，故名思意就是让目标基因失去功能。这个相对容易实现。因为基因经过长期的进
: 化出来的精细结构，随机的删除或者添加几个碱基对(生物里的0 1）就能让目标基因
: 失效。
: 如何实现？CAS9或者其他的核酸酶，在破坏DNA双链以后，细胞会自动修复损伤。这个
: 修复的机制叫做非同源性末端连接（Non-homology end joining,NHEJ）。就是直接把
: 绳子断开的两端直接连接回去。但是这个过程不精确，大概率的会随机造成几个碱基对
: 的删除或者添加。那么正好就可以让基因失效。
: 这就是贺所采取的手段：基因敲除。
: -------------------------------
|
Z**********g
发帖数: 14173 | 8 他第一句说“叔来科普一下基因编辑”
看来是你哥。
【在 x********e 的大作中提到】
: 第一句话就错了
|
l****9
发帖数: 6 | 9 纠正一点，DNA双链断裂后NHEJ修复时，随机发生的插入与删除碱基数并不限于几个，
可能达到数千碱基。 |
x****6
发帖数: 4339 | 10 谢谢更正。
从分布上来讲，几个碱基对的indel频率是最高的。
【在 l****9 的大作中提到】
: 纠正一点，DNA双链断裂后NHEJ修复时，随机发生的插入与删除碱基数并不限于几个，
: 可能达到数千碱基。
|
m****d
发帖数: 1 | 11 敲完基因后，就影响并控制蛋白质的合成与结构了，是这样吗？
如果是，那么这新DNA结构，导致新结构与新功能的蛋白质，要是产生的新蛋白质与毒
蛇的毒液相似，这样一人一个毒性，互相残杀上去咬一口就成，或者吃tm奶时，咬一口
，tm完蛋了。
【在 x****6 的大作中提到】
: 谢谢更正。
: 从分布上来讲，几个碱基对的indel频率是最高的。
|
x****6
发帖数: 4339 | 12 是的，
类意思于，你在一个程序里随机把一个迭代换成递归，什么后果？ 变了一个程序了。
你说的这种可能理论是存在的，但是概率几乎为零。因为进化出一个新的毒蛋白，那都
是接近100万年的时间尺度的。
除非你用cas9直接把一个已知的毒蛋白序列插到人基因组里，那么不用等100万年，几
个月就齐活
【在 m****d 的大作中提到】
: 敲完基因后，就影响并控制蛋白质的合成与结构了，是这样吗？
: 如果是，那么这新DNA结构，导致新结构与新功能的蛋白质，要是产生的新蛋白质与毒
: 蛇的毒液相似，这样一人一个毒性，互相残杀上去咬一口就成，或者吃tm奶时，咬一口
: ，tm完蛋了。
|
w********2
发帖数: 632 | 13 也就是说这货高效率的搞乱了ccr5这个基因，也不在乎你否和ccr5 delta32一样。如果
这样的话，他为啥选的切点和ccr5 delta32的缺失段的起点一样呢？完全可以随便找个
ccr5 frameshift中的点来切，然后让细胞自己乱修。 |
