y***i
发帖数: 11639 | 1 两个条件对比，本来计划是(a1,b1), (a2,b2)...(a6,b6)，做paired ttest。但样本的
RNA量太小，microarray data非常差。
我现在想能不能每5个样本的RNA合在一起做：
(a1+a2..+a5, b1+b2...+b5), (a6+a7..+a10, b6+b7...+b10)。。。。然后再做paired
ttest？ | a****m
发帖数: 693 | | g********r
发帖数: 8017 | 3 不理解。这样能提高power么？在降低单个样本误差的同时降低了样本数目。
paired
【在 y***i 的大作中提到】
: 两个条件对比，本来计划是(a1,b1), (a2,b2)...(a6,b6)，做paired ttest。但样本的
: RNA量太小，microarray data非常差。
: 我现在想能不能每5个样本的RNA合在一起做：
: (a1+a2..+a5, b1+b2...+b5), (a6+a7..+a10, b6+b7...+b10)。。。。然后再做paired
: ttest？
| y***i
发帖数: 11639 | 4 Thanks, of course >3.
【在 a****m 的大作中提到】
: 可以，但你的至少有3个重复吧
| y***i
发帖数: 11639 | 5 不是为了降低误差，是单一信号太差了，不能用。
本的
【在 g********r 的大作中提到】
: 不理解。这样能提高power么？在降低单个样本误差的同时降低了样本数目。
:
: paired
| g********r
发帖数: 8017 | 6 就是把五份RNA和在一起做一片array？做proteomics的人经常这么做。
【在 y***i 的大作中提到】
: 不是为了降低误差，是单一信号太差了，不能用。
:
: 本的
| d******e
发帖数: 7844 | 7 你先看结果，如果得到的结果符合你的预期，那就先这么做，然后再找合理的解释。
如果和在一起做效果也不行，你想理由也没啥意义，Microarray data不比纯统计，更
看重结果，方法说得不太通，但结果make sense就行。反正最后都是给一帮学生物的看
paired
【在 y***i 的大作中提到】
: 两个条件对比，本来计划是(a1,b1), (a2,b2)...(a6,b6)，做paired ttest。但样本的
: RNA量太小，microarray data非常差。
: 我现在想能不能每5个样本的RNA合在一起做：
: (a1+a2..+a5, b1+b2...+b5), (a6+a7..+a10, b6+b7...+b10)。。。。然后再做paired
: ttest？
| a****g
发帖数: 8131 | 8 你的样本很少的情况下可以折腾吗？
microarray的variance太大了
如果合起来做，只有3个repeat，你的power会不会很小
paired
【在 y***i 的大作中提到】
: 两个条件对比，本来计划是(a1,b1), (a2,b2)...(a6,b6)，做paired ttest。但样本的
: RNA量太小，microarray data非常差。
: 我现在想能不能每5个样本的RNA合在一起做：
: (a1+a2..+a5, b1+b2...+b5), (a6+a7..+a10, b6+b7...+b10)。。。。然后再做paired
: ttest？
|
|
