d*******e
发帖数: 10 | |
s**e
发帖数: 1523 | 2 我觉得应该还有。我的一位朋友在做PCP方面的，在筛新的下游基因。还有两个是做
cell adhesion相关的，做和beta catenin相关的一些东西。具体的不是很清楚，不过
申请到了funding。 |
T****r
发帖数: 4006 | |
c*********r
发帖数: 1312 | 4 我LP说这个通路是万金油，好多领域都能和它扯上那么点儿关系。
我们实验室做海胆和海葵的胚胎早期发育中体轴的建立和胚层分化，主要就是Wnt/beta
-catenin和Wnt/PCP这两个通路。现在好像PCP比较热门，和cilia、细胞极性、体轴发
育、果蝇的单眼和翅膀的毛，高等动物内耳毛的发育等等基础问题有关，又和cystic
kidney disease等疾病相关。。。 |
s**e
发帖数: 1523 | 5 PCR在二十年前是很火很火的。。。现在已经消退了很多了。 |
p**i
发帖数: 3525 | 6 海胆和海葵那个进化早一点?
beta
【在 c*********r 的大作中提到】
: 我LP说这个通路是万金油，好多领域都能和它扯上那么点儿关系。
: 我们实验室做海胆和海葵的胚胎早期发育中体轴的建立和胚层分化，主要就是Wnt/beta
: -catenin和Wnt/PCP这两个通路。现在好像PCP比较热门，和cilia、细胞极性、体轴发
: 育、果蝇的单眼和翅膀的毛，高等动物内耳毛的发育等等基础问题有关，又和cystic
: kidney disease等疾病相关。。。
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P****d
发帖数: 564 | |
a*****n
发帖数: 2835 | 8 差不多吧，总是很多水文，很多文章都是在瞎掰捣乱
【在 P****d 的大作中提到】
: ms添乱的比解决问题的多。
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w******n
发帖数: 168 | 9 不过wnt主要的component基本都发现了 就像Nusse同学今年NAS了一样
剩下的像PCP好像主要component也发现的差不多了
像wnt在传统发育学 在果蝇 线虫 斑马鱼 fogg的role基本都比较清楚了
但是关键是“老药新用”比如当时Zou yimin做出来在axon guidance中的作用
或者在synaptic genesis的作用
或者除了体轴发育这种粗调作用外 在local environment中niche的微调作用
我觉得还是很有搞头
beta
【在 c*********r 的大作中提到】
: 我LP说这个通路是万金油，好多领域都能和它扯上那么点儿关系。
: 我们实验室做海胆和海葵的胚胎早期发育中体轴的建立和胚层分化，主要就是Wnt/beta
: -catenin和Wnt/PCP这两个通路。现在好像PCP比较热门，和cilia、细胞极性、体轴发
: 育、果蝇的单眼和翅膀的毛，高等动物内耳毛的发育等等基础问题有关，又和cystic
: kidney disease等疾病相关。。。
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c*********r
发帖数: 1312 | 10 海葵早一些。
【在 p**i 的大作中提到】
: 海胆和海葵那个进化早一点?
:
: beta
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c*********r
发帖数: 1312 | 11 说道微调，刚看了篇文章说Wnt pathway和cell cycle相关，LRP S1490在G2/M期被
CDK14/Cyclin Y磷酸化导致Beta-catenin富集，还是挺有意思的。wnt和细胞周期、纺
锤体、centrosome、oriented cell division等等等等都能扯上点关系。。。
另外，Wnt的主要components基本上发现的差不多了，但不同的条件下哪些蛋白参与了
，怎么参与了还不清楚。比如海葵海胆早期发育（很早很早）时wnt pathway是激活的
，但似乎不需要Wnt ligand的参与；比如LRP、dishevelled等有那么多磷酸化位点，具
体怎么被磷酸化的，还不是很清楚。。。
【在 w******n 的大作中提到】
: 不过wnt主要的component基本都发现了 就像Nusse同学今年NAS了一样
: 剩下的像PCP好像主要component也发现的差不多了
: 像wnt在传统发育学 在果蝇 线虫 斑马鱼 fogg的role基本都比较清楚了
: 但是关键是“老药新用”比如当时Zou yimin做出来在axon guidance中的作用
: 或者在synaptic genesis的作用
: 或者除了体轴发育这种粗调作用外 在local environment中niche的微调作用
: 我觉得还是很有搞头
:
: beta
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p**i
发帖数: 3525 | 12 那个好养?
【在 c*********r 的大作中提到】
: 海葵早一些。
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p**i
发帖数: 3525 | 13 确切吗: 海葵海胆早期发育（很早很早）时wnt pathway是激活的，但似乎不需要Wnt
ligand的参与
【在 c*********r 的大作中提到】
: 说道微调，刚看了篇文章说Wnt pathway和cell cycle相关，LRP S1490在G2/M期被
: CDK14/Cyclin Y磷酸化导致Beta-catenin富集，还是挺有意思的。wnt和细胞周期、纺
: 锤体、centrosome、oriented cell division等等等等都能扯上点关系。。。
: 另外，Wnt的主要components基本上发现的差不多了，但不同的条件下哪些蛋白参与了
: ，怎么参与了还不清楚。比如海葵海胆早期发育（很早很早）时wnt pathway是激活的
: ，但似乎不需要Wnt ligand的参与；比如LRP、dishevelled等有那么多磷酸化位点，具
: 体怎么被磷酸化的，还不是很清楚。。。
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c*********r
发帖数: 1312 | 14 海葵好养。海胆很少有养的，都是买来产一次卵就不用了。。。
【在 p**i 的大作中提到】
: 那个好养?
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p**i
发帖数: 3525 | 15 Caltech 的一个大牛专做海胆，前一阵来作报告，有些好奇
【在 c*********r 的大作中提到】
: 海葵好养。海胆很少有养的，都是买来产一次卵就不用了。。。
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c*********r
发帖数: 1312 | 16 Eric Davidson吧。海胆领域的超级大牛了！提到Gene regulatory networks就不得不
提他啊！
【在 p**i 的大作中提到】
: Caltech 的一个大牛专做海胆，前一阵来作报告，有些好奇
|
p**i
发帖数: 3525 | 17 他到底有多牛?
【在 c*********r 的大作中提到】
: Eric Davidson吧。海胆领域的超级大牛了！提到Gene regulatory networks就不得不
: 提他啊！
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c*********r
发帖数: 1312 | 18 他70多岁了，思维敏捷依旧，sea urchin领域第一权威吧。Caltech的人应该更有发言
权，我只是了解一点点，造句用词可能不太恰当，如有不实还请原谅。。。标志性事件
之一是他2002年在science上发表了“the first real scale gene regulatory
network (including about 50 genes)”，对gene regulatory networks （GRN）理论
的发展贡献颇多，经常在顶级杂志上灌水，《The Regulatory Genome》发行了第二版
。现在做sea urchin的大多数都是他的徒子徒孙了。现在的lab很大，很多博后，很多
都在做cis regulatory elements相关的研究。
【在 p**i 的大作中提到】
: 他到底有多牛?
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c*********r
发帖数: 1312 | 19 是我目前见过的publication最多的PI。。。
【在 p**i 的大作中提到】
: 他到底有多牛?
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a***e
发帖数: 1010 | 20 why not create your own direction, instead of jump in something that has
been studied for such a long time?
Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt
pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself. |
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x**w
发帖数: 112 | 21 Eric Davidson
reductionism 的死忠拥趸
Gene tools的最有价值客户 (他实验室至少订过几千条 Morpholino)
不知道什么时候他画的那些“电路图”能在数学上被解释。。。
发信人: ppri (ppri), 信区: Biology
标 题: Re: wnt 通路还有得做没？
发信站: BBS 未名空间站 (Sat May 1 13:45:58 2010, 美东)
他到底有多牛? |
c*********r
发帖数: 1312 | 22 有道理啊，真希望咱也能搞出个新方向
【在 a***e 的大作中提到】
: why not create your own direction, instead of jump in something that has
: been studied for such a long time?
: Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt
: pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself.
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H******e
发帖数: 100 | 23 Nature. 2010 Apr 22;464(7292):1143-8. Epub 2010 Apr 7.
Generation of a novel wing colour pattern by the Wingless morphogen.
Werner T, Koshikawa S, Williams TM, Carroll SB.
我觉得Sean Carroll的这篇文章很有意思。 |
P****d
发帖数: 564 | 24 好漂亮的照片。是什么？
【在 c*********r 的大作中提到】
: 海葵早一些。
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O******e
发帖数: 4845 | 25 Wnt pathway在iPS中的作用被人发了没有？
【在 a***e 的大作中提到】
: why not create your own direction, instead of jump in something that has
: been studied for such a long time?
: Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt
: pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself.
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c*********r
发帖数: 1312 | 26 谢谢，海胆16细胞时候in situ hybridization的图。DAPI染核，红色的是in situ的信
号，merge。但是这个是sense strand probe，应该是用来做control的，结果却有信号
，老板不信，结果没用。。。
【在 P****d 的大作中提到】
: 好漂亮的照片。是什么？
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c*********r
发帖数: 1312 | 27 那几个factor里有Wnt相关的吗？
【在 O******e 的大作中提到】
: Wnt pathway在iPS中的作用被人发了没有？
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t*d
发帖数: 1290 | 28 Roeland Nusse was just elected to National Academy of Sciences.
WNT pathway in stem cell is just becoming hot, I think.
【在 a***e 的大作中提到】
: why not create your own direction, instead of jump in something that has
: been studied for such a long time?
: Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt
: pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself.
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a***e
发帖数: 1010 | 29 If you jumped in wnt pathway now and one day Nusse got a noble prize, you
will have contribute a lot but can't share the prize.
However, if you are the first one to apply iPS in clinics, you will have a
a much better chance to get the noble prize yourself.
【在 t*d 的大作中提到】
: Roeland Nusse was just elected to National Academy of Sciences.
: WNT pathway in stem cell is just becoming hot, I think.
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O******e
发帖数: 4845 | 30 谷了一把，貌似已经很多相关研究了。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 那几个factor里有Wnt相关的吗？
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c*********r
发帖数: 1312 | 31 isi了一把，只有6篇。都是2009年的。其中第二篇给了个阴阳regulator的说。。。
对iPS不熟，纯属看热闹。
有一点我一直在想，胚胎早期的细胞具有全能性，其实就是胚胎干细胞。在胚胎发育早
期决定性作用的factors，应该也是对干细胞的维持、分化等起作用。那么Wnt相关的一
些基因也应该在iPS中有重要作用吧，毕竟wnt在早期胚胎发育中不可或缺。
难道是因为Wnt的终端Beta-catenin只是transcriptional coactivator而不是
transcription factor。。。那位知道Yamanaka最初有没有做Wnt相关的基因啊？他都
是做的transcription factor吗？
【在 O******e 的大作中提到】
: 谷了一把，貌似已经很多相关研究了。
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O******e
发帖数: 4845 | 32 估计是有人试了，可惜没组合成功。
【在 c*********r 的大作中提到】
: isi了一把，只有6篇。都是2009年的。其中第二篇给了个阴阳regulator的说。。。
: 对iPS不熟，纯属看热闹。
: 有一点我一直在想，胚胎早期的细胞具有全能性，其实就是胚胎干细胞。在胚胎发育早
: 期决定性作用的factors，应该也是对干细胞的维持、分化等起作用。那么Wnt相关的一
: 些基因也应该在iPS中有重要作用吧，毕竟wnt在早期胚胎发育中不可或缺。
: 难道是因为Wnt的终端Beta-catenin只是transcriptional coactivator而不是
: transcription factor。。。那位知道Yamanaka最初有没有做Wnt相关的基因啊？他都
: 是做的transcription factor吗？
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g*r
发帖数: 2116 | 33 信号通路这种东西 就像是物理里面的理想状态
只要你愿意做 永远有的做
【在 d*******e 的大作中提到】
: 有没有了解这个领域的，能否指点一下？
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d****u
发帖数: 1553 | 34 那个海胆做完实验能吃吗？要是能吃我申请去他们实验室。最爱吃海胆了 |
c*********r
发帖数: 1312 | 35 如果再加上Wnt和其它信号通路的cross talk的话，可研究的东东还真不少。。。 |
c*********r
发帖数: 1312 | 36 你都是怎么吃啊？推荐一下吧。我唯一一次吃海胆是在国内，海胆炒饭，可能做得不地
道，感觉一般。
在日式的饮食里，听说uni（发音wūni？）是比较贵而其比较好的一种海胆卵。wiki了
一把：“In Japan, sea urchin is known as uni (ウニ?), and can retail for as
much as $450/kg”。所以有几次我们刚拿到新鲜的海胆卵，一个日本博后拿个移液器
洗了两百微升，打到嘴里了。。。有人录像为证。
我们用的海胆都是野生的，有公司潜水到海底捞的。实验只用注射点KCl刺激肌肉收缩
把卵或精子出来。然后那些海胆就不用了。这样的话其实那些海胆可以食用吧。我们一
个学期积累一箱海胆。。。海胆死后被腐蚀之后的壳也很漂亮。
【在 d****u 的大作中提到】
: 那个海胆做完实验能吃吗？要是能吃我申请去他们实验室。最爱吃海胆了
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a****d
发帖数: 1919 | 37 I believe that beta-catenin is one of his 24(or a different number)
transcription factors for the first iPS induction experiment.It turned out
that beta-catenin is not the necessary one for iPS as we learned now.
【在 c*********r 的大作中提到】
: isi了一把，只有6篇。都是2009年的。其中第二篇给了个阴阳regulator的说。。。
: 对iPS不熟，纯属看热闹。
: 有一点我一直在想，胚胎早期的细胞具有全能性，其实就是胚胎干细胞。在胚胎发育早
: 期决定性作用的factors，应该也是对干细胞的维持、分化等起作用。那么Wnt相关的一
: 些基因也应该在iPS中有重要作用吧，毕竟wnt在早期胚胎发育中不可或缺。
: 难道是因为Wnt的终端Beta-catenin只是transcriptional coactivator而不是
: transcription factor。。。那位知道Yamanaka最初有没有做Wnt相关的基因啊？他都
: 是做的transcription factor吗？
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d****u
发帖数: 1553 | 38 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃，不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看，弄
熟了吃绝对是浪费，一定要吃生
的，新鲜海胆。我没直接打开吃过，都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
，绝了，我一般都是稍微沾一点点
青芥和酱油，往嘴里一放，软软滑滑的，好吃啊！说到这里我自己的口水都出来了。
as
【在 c*********r 的大作中提到】
: 你都是怎么吃啊？推荐一下吧。我唯一一次吃海胆是在国内，海胆炒饭，可能做得不地
: 道，感觉一般。
: 在日式的饮食里，听说uni（发音wūni？）是比较贵而其比较好的一种海胆卵。wiki了
: 一把：“In Japan, sea urchin is known as uni (ウニ?), and can retail for as
: much as $450/kg”。所以有几次我们刚拿到新鲜的海胆卵，一个日本博后拿个移液器
: 洗了两百微升，打到嘴里了。。。有人录像为证。
: 我们用的海胆都是野生的，有公司潜水到海底捞的。实验只用注射点KCl刺激肌肉收缩
: 把卵或精子出来。然后那些海胆就不用了。这样的话其实那些海胆可以食用吧。我们一
: 个学期积累一箱海胆。。。海胆死后被腐蚀之后的壳也很漂亮。
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y**s
发帖数: 6809 | 39 。。。。。。。。
海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃，不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看，弄
熟了吃绝对是浪费，一定要吃生
的，新鲜海胆。我没直接打开吃过，都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
，绝了，我一般都是稍微沾一点点
青芥和酱油，往嘴里一放，软软滑滑的，好吃啊！说到这里我自己的口水都出来了。
as
【在 d****u 的大作中提到】
: 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃，不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看，弄
: 熟了吃绝对是浪费，一定要吃生
: 的，新鲜海胆。我没直接打开吃过，都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
: ，绝了，我一般都是稍微沾一点点
: 青芥和酱油，往嘴里一放，软软滑滑的，好吃啊！说到这里我自己的口水都出来了。
:
: as
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d****u
发帖数: 1553 | 40 c-myc是wnt的target gene吧
【在 c*********r 的大作中提到】
: 那几个factor里有Wnt相关的吗？
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c*********r
发帖数: 1312 | 41 Good to know. Thanks!
【在 a****d 的大作中提到】
: I believe that beta-catenin is one of his 24(or a different number)
: transcription factors for the first iPS induction experiment.It turned out
: that beta-catenin is not the necessary one for iPS as we learned now.
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c*********r
发帖数: 1312 | 42 那你赶快申请去Davidson实验室吧，我们的海胆都是从加州寄过来的。
【在 d****u 的大作中提到】
: 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃，不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看，弄
: 熟了吃绝对是浪费，一定要吃生
: 的，新鲜海胆。我没直接打开吃过，都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
: ，绝了，我一般都是稍微沾一点点
: 青芥和酱油，往嘴里一放，软软滑滑的，好吃啊！说到这里我自己的口水都出来了。
:
: as
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c*********r
发帖数: 1312 | 43 下次我一定试一下！LP在旁边威胁我下次一定要带回来几只。。。
【在 d****u 的大作中提到】
: 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃，不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看，弄
: 熟了吃绝对是浪费，一定要吃生
: 的，新鲜海胆。我没直接打开吃过，都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
: ，绝了，我一般都是稍微沾一点点
: 青芥和酱油，往嘴里一放，软软滑滑的，好吃啊！说到这里我自己的口水都出来了。
:
: as
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c*********r
发帖数: 1312 | 44 wiki了一下，“Myc is activated upon various mitogenic signals such as Wnt,
Shh and EGF (via the MAPK/ERK pathway).”看来Wnt比较上游。在胚胎发育里也是。
可能太上游的信号通路不会“直接”诱导细胞。。。（也许长期来看有可能？也许还更
多能一些？？）
【在 d****u 的大作中提到】
: c-myc是wnt的target gene吧
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c*********r
发帖数: 1312 | 45 不好意思，刚看到你的帖子。这个问题我没有深究过，只是附和老板和前辈们的结论。
在海胆和海葵中，Wnt pathway被激活的地方，以beta catenin作为marker，是
gastrulation的地方。我们实验室以前的数据显示，Wnt ligand不是localized。但是
Wnt pathway中的dishevelled在卵细胞甚至更早就localize在植物极，而且是必需的。
据说Wnt ligands的knock down都没有明显的表现性缺陷但是老板的文章里Dishevelled
下调后影响胚胎发育。不知道这些信息是否够证明Wnt ligands不参与早期的这些事件
。。。
早期的胚胎发育有些独特，是从一个巨大的单细胞开始的，和之后的多细胞的体系有所
不同吧。
Wnt
【在 p**i 的大作中提到】
: 确切吗: 海葵海胆早期发育（很早很早）时wnt pathway是激活的，但似乎不需要Wnt
: ligand的参与
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d****u
发帖数: 1553 | 46 这个wnt信号在发育中的作用在很多阶段都有报道，有时候是促进发育，有时候又是促
进分化。各个实验室都在灌水。还有
经典和非经典信号。所以具体Wnt信号到底起到什么做用还是很多人都在做，而且还不
是能发个好文章什么的。
Dishevelled
【在 c*********r 的大作中提到】
: 不好意思，刚看到你的帖子。这个问题我没有深究过，只是附和老板和前辈们的结论。
: 在海胆和海葵中，Wnt pathway被激活的地方，以beta catenin作为marker，是
: gastrulation的地方。我们实验室以前的数据显示，Wnt ligand不是localized。但是
: Wnt pathway中的dishevelled在卵细胞甚至更早就localize在植物极，而且是必需的。
: 据说Wnt ligands的knock down都没有明显的表现性缺陷但是老板的文章里Dishevelled
: 下调后影响胚胎发育。不知道这些信息是否够证明Wnt ligands不参与早期的这些事件
: 。。。
: 早期的胚胎发育有些独特，是从一个巨大的单细胞开始的，和之后的多细胞的体系有所
: 不同吧。
:
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d****u
发帖数: 1553 | 47 beta-catenin单独是没有转录活性的，严格来说是个转录激活因子，必须和TCF/LEF结
合才有转录活性。
【在 a****d 的大作中提到】
: I believe that beta-catenin is one of his 24(or a different number)
: transcription factors for the first iPS induction experiment.It turned out
: that beta-catenin is not the necessary one for iPS as we learned now.
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