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全部话题 - 话题: bioinfo
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y***i
发帖数: 11639
1
bioinfo有瞎米成就?任何一个时间段上,bioinfo的结果比bench work的结果来说,
基本可以忽略不计。
你以为会了t-test/PCA之类就等于会数据分析了?---- 至少已经能做现在bioinfo很
重要的一部分了。现在bioinfo对生物学有重要意义的研究方法有那么几块,t-test/
PCA可以说是一大块了。。。。
t*d
发帖数: 1290
2
兄弟们这种问题的时候,想得远一些、广一些。别局限与过去的经验和目前的现状。讨
论讨论生物医药行业的前景; 想想bioinfo 在这里面可以分多少羹。NGS 会给这个行业
带来什么?proteomics 是不是在在3、5年内会成熟起来?了解了这些,就可以大概估
计未来的 bioinfo 可以养活多少人了。在看看这两年 bioinfo 招生的趋势。大概可以
估计日后的就业市场会不会太拥挤。
瞎说一句,未来的 bioinfo 需要的最缺的可能不是 phd,而是master,懂得用适当的
工具做适当的事的人。和现在的 biostatics 类似。
t*d
发帖数: 1290
3
Arul M. Chinnaiyan 做得 bioinfo 还行。水的质量比较高。
Vamsi Mootha,wet,dry两样都玩得来。他的文章一般用 bioinfo 找到target gene,
用实验验证。说明 bioinfo 有些水还是有点用的。
bioinfo 一旦和实验配合好了,还是蛮有些用的。
f*********e
发帖数: 1144
4
呵呵,我找工作的时候顶着bioinfo phd,可是只会R,还只是皮毛。。。根本就不敢找跟
bioinfo相关的,碰到懂行的,一碰就坏了。 不过好处就是找其他领域的时候,让别人
比较肃然起敬,经常面完了之后,突然来一句,"oh,just noticed u got your phd in
bioinfo, tell me about it...impressive..."
总结,要懂其他的,顶一个bioinfo名头还是蛮能唬人
hahahahahha

string
n*****n
发帖数: 3123
5
bioinfo 范围很广,凡是用数学,统计,IT的方法来分析生物的数据都可以归为
bioinfo. 传统biostat就比较窄了。不过现在很多生统的人也在做bioinfo 。你可以看
下bioinformatics和biostatistics这两个journal都有什么文章就心里有数了。
bioinfo里有各种背景的人,统计, CS, 生物,数学,engineering。 我比较看好的是
生物+统计背景的,尤其一个lab有干有湿的这样最NB了。
w***f
发帖数: 903
6
你可以进CS的MS program做Bioinfo, 但是进Bioinfo MS就是笑话了。
你要是软件公司的老板,能收一个拿Bioinfo MS的码工? 没有人会看你上过什么课的。
要是换一下,你拿一个 CS MS,但是还是Bio, 那就是个Plus。
至于学校, 我觉得能给你奖学金就去。

作.
w***f
发帖数: 903
7
你可以进CS的MS program做Bioinfo, 但是进Bioinfo MS就是笑话了。
你要是软件公司的老板,能收一个拿Bioinfo MS的码工? 没有人会看你上过什么课的。
要是换一下,你拿一个 CS MS,但是还是Bio, 那就是个Plus。
至于学校, 我觉得能给你奖学金就去。

作.
t*******g
发帖数: 33
8
Hi,小弟是新人,发贴问个问题咯。
我就想问一个问题,我这种没有真正的CS学位的烂PhD去找码农的工作,会不会连phone
interview都拿不到?直接在简历这一关就死掉了
先说背景,本科是读生物的,但后来发现真的做不下去实验了,就读了个统计的双专业
,但后来发现统计也读不下去了,但写代码还是OK的。先在中西部一个很挫的学校读
bioinfo,但最后的学位应该是PhD in informatics with minor in computet science
。(如果知道是哪个学校也不要挑明哈,其实很容易搜出来的)
解释一下为什么来这么个破学校,没去读CS的master。
首先,家里太穷了,我真不好意思拿钱去读master。以后有需要的话,去读一个也OK。
其次,如果读bioinfo的话,可以去好一些的学校,但来这里主要有这么一个考虑。从
我自己的认识来开,bioinfo的实验室就两种,一种做数据处理,一种搞软件开发。那
种写写脚本分析数据,之后tell a story的事情我真不想做。好一点的学校做软件的肯
定不肯要我,他们肯定招CS科班的了。我愿意来这里的原因就是这个AP是CS... 阅读全帖
s*****0
发帖数: 357
9
Biotech的offer,做life science market research,薪水勉强够80k,其实自己已经可
以接受,但不扯白不扯,明天会给update。
说实话真是讽刺,找了一圈bioinfo的position, position的薪水越来越少,公司里pay
得多,但没要我,研究所学校里对我挺感兴趣,但新水跟senior postdoc和research
associate差不多。总结一个bioinfo的新水规律:
bioinformatics developer/engineer > bioinformatics scientist >
bioinformatics specialist/analyst。前者偏向招CS background,后者偏向招life
science. developer的薪水可以到达80~100k,analyst就可怜巴巴的50~70k。反正我也
没fit bioinfo的position, 所以没啥感觉。
去年找了两三个月的工作,因为没有H-1b quota,所以集中在了非营利组织,锯掉一个
offer,另外些有tele interview
k*****o
发帖数: 1486
10
来自主题: Biology版 - 关于做bioinformatics
选bioinfo的课就行了,你的数学和统计功底好的话肯定没问题。
还有,中国人数学底子本来就很好,就算是学也比美国人快很多(要不然为什么呢么多
F2去读统计呢)。
编成的话说不准,个人觉得逻辑思维还可以的话,学C++和VB都是突击一下就能用。
网上教学视频非常多,以你能考GT过来的1/4努力就能学到bioinfo要用的level(当然
不能用CS的那种高标准要求)。
总之,bioinfo选课很重要,就是说基础知识重要。不学进不来门,进来了比作
molecular/cellular的轻松多了。
s*********x
发帖数: 1923
11
来自主题: Biology版 - 关于做bioinformatics
cs 的 bioinfo 和外系的bioinfo的训练还是非常不一样的,比如cs的核心课bioinfo的
基本都没上过,Algorithm, theory of computation, computer architecture,
compiler ...
b****r
发帖数: 17995
12
呵呵,你是学什么的啊,怎么这么不讲逻辑,我都强调了多少次我以为bioinfo是生物
里最好的,你还在这里拿着整个生物的数据反复强调
而且反过来说,越多做生物的,就越需要做bioinfo的人辅助,即使做纯生物的日子难
过,bioinfo可能还是会很不错
j********e
发帖数: 52
13
你呀,就是嘴硬,哥明明是用过去十来年生物的扩展导致的恶果来做个类比,告诉你
bioinfo并不是你臆想的那么美好。你非得反驳,说5年增40%的爆炸式不是“大跨越”
,还说我拿整个生物的数据反复强调,到底是谁没有逻辑?
bioinfo现在已经回归理性发展轨道了,早几年哪个阿猫阿狗不来晃荡几下灌灌水?但
这并不是是说做这行就有多好,以后也就是低端的技术员职位多而已。给你个例子吧,
这个月礼来就会把其在新加坡的研发中心关了,里边有一大票做bioinfo的。
在象牙塔里做玫瑰梦是很美,可外面的世界是残酷的。
c****r
发帖数: 576
14
一边享受着bioinfo的成就,一边说着bioinfo的无用,有意思。
1. 软件不是研究生物信息的人做出来的么?你自己写个软件(而不是某个程序)试试
?新的仪器在进步,新的数据在产生,旧的软件总有被淘汰的一天。
2. 稍加培训?你以为会了t-test/PCA之类就等于会数据分析了?

实际上等一些分析软件,工具平台大众化
后,这些分析做biology的都能做,并不需要专业的bioinfo。即使现在,做biology的
,在软件和分析方法方面稍加学习或培训,就能很好的做这些数据分析了
b*******1
发帖数: 127
15
For industry jobs, biosta is narrower, focusing on analyzing clinical trial
data. Bioinfo is more flexible. In terms of salary, biosta is pretty good
overall. Bioinfo is more diversified. Data analyst has lower salary, but
bioinfo scientists who understands biological/clinical questions has higher
salary.
A*******e
发帖数: 284
16
真正学生物的人,从来不敢唯生物独尊。任何一个学生物的人,在大学里都花了很多时
间学物理和化学。生物学发展到现在,做生物的对本行业的知识更新速度有切身体会,
keep learning.否则极快跟不上,做生物的,除了bench work,还要阅读大量文献。学
一些infomatics,对现在的生物而言,也是必须的。我每天都会用到你们bioinfo的工
具和软件。实际上,做bench work的,并不是你说的懒于学习,做生物的,若与懒字有
半点关系,基本没戏了。做生物的,大都有phd,我不认为这些人的智商低于你们做
informatics的。
为数学/物理/计算机背景出身的学生所设立的生物课,大
家都踊跃参加, 这是因为你们会学到非常interesting的东西;
反之,为生物背景的学生设的简单数据分析+编程课,参加的人一次比
一次少, 这是因为这些课程无用,boring,学了也不能解决做bench work所产生数据
分析问题,简单告诉你,bench work所产生数据形式千差万别,这是生物这一学科的特
点,并不是一两门简单的课程所能解决的。曾有做纯informatics的办phylog... 阅读全帖
y********a
发帖数: 138
17
Bioinfo is way more than statistical analysis/software-development and is a broad
discipline(structure,function,pathogenesis...)
Goal is to consolidate, correlate data & knowledge in a quantitative manner(
physicical/chemical principles,math models) for improved understanding and
new hypothesis generation. It is a critial component of bio nowadays,
because given the data complexity and diversity, manual operation and low-
dimension(e.g. pair-wise) interpretation is no longer effective.
Both bi... 阅读全帖
c****r
发帖数: 576
18
"反之,为生物背景的学生设的简单数据分析+编程课,参加的人一次比
一次少, 这是因为这些课程无用,boring,学了也不能解决做bench work所产生数据
分析问题,简单告诉你,bench work所产生数据形式千差万别,这是生物这一学科的特
点,并不是一两门简单的课程所能解决的。曾有做纯informatics的办phylogenetics培
训,让我去听,你说我会去吗。 对我而言,google是我最大的老师。"
搞笑,我见过生物出身会编程的也多的是,从做简单的进化树到做数据库,写算法的都
有。连入门课学都不会的人就不要找借口了。生物数据当然是千差万别,所以方法当然
也各不相同,但基本的数学和编程却是所有方法都需要的、互通的。因为所谓的“无用
”而拒绝学习,只不过是懒人的想当然而已。
“为数学/物理/计算机背景出身的学生所设立的生物课,大
家都踊跃参加, 这是因为你们会学到非常interesting的东西”
OK,“interesting”这个词用得好啊,生物是很interesting,但并不很attractive,
也不sexy。我们学习生物不是追求interesting,而是学... 阅读全帖
o********r
发帖数: 775
19
其他都没啥大错,不过这一句有点理想主义:“还可以找实验室帮助验证”。呵呵,这
个可以算是bioinfo的bottleneck,目前bioinfo主要还在academia或者non-profit,想
找人validate你的结果基本都得求爷爷告奶奶,除非你的结果对他们也很有用。
当然这也是bioinfo paper上CNS和PLOS one间的硬件差别
S*M
发帖数: 10832
20
来自主题: Biology版 - 请推荐Bioinformatics入门读物
理论化学博士,考虑转行ing
想了解一下bioinfo到底是干吗的
不知道这行有没有公认的比较全面的入门书
谢谢
另外,看到很多地方招bioinfo博后,都明确要求相关背景
不知道我这种既不是生物,也不是CS的
有没有可能找到bioinfo的博后
p*******i
发帖数: 1181
21
楼主的背景,在美国想找Bioinformatics Research Scientist很难 因为本身是国内的
学历就比较吃亏,在加上文章不够牛(是真的不够牛,total IF这边没人看的。楼主也
许在国内能发5篇确实很不容易,但是Bioinfo在美国想混挂名文章真心很容易,我室友
Bioinfo Phd 5年11篇文章,一作四篇,包括NAR,总引用数100多了,投
Bioinformatics Research Scientist也没找到好位置,只有好些博后的offer。最近几
年药厂裁人很厉害,这个行业美国过剩的很,不建议楼主过来找。国内最近这个行业发
展的很快,应该机会要多很多。
至于直接投生统,我自己是统计的Phd,在生统行业工作。以我的经验来说,生统Phd的
工作已经不是编程的了(编程的话MS的SAS Programmer一大把,年薪5万能招一堆),
核心是modeling,楼主建议你至少Linear Model,Multivariate ANOVA之类的系统学一
遍,不仅仅要知道怎么看SAS或者R的输出结果,还必须要知道为什么(比如说residual
不Normal的时候怎... 阅读全帖
h**********t
发帖数: 545
22
来自主题: Biology版 - Bench恐惧症,怎么办?
他是bioinformatics么?
对于bioinfo,我其实心里很虚的,虽然系里不管是postdoc还是研究生,总会咨询我一
些bioinfo的问题,我也基本上能给予解答(昆虫学对于stat和bioinfo的使用还很初级
,和正统的agronomy没法比),但是我心里清楚,我只知其表,不知其里。
我也曾经想知其里,数学基础也就是国内工程类的水平,曾经看过几本线性模型分析方
法教材,结果是“如堕五里雾中”。深感自己非学这方面的料
t**l
发帖数: 109
23
来自主题: Biology版 - 该转到computational bio领域吗
谢谢你那么多字的回复,感觉很有用。
我今天和这个做计算的老师谈了谈,她问我学过线性代数,或者计算机课程吗。我本科
生物,从来没想过计算机科学和统计这些东西。这个计算的教授做的是新的算分分析,
但是同时也给几个wet-lab的分析一些chip-seq,CLIP这些data,她说分析别人的data都
是routine method,但是她自己的学生都是要做新method. 所以就目前来说,我的背景
无法加入她的lab.她建议我先修一下bioinfo和system bio的课程在第二年,然后有了
wet-lab之后,可以来她的dry lab做个summer rotation学学programing之类的。
我第一年也在一个大牛的wet-lab里面做rotation,我的project就是bisulfate-seq.但
是我做的就是准备工作,后期用mi-seq出来的data是带我的博后自己分析出来的。当时
感觉自己就像是个傻子,除了pcr,cell culture就什么都不知道,计算机一点都不会
,我也是那时候才意识到计算机挺重要的,而且我想以后的我做的wet-lab的实验会涉
及很多sequ... 阅读全帖
x******m
发帖数: 736
24
来自主题: Biology版 - 关于美国的生统博后!
你可以做做bioinfo,找bioinfo的posdoc,现在生统也不行了,bioinfo倒是有些职位
,虽然大部分在学术界,很多core facility都想招一些bioinformatician。
e*******o
发帖数: 4654
25
来自主题: Biology版 - 我再给指个转行路吧
单从买买提生物版就可以看出来,bioinfo 的phd 还是比较好找工作的,因为bioinfo
phd 本来就不多,这些年发展很快。
好多对学术丧失兴趣的都当马工或者data scientist了。(生物信息的是最符合data
scientist 的专业之一)
这就导致了,很多做bioinfor 的实验室,其实招人(尤其是postdoc)不容易。尤其是
不是很牛的。
所以,你如果有个生物phd,学学编程,半年或者一年,找个实验室往bioinfo 转还是
比较靠谱的。
只要迈出第一步,会越来越容易的。
n******7
发帖数: 12463
26
来自主题: Biology版 - 我再给指个转行路吧
其实 很早之前我也想写个转行bioinfo的经验和教训
但是看看自己还这么苦逼,实在没脸写
个中辛酸 一言难尽
没有计算的学位,又想做bioinfo,位置很尴尬
之前的老板,生物的装着懂生物信息,明着说让我不要做ML,
因为他有些ML的想法,但是我经常不听他的
其实他连个binomial distribution都整不明白
前段时间一个project改了算法,R code太慢,花了几天改写成java多线程code了
又被老板质疑我是想学java找工作
其实我是觉得写c++比较麻烦,java写的快一些,速度也在2x之类
归根到底,还是biology + postdoc这个烂专业烂坑组合
我的建议是
生物的人即使做了bioinfo,也要想办法培养/证明自己的programming能力
千万不要满足于做人肉数据处理机
n******7
发帖数: 12463
27
来自主题: Biology版 - 转行 bioinformatics
so true!
我做了很多很多年的bioinfo,涉及几乎bioinfo的每个主要领域(除了进化)
microarray/NGS
expression/SV/TFBS/methylation
miRNA/lncRNA
protein mutaton/sequence analysis
protein/RNA structure&dynamics
network
最后感觉就是,太多需要学习了解的
费了老鼻子劲,结果单拼每个方面都不够牛逼
很没意思
一直认为生物信息就是三大块的知识点
生物,编程,统计/线代/算法/ML
最近几年在努力加强ML和统计方面,有些效果,但是准备不再花太多心思了
一来基础还是太差,比一直搞这个的科班差距明显,不能成为自己的一个卖点。
二来在生物和编程方面投入回报更大。
不过,我觉得bioinfo真的是很有意思的。最接近我当年报生物的初衷的职业。所以也
耗了这么多年青春。。
n******7
发帖数: 12463
28
来自主题: Biology版 - 转行 bioinformatics
so true!
我做了很多很多年的bioinfo,涉及几乎bioinfo的每个主要领域(除了进化)
microarray/NGS
expression/SV/TFBS/methylation
miRNA/lncRNA
protein mutaton/sequence analysis
protein/RNA structure&dynamics
network
最后感觉就是,太多需要学习了解的
费了老鼻子劲,结果单拼每个方面都不够牛逼
很没意思
一直认为生物信息就是三大块的知识点
生物,编程,统计/线代/算法/ML
最近几年在努力加强ML和统计方面,有些效果,但是准备不再花太多心思了
一来基础还是太差,比一直搞这个的科班差距明显,不能成为自己的一个卖点。
二来在生物和编程方面投入回报更大。
不过,我觉得bioinfo真的是很有意思的。最接近我当年报生物的初衷的职业。所以也
耗了这么多年青春。。
s****e
发帖数: 1180
29
来自主题: Statistics版 - 请大家帮忙参谋thesis方向
我觉得,一个博士的thesis和以后做什么工作关系不是非常大,我博士弄的是bayes,
后来干的东西和这毫不相关,而且,我找工作的时候,投一些和bayes有关的工作,有
些人家电面都不给。主要还是看你在哪方面已经胸有成竹,或是特别感兴趣,这样做起
来顺手,有干劲,能早点毕业。但是如果你想到it业工作,建议现在把编程能力搞上去
,顺便machine learning 提高提高。如果想去药厂,当然就survival, longitudinal,
clinical trial那几块了。现在,还有一个问题是,我觉得,biostat, bioinfo,有点
成了坑的感觉,好些biostat, bioinfo的人告诉我,他们投一些生物制药以外的工作
,如it,投不中,主要好些hr看到bio那个词,就觉得他们不适合那工作,不给面试。我
以前认识一学bioinfo phd的人,在校顺手拿了cs master,毕业后纯靠cs master找工
作,当了software engineer. 所以你自己想想。还有,就是把英语听说好好提高一下
,面试的时候会好一些。不行的话别进业界了,发牛文章,当facult... 阅读全帖
h****l
发帖数: 2993
30
我本人就参与了人类基因组计划,我当然知道这个包括生物信息的部分,也包括生物的
部分,这2部分相互合作,但是互相之间懂的很少,我的意思是bioinfo们完全不知道
lab里面做的是什么,他们只理解结果,做wet lab的人就只管产生数据,至于分析的细
节一般是不太懂的,大部分只能看懂最后的分析结果。
理论上,bioinfo的人属于计算机专业更多于生物专业。他们只干编程,处理数据的活
,现在有太多原computer的人转到生物信息了,当然也有一些原生物的人,计算机比较
爱好的,经过一段时间的学习,也可以转到生物信息。但是生物信息和生物这2个专业
确实相隔甚远。
h******y
发帖数: 1374
31
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: StephenKing (88), 信区: Biology
标 题: 弱弱地请教酶切问题!!!
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Apr 29 22:03:59 2011, 美东)
我最近酶切质粒(PMD-18T)总是切的相当不好,能切开,但是切开的目的带特别弱,质
粒很亮,我guarantee质粒浓度没问题,会不会是目的带弱质粒本身的碱基数太多了?
我用的酶是ASCI和NCOI,请高手指点,不胜感激!
PS:我在考虑可不可以加大上样量,或者在酶切体系中少加点水?
PPS:我以前博士做的是bioinfo,现在博后为了跟一个NAS的大佬,被强迫做bench
work,这一年来非常痛苦。进展很慢。只有一篇文章,刚写好,压在老板手里,还没改。
我是不是应该转回bioinfo?
R***n
发帖数: 680
32
来自主题: Military版 - 印度人真的会搞毁公司?
老中当时为什么招他进来?
做bioinfo的老中很多。

bioinfo
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.2.2
c*********2
发帖数: 2752
33
没错啊,quant还是比bioinfo要好太多了。。
bioinfo是读bio快速转坑的捷径,说不定最后还可以去做普通码农。
T****i
发帖数: 15191
34
你不要激愤。我也是做web lab 的,但觉得bioinfo是个很有用的辅助工具。实验设计
也很重要,wet lab的实验结果直接拿来给bioinfo分析,本来就不太合适。有的甚至是
garbage in garbage out。还是得专门好好设计实验。
a*****n
发帖数: 653
35
没想到bioinfo现在还这么热。都有点后悔当初据掉bioinfo PhD的offer了, hehe.

由是个大

发帖数: 1
36
大家好!
我是CS的phd,做bioinformatics,是偏向于用machine learning (deep learning)
来做生物问题,而不是biostats或者genome assembly那套。我背景是top 10的cs phd
,现在在stanford医学院做的postdoc。我今年申请的很晚,从1月1日开始到1月15日陆
续提交了40多个学校,至今没有任何消息。
我说说我的不足点吧,大家能不能帮我分析具体是哪个原因导致我至今没有消息。这样
我明年再上market可以避免。
1. 两个重要的paper都是under review。都是大子刊,都是19年12月左右under review
,我也因此想提早一年上market。这种paper是不是都不算数?我情况特殊,申请的都
是cs系,cs的人都人手一堆会议论文,可能觉得我这种under review的都不算数。但其
实我的领域,尤其是好的期刊,能让paper送审就很艰难了。
2. 材料提交晚,cs系都很早开始面试,比如一个我中意的学校 9月就开始面试了。我
因为上market仓促,所以导师的推荐信也迟了很久,昨天才刚... 阅读全帖
h******r
发帖数: 31
37
感谢你这么认真的回复。非常中肯!谢谢!
看来你也是内行,对很多东西都有了解,不简单。请问你为什么认为bioinformatics有
前途呢?我的确承认bioinfo会一直有市场,有需求。但我总觉得这个行业不冷不热的
。生物的东西风险大,周期长。很多时候就是靠吹泡泡,骗国家政府的钱来维持的。到
现在为止也没有哪些新药是从bioinfo来的。如果哪一天国会终于觉得这是一个骗局的
时候,NIH的funding就要紧缩,大家的日子就要难过。相比之下,还是互联网,大数据
这样的行业让人觉得更实在。
c**********a
发帖数: 659
38
看了一下,bioinfo 的工业界机会一般多,有好些是在 non-profit. 但是non profit
非 post doc 的职位,一般不要phd. 所以你要么当bioinfo post doc 申绿卡,再进工
业界.要么转coder 吧,或者工业界其它ds, da 的职位,不过那些的offer 比coder
难拿.
别人说的话,不必太当真.很多人可能都是外行.要自己亲自看看.总得说来美国有些
行业基本都是夕阳产业了.最hot 的还是it. generally 的讲,公司有startup, new-
corperated, old corperated, etc. 自己看看清楚.
y********a
发帖数: 138
39
来自主题: Postdoc版 - 郁闷-关于LD读薄厚
Disagree
1.bioinformatics's been hot for >5yrs, and is getting saturated now. To enter
top school, a decent postdoc is usually needed.
2, saying bioinformatians are technicians is a narrow-minded assertion.
Don't be jealous about bioinfor gets all popular nowadays and become a
necessary part of CNS publications. Bio is entering a high-throughput era
demanded by the efficiency needs. Complex data understanding and
consolidation by bioinfo is a key to the future of bio.
3. thinking bioinfor = CS i... 阅读全帖
w***n
发帖数: 1084
40
来自主题: Postdoc版 - 郁闷-关于LD读薄厚
这么说吧,如果你ld能够最终找到教职,你帖子里那些问题都不是什么大问题。
但就怕最后竹篮打水一场空。虽说bioinfo这个方向opening多,但这年头都不好说。而
且bioinfo好找也是相对于别的方向而言的。
你得判断你ld对自己有没有个清醒的认识。比如说,他师兄,同学或者认识的同背景的
人有谁找到了教职的,都什么学校。大概要搞到什么位置的学校。他方向每年多少人毕
业,得什么水平的去什么学校,他在这些人里头算什么位置,他出来要和那些人竞争。
还是那句话,faculty job可比industry job难找多了,竞争激烈多了。
y*******o
发帖数: 236
41
来自主题: Returnee版 - 有个deal,有没必要归?
本科学校新进个院士要当院长,同时刚跟我本科老板A一起整了个大项目,一半挂国家
叉叉中心一半啥啥公司那种,正搭建阶段,据闻funding挺多正在找合适的人。新搭了
一些技术刚好是我现在每天工作做的,老板A想找我回去,意思是先把位置占住。本人
单身wsn,生物本,数学硕,原是数理金融方向,干过短时间分析员经济不好时候被踢
,后在医院做bioinfo至今。老板A说回去的话待遇好谈并可读院士博士,不过个人嚼着
只是硕士待遇应该不会有多好,回去至少账面收入要大缩水。
另一本科老板B现是系主任,之前跟我提过四五年后系里有批发考题要退休要我努力一
把拿个屁爱着地四五年后回去找他。本人科研兴趣一般,gossip混关系更在行。我现在
的工作而言,环境待遇都还不错,但发展空间不太大,可以做到老,跳的话或是去本地
药厂继续bioinfo,或是biotech做it。重奔金融也是一种可能,但前景太不明朗代价可
能很重,基本不考虑了。
老板A的这个deal,有没必要回?
x*b
发帖数: 253
42
Well, even a CS PhD in bioinfo likes to do postdoc in order to get a good
position.
This year all the top bioinfo faculty candidates have postdoc experience.

years
pharmaceutical

那么过几年之后竞争faculty
vision很难找faculty的(right?),是不是就因为工业界job
d********g
发帖数: 10
43
Just curious. I don't work in bioinfo.
I know recomb and ismb are the best conferences in bioinfo. But this area
seems to focus more on journal publications.
What journals the hiring committees are looking for from the candidates?
As far as I know, not so many computational people have first-author Nature/
Science paper, right?

行乐
20
之类
开外
postdoc
吧。
a***c
发帖数: 315
44
你如果不是2012年前毕业,BioInformatics没啥前途. BioInformatics的坑都在学校,工业界基本没啥工作. CRA 08年计算机博士工作机会分布,BioInformatics倒数第几. 学校的坑现在添的差不多了,到2012估计坑都满了. Bioinfo好忽悠,政府钱多,学校坑都满了,工业界没机会,最后楼主毕业只有做颇死刀了.所有政府资助主导的,没大规模工业应用的领域最后一样结果.
还有BioInfo的年会和文章发的地方在计算机领域里都挺烂的. 文章质量普遍不敢恭委.
a***c
发帖数: 315
45
BioInfo发nature/science的非常罕见.大多数是在
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
Journal of Computational Biology
Nucleic Acids Research
上灌.还有一个排名很低的KDD bioinfo年会.说实话,大家觉得CS系里在这四个地方灌水
的像是CS的吗.
z**********f
发帖数: 74
46
生物转CS,那楼主要多多努力了,尽早行动;俺当初生物PHD,读了两年差点把人读废
了,费尽千辛万苦转到Bioinfo,快毕业时找实习找工作,发现基本找不到,又费了点
时间学CS,写论文直接写了差不多大半年,很多东西都要自己从头开始学,此中辛苦不
经历的人是无法体会的;终于找到码工工作了,干活的能力还是大大不行,很多时候项
目做不出来的时候睡觉很多时候突然惊醒,向比自己小4~5岁的同事请教,遇到不nice
的被讥笑个面红耳赤。早上八点半起来就开始琢磨代码,晚上12点睡觉,几个月后终于
比较熟练了。知识面还是窄,很多时候人家探讨问题自己都不知道,还需要多努力。
一定要把Java学好,这个用的太多了,core Java的部分每天反复练,坚持写日志。如
果想做传统的web application,那么Java EE学几个框架,例如Spring整合Hibernate
,EJB3.0之类,不过这些东东配置文件调的人想吐;然后RIA前台技术学个AJAX,HTML5
,Flex之类,MVC搞搞熟;然后database稍微学点,简单的SQL会写,知道如何调SP之类
。如果想学移动平台app开发,感觉这个... 阅读全帖
z**********f
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生物转CS,那楼主要多多努力了,尽早行动;俺当初生物PHD,读了两年差点把人读废
了,费尽千辛万苦转到Bioinfo,快毕业时找实习找工作,发现基本找不到,又费了点
时间学CS,写论文直接写了差不多大半年,很多东西都要自己从头开始学,此中辛苦不
经历的人是无法体会的;终于找到码工工作了,干活的能力还是大大不行,很多时候项
目做不出来的时候睡觉很多时候突然惊醒,向比自己小4~5岁的同事请教,遇到不nice
的被讥笑个面红耳赤。早上八点半起来就开始琢磨代码,晚上12点睡觉,几个月后终于
比较熟练了。知识面还是窄,很多时候人家探讨问题自己都不知道,还需要多努力。
一定要把Java学好,这个用的太多了,core Java的部分每天反复练,坚持写日志。如
果想做传统的web application,那么Java EE学几个框架,例如Spring整合Hibernate
,EJB3.0之类,不过这些东东配置文件调的人想吐;然后RIA前台技术学个AJAX,HTML5
,Flex之类,MVC搞搞熟;然后database稍微学点,简单的SQL会写,知道如何调SP之类
。如果想学移动平台app开发,感觉这个... 阅读全帖
K*******a
发帖数: 100
48
本来是生化PhD学生, 读了一年就发现实在没意思也没兴趣, 准备转CS读个MS找找工作.
Transcript上仅有的和CS有关的课是本科(生物)的C++和上学期修的Database(本来想修
算法或者数构的, 但是和schedule冲突), 两个都拿了A. 这学期准备修一门Bioinfo,
原因是已经申请了本校的Bioinfo MS(这个program课程和CS MS基本一样, 区别就是多
了几门生物的课), 而这门课就是admission committee的头儿开的,
准备抱抱大腿增加录取可能性.
现在已经申了一些学校, 包括本校, USC, Columbia, UC Santa Cruz, TAMU等, 除了本
校之外申的都是CS的MS. 计划再申Calpoly和SJSU, 因为据说好找工作.
想问下版上的牛人们还有别的推荐的学校吗? 最好方便找工作的~
多谢了~
K*******a
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本来是生化PhD学生, 读了一年就发现实在没意思也没兴趣, 准备转CS读个MS找找工作.
Transcript上仅有的和CS有关的课是本科(生物)的C++和上学期修的Database(本来想修
算法或者数构的, 但是和schedule冲突), 两个都拿了A. 这学期准备修一门Bioinfo,
原因是已经申请了本校的Bioinfo MS(这个program课程和CS MS基本一样, 区别就是多
了几门生物的课), 而这门课就是admission committee的头儿开的,
准备抱抱大腿增加录取可能性.
现在已经申了一些学校, 包括本校, USC, Columbia, UC Santa Cruz, TAMU等, 除了本
校之外申的都是CS的MS. 计划再申Calpoly和SJSU, 因为据说好找工作.
想问下版上的牛人们还有别的推荐的学校吗? 最好方便找工作的~
多谢了~
n******7
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50
来自主题: Hardware版 - Mac Pro 配置推荐
我们这一层楼做bioinfo的,没有看到用mac pro的,用imac的倒是有
以前在另一层楼做bioinfo的地方,也没有一个用mac pro的,倒是一个同事用ibook,
等他当了PI,立刻订了一个mac pro
你这比较也不合适,官网升级到极端配置当然是杀猪价,要性价比完全可以自己加东西

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