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Biology版 - 有一个digestion的问题
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X***h
发帖数: 74
1
如果我PCR后的product比较干净,能否不处理直接restriction digest? 现在我比较麻
烦的是如
果用column purification总是丢失大部分的DNA,后面digest完了还要gel
purification,
那就所剩无几了。
或者用SAP 去除primers,然后Ethanol-sodium acetate precipitation,总可以上
digestion了吧。
l***y
发帖数: 638
2
要看用啥酶了
不过pcr又不值钱,多做几管purify,总能拿到足够dna

【在 X***h 的大作中提到】
: 如果我PCR后的product比较干净,能否不处理直接restriction digest? 现在我比较麻
: 烦的是如
: 果用column purification总是丢失大部分的DNA,后面digest完了还要gel
: purification,
: 那就所剩无几了。
: 或者用SAP 去除primers,然后Ethanol-sodium acetate precipitation,总可以上
: digestion了吧。

X***h
发帖数: 74
3
ft,template值钱啊。
用的是SacI HF和HindIII。

【在 l***y 的大作中提到】
: 要看用啥酶了
: 不过pcr又不值钱,多做几管purify,总能拿到足够dna

s******r
发帖数: 2876
4
你既然都P出来了,完全可以用PCR产物第二次扩增一遍,
DNA还不是要多少有多少。

如果我PCR后的product比较干净,能否不处理直接restriction digest? 现在我比较麻
烦的是如
果用column purification总是丢失大部分的DNA,后面digest完了还要gel
purification,
那就所剩无几了。
或者用SAP 去除primers,然后Ethanol-sodium acetate precipitation,总可以上
digestion了吧。

【在 X***h 的大作中提到】
: 如果我PCR后的product比较干净,能否不处理直接restriction digest? 现在我比较麻
: 烦的是如
: 果用column purification总是丢失大部分的DNA,后面digest完了还要gel
: purification,
: 那就所剩无几了。
: 或者用SAP 去除primers,然后Ethanol-sodium acetate precipitation,总可以上
: digestion了吧。

e****s
发帖数: 1125
5
你PCR完了还没有Template?
PCR产物不就是Template了吗?
通常那些PCR clean-up的Kit效率还是不错的,除非你PCR产物超级小或者大。

【在 X***h 的大作中提到】
: ft,template值钱啊。
: 用的是SacI HF和HindIII。

X***h
发帖数: 74
6
实际上是超小。~100bp。
这样的小片段在用column的时候是不是bind完了spin的时间需要短一些呢?我都是照着
标准的流程做
的,结果非常low.

【在 e****s 的大作中提到】
: 你PCR完了还没有Template?
: PCR产物不就是Template了吗?
: 通常那些PCR clean-up的Kit效率还是不错的,除非你PCR产物超级小或者大。

e****s
发帖数: 1125
7
我用ZYMO的Kit弄过80bp的,我只是把2次洗涤,减到一次。效果很好。
关键还是PCR产物多点就好了。

【在 X***h 的大作中提到】
: 实际上是超小。~100bp。
: 这样的小片段在用column的时候是不是bind完了spin的时间需要短一些呢?我都是照着
: 标准的流程做
: 的,结果非常low.

X***h
发帖数: 74
8
恩,我先triple我的PCR,然后再试试一半gel purify,一半ethanol/acetate
precipitation.

【在 e****s 的大作中提到】
: 我用ZYMO的Kit弄过80bp的,我只是把2次洗涤,减到一次。效果很好。
: 关键还是PCR产物多点就好了。

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